environments (Bernardet et al., 199

environments (Bernardet et al., 1996, 2002). At the time
of writing, this family, which constitutes one of the major
branches of the phylum Bacteroidetes, holds 101 genera
with validly published names (http://www.bacterio.cict.fr/).
The aim of the present work was to determine the exact
taxonomic position of strain ck-I2-15T by using a
polyphasic approach that included the determination of
phenotypic properties and a detailed phylogenetic analysis
based on 16S rRNA gene sequences.
Genomic DNA was prepared according to the method of
Ausubel et al. (1995) and the 16S rRNA gene was amplified
by PCR using primers that have been described previously
(Liu & Shao, 2005). Sequences of related taxa were
obtained from the GenBank database. Phylogenetic trees
based on the neighbour-joining (Saitou & Nei, 1987),
maximum-likelihood (Felsenstein, 1981) and maximumparsimony
(Swofford, 1993) algorithms were then constructed
within the MEGA5 software package (Tamura et al.,
2011). The topology of each tree was evaluated by
bootstrap analysis, with 1000 resamplings.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สภาพแวดล้อม (Bernardet et al., 1996, 2002) ในขณะเขียน ครอบครัวนี้ ซึ่งหลักการอย่างใดอย่างหนึ่งสาขาของไฟลัม Bacteroidetes เก็บสกุล 101มี validly ประกาศชื่อ (ส่วน http://www.bacterio.cict.fr/)จุดมุ่งหมายของงานนำเสนอได้กำหนดแน่นอนตำแหน่งต้องใช้ ck-I2-15T โดยใช้อนุกรมวิธานการpolyphasic วิธีที่จะคุณสมบัติไทป์และวิเคราะห์ phylogeneticตาม 16S rRNA ลำดับยีนGenomic DNA ถูกจัดเตรียมตามวิธีของAusubel et al. (1995) และ 16S rRNA ยีนถูกขยายโดย PCR โดยใช้ไพรเมอร์ที่มีการอธิบายไว้ก่อนหน้านี้(หลิวและเสียว 2005) ลำดับของ taxa ที่เกี่ยวข้องได้ได้จากฐานข้อมูลของ GenBank ต้นไม้ phylogeneticตามเพื่อนบ้านรวม (Saitou และ Nei, 1987),สูงสุดโอกาส (Felsenstein, 1981) และ maximumparsimony(Swofford, 1993) อัลกอริทึมได้ถูกสร้างแล้วภายในแพคเกจซอฟต์แวร์ MEGA5 (Tamura et al.,2011) . โครงสร้างของต้นไม้แต่ละต้นถูกประเมินโดยเริ่มต้นระบบวิเคราะห์ กับ 1000 resamplings

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สภาพแวดล้อม (Bernardet et al., 1996, 2002) ในขณะที่การเขียนครอบครัวนี้ซึ่งถือเป็นหนึ่งในหลักสาขาของประเภทBacteroidetes ถือ 101 จำพวกที่มีชื่อการตีพิมพ์อย่างถูกต้อง(http://www.bacterio.cict.fr/). จุดมุ่งหมายของการทำงานในปัจจุบันคือ การกำหนดที่แน่นอนตำแหน่งการจัดหมวดหมู่ของสายพันธุ์CK-I2-15T โดยใช้วิธีการpolyphasic รวมถึงความมุ่งมั่นของคุณสมบัติฟีโนไทป์และการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการรายละเอียดขึ้นอยู่กับ16S rRNA ลำดับยีน. จีโนมดีเอ็นเอถูกจัดทำขึ้นตามวิธีการของAusubel et al, (1995) และยีน 16S rRNA ถูกขยายโดยวิธีPCR โดยใช้ไพรเมอร์ที่ได้รับการอธิบายไว้ก่อนหน้า(หลิวและ Shao 2005) ลำดับของแท็กซ่าที่เกี่ยวข้องกันที่ได้รับจากฐานข้อมูล GenBank ต้นไม้ที่ขึ้นอยู่กับเพื่อนบ้านเข้า (Saitou และ Nei, 1987) โอกาสสูงสุด (Felsenstein, 1981) และ maximumparsimony (Swofford, 1993) ขั้นตอนวิธีการที่ถูกสร้างขึ้นแล้วภายในแพคเกจซอฟต์แวร์MEGA5 (ทามูระ et al., 2011) โครงสร้างของต้นไม้แต่ละต้นถูกประเมินโดยการวิเคราะห์บูต, 1000 resamplings

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สภาพแวดล้อม ( bernardet et al . , 1996 , 2002 ) ตอนนั้น
เขียน ครอบครัว ซึ่งถือเป็นหนึ่งในสาขาหลักของไฟลัม bacteroidetes

ถือ 101 สกุลกับได้อย่างถูกต้องตีพิมพ์ชื่อ ( http : / / www.bacterio . cict . fr / )
จุดมุ่งหมายของงานปัจจุบันเพื่อกำหนดตำแหน่งที่แน่นอนของอนุกรมวิธาน
ck-i2-15t สายพันธุ์โดยใช้ เป็นแนวทาง
polyphasic ที่รวมการหา
คุณสมบัติคุณสมบัติและรายละเอียดต่างๆตามการวิเคราะห์ลำดับเบส 16S rRNA ยีน
.
genomic DNA ที่เตรียมไว้ตามวิธีการของ
ซูเบล et al . ( 1995 ) และ 16S rRNA ยีนโดยวิธี PCR โดยใช้ไพรเมอร์เบส

ที่ได้อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ( หลิว& Shao , 2005 ) ลำดับของที่เกี่ยวข้องและถูก
ได้จากขนาดของฐานข้อมูล
phylogenetic ต้นไม้ตามเพื่อนบ้านร่วม ( ไซโตะ&เนย , 1987 ) ,
ความน่าจะเป็นสูงสุด ( felsenstein , 1981 ) และ maximumparsimony
( สวอฟฟอร์ด , 1993 ) ขั้นตอนวิธีถูกสร้างแล้ว
ภายใน mega5 แพคเกจซอฟต์แวร์ ( ทามูระ et al . ,
2011 ) โครงสร้างของต้นไม้แต่ละต้นถูกประเมินโดย
การวิเคราะห์บู กับ 1000 resamplings .