We describe a scalable, highly para

We describe a scalable, highly parallel sequencing system with raw throughput significantly greater
than that of state-of-the-art capillary electrophoresis instruments. The apparatus uses a novel 60×60
mm2
fibreoptic slide containing 1,600,000 individual wells and is able to sequence 25 million bases,
at 99% or better accuracy (phred 20), in a 4 hour run. To provide sequencing templates, we clonally
amplify DNA fragments on beads in the droplets of an emulsion. The template-carrying beads are
loaded into the wells to convert each into a picoliter-scale sequencing reactor. We perform sequencing
by synthesis using a pyrosequencing protocol optimized for solid support and the small dimension
of the open reactors. Here we show the utility, throughput, accuracy and robustness of this system
by shotgun sequencing and de novo assembling the Mycoplasma genitalium genome with 96%
coverage at 99.96 % accuracy in one run of the machine.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เราอธิบายแบบปรับขนาดได้ สูงขนานระบบลำดับ มีวัตถุดิบปริมาณมากกว่าที่เครื่องมือศิลปะของอิฝอย เครื่องใช้นวนิยาย 60 × 60mm2 กเซนภาพนิ่งที่มี 1,600,000 เวลส์ และสามารถลำดับ 25 ล้านฐานที่ 99% หรือความแม่นยำ (phred 20), ในชั่วโมง 4 เรียกใช้ ระบุแม่แบบ sequencing เรา clonallyขยายชิ้นส่วนดีเอ็นเอบนลูกปัดในหยดของอิมัลชัน มีเม็ดแบบพกพาโหลดลงหลุมในเครื่องปฏิกรณ์ sequencing picoliter สเกลแต่ละแปลง เราทำการจัดลำดับโดยการสังเคราะห์ โดยใช้โพรโทคอ pyrosequencing เหมาะสำหรับการรองรับและขนาดเล็กเตาปฏิกรณ์เปิด ที่นี่เราแสดงอรรถประโยชน์ ปริมาณ ความแม่นยำ และความทนทานของระบบนี้โดย shotgun sequencing และ de novo ประกอบจีโน genitalium ไก่ 96%ครอบคลุมแม่นยำ 99.96% ในระยะหนึ่งของเครื่อง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เราอธิบายขยายขีดความสามารถของระบบลำดับขนานอย่างมากกับการส่งผ่านข้อมูลดิบอย่างมีนัยสำคัญมากขึ้น
กว่าที่ของรัฐของศิลปะเครื่องมืออิเล็กเส้นเลือดฝอย อุปกรณ์ที่ใช้นวนิยาย 60 × 60
mm2
สไลด์ไฟเบอร์ออปติกที่มี 1,600,000 แต่ละหลุมและสามารถที่จะจัดลำดับ 25 ล้านฐาน
ที่ 99% หรือความถูกต้องดีกว่า (phred 20) ในรอบ 4 ชั่วโมง เพื่อให้แม่ลำดับเรา clonally
ขยายดีเอ็นเอบนลูกปัดในหยดของอิมัลชัน ลูกปัดแม่แบบการดำเนินการจะ
โหลดลงในหลุมแต่ละแปลงเป็น picoliter ลำดับขนาดของเครื่องปฏิกรณ์ เราดำเนินการจัดลำดับ
โดยการสังเคราะห์โดยใช้โปรโตคอล pyrosequencing ที่ดีที่สุดสำหรับการสนับสนุนที่แข็งแกร่งและมีขนาดเล็ก
ของเครื่องปฏิกรณ์เปิด ที่นี่เราแสดงยูทิลิตี้ผ่านความถูกต้องและความทนทานของระบบนี้
โดยลำดับปืนลูกซองและ Novo ประกอบจีโนม Mycoplasma genitalium กับ 96%
ความคุ้มครองในความถูกต้อง 99.96% หนึ่งในการทำงานของเครื่อง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เราอธิบายระบบคู่ขนานระบบจัดลำดับด้วยอัตราความเร็วสูงดิบอย่างมีนัยสำคัญมากขึ้นกว่าที่ของรัฐ - of - the - art capillary electrophoresis เครื่องมือ เครื่องมือใช้นวนิยาย 60 × 60แน่นนำแสงภาพนิ่งที่มี 1600000 หลุมบุคคล และสามารถลำดับฐาน 25 ล้านที่ 99 % หรือดีกว่าความถูกต้อง ( phred 20 ) ใน 4 ชั่วโมงวิ่ง เพื่อให้เรา clonally แม่แบบจัดลำดับขยายดีเอ็นเอบนเม็ดหยดของอิมัลชัน แม่แบบแบกคือลูกปัดโหลดลงในบ่อแต่ละแปลงเป็นพิโคลิตรขนาดของถัง เราแสดงลำดับโดยการสังเคราะห์โดยใช้โปรโตคอลการสนับสนุนที่มั่นคงและไพโรซีเควนซิงเหมาะสำหรับขนาดเล็กของเครื่องที่เปิด ที่นี่เราแสดงอรรถประโยชน์สูง ความถูกต้อง และเสถียรภาพของระบบนี้โดยลำดับปืนลูกซองและอีกครั้งประกอบกับ 96% Mycoplasma genitalium จีโนมครอบคลุมความถูกต้อง 99.96% ที่ใช้ในหนึ่งของเครื่อง