Actinomycetes, a group of filamento

Actinomycetes, a group of filamentous, Gram-positive bacteria, have long been a remarkable source of useful therapeutics. Recent genome sequencing and transcriptomic studies have shown that these bacteria, responsible for half of the clinically used antibiotics, also harbor a large reservoir of gene clusters, which have the potential to produce novel secreted small molecules. Yet, many of these clusters are not expressed under common culture conditions. One reason why these clusters have not been linked to a secreted small molecule lies in the way that actinomycetes have typically been studied: as pure cultures in nutrient-rich media that do not mimic the complex environments in which these bacteria evolved. New methods based on multispecies culture conditions provide an alternative approach to investigating the products of these gene clusters. We have recently implemented binary interspecies interaction assays to mine for new secondary metabolites and to study the underlying biology of interactinomycete interactions. Here, we describe the detailed biological and chemical methods comprising these studies.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Actinomycetes กลุ่ม filamentous แบคทีเรียแกรมบวกแบคทีเรีย ได้รับแหล่งโดดเด่นของ therapeutics เป็นประโยชน์ จีโนมลำดับและ transcriptomic การศึกษาล่าสุดได้แสดงว่า เชื้อแบคทีเรียเหล่านี้ ความรับผิดชอบครึ่งหนึ่งของยาปฏิชีวนะที่ใช้ทางคลินิก ยัง harbor อ่างเก็บน้ำขนาดใหญ่ของกลุ่มยีน ซึ่งมีศักยภาพในการผลิตนวนิยายของโมเลกุลขนาดเล็ก secreted ยัง หลายคลัสเตอร์เหล่านี้จะไม่แสดงวัฒนธรรมสภาวะทั่วไป เหตุผลหนึ่งที่ทำไมคลัสเตอร์เหล่านี้ไม่ได้เชื่อมโยงไปเป็นโมเลกุลขนาดเล็ก secreted อยู่แบบว่า actinomycetes มีโดยทั่วไปแล้วศึกษา: เป็นวัฒนธรรมบริสุทธิ์ในสื่อที่อุดมไปด้วยสารเลียนแบบสภาพแวดล้อมที่ซับซ้อนซึ่งแบคทีเรียเหล่านี้พัฒนา วิธีการใหม่ตามเงื่อนไข multispecies วัฒนธรรมมีวิธีการอื่นเพื่อตรวจสอบผลิตภัณฑ์ของกลุ่มยีนเหล่านี้ เราเพิ่งใช้โต้ตอบ interspecies ไบนารี assays ทาง metabolites รองใหม่ และศึกษาชีววิทยาพื้นฐานของ interactinomycete โต้ตอบ ที่นี่ เราอธิบายรายละเอียดทางเคมี และชีวภาพวิธีการศึกษาเหล่านี้ประกอบด้วย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

actinomycetes กลุ่มใยแบคทีเรียแกรมบวกมีมานานแล้วเป็นแหล่งที่โดดเด่นของการรักษาที่มีประโยชน์ ลำดับจีโนมที่ผ่านมาและการศึกษา transcriptomic แสดงให้เห็นว่าแบคทีเรียเหล่านี้มีความรับผิดชอบสำหรับครึ่งหนึ่งของยาปฏิชีวนะที่ใช้ในทางการแพทย์ยังท่าเรืออ่างเก็บน้ำขนาดใหญ่ของกลุ่มยีนที่มีศักยภาพในการผลิตนวนิยายหลั่งโมเลกุลขนาดเล็ก แต่หลายกลุ่มเหล่านี้จะไม่ได้แสดงภายใต้เงื่อนไขวัฒนธรรมร่วมกัน อีกเหตุผลหนึ่งที่กลุ่มเหล่านี้ยังไม่ได้รับการเชื่อมโยงกับโมเลกุลขนาดเล็กหลั่งอยู่ในวิธีการที่แอคติโนมัยได้รับการศึกษาโดยทั่วไป: เป็นวัฒนธรรมที่บริสุทธิ์ในสื่ออุดมด้วยสารอาหารที่ไม่ได้เลียนแบบสภาพแวดล้อมที่ซับซ้อนซึ่งแบคทีเรียเหล่านี้พัฒนา วิธีการใหม่ขึ้นอยู่กับเงื่อนไข multispecies วัฒนธรรมให้วิธีการทางเลือกในการตรวจสอบผลิตภัณฑ์ของกลุ่มยีนเหล่านี้ เราได้ดำเนินการเมื่อเร็ว ๆ นี้ไบนารี interspecies การตรวจการทำงานร่วมกันไปยังเหมืองสำหรับสารทุติยภูมิใหม่และศึกษาชีววิทยาพื้นฐานของการมีปฏิสัมพันธ์ interactinomycete ที่นี่เราจะอธิบายวิธีการทางชีวภาพและสารเคมีที่ประกอบไปด้วยรายละเอียดการศึกษาเหล่านี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แอคติโนมัยซีท กลุ่มที่มี แบคทีเรีย แกรมบวก มานาน เป็นแหล่งที่โดดเด่นของที่มีประโยชน์มากที่สุดในโลก การศึกษาลำดับจีโนมและ transcriptomic ล่าสุดแสดงให้เห็นว่า แบคทีเรียเหล่านี้รับผิดชอบครึ่งหนึ่งของยาปฏิชีวนะที่ใช้ทางการแพทย์ นอกจากนี้ ท่าเรืออ่างเก็บน้ำขนาดใหญ่ของกลุ่มยีน ซึ่งมีศักยภาพในการผลิตใหม่ที่มีโมเลกุลขนาดเล็ก ยังหลายกลุ่มเหล่านี้จะไม่แสดงภายใต้สภาพเพาะเลี้ยงทั่วไป เหตุผลหนึ่งที่กลุ่มเหล่านี้ไม่ได้ถูกเชื่อมโยงกับหลั่งโมเลกุลเล็กอยู่ในทางที่ถูกศึกษาด้วยกัน มักจะเป็นเชื้อบริสุทธิ์ในสารอาหารที่อุดมไปด้วยสื่อที่ไม่เลียนแบบซับซ้อนสภาพแวดล้อมที่แบคทีเรียเหล่านี้วิวัฒนาการใหม่โดยวิธีเพาะเลี้ยง multispecies ให้วิธีการตรวจสอบผลิตภัณฑ์ของกลุ่มยีนเหล่านี้ เราได้ดำเนินการเมื่อเร็ว interspecies ปฏิสัมพันธ์หรือไบนารีของฉันสำหรับชนิดทุติยภูมิใหม่และศึกษาพื้นฐานชีววิทยาของ interactinomycete การโต้ตอบ ที่นี่เราอธิบายรายละเอียดวิธีการทางชีววิทยาและเคมี ประกอบด้วย การศึกษาเหล่านี้