Genetic variation is the fundamental element of biodiversity, and it is crucial for endangered species to retain as much
genetic variation as possible to improve their chances of recovery (Frankham, 2005; Yue et al., 2004). Asian arowana, an
endangered species, is mainly distributed in the lakes, rivers, reservoirs and waterways of Southeast Asia, including
Cambodia, Indonesia, Laos, Malaysia, the Philippines, Vietnam and possibly Thailand. The golden arowana is native to BukitMerah Lake in Malaysia and Sumatra in Indonesia (Dawes et al., 1999). The green arowana is widely distributed throughout
the Southeast Asia region, whereas the red arowana originates only from Indonesia’s Kalimantan province (Goh and Chua,
1999). According to the available information, the natural origin of the different color varieties is different (Dawes et al.,
1999). For the three Asian arowana, genetic studies have demonstrated genetic variation using several DNA-based molecular
markers and techniques among S. formosus isolates in Malaysia and other countries of southeast Asia; these techniques
and markers include RAPD (Yue et al., 2002), AFLP (Yue et al., 2004), SSR (Yue et al., 2004; Mu et al., 2011), the mtDNA
cytochrome b (cytb) gene (Hu et al., 2009), and the ATP synthase gene (Tang et al., 2004) of mitochondrial (mt) DNA. The
studies have also confirmed the usefulness of molecular biology, based on DNA polymorphisms, for studying within and
between populations.
In this study, genetic variation was detected among the green, red and golden arowana within three different mtDNA
regions: p12S, p16S and pcox3. The mitochondrial DNA displayed a low level of informative characters per total length (1.66%
for p12S, 4.46% for p16S and 5.32% for pcox3) in all comparisons, but it showed higher variation than the ND2 (0.86%)
(Rahman et al., 2010) and cytb genes (0.64%) (Hu et al., 2009), which demonstrates that the three mtDNA regions have more
phylogenetic information characters and variability and are better markers for both phylogenetic and population studies.
Considering the evolutionary rate of the different regions of mtDNA, we also found that the sequence differences were 1.66%
for p12S, 2.4% for p16S, and 3.2% for pcox3 among all the isolates of S. formosus, and we showed that the sequence variation
was higher in pcox3 than in p16S and p12S, though p16S was more variable than p12S. Comparing the three mtDNA genes
used, the maximal sequence difference in p12S was observed in the green and golden arowana (1.3%). For p16S, the maximal
sequence difference was in the green arowana (2.4%), while the maximal sequence difference for pcox3 was in the red
arowana (3.2%). The above variations may be related to the geologic history and/or the dispersal abilities of the species as
a result of habitat loss from swamp clearance in Malaysia and dredging in different geographical regions in Thailand (Scott
and Fuller, 1976). At the same time, the results of this study suggest that the diversification of the phenotypic traits among
the different varieties of S. formosus is likely associated with genetic divergences.
In contrast to the high haplotype diversity (0.663–0.997), a low nucleotide diversity (0.00311–0.03112) was found in all
three mitochondrial regions among the S. formosus individuals. Similar results have been reported for a wide range of fish
species, e.g., Pomacentrus coelestis (Liu et al., 2008). Grant and Bowen (1998) proposed that this result might be attributed to
a rapid population expansion after a period of low effective population size. Many species of this category are believed to have
originated in the Pliocene or early Pleistocene, but their mtDNA genealogies coalesce on a more recent scale. Nei (1987)
thought that a high haplotype diversity could be maintained within populations under several conditions, such as a large
population size, environmental heterogeneity, and life-history traits that favor a rapid population expansion. Although little is
known about the evolutionary history of S. formosus, the green variety is thought to still be relatively common in nature and is
normally located in different parts of rivers and lakes, while the red and the golden arowana have been raised separately and
quickly in Southeast Asia because of the vastly increasing prices of the two varieties in the ornamental fish market. This may
have contributed to a rapid population growth and enhanced the retention of new mutations that result in a high haplotype
diversity.
Reliable phylogenetic inference from biological sequence data is crucial for studies in molecular systematics (Lockhart
et al., 1995). The dendrograms constructed by NJ, MP, ML and BI analyses, based on the combined sequences of p12S, p16S
and pcox3, were identical or similar, whichwas in agreement with trees constructed earlier by others using various molecular
techniques (Kumazawa and Mutsumi, 2000; Yue et al., 2004) and is a currently accepted taxonomy (Hilton, 2003; Nelson,
2005). All the S. formosus that clustered into one group showed remarkably similar genetic relationships.
In conclusion, sequences data of the mitochondrial 12S, 16S, and cox3 genes revealed genetic variability among different
the S. formosus varieties, including the golden arowana, green arowana and red arowana. pcox3 appeared to be more variable
than p12S and p16S, which shows that pcox3 is a more suitable marker for genetic variation among the different varieties of
S. formosus. Phylogenetic relationships based on the combined genes effectively differentiated the green arowana variety but
showed no genetic relationships among the three varieties of S. formosus.
การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมเป็นองค์ประกอบพื้นฐานของความหลากหลายทางชีวภาพและมันเป็นสิ่งสำคัญสำหรับสัตว์ใกล้สูญพันธุ์ที่จะรักษาความหลากหลายทางพันธุกรรมมากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้
เพื่อเพิ่มโอกาสของการกู้คืน (Frankham 2005. yue et al, 2004) arowana เอเชียสายพันธุ์
อันตรายมีการกระจายส่วนใหญ่อยู่ในทะเลสาบแม่น้ำอ่างเก็บน้ำและทางน้ำของเอเชียตะวันออกเฉียงใต้รวมทั้ง
กัมพูชาอินโดนีเซียลาว, มาเลเซีย,ฟิลิปปินส์, เวียดนามและประเทศไทยอาจจะ arowana ทองเป็นพื้นเมือง Bukitmerah ทะเลสาบในมาเลเซียและเกาะสุมาตราในอินโดนีเซีย (ดอว์สและอัล., 1999) arowana สีเขียวมีการกระจายกันอย่างแพร่หลายทั่วภูมิภาคเอเชีย
ตะวันออกเฉียงใต้ในขณะที่ arowana แดงมาเฉพาะจากอินโดนีเซียในจังหวัดกาลิมันตัน (GOH และ Chua,
1999) ตามข้อมูลที่มีอยู่มาจากธรรมชาติของพันธุ์สีที่แตกต่างกันจะแตกต่างกัน (ดอว์สและอัล.
1999) สำหรับสาม arowana เอเชียศึกษาพันธุกรรมได้แสดงให้เห็นการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมโดยใช้โมเลกุลเครื่องหมายดีเอ็นเอ
-based หลายและเทคนิคในหมู่ s ฟอร์มอซัแยกในมาเลเซียและประเทศอื่น ๆ ของเอเชียตะวันออกเฉียงใต้เทคนิคเหล่านี้
และเครื่องหมายรวมถึง rapd, aflp (yue et al, 2004.), (yue et al, 2002.)SSR (yue et al, 2004;.. mu et al, 2011) (. hu et al, 2009)
mtDNA cytochrome b (cytb) ยีนและยีนเทสเอทีพี (. รสตอัล, 2004) ของยล (mt) dna
การศึกษานอกจากนี้ยังได้รับการยืนยันประโยชน์ของชีววิทยาโมเลกุลบนพื้นฐานของความหลากหลาย dna, สำหรับการศึกษาภายในและระหว่างประชากร
.
ในการศึกษาครั้งนี้การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมถูกตรวจพบในสีเขียวarowana สีแดงและสีทองภายในสาม mtdna
ภูมิภาคที่แตกต่างกัน p12s, p16s และ pcox3 dna ยลแสดงระดับต่ำของตัวละครให้ข้อมูลต่อความยาวทั้งหมด (1.66%
เพื่อ p12s, 4.46% ใน p16s และ 5.32% ใน pcox3) ในการเปรียบเทียบทั้งหมด แต่มันแสดงให้เห็นการเปลี่ยนแปลงที่สูงกว่า ND2 (0.86%)
(เราะห์มานและรหัส อั. 2010) และยีน cytb (0.64%) (hu et al,., 2009)ซึ่งแสดงให้เห็นว่าภูมิภาค mtdna สามมีมากขึ้น
อักขระข้อมูลสายวิวัฒนาการและความแปรปรวนและเป็นเครื่องหมายที่ดีกว่าสำหรับทั้งการศึกษาสายวิวัฒนาการและประชากร.
พิจารณาอัตราการวิวัฒนาการของภูมิภาคต่างๆของ mtDNA เรายังพบว่ามีความแตกต่างตามลำดับเป็น 1.66%
เพื่อ p12s 2.4% ใน p16s และ 3.2% ใน pcox3 ในหมู่สายพันธุ์ทั้งหมดของ s ฟอร์มอซัส,และเราแสดงให้เห็นว่าการเปลี่ยนแปลงลำดับ
สูงใน pcox3 กว่าใน p16s และ p12s แต่ p16s เป็นตัวแปรมากกว่า p12s เปรียบเทียบสามยีน mtdna
ใช้ความแตกต่างในลำดับสูงสุด p12s ถูกตั้งข้อสังเกตใน arowana สีเขียวและสีทอง (1.3%) เพื่อ p16s, สูงสุด
ลำดับความแตกต่างใน arowana สีเขียว (2.4%) ในขณะที่ความแตกต่างของลำดับสูงสุดเพื่อ pcox3 เป็นสีแดง
arowana (3.2%) รูปแบบดังกล่าวข้างต้นอาจจะเกี่ยวข้องกับประวัติศาสตร์ทางธรณีวิทยาและ / หรือความสามารถในการกระจายของสายพันธุ์เป็น
ผลมาจากการสูญเสียที่อยู่อาศัยจากการกวาดล้างบึงในมาเลเซียและการขุดลอกในพื้นที่ทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกันในประเทศไทย (สก็อต
และฟูลเลอร์, 1976) ในขณะเดียวกันผลการศึกษานี้ชี้ให้เห็นว่าการกระจายความเสี่ยงของลักษณะฟีโนไทป์ในหมู่
สายพันธุ์ที่แตกต่างกันของส ฟอร์มอซัสมีแนวโน้มที่เกี่ยวข้องกับความแตกต่างทางพันธุกรรม.
ในทางตรงกันข้ามกับความหลากหลาย haplotype สูง (0.663-0.997), ความหลากหลายเบื่อหน่ายต่ำ (0.00311-0.03112) ถูกพบได้ในทุกภูมิภาคที่สาม
ยลหมู่ s บุคคล formosus ผลที่คล้ายกันได้รับการรายงานที่หลากหลายของปลา
ชนิดเช่น pomacentrus coelestis (liu และคณะ. 2008)และให้เวน (1998) เสนอว่าผลนี้อาจจะนำมาประกอบกับการขยายตัวของประชากร
อย่างรวดเร็วหลังจากช่วงเวลาที่มีประสิทธิภาพขนาดของประชากรต่ำ หลายสายพันธุ์ของประเภทนี้เชื่อว่ามีต้นกำเนิดใน
Pliocene หรือ Pleistocene ก่อน แต่วงศ์วานว่านเครือ mtDNA ของพวกเขารวมกันในระดับที่ผ่านมามากขึ้น เขตปกครองตนเอง (1987)
คิดว่าความหลากหลาย haplotype สูงจะได้รับการรักษาภายในประชากรภายใต้เงื่อนไขหลายประการเช่นขนาดใหญ่
ประชากรขนาด, ความหลากหลายด้านสิ่งแวดล้อมและลักษณะชีวิตประวัติศาสตร์ที่สนับสนุนการขยายตัวของประชากรอย่างรวดเร็ว แต่ไม่ค่อยเป็นที่รู้จักกันเกี่ยวกับ
ประวัติศาสตร์วิวัฒนาการของ s ฟอร์มอซัส, ความหลากหลายสีเขียวเป็นความคิดที่ยังคงเป็นที่ค่อนข้างทั่วไปในธรรมชาติและเป็น
ตั้งอยู่ตามปกติในส่วนต่างๆของแม่น้ำและทะเลสาบในขณะที่สีแดงและสีทอง arowana ได้รับการยกและแยก
อย่างรวดเร็วในเอเชียตะวันออกเฉียงใต้เนื่องจากราคาที่เพิ่มขึ้นอย่างมากมายของทั้งสองสายพันธุ์ในตลาดปลาสวยงาม นี้อาจ
มีส่วนทำให้การเติบโตของประชากรอย่างรวดเร็วและการเก็บรักษาที่เพิ่มขึ้นของการกลายพันธุ์ใหม่ที่มีผลในการ haplotype
ความหลากหลายสูง.
อนุมานสายวิวัฒนาการที่เชื่อถือได้จากข้อมูลลำดับชีวภาพเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการศึกษาในระดับโมเลกุล systematics (
ล็อกฮาร์ตและอัล., 1995) dendrograms สร้างโดย nj, MP, มล. และสองการวิเคราะห์ตามลำดับรวมของ p12s, p16s
และ pcox3 เป็นเหมือนกันหรือคล้ายกัน whichwas ในข้อตกลงกับต้นไม้ที่สร้างก่อนหน้านี้โดยคนอื่น ๆ โดยใช้เทคนิคโมเลกุล
ต่างๆ (Kumazawa และมุทสึ,2000;. yue et al, 2004) และเป็นอนุกรมวิธานได้รับการยอมรับในปัจจุบัน (ฮิลตัน, 2003; เนลสัน,
2005) ทั้งหมดที่ ฟอร์มอซัสที่กระจุกตัวอยู่ในกลุ่มหนึ่งที่แสดงให้เห็นความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมที่คล้ายกันอย่างน่าทึ่ง.
ในการสรุปข้อมูลของลำดับ 12s ยล, 16s และยีน cox3 เปิดเผยความแปรปรวนทางพันธุกรรมที่แตกต่างกันในหมู่
s พันธุ์ฟอร์มอซัสรวมทั้ง arowana ทอง arowana สีเขียวและสีแดง arowanapcox3 ดูเหมือนจะเป็นตัวแปรมากขึ้นกว่า
p12s และ p16s ซึ่งแสดงให้เห็นว่า pcox3 เป็นเครื่องหมายที่เหมาะสมมากขึ้นสำหรับการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมในสายพันธุ์ที่แตกต่างกันของ
s ฟอร์มอซัส ความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการอยู่บนพื้นฐานของยีนรวมกันได้อย่างมีประสิทธิภาพที่แตกต่างหลากหลาย arowana สีเขียว แต่
พบว่าไม่มีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมในสามพันธุ์ของ s ฟอร์มอซัส
การแปล กรุณารอสักครู่..

ความผันแปรทางพันธุกรรมเป็นองค์ประกอบพื้นฐานของความหลากหลายทางชีวภาพ และมันเป็นสิ่งสำคัญสำหรับพันธุ์การรักษามากที่สุด
ความผันแปรทางพันธุกรรมเป็นการเพิ่มโอกาสในการกู้คืน (Frankham, 2005 หยู et al., 2004) ปลาตะพัด การ
ส่วนใหญ่มีกระจายพันธุ์ ทะเลสาบ แม่น้ำ อ่างเก็บน้ำ และใจกลางของเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ รวม
กัมพูชา อินโดนีเซีย ลาว มาเลเซีย ฟิลิปปินส์ เวียดนาม และอาจรวมถึงประเทศไทย ปลาอะโรวาน่าทองจะเป็นเล BukitMerah ในมาเลเซียและเกาะสุมาตราในอินโดนีเซีย (การดอวส์ et al., 1999) ปลาอะโรวาน่าเขียวมีกระจายอย่างกว้างขวางตลอด
ภูมิภาคเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ ในขณะที่ปลาอะโรวาน่าสีแดงมีต้นกำเนิดมาจากอินโดนีเซียจังหวัดกาลิมันตัน (โก๊ะและชัว,
1999) ตามข้อมูลที่มี จุดเริ่มต้นของธรรมชาติพันธุ์สีแตกต่างกันจะแตกต่างกัน (การดอวส์ et al.,
1999) สำหรับสามตะพัด การศึกษาทางพันธุกรรมได้แสดงความผันแปรทางพันธุกรรมที่ใช้หลายตามดีเอ็นเอโมเลกุล
เครื่องหมายและเทคนิคระหว่าง S. formosus isolates ในประเทศมาเลเซียและประเทศอื่น ๆ ในภูมิภาคเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ เทคนิคเหล่านี้
และเครื่องหมายอาร์เอพีดี (ยิวและ al., 2002), AFLP (หยู et al., 2004), SSR (หยู et al., 2004 หมู่ et al., 2011), mtDNA
ยีน cytochrome b (cytb) (Hu et al., 2009), และ ATP synthase ยีน (Tang et al., 2004) ของ mitochondrial (mt) ดีเอ็นเอ ใน
การศึกษายังได้ยืนยันประโยชน์ของอณูชีววิทยา ตาม polymorphisms ดีเอ็นเอ การศึกษาภายใน และ
ระหว่างประชากร
ในการศึกษานี้ ความผันแปรทางพันธุกรรมพบระหว่างสีเขียว ปลาอะโรวาน่าสีแดง และสีทองภายในต่าง ๆ mtDNA สาม
ภูมิภาค: p12S, p16S และ pcox3 ใน mitochondrial DNA แสดงอักขระข้อมูลต่อความยาวรวมในระดับต่ำ (1.66%
for p12S, 4.46% สำหรับ p16S และ pcox3 $ 5.32%) ทั้งหมดเปรียบเทียบ แต่เห็นการเปลี่ยนแปลงสูงกว่า ND2 (0.86%)
(เราะหฺมาน et al., 2010) และยีน cytb (0.64%) (Hu et al., 2009), ซึ่งแสดงให้เห็นว่า ภูมิภาค mtDNA สามมี
phylogenetic ข้อมูลอักขระ และความแปรผัน และมีดีเครื่องหมายทั้ง phylogenetic และประชากรศึกษา.
พิจารณาอัตราวิวัฒนาการของภูมิภาคต่าง ๆ ของ mtDNA เราพบว่า ลำดับความแตกต่างได้ที่ p12S 1.66%
for, 2.4% สำหรับ p16S และ pcox3 ระหว่าง isolates ทั้งหมดของ S. formosus, 3.2% และเราพบว่าการเปลี่ยนแปลงลำดับ
สูงกว่า pcox3 มากกว่า p16S และ p12S แม้ว่า p16S เป็นตัวแปรที่เพิ่มมากขึ้นกว่า p12S การเปรียบเทียบยีน mtDNA สาม
ใช้ ความแตกต่างลำดับสูงสุดของ p12S ที่พบในปลาสีเขียว และทองอะโรวาน่า (1.3%) สำหรับ p16S, maximal
ลำดับความแตกต่างได้ในปลาอะโรวาน่าเขียว (2.4%), ในขณะที่ความแตกต่างลำดับสูงสุดสำหรับ pcox3 อยู่ในสีแดง
ปลาอะโรวาน่า (3.2%) รูปแบบข้างต้นอาจเกี่ยวข้องกับประวัติศาสตร์ธรณีวิทยาและ/หรือความสามารถ dispersal พันธุ์เป็น
ผลขาดทุนอยู่อาศัยจากพรุเคลียร์ในมาเลเซียและ dredging ในภูมิภาคทางภูมิศาสตร์ในประเทศไทย (สกอตต์
และ Fuller, 1976) แนะในเวลาเดียวกัน ผลของการศึกษานี้นำที่วิสาหกิจของลักษณะไทป์ใน
พันธุ์ S. formosus แตกต่างกันคืออาจจะเกี่ยวข้องกับพันธุกรรม divergences.
ตรงข้ามความหลากหลาย haplotype สูง (0.663–0.997), ความหลากหลายต่ำนิวคลีโอไทด์ (0.00311–0.03112) พบใน
สามภูมิภาค mitochondrial ระหว่าง S. formosus บุคคล มีการรายงานผลลัพธ์ที่คล้ายกันสำหรับความหลากหลายของปลา
ชนิด เช่น Pomacentrus coelestis (หลิว et al., 2008) เงินช่วยเหลือและเวน (1998) เสนอว่า ผลนี้อาจเกิดจากการ
ขยายประชากรอย่างรวดเร็วหลังจากช่วงของขนาดประชากรต่ำมีผลบังคับใช้ พันธุ์ในประเภทนี้เชื่อว่ามี
มาใน Pleistocene Pliocene หรือต้น แต่ของ mtDNA genealogies รวม coalesce ในล่าสุด Nei (1987)
คิดว่า สามารถรักษาความหลากหลายทางชีวภาพสูง haplotype ภายในประชากรภายใต้เงื่อนไขหลายประการ เช่นขนาดใหญ่
ขนาดประชากร สิ่งแวดล้อม heterogeneity และลักษณะประวัติชีวิตที่ชอบขยายประชากรอย่างรวดเร็ว แต่น้อย
รู้จักเกี่ยวกับประวัติวิวัฒนาการของ S. formosus หลากหลายสีเขียวคิดว่า ยังคง จะค่อนข้างทั่วไปในธรรมชาติ และเป็น
โดยปกติจะอยู่ในส่วนต่าง ๆ ของแม่น้ำและทะเลสาบ ในขณะที่ปลาอะโรวาน่าสีทองและสีแดงได้รับการเลี้ยงแยกต่างหาก และ
อย่างรวดเร็วในเอเชียตะวันออกเฉียงใต้เนื่องจากราคาเพิ่มขึ้นเสมือนของสองสายพันธุ์ในตลาดปลาสวยงาม พฤษภาคมนี้
ส่วนการเจริญเติบโตของประชากรอย่างรวดเร็ว และเพิ่มการเก็บรักษาของกลายพันธุ์ใหม่ที่ส่งผล haplotype สูง
หลากหลาย
ข้อ phylogenetic เชื่อถือได้จากชีวภาพลำดับข้อมูลเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการศึกษาในอนุกรมวิธานระดับโมเลกุลของ (Lockhart
et al., 1995) Dendrograms สร้าง โดย NJ, MP, ML และ BI วิเคราะห์ ตามลำดับรวมของ p12S, p16S
pcox3 และ whichwas เหมือนกัน หรือคล้าย กัน ข้อตกลงกับต้นไม้ที่สร้างขึ้นก่อนหน้านี้ โดยผู้อื่นได้ใช้โมเลกุลต่าง ๆ
เทคนิค (Kumazawa และ Mutsumi 2000 หยู et al., 2004) และเป็นระบบที่ยอมรับในปัจจุบัน (ฮิลตัน 2003 เนลสัน,
2005) ทั้งหมด S. formosus ที่จับกลุ่มเป็นกลุ่มหนึ่งพบเหมือนทางพันธุกรรมความสัมพันธ์.
ข้อมูลลำดับของ mitochondrial 12S, 16S และยีน cox3 เปิดเผยความแปรผันทางพันธุกรรมผู้อื่นเบียดเบียน
สายพันธุ์ formosus, S. ปลาอะโรวาน่าสีทอง สีเขียวปลาอะโรวาน่า และปลาอะโรวาน่าสีแดง pcox3 ปรากฏ ว่าตัวแปรเพิ่มเติม
p12S และ p16S ซึ่งแสดง pcox3 ที่เป็นเครื่องหมายที่เหมาะสำหรับการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมระหว่างสายพันธุ์ต่าง ๆ ของ
S. formosus ความสัมพันธ์ phylogenetic ตามยีนรวมกันได้อย่างมีประสิทธิภาพแตกต่างกันหลากหลายปลาอะโรวาน่าเขียว แต่
แสดงให้เห็นว่าไม่มีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างพันธุ์ S. formosus สาม
การแปล กรุณารอสักครู่..
