Steps in a phenetic analysisa. Sele

Steps in a phenetic analysis

a. Select the organisms under study. Taxa are called OTUs (Operational Taxonomic Units).
b. Choose the characters that will be scored for each OTU.
c. Construct an OTU by character matrix.
d. Use some mathematical formula to describe the degree of similarity or distance between each pariwise comparison of OTUs. For example, the Simple Matching Coefficient (S) is:

S = # matches between two OTUs X 100 [matches = 1, 1 and 0,0]
Total # of characters

e. Construct another matrix that gives all pairwise S values
f. Use a clustering technique (more on this below) to produce a dendrogram. A commonly used one is UPGMA
(Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Averaging).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ขั้นตอนในการวิเคราะห์ phenetica. เลือกสิ่งมีชีวิตภายใต้การศึกษา Taxa เรียกว่า OTUs (หน่วยงานอนุกรมวิธาน)b. เลือกตัวที่จะทำประตูในแต่ละ OTUค.สร้างการ OTU โดยอักขระเมตริกซ์d. ใช้บางสูตรทางคณิตศาสตร์เพื่ออธิบายระดับของความคล้ายคลึงกันหรือระยะห่างระหว่างแต่ละเปรียบเทียบ pariwise OTUs ตัวอย่าง ตัวอย่างตรงกับสัมประสิทธิ์ (S) คือ: S #ตรงระหว่างสอง OTUs X 100 = [ตรง = 1, 1 และ 0,0]#รวมตัว e. สร้างเมตริกซ์อื่นที่ให้ค่า S แพร์ไวส์ทั้งหมดนี่ใช้เทคนิคระบบคลัสเตอร์ (เพิ่มเติมบนนี้ด้านล่าง) เพื่อผลิตเป็น dendrogram ที่ใช้กันทั่วไปคือ UPGMA(กลุ่มคู่ unweighted วิธี ด้วยการหาค่าเฉลี่ยเลขคณิต)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ขั้นตอนในการวิเคราะห์ phenetic เลือกสิ่งมีชีวิตภายใต้การศึกษา แท็กซ่าจะเรียกว่า Otus (การดำเนินงานอนุกรมวิธานหน่วย). ข เลือกตัวอักษรที่จะได้รับคะแนนสำหรับแต่ละ OTU. ค สร้าง OTU โดยเมทริกซ์ตัวอักษร. d ใช้สูตรทางคณิตศาสตร์บางอย่างที่จะอธิบายระดับของความคล้ายคลึงกันหรือระยะห่างระหว่างแต่ละเปรียบเทียบ pariwise ของ Otus ยกตัวอย่างเช่นค่าสัมประสิทธิ์การจับคู่ที่เรียบง่าย (S) คือS = # ตรงระหว่างสอง Otus X 100 [การแข่งขัน = 1, 0,0 และ 1] รวม # ของตัวละครอี สร้างเมทริกซ์ที่ช่วยให้ค่า S จากจำนวนทั้งหมดอีกฉ ใช้เทคนิคการจัดกลุ่ม (เพิ่มเติมเกี่ยวกับเรื่องนี้ด้านล่าง) ในการผลิต dendrogram ที่ใช้กันทั่วไปคือหนึ่ง UPGMA (ชั่งคู่กลุ่มที่มีวิธีการเฉลี่ยเลขคณิต)