PLFA16:15cisdidnotcorrelatewithspo

PLFA16:15cisdidnotcorrelatewithsporedensity,whichisconsistent with earlier results suggesting that the PLFA biomarker indicatesfungalhyphaldensityandisconfoundedbyitsoccurrence in Gram-negative bacteria. We did not measure AM fungal hyphae sowecannotevaluatetheutilityofthePLFAbiomarkerforthatpurpose. In roots ELFA 16:15cis was the only biomarker to provide statistically significant correlations to colonization in both experiments. The remaining biomarkers all worked in one experiment but not in the other. IntheoryELFAshouldbeequivalenttothesumofNLFA,glycolipid FA, and PLFA, and this is consistent with our finding that ELFA was always greater than the sum of NLFA and PLFA. The superiority of NLFA over ELFA for measuring spores can be explained by the inclusion of PLFA 16:15cis from Gram-negative bacteria and fungal hyphae in ELFA. However, the fact that ELFA is superior to both NLFA and PLFA in correlations to root colonization is not so easily explained. Since ELFA includes NLFA, glycolipids, and PLFA, itislogicaltoconcludethatELFA16:15cisissummingupthecontributionsofspores,vesicles,andhyphae,whereasNLFA16:15cis doesnotincludethehyphaewhilePLFA16:15cisdoesnotinclude sporesorvesiclesandinadditionisconfoundedbyGram-negative bacteria (Olsson et al., 1995; Olsson, 1999). ThePLFAbiomarkerwasahigherproportionofELFAinsoilthan in roots, while NLFA was a higher proportion of ELFA in roots than soil,andtheNLFAtoPLFAbiomarkerratiowashigherinrootsthan soil. These results indicate that relatively more lipid was used for energy storage in roots than in soil, which we attribute to vesicle formation in roots (Olsson et al., 1995). Differencesinsporecountsandrootcolonizationwereobserved betweenthethreesoils.ThesedifferencesmaybeduetothedifferentAMFspeciescompositionamongthesoilsandtodifferencesin edaphic factors between the soils, particularly pH (Coughlan et al., 2000;Rousketal.,2009).Thesepatternswereverysimilartothose observed for NLFA and ELFA but not PLFA. Thus, across three soils varying in AMF community composition, similar but not identical conclusions regarding relative spore density and root colonization canbeachievedbylipidanalysisandtraditionalmicroscopicmethods. However, our experiment was limited to one plant species, maize, and it is possible that results would be different in other plant species. If the only purpose of a lipid analysis is to estimate AMF spore density and plant root colonization, our results indicate that ELFA is the best choice, and can also be used for microbial community analysis as an alternative to PLFA (Drijber et al., 2000). However, if PLFA-based microbial community analysis is needed, the addition ofNLFAtomeasureAMFsporesrequireslittleadditionallaborover that of doing PLFA alone.
Acknowledgements
We thank Stanley Tesch for technical assistance. Financial support from Department of Biotechnology, Govt. of India to MPS for carrying out this work during his DBT-CREST fellowship is gratefully acknowledged.
References
Allison, V.J., Yermakov, Z., Miller, R.M., Jastrow, J.D., Matamala, R., 2007. Using landscape and depth gradients to decouple the impact of correlated environmental variables on soil microbial community composition. Soil Biol. Biochem. 39, 505–516. Bååth, E., Díaz-Ravi˜na, M., Frostegård, A., Campbell, C.D., 1998. Effect of metal-rich sludgeamendmentsonthesoilmicrobialcommunity.Appl.Environ.Microbiol. 64, 238–245.
Buyer, J.S., Roberts, D.P., Russek-Cohen, E., 2002. Soil and plant effects on microbial community structure. Can. J. Microbiol. 48, 955–964. Buyer,J.S.,Sasser,M.,2012.Highthroughputphospholipidfattyacidanalysisofsoils. Appl. Soil Ecol. 61, 127–130. Buyer, J.S., Teasdale, J.R., Roberts, D.P., Zasada, I.A., Maul, J.E., 2010. Factors affecting soil microbial community structure in tomato cropping systems. Soil Biol. Biochem. 42, 831–841. Clark, R.B., Zeto, S.K., 2000. Mineral acquisition by arbuscular mycorrhizal plants. J. Plant Nutr. 23, 867–902. Coughlan, A.P., Dalpé, Y., Lapointe, L., Piché, Y., 2000. Soil pH-induced changes in root colonization, diversity, and reproduction of symbiotic arbuscular mycorrhizal fungi from healthy and declining maple forests. Can. J. For. Res. 30, 1543–1554. Drijber, R.A., Doran, J.W., Parkhurst, A.M., Lyon, D.J., 2000. Changes in soil microbial community structure with tillage under long-term wheat-fallow management. Soil Biol. Biochem. 32, 1419–1430. Frostegård, A., Bååth, E., Tunlid, A., 1993. Shifts in the structure of soil microbial communities in limed forests as revealed by phospholipid fatty acid analysis. Soil Biol. Biochem. 25, 723–730. Gange, A.C., Bower, E., Stagg, P.G., Aplin, D.M., Gillam, A.E., Bracken, M., 1999. A comparison of visualisation techniques for recording arbuscular mycorrhizal colonisation. New Phytol. 142, 123–132. Gerdemann, J.W., Nicholson, T.H., 1963. Spores of mycorrhizal endogone species extracted from soil by wet sieving and decanting. Trans. Br. Mycol. Soc. 46, 235–244. Giovannetti,M.,Mosse,B.,1980.Anevaluationoftechniquesformeasuringvesicular arbuscular mycorrhizal infection in roots. New Phytol. 84, 489–500. Grigera, M.S., Drijber, R.A., Wienhold, B.J., 2007. Increased abundance of arbuscular mycorrhizal fungi in soil coincides with the reproductive stages of maize. Soil Biol. Biochem. 39, 1401–1409. Ianson, D.C., Allen, M.F., 1986. The effect of soil texture on extraction of vesicular–arbuscular mycorrhizal spores from arid soils. Mycologia 78, 164–168. Larsen,J.,Bødker,L.,2001.Interactionsbetweenpearootinhabitingfungiexamined using signature fatty acids. New Phytol. 149, 487–493. Lehman, R.M., Taheri, W.I., Osborne, S.L., Buyer, J.S., Douds Jr., D.D., 2012. Fall cover croppingcanincreasearbuscularmycorrhizaeinsoilssupportingintensiveagricultural production. Appl. Soil Ecol. 61, 300–304. Li,X.L.,George,E.,Marschner,H.,1991.Extensionofthephosphorusdepletionzone in VA mycorrhizal white clover in a calcareous soil. Plant Soil 136, 41–48. Moore-Kucera, J., Dick, R.P., 2008. PLFA profiling of microbial community structure and seasonal shifts in soils of a Douglas-fir chronosequence. Microb. Ecol. 55, 500–511. Olsson, P.A., 1999. Signature fatty acids provide tools for determination of the distributionandinteractionsofmycorrhizalfungiinsoil.FEMSMicrobiol.Ecol.29, 303–310. Olsson,P.A.,Bååth,E.,Jakobsen,I.,Söderström,B.,1995.Theuseofphospholipidand neutral lipid fatty acids to estimate biomass of arbuscular mycorrhizal fungi in soil. Mycol. Res. 99, 623–629. Phillips,J.M.,Hayman,D.S.,1970.Improvedproceduresforclearingrootsandstaining parasitic and vesicular–arbuscular fungi for rapid assessment of infection. Trans. Br. Mycol. Soc. 55, 158–161. Rasmann, C., Graham, J.H., Chellemi, D.O., Datnoff, L.E., Larsen, J., 2009. Resilient populationsofrootfungioccurwithinfivetomatoproductionsystemsinsoutheast Florida. Appl. Soil Ecol. 43, 22–31. Rousk, J., Brookes, P.C., Bååth, E., 2009. Contrasting soil pH effects on fungal and bacterialgrowthsuggestfunctionalredundancyincarbonmineralization.Appl. Environ. Microbiol. 75, 1589–1596. Schenck,N.C.,Perez,Y.,1990.ManualfortheIdentificationofVAMycorrhizalFungi, 3rd ed. Synergistic, Gainesville, FL. Schutter, M.E., Dick, R.P., 2000. Comparison of fatty acid methyl ester (FAME) methods for characterizing microbial communities. Soil Sci. Soc. Am. J. 64, 1659–1668. Smith, S., Read, D., 2008. Mycorrhizal Symbiosis. Academic Press, New York. Soil Survey Staff, 2010. Keys to Soil Taxonomy, 11th ed. USDA-Natural Resources Conservation Service, Washington, DC. Stroup, W.W., 2014. Rethinking the analysis of non-normal data in plant and soil science. Agron. J. 106, 1–17. Van Aarle, I.M., Olsson, P.A., 2003. Fungal lipid accumulation and development of mycelial structures by two arbuscular mycorrhizal fungi. Appl. Environ. Microbiol. 69, 6762–6767. Vestberg, M., Polojärvi, A., Pitkänen, T., Kaipainen, S., Puolakka, E., Keskitalo, M., 2012.Neutrallipidfattyacidanalysisisasensitivemarkerforquantitativeestimationofarbuscularmycorrhizalfungiinagriculturalsoilwithcropsofdifferent mycotrophy. Agric. Food Sci. 21, 12–27. Zelles,L.,1997.Phospholipidfattyacidprofilesinselectedmembersofsoilmicrobial communities. Chemosphere 35, 275–299. Zelles, L., Bai, Q.Y., Ma, R.X., Rackwitz, R., Winter, K., Beese, F., 1994. Microbial biomass, metabolic activity and nutritional status determined from fatty acid patterns and poly-hydroxybutyrate in agriculturally managed soils. Soil Biol. Biochem. 26, 439–446.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

PLFA16:1 5cisdidnotcorrelatewithsporedensity, whichisconsistent กับผลก่อนหน้านี้ที่แนะนำที่ indicatesfungalhyphaldensityandisconfoundedbyitsoccurrence ไบโอมาร์คเกอร์ PLFA ในแบคทีเรียแบคทีเรียแกรมลบ นอกจากนี้เราไม่ได้วัด AM hyphae เชื้อรา sowecannotevaluatetheutilityofthePLFAbiomarkerforthatpurpose ในราก ELFA 16:1 5cis ถูกไบโอมาร์คเกอร์เพียงเพื่อให้ significant สัมพันธ์กับอาณานิคมในทั้งสองการทดลองทางสถิติ Biomarkers ที่เหลือทั้งหมดทำงาน ในการทดลองที่หนึ่ง แต่ ในอีกไม่ IntheoryELFAshouldbeequivalenttothesumofNLFA ไกลโคลิพิด FA และ PLFA และนี้จะสอดคล้องกับ finding ของ ELFA อยู่เสมอมากกว่าผลรวมของ NLFA และ PLFA สามารถอธิบาย โดยรวมของ 5cis PLFA 16:1 ปมของ NLFA ผ่าน ELFA วัดเพาะเฟิร์นจากแบคทีเรียแบคทีเรียแกรมลบและเชื้อรา hyphae ใน ELFA อย่างไรก็ตาม ข้อเท็จจริงว่า ELFA ห้อง NLFA และ PLFA ในความสัมพันธ์กับรากสนามไม่ง่ายดังนั้นอธิบาย ตั้งแต่ ELFA รวม NLFA, glycolipids และ PLFA, itislogicaltoconcludethatELFA16:1 5cisissummingupthecontributionsofspores อสุจิ andhyphae, whereasNLFA16:1 5cis doesnotincludethehyphaewhilePLFA16:1 5cisdoesnotinclude sporesorvesiclesandinadditionisconfoundedbyGram ลบแบคทีเรีย (Olsson et al., 1995 Olsson, 1999) ThePLFAbiomarkerwasahigherproportionofELFAinsoilthan ในราก ขณะ NLFA สูงกว่าสัดส่วนของ ELFA ในรากกว่าดิน ดิน andtheNLFAtoPLFAbiomarkerratiowashigherinrootsthan ผลลัพธ์เหล่านี้บ่งชี้ว่า มีใช้ไขมันค่อนข้างมากสำหรับพลังงานที่เก็บในรากมากกว่าในดิน ซึ่งเรากำหนดให้กับการก่อตัวของเวสิเคิลในราก (Olsson et al., 1995) Differencesinsporecountsandrootcolonizationwereobserved betweenthethreesoils ปัจจัย edaphic ThesedifferencesmaybeduetothedifferentAMFspeciescompositionamongthesoilsandtodifferencesin ระหว่างดินเนื้อปูน โดยเฉพาะอย่างยิ่งค่า pH (Coughlan et al., 2000 Rousketal., 2009) สังเกตใน NLFA และ ELFA แต่ไม่ PLFA Thesepatternswereverysimilartothose ดังนั้น ทั้งสามดินเนื้อปูนแตกต่างกันในองค์ประกอบชุมชน AMF คล้าย แต่ไม่เหมือนกับบทสรุปเกี่ยวกับญาติสปอร์ canbeachievedbylipidanalysisandtraditionalmicroscopicmethods สนามความหนาแน่นและราก อย่างไรก็ตาม การทดลองของเราถูกจำกัดชนิดหนึ่งพืช ข้าวโพด และเป็นไปได้ว่า ผลลัพธ์จะแตกต่างกันในพืชชนิดอื่น ๆ ถ้าวัตถุประสงค์เฉพาะของการวิเคราะห์กระบวนการประเมิน AMF สปอร์ความหนาแน่นสนามรากพืช ผลของเราบ่งชี้ว่า ELFA เป็นตัวเลือกดีที่สุด และยังสามารถใช้สำหรับการวิเคราะห์จุลินทรีย์ชุมชนเป็นทางเลือก PLFA (Drijber และ al., 2000) อย่างไรก็ตาม ถ้า ต้องการวิเคราะห์ชุมชนจุลินทรีย์ตาม PLFA, ofNLFAtomeasureAMFsporesrequireslittleadditionallaborover นอกจากนี้ที่ทำ PLFA คนเดียวถาม-ตอบเราขอขอบคุณ Stanley Tesch ขอความช่วยเหลือทางเทคนิค สนับสนุนทางการเงินจากภาควิชาเทคโนโลยีชีวภาพ govt.ของอินเดียให้ MPS สำหรับดำเนินงานนี้ในสามัคคีธรรมเขาหงอน DBT ควระมีการยอมรับการอ้างอิงแอลลิสัน วีเจ Yermakov, z., มิลเลอร์ R.M. แจสตรอล J.D., Matamala, R., 2007 ใช้ภูมิประเทศและความลึกไล่ระดับสี decouple ผลกระทบของตัวแปรด้านสิ่งแวดล้อม correlated บนองค์ประกอบชุมชนจุลินทรีย์ดิน ดิน Biol. Biochem 39, 505-516 Bååth, E., Díaz Ravi˜na เมตร Frostegård, A., Campbell, C.D., 1998 ผลของโลหะริช sludgeamendmentsonthesoilmicrobialcommunity Appl.Environ.Microbiol. 64, 238-245Buyer, J.S., Roberts, D.P., Russek-Cohen, E., 2002. Soil and plant effects on microbial community structure. Can. J. Microbiol. 48, 955–964. Buyer,J.S.,Sasser,M.,2012.Highthroughputphospholipidfattyacidanalysisofsoils. Appl. Soil Ecol. 61, 127–130. Buyer, J.S., Teasdale, J.R., Roberts, D.P., Zasada, I.A., Maul, J.E., 2010. Factors affecting soil microbial community structure in tomato cropping systems. Soil Biol. Biochem. 42, 831–841. Clark, R.B., Zeto, S.K., 2000. Mineral acquisition by arbuscular mycorrhizal plants. J. Plant Nutr. 23, 867–902. Coughlan, A.P., Dalpé, Y., Lapointe, L., Piché, Y., 2000. Soil pH-induced changes in root colonization, diversity, and reproduction of symbiotic arbuscular mycorrhizal fungi from healthy and declining maple forests. Can. J. For. Res. 30, 1543–1554. Drijber, R.A., Doran, J.W., Parkhurst, A.M., Lyon, D.J., 2000. Changes in soil microbial community structure with tillage under long-term wheat-fallow management. Soil Biol. Biochem. 32, 1419–1430. Frostegård, A., Bååth, E., Tunlid, A., 1993. Shifts in the structure of soil microbial communities in limed forests as revealed by phospholipid fatty acid analysis. Soil Biol. Biochem. 25, 723–730. Gange, A.C., Bower, E., Stagg, P.G., Aplin, D.M., Gillam, A.E., Bracken, M., 1999. A comparison of visualisation techniques for recording arbuscular mycorrhizal colonisation. New Phytol. 142, 123–132. Gerdemann, J.W., Nicholson, T.H., 1963. Spores of mycorrhizal endogone species extracted from soil by wet sieving and decanting. Trans. Br. Mycol. Soc. 46, 235–244. Giovannetti,M.,Mosse,B.,1980.Anevaluationoftechniquesformeasuringvesicular arbuscular mycorrhizal infection in roots. New Phytol. 84, 489–500. Grigera, M.S., Drijber, R.A., Wienhold, B.J., 2007. Increased abundance of arbuscular mycorrhizal fungi in soil coincides with the reproductive stages of maize. Soil Biol. Biochem. 39, 1401–1409. Ianson, D.C., Allen, M.F., 1986. The effect of soil texture on extraction of vesicular–arbuscular mycorrhizal spores from arid soils. Mycologia 78, 164–168. Larsen,J.,Bødker,L.,2001.Interactionsbetweenpearootinhabitingfungiexamined using signature fatty acids. New Phytol. 149, 487–493. Lehman, R.M., Taheri, W.I., Osborne, S.L., Buyer, J.S., Douds Jr., D.D., 2012. Fall cover croppingcanincreasearbuscularmycorrhizaeinsoilssupportingintensiveagricultural production. Appl. Soil Ecol. 61, 300–304. Li,X.L.,George,E.,Marschner,H.,1991.Extensionofthephosphorusdepletionzone in VA mycorrhizal white clover in a calcareous soil. Plant Soil 136, 41–48. Moore-Kucera, J., Dick, R.P., 2008. PLFA profiling of microbial community structure and seasonal shifts in soils of a Douglas-fir chronosequence. Microb. Ecol. 55, 500–511. Olsson, P.A., 1999. Signature fatty acids provide tools for determination of the distributionandinteractionsofmycorrhizalfungiinsoil.FEMSMicrobiol.Ecol.29, 303–310. Olsson,P.A.,Bååth,E.,Jakobsen,I.,Söderström,B.,1995.Theuseofphospholipidand neutral lipid fatty acids to estimate biomass of arbuscular mycorrhizal fungi in soil. Mycol. Res. 99, 623–629. Phillips,J.M.,Hayman,D.S.,1970.Improvedproceduresforclearingrootsandstaining parasitic and vesicular–arbuscular fungi for rapid assessment of infection. Trans. Br. Mycol. Soc. 55, 158–161. Rasmann, C., Graham, J.H., Chellemi, D.O., Datnoff, L.E., Larsen, J., 2009. Resilient populationsofrootfungioccurwithinfivetomatoproductionsystemsinsoutheast Florida. Appl. Soil Ecol. 43, 22–31. Rousk, J., Brookes, P.C., Bååth, E., 2009. Contrasting soil pH effects on fungal and bacterialgrowthsuggestfunctionalredundancyincarbonmineralization.Appl. Environ. Microbiol. 75, 1589–1596. Schenck,N.C.,Perez,Y.,1990.ManualfortheIdentificationofVAMycorrhizalFungi, 3rd ed. Synergistic, Gainesville, FL. Schutter, M.E., Dick, R.P., 2000. Comparison of fatty acid methyl ester (FAME) methods for characterizing microbial communities. Soil Sci. Soc. Am. J. 64, 1659–1668. Smith, S., Read, D., 2008. Mycorrhizal Symbiosis. Academic Press, New York. Soil Survey Staff, 2010. Keys to Soil Taxonomy, 11th ed. USDA-Natural Resources Conservation Service, Washington, DC. Stroup, W.W., 2014. Rethinking the analysis of non-normal data in plant and soil science. Agron. J. 106, 1–17. Van Aarle, I.M., Olsson, P.A., 2003. Fungal lipid accumulation and development of mycelial structures by two arbuscular mycorrhizal fungi. Appl. Environ. Microbiol. 69, 6762–6767. Vestberg, M., Polojärvi, A., Pitkänen, T., Kaipainen, S., Puolakka, E., Keskitalo, M., 2012.Neutrallipidfattyacidanalysisisasensitivemarkerforquantitativeestimationofarbuscularmycorrhizalfungiinagriculturalsoilwithcropsofdifferent mycotrophy. Agric. Food Sci. 21, 12–27. Zelles,L.,1997.Phospholipidfattyacidprofilesinselectedmembersofsoilmicrobial communities. Chemosphere 35, 275–299. Zelles, L., Bai, Q.Y., Ma, R.X., Rackwitz, R., Winter, K., Beese, F., 1994. Microbial biomass, metabolic activity and nutritional status determined from fatty acid patterns and poly-hydroxybutyrate in agriculturally managed soils. Soil Biol. Biochem. 26, 439–446.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

PLFA16: 1 5cisdidnotcorrelatewithsporedensity, whichisconsistent กับผลลัพธ์ที่ก่อนหน้านี้บอกว่า indicatesfungalhyphaldensityandisconfoundedbyitsoccurrence biomarker PLFA ในแบคทีเรียแกรมลบ เราไม่ได้วัดเส้นใยเชื้อรา AM sowecannotevaluatetheutilityofthePLFAbiomarkerforthatpurpose ในราก ELFA 16: 1 5cis เป็น biomarker เพียงเพื่อให้มีนัยสำคัญทางสถิติความสัมพันธ์ลาดเทไปตั้งรกรากในการทดลองทั้งสอง biomarkers ทำงานที่เหลืออยู่ทั้งหมดในการทดลอง แต่ไม่ได้อยู่ในที่อื่น ๆ IntheoryELFAshouldbeequivalenttothesumofNLFA, glycolipid เอฟเอและ PLFA และนี่คือสอดคล้องกับสายของเรา nding ที่ ELFA ก็มักจะมากกว่าผลรวมของ NLFA และ PLFA เหนือกว่าของ NLFA มากกว่า ELFA สำหรับการวัดสปอร์สามารถอธิบายได้โดยรวมของ PLFA 16: 1 5cis จากแบคทีเรียแกรมลบและเส้นใยของเชื้อราใน ELFA แต่ความจริงที่ว่า ELFA จะดีกว่าทั้ง NLFA และ PLFA ในความสัมพันธ์ที่จะตั้งรกรากขุดรากถอนโคนไม่ได้อธิบายได้อย่างง่ายดาย ตั้งแต่ ELFA รวม NLFA, glycolipids และ PLFA, doesnotincludethehyphaewhilePLFA16: 1 5cisdoesnotinclude แบคทีเรีย sporesorvesiclesandinadditionisconfoundedbyGram ลบ. (โอลส์สัน, et al, 1995; โอลส์สัน, 1999) ThePLFAbiomarkerwasahigherproportionofELFAinsoilthan รากในขณะที่ NLFA เป็นสัดส่วนที่สูงขึ้นของ ELFA ในรากกว่าดินดิน andtheNLFAtoPLFAbiomarkerratiowashigherinrootsthan ผลลัพธ์เหล่านี้บ่งชี้ว่าไขมันค่อนข้างมากขึ้นที่ใช้สำหรับการจัดเก็บพลังงานในรากกว่าในดินซึ่งเราแอตทริบิวต์ตุ่มก่อตัวอยู่ในราก (โอลส์สัน et al., 1995) Differencesinsporecountsandrootcolonizationwereobserved ปัจจัยทางดินระหว่างดินที่เป็นกรดเป็นด่างโดยเฉพาะอย่างยิ่ง (Coughlan et al, 2000;.. Rousketal 2009) .Thesepatternswereverysimilartothose สังเกต NLFA และ ELFA แต่ไม่ PLFA ดังนั้นในสามดินที่แตกต่างกันในองค์ประกอบชุมชน AMF ข้อสรุปที่คล้ายกัน แต่ไม่เหมือนกันเกี่ยวกับความหนาแน่นของสปอร์ญาติและการล่าอาณานิคมราก canbeachievedbylipidanalysisandtraditionalmicroscopicmethods แต่การทดลองของเราถูก จำกัด ให้เป็นหนึ่งในสายพันธุ์พืชข้าวโพดและมันก็เป็นไปได้ว่าผลจะแตกต่างกันในพันธุ์พืชอื่น ๆ ถ้าวัตถุประสงค์เฉพาะของการวิเคราะห์ไขมันคือการประเมินความหนาแน่นของสปอร์ AMF และการล่าอาณานิคมรากพืชผลของเราแสดงให้เห็นว่า ELFA เป็นตัวเลือกที่ดีที่สุดและยังสามารถใช้ในการวิเคราะห์ชุมชนจุลินทรีย์เป็นทางเลือกให้ PLFA (Drijber et al., 2000 ) แต่ถ้าการวิเคราะห์กลุ่มจุลินทรีย์ PLFA ตามเป็นสิ่งจำเป็นนอกจาก ofNLFAtomeasureAMFsporesrequireslittleadditionallaborover ว่าการทำ PLFA เพียงอย่างเดียว. the
กิตติกรรมประกาศเราขอขอบคุณสแตนเลย์ Tesch สำหรับความช่วยเหลือด้านเทคนิค
การสนับสนุนทางการเงินจากภาควิชาเทคโนโลยีชีวภาพคั่ก ของอินเดียเพื่อ MPS สำหรับการดำเนินงานในช่วงนี้คบหา DBT-CREST ของเขาจะได้รับการยอมรับสุดซึ้ง.
อ้างอิงแอลลิสัน, วีเจ, Yermakov ซีมิลเลอร์, RM, Jastrow, JD, Matamala หม่อมราชวงศ์ 2007 ใช้การไล่ระดับสีภูมิทัศน์และความลึกให้กับ decouple ผลกระทบของตัวแปรด้านสิ่งแวดล้อมในดินที่มีความสัมพันธ์กับชุมชนขององค์ประกอบของจุลินทรีย์
ดิน Biol Biochem 39, 505-516 Baath, อีDíaz-Ravi~na เมตรFrostegård, a, แคมป์เบลซีดี, ปี 1998 ผลของ sludgeamendmentsonthesoilmicrobialcommunity.Appl.Environ.Microbiol โลหะที่อุดมไปด้วย 64, 238-245.
ผู้ซื้อ JS โรเบิร์ต, DP, Russek โคเฮน, อี 2002 ดินและพืชผลกระทบกับโครงสร้างกลุ่มจุลินทรีย์ สามารถ เจ Microbiol 48, 955-964 ผู้ซื้อ JS, Sasser เมตร 2012.Highthroughputphospholipidfattyacidanalysisofsoils Appl ดิน Ecol 61, 127-130 ผู้ซื้อ JS, Teasdale จูเนียร์, โรเบิร์ต, DP, Zasada, IA, ขย้ำ, JE 2010 ปัจจัยที่มีผลโครงสร้างกลุ่มจุลินทรีย์ดินในระบบการปลูกพืชมะเขือเทศ ดิน Biol Biochem 42, 831-841 คลาร์ก, RB, Zeto, เอสเค, ปี 2000 การซื้อกิจการแร่พืช mycorrhizal Arbuscular โรงเจ Nutr 23 867-902 Coughlan, AP, Dalpe, วาย, Lapointe ลิตร, Piche, วาย, 2000 การเปลี่ยนแปลงค่า pH ของดินที่เกิดขึ้นในการล่าอาณานิคมรากความหลากหลายและการสืบพันธุ์ของ Arbuscular ชีวภาพจากเชื้อรามีสุขภาพดีและการลดลงของป่าไม้เมเปิ้ล สามารถ สำหรับเจ Res 30 1543-1554 Drijber ราโดรันเจดับบลิว, Parkhurst, AM, ลียง, ดีเจ 2000 การเปลี่ยนแปลงโครงสร้างในดินกลุ่มจุลินทรีย์ที่มีดินแบบภายใต้การบริหารข้าวสาลีที่รกร้างในระยะยาว ดิน Biol Biochem 32, 1419-1430 Frostegård, a, Baath, อี Tunlid, a, 1993 กะในโครงสร้างของดินกลุ่มจุลินทรีย์ในป่า limed เปิดเผยโดยการวิเคราะห์กรดไขมันเรียม ดิน Biol Biochem 25, 723-730 ลวด, AC, ซุ้ม, อีแต๊กซ์, PG, Aplin, DM, กิลแลม, AE, เฟิร์น, M. , 1999. การเปรียบเทียบเทคนิคการสร้างภาพสำหรับการบันทึกการตั้งรกราก Arbuscular mycorrhizal ใหม่ phytol 142, 123-132 Gerdemann เจดับบลิว, นิโคลสัน, TH, 1963 สปอร์ของสายพันธุ์ endogone mycorrhizal สกัดจากดินโดย sieving เปียกและ decanting ทรานส์ br Mycol Soc 46, 235-244 Giovannetti เมตรมอสส์, บี 1980.Anevaluationoftechniquesformeasuringvesicular Arbuscular ติดเชื้อไมคอไรซาในราก ใหม่ phytol 84, 489-500 Grigera, MS, Drijber, RA, Wienhold บีเจ 2007 เพิ่มความอุดมสมบูรณ์ของเชื้อราไมคอไรซา Arbuscular ในดินเกิดขึ้นพร้อมกับขั้นตอนการสืบพันธุ์ของข้าวโพดเลี้ยงสัตว์ ดิน Biol Biochem 39, 1401-1409 Ianson ดีซีอัลเลน MF 1986 ผลของพื้นผิวดินในการสกัดของตุ่ม-Arbuscular สปอร์ไมคอไรซาจากดินที่แห้งแล้ง Mycologia 78, 164-168 เสนเจBødkerลิตร, 2001.Interactionsbetweenpearootinhabitingfungiexamined ใช้กรดไขมันลายเซ็น ใหม่ phytol 149, 487-493 เลห์แมน, RM, Taheri, WI, ออสบอร์, SL, ผู้ซื้อ, JS, Douds จูเนียร์ DD 2012 ฤดูใบไม้ร่วงปกผลิต croppingcanincreasearbuscularmycorrhizaeinsoilssupportingintensiveagricultural Appl ดิน Ecol 61, 300-304 หลี่, XL, จอร์จอี Marschner, เอช 1991.Extensionofthephosphorusdepletionzone ในเวอร์จิเนีย mycorrhizal จำพวกถั่วสีขาวในดินเนื้อปูน ดินพืช 136, 41-48 มัวร์-Kucera เจดิ๊ก RP 2008 PLFA โปรไฟลิงของโครงสร้างกลุ่มจุลินทรีย์และการเปลี่ยนแปลงตามฤดูกาลในดินของสาย Douglas- อาช่วงระยะเวลา จุลชีววิทยา Ecol 55, 500-511 โอลส์สัน, PA, 1999 ลายเซ็นกรดไขมันที่มีเครื่องมือในการกำหนด distributionandinteractionsofmycorrhizalfungiinsoil.FEMSMicrobiol.Ecol.29, 303-310 โอลส์สัน, PA, Baath, อี Jakobsen, I. , Soderstrom, บี 1995.Theuseofphospholipidand กรดไขมันไขมันที่เป็นกลางในการประเมินมวลชีวภาพของเชื้อราไมคอไรซา Arbuscular ในดิน Mycol Res 99, 623-629 ฟิลลิปเจ, เฮย์แมนเอส, 1970.Improvedproceduresforclearingrootsandstaining เชื้อราปรสิตและตุ่ม-Arbuscular สำหรับการประเมินอย่างรวดเร็วของการติดเชื้อ ทรานส์ br Mycol Soc 55, 158-161 Rasmann ซี, เกรแฮม JH, Chellemi, DO, Datnoff, LE เสนเจ 2009 ยืดหยุ่น populationsofrootfungioccurwithin สาย vetomatoproductionsystemsinsoutheast ฟลอริด้า Appl ดิน Ecol 43, 22-31 Rousk เจบรูกส์, PC, Baath อี 2009 ตัดกันผลกระทบค่า pH ของดินบนเชื้อราและ bacterialgrowthsuggestfunctionalredundancyincarbonmineralization.Appl Environ Microbiol 75, 1589-1596 รงค์, NC, เปเรซวาย, 1990.ManualfortheIdenti สาย cationofVAMycorrhizalFungi เอ็ด 3 แพลเลเดียม Gainesville, ฟลอริดา Schutter, ME, ดิ๊ก RP 2000 เปรียบเทียบกรดไขมันเมทิลเอสเตอร์ (FAME) วิธีการในการพัฒนาการชุมชนจุลินทรีย์ ดินวิทย์ Soc Am เจ 64, 1659-1668 สมิ ธ เอส, อ่าน, D. 2008 ไมคอไรซา Symbiosis นักวิชาการสื่อมวลชนนิวยอร์ก ดินพนักงานการสำรวจปี 2010 กุญแจสู่อนุกรมวิธานดินเอ็ด 11 USDA ธรรมชาติอนุรักษ์ทรัพยากรบริการวอชิงตันดีซี Stroup, WW 2014 ทบทวนการวิเคราะห์ข้อมูลที่ไม่ปกติในโรงงานและวิทยาศาสตร์ดิน Agron เจ 106, 1-17 Van Aarle, IM, โอลส์สัน, PA, 2003 เชื้อราสะสมไขมันและการพัฒนาของโครงสร้างเส้นใยสองเชื้อราไมคอไรซา Arbuscular Appl Environ Microbiol 69, 6762-6767 Vestberg เมตรPolojärvi, a, Pitkänenตัน Kaipainen เอส, Puolakka, อี Keskitalo เมตร mycotrophy Agric อาหารวิทย์ 21, 12-27 Zelles ลิตร, 1997.Phospholipidfattyacidpro สายชุมชน lesinselectedmembersofsoilmicrobial Chemosphere 35, 275-299 Zelles ลิตร, ตากใบ QY แม่ RX, Rackwitz หม่อมราชวงศ์ฤดูหนาว, เค Beese เอฟ 1994 ชีวมวลจุลินทรีย์กิจกรรมการเผาผลาญอาหารและภาวะโภชนาการกำหนดจากรูปแบบของกรดไขมันและโพลีไฮดรอกซีในการจัดการข้าวอู่น้ำ ดิน ดิน Biol Biochem 26 439-446

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

plfa16:1  5cisdidnotcorrelatewithsporedensity whichisconsistent , กับก่อนหน้านี้ ผลบอกว่า plfa ไบโอมาร์คเกอร์ indicatesfungalhyphaldensityandisconfoundedbyitsoccurrence ในแบคทีเรียแกรมลบ เราไม่ได้วัดเป็นเส้นใยรา sowecannotevaluatetheutilityoftheplfabiomarkerforthatpurpose . ในราก elfa 16 :1  5cis เป็นไบโอมาร์คเกอร์เท่านั้นที่จะให้ signi จึงไม่สามารถมีความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติกับการล่าอาณานิคมในทั้ง 2 การทดลอง ที่เหลือซึ่งทั้งหมดทำงานในหนึ่งการทดลอง แต่ไม่ได้อยู่ในอื่น ๆ intheoryelfashouldbeequivalenttothesumofnlfa ไกลโคลิพิด , ฟ้า และ plfa และสอดคล้องกับของเราจึงหาที่ elfa เป็นมากกว่าผลรวมของ nlfa และ plfa .เหนือกว่าของ nlfa กว่า elfa วัดสปอร์สามารถอธิบายได้โดยรวมของ plfa 1  5cis จากแบคทีเรียกรัมลบ และเส้นใยราใน elfa . อย่างไรก็ตาม ข้อเท็จจริงที่ elfa เหนือกว่าทั้ง nlfa plfa ในความสัมพันธ์กับการล่าอาณานิคม และรากไม่สามารถอธิบายได้ ตั้งแต่ elfa รวมถึง nlfa ไกลโคลิพิด , และ plfa itislogicaltoconcludethatelfa16 : ,1  5cisissummingupthecontributionsofspores เล็ก andhyphae , , ,  whereasnlfa16:1 5cis doesnotincludethehyphaewhileplfa16:1  5cisdoesnotinclude sporesorvesiclesandinadditionisconfoundedbygram ลบแบคทีเรีย ( โอลส์สัน et al . , 1995 ; โอลส์สัน , 1999 ) theplfabiomarkerwasahigherproportionofelfainsoilthan ในราก ส่วน nlfa เป็นสัดส่วนที่สูงของ elfa ในรากมากกว่าดินดิน andthenlfatoplfabiomarkerratiowashigherinrootsthan . ผลลัพธ์เหล่านี้บ่งชี้ว่า ค่อนข้างมากและถูกใช้สำหรับการจัดเก็บพลังงานในรากมากกว่าในดินซึ่งเราคุณลักษณะการเกิดเวสิเคิลในราก ( โอลส์สัน et al . , 1995 ) differencesinsporecountsandrootcolonizationwereobserved betweenthethreesoils .thesedifferencesmaybeduetothedifferentamfspeciescompositionamongthesoilsandtodifferencesin ครั้งนี้ปัจจัยระหว่างดิน โดยเฉพาะ pH ( Coughlan et al . , 2000 ; rousketal . , 2009 ) thesepatternswereverysimilartothose ) และ nlfa elfa แต่ไม่ plfa . ดังนั้น ทั้งสามองค์ประกอบของดินที่แตกต่างกันในชุมชนว่าการคล้ายแต่ไม่เหมือน สรุปเกี่ยวกับความหนาแน่นสัมพัทธ์และ canbeachievedbylipidanalysisandtraditionalmicroscopicmethods สปอร์รากการเป็นอาณานิคม อย่างไรก็ตาม การทดลองของเราถูก จำกัด ไปยังสายพันธุ์ข้าวโพดต้นหนึ่ง และก็เป็นไปได้ว่า ผลลัพธ์จะแตกต่างกันในพืชชนิดอื่น ๆ ถ้าจุดประสงค์ของการวิเคราะห์เพื่อประเมินความหนาแน่นของรากพืช และการสร้างสปอร์ AMF ,ผลของเราระบุว่า elfa เป็นทางเลือกที่ดีที่สุด และยังสามารถใช้สำหรับการวิเคราะห์ชุมชนจุลินทรีย์เป็นทางเลือก plfa ( drijber et al . , 2000 ) แต่ถ้า plfa การวิเคราะห์ชุมชนจุลินทรีย์ตามต้องการ นอกจากนี้ ofnlfatomeasureamfsporesrequireslittleadditionallaborover ที่ทำ plfa คนเดียว

เราขอขอบคุณ Stanley tesch ขอบคุณสำหรับความช่วยเหลือทางเทคนิคทุนสนับสนุนจากภาควิชาเทคโนโลยีชีวภาพ , Govt . ของอินเดีย ส.ส. เพื่อทำงานในสมาคม dbt-crest ของเขาสุดซึ้งยอมรับ .
อ้างอิง
อัลลิสัน วีเจ yermakov ซี , มิลเลอร์ , r.m. จาซโทรว์ , เจดี , matamala , R , 2550 การใช้ภูมิประเทศและความลึกไล่ระดับสีถึงดีคัปเปิลผลกระทบของสิ่งแวดล้อมต่อชุมชนจุลินทรีย์ในดินมีตัวแปรองค์ประกอบ ดิน วท บ วท .วิชาเคมี 39 , 505 – 516 . B åå th e , D í az ˜ราวีนา ม. frosteg ปี Rd , A . Campbell , การพัฒนาชุมชน , 2541 ผลของ sludgeamendmentsonthesoilmicrobialcommunity.appl.environ.microbiol อุดมโลหะ 64 , 238 – 245 .
ผู้ซื้อ , โรเบิร์ต เจ. เอส. russek D.P . , , โคเฮน , E . , 2002 ดินและพืชที่มีต่อโครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์ สามารถ เจ ธนิดา เหรียญทอง B Sc . 48 , 955 - 960 . ผู้ซื้อ เจ. เอส. , Sasser , เอ็ม , 2012highthroughputphospholipidfattyacidanalysisofsoils . แอปเปิ้ล Ecol ดิน 61 , 127 – 130 ผู้ซื้อ เจ. เอส. ทีสเดล , เจ. อาร์. โรเบิร์ต D.P zasada I.A มอล , , , , j.e. 2010 ปัจจัยที่มีผลต่อโครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์ดินในระบบการปลูกมะเขือเทศ . ดิน วท บ วท . วิชาเคมี 42 , 748 สำหรับคุณ . คล้าก , r.b. zeto ยสปอร์กูลือบือ , , , 2000 ซื้อน้ำแร่จากไมโคไรซา พืช เจโรงงาน NUTR . 23 , 867 - 007 . Coughlan ,เอพี dalp é , Y . L . ลาพอนเต้ , , pich และ Y , 2000 ดินเกิดการเปลี่ยนแปลงในการล่าอาณานิคม รากความหลากหลายและการแพร่พันธุ์ของเชื้อราไมโคไรซาชนิดน้ำเพื่อสุขภาพ และการลดลงของเมเปิ้ลป่า สามารถ เจ. . . . . . . ความละเอียด 1 – 30 , 1640 . drijber r.a. ดูแรน , , J.W . พาร์กเฮิร์สต์ , ตี , Lyon , ดีเจ , 2000การเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์ในดินด้วยการไถพรวนภายใต้การจัดการข้าวสาลีระยะยาวรกร้าง ดิน วท บ วท . วิชาเคมี 32 ) – 1 . frosteg ปี Rd , A , B åå th e . tunlid , A . , 1993 การเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างของจุลินทรีย์ดินในป่าชุมชน limed เป็นเปิดเผยโดยการวิเคราะห์กรดไขมันฟอสโฟลิปิด . ดิน วท บ วท . วิชาเคมี 25 , 723 - 730 . แม่น้ำคงคา , ไฟฟ้า , ซุ้ม ว่านสแต็ก พีจี แอพลิ้น d.m. กิลเลิ่ม 700 , , , ,ใบเฟิร์น , M . , 1999 การเปรียบเทียบเทคนิคการถ่ายภาพเพื่อบันทึกน้ำไมโคไรซาอาณานิคม . ใหม่ไฟทอล . 142 , 123 – 132 . gerdemann J.W . นิโคลสัน , t.h. , 2506 . สปอร์ของ endogone ไมโคไรซาชนิดสกัดจากดินเปียก sieving และริน . ทรานส์ . แก้ไข mycol . ซอค 46 , 235 – 244 ซึ่งมีน้อยอย่างให้เลือกกิน เอ็ม มอสส์ บี , 2523anevaluationoftechniquesformeasuringvesicular น้ำเชื้อไมโคไรซาในราก ใหม่ไฟทอล . 84 , 489 – 500 grigera วท ม drijber r.a. , , , wienhold บีเจ ) เพิ่มความอุดมสมบูรณ์ของน้ำในดิน เชื้อราไมโคไรซาเกิดขึ้นพร้อมกับขั้นตอนการสืบพันธุ์ของข้าวโพด ดิน วท บ วท . วิชาเคมี 39 , 1944 – 1409 . ianson , DC , Allen ) , 2529 .ผลของการสกัดจากเนื้อดินี่ซึ่งเป็นตุ่มพองน้ำไมโคไรซาสปอร์จากดิน และแห้งแล้ง mycologia 78 , 164 – 168 . ลาร์เซน เจ บี ขึ้น dker L 2001.interactionsbetweenpearootinhabitingfungiexamined ใช้ลายเซ็นต์ , กรดไขมัน ใหม่ไฟทอล . 149 , 487 – 493 . r.m. taheri w.i. เลห์แมน , , , , เริ่ม ออสบอร์น ผู้ซื้อ เจ. เอส. douds , จูเนียร์ d.d. 2012ตกครอบคลุมการผลิต croppingcanincreasearbuscularmycorrhizaeinsoilssupportingintensiveagricultural . แอปเปิ้ล Ecol ดิน 61 , 300 – 304 ลี x.l. จอร์จ เช่น มาร์ชเนอร์ , H 1991.extensionofthephosphorusdepletionzone ใน VA , ไมโคไรซา ขาวเวอร์ในดินเนื้อปูน . พืชดิน 136 , 41 - 48 มัวร์คูเซอรา เจ ดิ๊ก r.p. 2008plfa Pro จึงหลิงของโครงสร้างและตามฤดูกาลกะในดินของดักลาส - จึง R chronosequence ชุมชนจุลินทรีย์ microb . Ecol . 55 , 500 – 511 . โอลส์สัน , P.A , 1999 ลายเซ็นของกรดไขมันให้เครื่องมือสำหรับการวิเคราะห์ distributionandinteractionsofmycorrhizalfungiinsoil.femsmicrobiol.ecol.29 303 – 310 โอลส์สัน , P.A , B åå th , อีริค จาคอบเซ่น , I , S ö derstr ö m , B . , 1995theuseofphospholipidand เป็นกลางไขมันกรดไขมันเพื่อประมาณมวลชีวภาพของเชื้อราไมโคไรซาน้ำในดิน mycol . ความละเอียดพิมพ์ 99 , 623 สำหรับคุณ . ฟิลลิป JM Hayman D.S . , , , ี่ซึ่งเป็นตุ่มพองน้ำและ 1970.improvedproceduresforclearingrootsandstaining ปรสิตและเชื้อราสำหรับการประเมินอย่างรวดเร็วของการติดเชื้อ ทรานส์ . แก้ไข mycol . ซอค 55 , 157 และ 161 . rasmann , C . , เกรแฮม j.h. chellemi d.o. , , , , datnoff l.e. Larsen , J . , , ,2009 ยืดหยุ่น populationsofrootfungioccurwithin จึง vetomatoproductionsystemsinsoutheast ฟลอริด้า แอปเปิ้ล Ecol ดิน 43 , 22 – 31 rousk , J . , บรูค , PC , B åå th , E . , 2009 ตัดดินต่อเชื้อราและ bacterialgrowthsuggestfunctionalredundancyincarbonmineralization.appl . สิ่งแวดล้อม ธนิดา เหรียญทอง B Sc . 75 แผนที่–ขอ . เชงก์ , แคลิฟอร์เนีย เปเรซ วายจึง cationofvamycorrhizalfungi manualfortheidenti , 2533 .3 . เสริมฤทธิ์ , Gainesville , ฟลอริด้า schutter ชันสูตร ดิ๊ก r.p. , 2000 การเปรียบเทียบของกรดไขมันเมทิลเอสเทอร์ ( ชื่อเสียง ) วิธีการเพื่อการพัฒนาชุมชนจุลินทรีย์ วิทยาศาสตร์ทางดิน ซอค เป็น J . 64 , ที่– 1668 . สมิ ธ , S . , อ่าน , D . , 2008 ไมโคไรซา symbiosis . กด , New York ในทางวิชาการ พนักงานสำรวจดิน 2010 คีย์การอนุกรมวิธานดิน , การอนุรักษ์ทรัพยากรธรรมชาติ 11 . USDA บริการ , Washington , DC