To investigate to which level the P

To investigate to which level the PR-1 protein sequence of N.
mirabilis is homolog to other plant species, a molecular phylogenetic
analysis by Maximum Likelihood and Neighbor-Joining method
was performed. The analysis involved the PR-1 protein
sequences from 23 different plant species, including N. mirabilis
(Supplementary Fig. 1). Using MUSCLE software for alignment
and MEGA5 program to reconstruct the evolutionary histories of
the applied species, in Fig. 3A the bootstrap consensus tree inferred
from 1000 replicates is shown (Felsenstein, 1985). Here, ML and NJ
method were combined in one tree regarding to the bootstrap values,
pointed out next to each branch in Fig. 3A (ML value/NJ value).
One lineage consists of N. mirabilis (NEMI1), V. vinifera (VIVI1) and
Ricinus communis (RICO1) with bootstrap support values of 52%
and 65% respectively, to NEMI1. Bootstrap values of N. mirabilis
with respect to the other tested species were lower than 50%. To
address the feature of glycosylation sites found in NmPR-1 protein, all other 22 protein sequences were further analyzed using the
NetNGlyc program. Strikingly, the two neighboring species, R. communis
and V. vinifera, that form a lineage with N. mirabilis were predicted
to contain one N-glycosylation site each (Fig. 3B). To our
knowledge, NmPR-1 is the first example of a highly glycosylated
PR-1 protein in plants

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การตรวจสอบที่ระดับลำดับโปรตีน PR 1 ของ N.mirabilis เป็น homolog กับพืชชนิดอื่น ๆ ในโมเลกุลทางวิเคราะห์ โดยวิธีสูงสุดโอกาสและเพื่อนบ้านที่เข้าร่วมได้ดำเนินการ การวิเคราะห์ที่เกี่ยวข้องกับโปรตีน PR 1ลำดับจาก 23 พืชต่างพันธุ์ รวมถึง N. mirabilis(เสริมรูปที่ 1) โดยใช้ซอฟต์แวร์ของกล้ามเนื้อสำหรับการจัดตำแหน่งและโปรแกรม MEGA5 เพื่อสร้างประวัติศาสตร์วิวัฒนาการของใช้พันธุ์ ในรูปที่ 3A สรุปแผนภูมิการเริ่มต้นระบบฉันทามติจาก 1000 replicates จะปรากฏ (Felsenstein, 1985) ที่นี่ ML และ NJถูกรวมในหนึ่งแผนภูมิวิธีการค่าเริ่มต้นชี้อยู่ถัดจากแต่ละสาขาในรูป 3A (ค่า ค่า/NJ ML)ประกอบด้วยเชื้อสายหนึ่งของ N. mirabilis (NEMI1), V. vinifera (VIVI1) และRicinus communis (RICO1) ที่ มีค่าเริ่มต้นระบบสนับสนุนของ 52%และ 65% ตามลำดับ เพื่อ NEMI1 ค่าเริ่มต้นของ N. mirabilisเกี่ยวกับสายพันธุ์ที่ผ่านการทดสอบอื่น ๆ ได้ต่ำกว่า 50% ถึงอยู่ลักษณะการทำงานของเว็บไซต์ glycosylation พบโปรตีน NmPR-1 ลำดับ 22 โปรตีนอื่น ๆ ทั้งหมดได้วิเคราะห์โดยใช้ต่อไปนี้โปรแกรมของ NetNGlyc อันโดดเด่น สองใกล้เคียงพันธุ์ อาร์ communisและ V. vinifera แบบฟอร์มนั้นเป็นเชื้อสายกับ N. mirabilis ถูกคาดการณ์ไว้มี N-glycosylation ไซต์หนึ่งละ (รูปที่ 3B) การของเราความรู้ NmPR-1 เป็นตัวอย่างแรกของ glycosylated สูงประชาสัมพันธ์-1 โปรตีนในพืช

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เพื่อตรวจสอบที่ระดับลำดับโปรตีน PR-1 ของสหประชาชาติ
mirabilis เป็น homolog สายพันธุ์พืชอื่น ๆ ซึ่งเป็นโมเลกุล phylogenetic
วิเคราะห์โดยสูงสุดโอกาสและวิธีเพื่อนบ้านเข้า
ได้ดำเนินการ การวิเคราะห์ที่เกี่ยวข้องกับโปรตีน PR-1
ลำดับจาก 23 สายพันธุ์พืชที่แตกต่างกันรวมทั้ง N. mirabilis
(เสริมรูป. 1) การใช้ซอฟแวร์สำหรับการจัดตำแหน่งกล้ามเนื้อ
และโปรแกรม MEGA5 ที่จะสร้างประวัติศาสตร์วิวัฒนาการของ
สายพันธุ์ที่นำมาใช้ในรูป 3A ต้นไม้ฉันทามติบูตอนุมาน
1000 ซ้ำปรากฏ (Felsenstein, 1985) นี่ ML และนิวเจอร์ซีย์
วิธีการทำงานร่วมกันในต้นไม้ต้นหนึ่งเกี่ยวกับค่าบูตที่
ชี้ให้เห็นถัดจากแต่ละสาขาในรูป 3A (ค่า ML / ค่า NJ)
หนึ่งเชื้อสายประกอบด้วยเอ็น
mirabilis (NEMI1) โวลต์ vinifera (VIVI1) และ Ricinus communis (RICO1) ที่มีค่าการสนับสนุนเงินทุน 52%
และ 65% ตามลำดับเพื่อ NEMI1 ค่าเงินทุนของ mirabilis เอ็น
ที่เกี่ยวกับสายพันธุ์ที่ผ่านการทดสอบอื่น ๆ ต่ำกว่า 50% จะ
อยู่ที่คุณลักษณะของเว็บไซต์ glycosylation พบใน NMPR-1 โปรตีนอื่น ๆ ทั้งหมด 22 โปรตีนที่ได้มาวิเคราะห์เพิ่มเติมได้โดยใช้
โปรแกรม NetNGlyc ยอดเยี่ยมทั้งสองสายพันธุ์ใกล้เคียง, R. communis
โวลต์และ vinifera ว่ารูปแบบเชื้อสายกับ mirabilis เอ็นถูกคาดการณ์
ว่าจะมีเว็บไซต์หนึ่ง N-glycosylation แต่ละ (รูป. 3B) ของเรา
ความรู้ NMPR-1 เป็นตัวอย่างแรกของ glycosylated สูง
PR-1 โปรตีนในพืช vinifera (VIVI1) และ Ricinus communis (RICO1) ที่มีค่าการสนับสนุนเงินทุน 52% และ 65% ตามลำดับเพื่อ NEMI1 ค่าเงินทุนของ mirabilis เอ็นที่เกี่ยวกับสายพันธุ์ที่ผ่านการทดสอบอื่น ๆ ต่ำกว่า 50% จะอยู่ที่คุณลักษณะของเว็บไซต์ glycosylation พบใน NMPR-1 โปรตีนอื่น ๆ ทั้งหมด 22 โปรตีนที่ได้มาวิเคราะห์เพิ่มเติมได้โดยใช้โปรแกรม NetNGlyc ยอดเยี่ยมทั้งสองสายพันธุ์ใกล้เคียง, R. communis โวลต์และ vinifera ว่ารูปแบบเชื้อสายกับ mirabilis เอ็นถูกคาดการณ์ว่าจะมีเว็บไซต์หนึ่ง N-glycosylation แต่ละ (รูป. 3B) ของเราความรู้ NMPR-1 เป็นตัวอย่างแรกของ glycosylated สูงPR-1 โปรตีนในพืช vinifera (VIVI1) และ Ricinus communis (RICO1) ที่มีค่าการสนับสนุนเงินทุน 52% และ 65% ตามลำดับเพื่อ NEMI1 ค่าเงินทุนของ mirabilis เอ็นที่เกี่ยวกับสายพันธุ์ที่ผ่านการทดสอบอื่น ๆ ต่ำกว่า 50% จะอยู่ที่คุณลักษณะของเว็บไซต์ glycosylation พบใน NMPR-1 โปรตีนอื่น ๆ ทั้งหมด 22 โปรตีนที่ได้มาวิเคราะห์เพิ่มเติมได้โดยใช้โปรแกรม NetNGlyc ยอดเยี่ยมทั้งสองสายพันธุ์ใกล้เคียง, R. communis โวลต์และ vinifera ว่ารูปแบบเชื้อสายกับ mirabilis เอ็นถูกคาดการณ์ว่าจะมีเว็บไซต์หนึ่ง N-glycosylation แต่ละ (รูป. 3B) ของเราความรู้ NMPR-1 เป็นตัวอย่างแรกของ glycosylated สูงPR-1 โปรตีนในพืช mirabilis ที่เกี่ยวกับสายพันธุ์ที่ผ่านการทดสอบอื่น ๆ ต่ำกว่า 50% จะอยู่ที่คุณลักษณะของเว็บไซต์ glycosylation พบใน NMPR-1 โปรตีนอื่น ๆ ทั้งหมด 22 โปรตีนที่ได้มาวิเคราะห์เพิ่มเติมได้โดยใช้โปรแกรม NetNGlyc ยอดเยี่ยมทั้งสองสายพันธุ์ใกล้เคียง, R. communis โวลต์และ vinifera ว่ารูปแบบเชื้อสายกับ mirabilis เอ็นถูกคาดการณ์ว่าจะมีเว็บไซต์หนึ่ง N-glycosylation แต่ละ (รูป. 3B) ของเราความรู้ NMPR-1 เป็นตัวอย่างแรกของ glycosylated สูงPR-1 โปรตีนในพืช mirabilis ที่เกี่ยวกับสายพันธุ์ที่ผ่านการทดสอบอื่น ๆ ต่ำกว่า 50% จะอยู่ที่คุณลักษณะของเว็บไซต์ glycosylation พบใน NMPR-1 โปรตีนอื่น ๆ ทั้งหมด 22 โปรตีนที่ได้มาวิเคราะห์เพิ่มเติมได้โดยใช้โปรแกรม NetNGlyc ยอดเยี่ยมทั้งสองสายพันธุ์ใกล้เคียง, R. communis โวลต์และ vinifera ว่ารูปแบบเชื้อสายกับ mirabilis เอ็นถูกคาดการณ์ว่าจะมีเว็บไซต์หนึ่ง N-glycosylation แต่ละ (รูป. 3B) ของเราความรู้ NMPR-1 เป็นตัวอย่างแรกของ glycosylated สูงPR-1 โปรตีนในพืช รูปแบบที่เชื้อสายกับ mirabilis เอ็นถูกคาดการณ์ ว่าจะมีเว็บไซต์หนึ่ง N-glycosylation แต่ละ (รูป. 3B) ของเราความรู้ NMPR-1 เป็นตัวอย่างแรกของ glycosylated สูงPR-1 โปรตีนในพืช รูปแบบที่เชื้อสายกับ mirabilis เอ็นถูกคาดการณ์ ว่าจะมีเว็บไซต์หนึ่ง N-glycosylation แต่ละ (รูป. 3B) ของเราความรู้ NMPR-1 เป็นตัวอย่างแรกของ glycosylated สูงPR-1 โปรตีนในพืช

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เพื่อศึกษาระดับโปรตีนที่ pr-1 ลำดับ .มิราบิลิส เป็น homolog กับพืชชนิดอื่น ซึ่งเป็นโมเลกุลการวิเคราะห์โดยวิธีความน่าจะเป็นสูงสุด และเพื่อนบ้านเข้าร่วมกำหนด การวิเคราะห์โปรตีน pr-1 เกี่ยวข้องลำดับ 23 จากพืชชนิดต่าง ๆรวมทั้งมก. )( เพิ่มเติมรูปที่ 1 ) ซอฟต์แวร์สำหรับการใช้กล้ามเนื้อและโปรแกรม mega5 เพื่อสร้างประวัติศาสตร์ของวิวัฒนาการใช้ชนิดในรูปที่ 3A ต้นไม้มีบูท เอกฉันท์จาก 1 , 000 ซ้ำแสดง ( felsenstein , 1985 ) นี่ขนาด NJวิธีการรวมอยู่ในต้นไม้ต้นหนึ่งซึ่งเท่ากับค่าชี้ให้เห็นถัดจากแต่ละสาขาในรูปที่ 3A ( ค่ามิลลิลิตร / NJ ค่า )คนเชื้อสายประกอบด้วยเอ็น มิราบิลิส ( nemi1 ) , V . vinifera ( vivi1 ) และricinus communis ( rico1 ) มีค่าเท่ากับ 52% สนับสนุนของและ 65 ตามลำดับ เพื่อ nemi1 . ค่าบูท ( มก.ด้วยความเคารพอื่น ๆทดสอบชนิดต่ำกว่า 50% เพื่อที่อยู่คุณลักษณะของเว็บไซต์ที่พบใน nmpr-1 glycosylation โปรตีนอื่นๆ ทั้งหมด 22 โปรตีน ลำดับได้วิเคราะห์โดยใช้โปรแกรม netnglyc . ข้อมูล สองประเทศเพื่อนบ้าน communis ชนิด Rและ V . vinifera , ฟอร์มการกับมิราบิลิสถูกทำนาย )มีหนึ่งเว็บไซต์แต่ละ n-glycosylation ( รูปที่ 3B ) ของเราความรู้ nmpr-1 เป็นตัวอย่างแรกของอย่างอื่นpr-1 โปรตีนในพืช