The calpain gene family and its inh

The calpain gene family and its inhibitors have diverse effects, many related to protein turnover, which appear to affect a range of phenotypes such as diabetes, exercise-induced muscle injury, and pathological events associated with degenerative neural diseases in humans, fertility, longevity, and postmortem effects on meat tenderness in livestock species. The calpains are inhibited by calpastatin, which binds directly to calpain. Here we report the direct measurement of epistatic interactions of causative mutations for quantitative trait loci (QTL) at calpain 1 (CAPN1), located on chromosome 29, with causative mutations for QTL variation at calpastatin (CAST), located on chromosome 7, in cattle. First we identified potential causative mutations at CAST and then genotyped these along with putative causative mutations at CAPN1 in >1500 cattle of seven breeds. The maximum allele substitution effect on the phenotype of the CAPN1:c.947G>C single nucleotide polymorphism (SNP) was 0.14 σp (P = 0.0003) and of the CAST:c.155C>T SNP was also 0.14 σp (P = 0.0011) when measured across breeds. We found significant epistasis between SNPs at CAPN1 and CAST in both taurine and zebu derived breeds. There were more additive × dominance components of epistasis than additive × additive and dominance × dominance components combined. A minority of breed comparisons did not show epistasis, suggesting that genetic variation at other genes may influence the degree of epistasis found in this system.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ครอบครัวยีน calpain และ inhibitors ที่มีลักษณะพิเศษที่หลากหลาย หลายที่เกี่ยวข้องกับการหมุนเวียนของโปรตีน ซึ่งจะมีผลต่อช่วงของฟีเช่นโรคเบาหวาน การบาดเจ็บของกล้ามเนื้อเกิดจากการออกกำลังกาย และเหตุการณ์ที่เกี่ยวข้องกับโรคประสาทเสื่อมในมนุษย์ อุดมสมบูรณ์ ลักษณะ และเจ็บในเนื้อในปศุสัตว์ชนิด postmortem ผลทางพยาธิวิทยา Calpains ถูกห้าม โดย calpastatin ซึ่ง binds กับ calpain โดยตรง ที่นี่เรารายงานวัดโต้ epistatic ของสาเหตุการกลายพันธุ์ในเชิงปริมาณติด loci (QTL) ใน calpain 1 (CAPN1), ที่อยู่บนโครโมโซม 29 มีสาเหตุการกลายพันธุ์ความผันแปร QTL ที่ calpastatin (นักแสดง), ตั้งอยู่บนโครโมโซม 7 โดยตรงในวัวควาย ครั้งแรก เราระบุกลายพันธุ์สาเหตุการเกิด ที่หล่อแล้ว genotyped นี้รวม putative กลายพันธุ์สาเหตุการที่ CAPN1 ใน > วัว 1500 ของสายพันธุ์เจ็ด ผลทดแทนสูงสุด allele phenotype ของ CAPN1:c.947G > C เดียวนิวคลีโอไทด์โพลีมอร์ฟิซึม (SNP) ถูก 0.14 σp (P = 0.0003) และ CAST:c.155C > T SNP ยัง 0.14 σp (P = 0.0011) เมื่อวัดข้ามสายพันธุ์ เราพบสำคัญ epistasis ระหว่าง SNPs ที่ CAPN1 และหล่อใน taurine และ zebu มาสายพันธุ์ มีฟิลด์สามารถปกครองคณะ epistasis กว่าสามารถซื้อที่สามารถเพิ่มเติมและคอมโพเนนต์ในการครอบงำ×ปกครองรวม ชนกลุ่มน้อยของสายพันธุ์เปรียบเทียบได้แสดง epistasis แนะนำว่า ความแปรผันทางพันธุกรรมที่ยีนอื่น ๆ อาจมีอิทธิพลต่อระดับของ epistasis ที่พบในระบบนี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ครอบครัวยีน calpain และโปรตีนที่มีผลกระทบที่แตกต่างกันจำนวนมากที่เกี่ยวข้องกับการหมุนเวียนของโปรตีนซึ่งดูเหมือนจะส่งผลกระทบต่อช่วงของ phenotypes เช่นโรคเบาหวานที่ได้รับบาดเจ็บกล้ามเนื้อการออกกำลังกายที่เกิดขึ้นและเหตุการณ์ทางพยาธิวิทยาที่เกี่ยวข้องกับโรคของระบบประสาทเสื่อมในมนุษย์, ความอุดมสมบูรณ์อายุยืน และผลการชันสูตรศพในความอ่อนโยนเนื้อสัตว์ในสายพันธุ์ปศุสัตว์ calpains จะถูกยับยั้งโดย calpastatin ซึ่งผูกโดยตรงกับ calpain ที่นี่เรารายงานการวัดโดยตรงของการมีปฏิสัมพันธ์ epistatic ของการกลายพันธุ์ที่ก่อให้เกิดสำหรับตำแหน่งลักษณะเชิงปริมาณ (QTL) ที่ calpain 1 (CAPN1) ที่ตั้งอยู่บนโครโมโซมที่ 29 ที่มีการกลายพันธุ์ที่ก่อให้เกิดสำหรับรูปแบบ QTL ที่ calpastatin (นักแสดง) ที่ตั้งอยู่บนโครโมโซมที่ 7 ในวัว . ครั้งแรกที่เราระบุสาเหตุการกลายพันธุ์ที่มีศักยภาพที่หล่อแล้ว genotyped เหล่านี้พร้อมกับการกลายพันธุ์ที่ก่อให้เกิดสมมุติที่ CAPN1 ใน> 1500 วัวเจ็ดสายพันธุ์ ผลการแทนอัลลีลสูงสุดฟีโนไทป์ของ CAPN1: c.947G> C แตกต่างเบื่อหน่ายเดียว (SNP) เป็น 0.14 σp (P = 0.0003) และของนักแสดง: c.155C> T SNP ยังเป็น 0.14 σp (P = 0.0011 ) เมื่อวัดข้ามสายพันธุ์ เราพบว่ามีนัยสำคัญระหว่าง epistasis SNPs ที่ CAPN1 และนักแสดงในทอรีนและวัวสีบิวสายพันธุ์ที่ได้มา มีสารเติมแต่งเพิ่มเติม×ส่วนประกอบปกครองของ epistasis กว่าสารเติมแต่ง×สารเติมแต่งและการปกครองการปกครอง×ส่วนประกอบรวม​​กัน ชนกลุ่มน้อยของการเปรียบเทียบสายพันธุ์ไม่ได้แสดง epistasis ชี้ให้เห็นว่าการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมของยีนอื่น ๆ ที่อาจมีผลต่อระดับของ epistasis ที่พบในระบบนี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ที่คาลยีนครอบครัวและยับยั้งได้ผลหลากหลาย มากมายที่เกี่ยวข้องกับการหมุนเวียนของโปรตีน ซึ่งปรากฏผล ช่วงของการเกิดการบาดเจ็บของกล้ามเนื้อ การออกกำลัง เช่น โรคเบาหวาน และโรคเกี่ยวกับประสาทพยาธิวิทยาที่เกี่ยวข้องกับเหตุการณ์ในมนุษย์ , ความอุดมสมบูรณ์ , ยืนยาว , และหลังจากผลเนื้อนุ่มพันธุ์ปศุสัตว์การ calpains ถูกยับยั้งโดย calpastatin ซึ่งผูกตรงเพน . ที่นี่เรารายงานโดยตรงการวัด epistatic ปฏิสัมพันธ์ของการกลายพันธุ์ที่เป็นสาเหตุให้ปริมาณของลักษณะ ( QTL ) ที่ 1 ( คาล capn1 ) ตั้งอยู่บนโครโมโซม 29 มีการกลายพันธุ์ ตามลำดับ สำหรับความแปรปรวนที่ calpastatin ( โยน ) ตั้งอยู่บนโครโมโซม 7 ในโคครั้งแรกที่เราระบุที่มีศักยภาพก่อให้เกิดการกลายพันธุ์ที่โยนแล้ว genotyped เหล่านี้พร้อมกับการกลายพันธุ์ที่เป็นสาเหตุซึ่ง capn1 ใน > 1500 โค 7 สายพันธุ์ สูงสุดในการชดเชยผลของ capn1 : c.947g > C polymorphism ( SNP ) เป็นซิงเกิลนิวคลีโอไทด์ 0.14 σ p ( p = 0.0003 ) และ นักแสดง : c.155c > T SNP เป็น 0.14 σ P ( P = 0.0011 ) เมื่อวัดในสายพันธุ์เราพบ epistasis อย่างมีนัยสำคัญระหว่าง snps ที่ capn1 และโยนทั้งสองนเซบูและสายพันธุ์ มีการบวก×การปกครองส่วนประกอบของ epistasis กว่าการบวก×การบวกและการปกครอง×การปกครองส่วนประกอบรวมกัน เป็นส่วนน้อยของการเปรียบเทียบพันธุ์ epistasis ไม่แสดง ,แนะนำว่า ความแปรปรวนทางพันธุกรรมยีนอื่น ๆที่อาจมีผลต่อระดับของ epistasis พบในระบบนี้