The microbial genome database (MBGD

The microbial genome database (MBGD) for comparative analysis is a platform for microbial comparative genomics based on automated ortholog group identification. A prominent feature of MBGD is that it allows users to create ortholog groups using a specified subgroup of organisms. Advanced functionalities include: (i) enhanced assignment of functional annotation, including external database links to each orthologous group, (ii) interface for choosing a set of genomes to compare based on phenotypic properties, (iii) the addition of more eukaryotic microbial genomes (fungi and protists) and some higher eukaryotes as references and (iv) enhancement of the MyMBGD mode, which allows users to add their own genomes to MBGD and now accepts raw genomic sequences without any annotation (in such a case, it runs a gene-finding procedure before identifying the orthologs).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ฐานข้อมูลกลุ่มจุลินทรีย์ (MBGD) สำหรับการวิเคราะห์เปรียบเทียบคือ แพลตฟอร์มสำหรับ genomics เปรียบเทียบจุลินทรีย์ตามรหัสกลุ่ม ortholog อัตโนมัติ คุณลักษณะเด่นของ MBGD คือ มันช่วยให้ผู้ใช้สร้างกลุ่ม ortholog ใช้ระบุกลุ่มย่อยของสิ่งมีชีวิต รวมฟังก์ชันการทำงานขั้นสูง: กำหนด (i) เพิ่มขึ้นของข้อมูลกำกับที่ทำงาน รวมทั้งฐานข้อมูลภายนอกการเชื่อมโยงแต่ละกลุ่ม orthologous, (ii) อินเตอร์เฟซสำหรับการเลือกชุดของ genomes เปรียบเทียบตามคุณสมบัติฟีโนไทป์, (iii) การเพิ่มขึ้น eukaryotic genomes จุลินทรีย์ (เชื้อราและชี่) และบาง eukaryotes สูงเป็นการอ้างอิงและ (iv) การเพิ่มโหมด MyMBGD ซึ่งผู้ใช้สามารถเพิ่ม genomes ของตนเองเพื่อ MBGD และตอนนี้ ยอมรับวัตถุดิบลำดับที่ออก โดยไม่มีคำอธิบายใด ๆ (ในกรณีดังกล่าว มันเรียกใช้กระบวนการค้นหายีนก่อนระบุ orthologs)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

จุลินทรีย์จีโนมฐานข้อมูล (MBGD) สำหรับการวิเคราะห์เปรียบเทียบเป็นแพลตฟอร์มสำหรับการเปรียบเทียบฟังก์ชั่จุลินทรีย์ขึ้นอยู่กับบัตรประจำตัวกลุ่ม ortholog อัตโนมัติ คุณลักษณะที่โดดเด่นของ MBGD ก็คือว่ามันจะช่วยให้ผู้ใช้สามารถสร้างกลุ่ม ortholog ใช้กลุ่มย่อยระบุของสิ่งมีชีวิต ฟังก์ชันการทำงานขั้นสูงรวมถึง: (i) ที่ได้รับมอบหมายที่เพิ่มขึ้นของคำอธิบายประกอบการทำงานรวมทั้งการเชื่อมโยงฐานข้อมูลภายนอกแต่ละกลุ่ม orthologous (ii) อินเตอร์เฟซสำหรับการเลือกชุดของจีโนมเพื่อเปรียบเทียบขึ้นอยู่กับคุณสมบัติฟีโนไทป์ (iii) การเพิ่มขึ้นของจีโนมของจุลินทรีย์ eukaryotic มากขึ้น ( เชื้อราและ protists) และบางส่วนยูคาริโอที่สูงขึ้นตามการอ้างอิงและ (iv) การเพิ่มประสิทธิภาพของโหมด MyMBGD ซึ่งจะช่วยให้ผู้ใช้สามารถเพิ่มจีโนมของตัวเองเพื่อ MBGD และตอนนี้ยอมรับลำดับจีโนมดิบโดยไม่ต้องอธิบายประกอบใด ๆ (ในกรณีเช่นนี้จะทำงาน gene- หาขั้นตอนก่อนที่จะระบุ orthologs) ที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ฐานข้อมูลจีโนมของจุลินทรีย์ ( mbgd ) สำหรับการวิเคราะห์เปรียบเทียบเป็นแพลตฟอร์มสำหรับการเปรียบเทียบลักษณะทางพันธุกรรมตาม ortholog กลุ่มรหัสอัตโนมัติ จุดเด่นของ mbgd ก็คือว่ามันช่วยให้ผู้ใช้สามารถสร้างกลุ่ม ortholog ใช้ระบุกลุ่มย่อยของสิ่งมีชีวิต ฟังก์ชันขั้นสูงรวมถึง : ( 1 ) การเพิ่มหมายเหตุการทำงาน รวมถึงการเชื่อมโยงกับฐานข้อมูลภายนอก orthologous แต่ละกลุ่ม ( 2 ) อินเตอร์เฟซสำหรับการเลือกชุดของจีโนมเปรียบเทียบตามคุณสมบัติที่ใกล้เคียง ( 3 ) เพิ่มเข้ามามากกว่าจุลินทรีย์ Genomes ( เชื้อราและโพรทิสต์ ) และสูงกว่ายูแคริโอตเป็นข้อมูลอ้างอิงและ ( iv ) เพิ่มโหมด mymbgd ซึ่งจะช่วยให้ผู้ใช้เพื่อเพิ่มจีโนมของตัวเองเพื่อ mbgd ตอนนี้ยอมรับลำดับจีโนมดิบโดยไม่ต้องใด ๆ บันทึกย่อ ( เช่นในกรณี มันวิ่งยีนหาขั้นตอนก่อนการ orthologs )