It is suggested that only 17% of the known fungi can be readily grown in culture [7]. As traditional methods have many pitfalls, culture-independent methods show great potential in monitoring shifts or diversity of microbial community in a variety of environmental samples, such as Phospholipid Fatty Acid analysis (PLFA), Fatty Acid Methyl Ester profile (FAME), Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP), Ribosomal Intergenic Spacer Analysis (RISA), Denaturing/Temperature Gradient Gel Electrophoresis (DGGE/TGGE), Single Strand Configuration Polymorphism (SSCP), Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis (ARDRA), etc. Among these, T-RFLP and DGGE are two most widely used and effective methods in analyzing the spatial and temporal shifts of microbial community. T-RFLP method takes advantage in high throughputs, reproducible and web-based RDP database [8], while DGGE has high resolution by separating the same size fragments and sequencing each band[9]. Thus, in this study, the combination of the two methods would give a better understanding of the soil fungal community in cucumber rhizosphere.
It is suggested that only 17% of the known fungi can be readily grown in culture [7]. As traditional methods have many pitfalls, culture-independent methods show great potential in monitoring shifts or diversity of microbial community in a variety of environmental samples, such as Phospholipid Fatty Acid analysis (PLFA), Fatty Acid Methyl Ester profile (FAME), Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP), Ribosomal Intergenic Spacer Analysis (RISA), Denaturing/Temperature Gradient Gel Electrophoresis (DGGE/TGGE), Single Strand Configuration Polymorphism (SSCP), Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis (ARDRA), etc. Among these, T-RFLP and DGGE are two most widely used and effective methods in analyzing the spatial and temporal shifts of microbial community. T-RFLP method takes advantage in high throughputs, reproducible and web-based RDP database [8], while DGGE has high resolution by separating the same size fragments and sequencing each band[9]. Thus, in this study, the combination of the two methods would give a better understanding of the soil fungal community in cucumber rhizosphere.
การแปล กรุณารอสักครู่..

พบว่ามีเพียงร้อยละ 17 ของรู้จักเชื้อราสามารถพร้อมเพาะ [ 7 ] เป็นวิธีแบบดั้งเดิมมีข้อผิดพลาดหลายวัฒนธรรมอิสระวิธีการแสดงศักยภาพที่ดีในการเปลี่ยนแปลงหรือความหลากหลายของชุมชนจุลินทรีย์ในความหลากหลายของตัวอย่างสิ่งแวดล้อม เช่น การวิเคราะห์กรดไขมันฟอสโฟลิพิด ( plfa ) , กรดไขมันเมทิลเอสเทอร์ โปรไฟล์ ( ชื่อเสียง )เทอร์มินัลจำกัด fragment length polymorphism ( t-rflp ) , การวิเคราะห์ spacer ribosomal ส่า ( ลิซ่า ) ี่ / อุณหภูมิลาด gel electrophoresis ( การทดลอง / tgge ) , การปรับแต่งเส้นเดียว - ( จำนวนจำกัด ) , การวิเคราะห์ดีเอ็นเอของไรโบโซม ( ardra ) , ฯลฯ ในหมู่เหล่านี้t-rflp และการทดลองเป็นสองส่วนใหญ่ใช้กันอย่างแพร่หลายและวิธีที่มีประสิทธิภาพในการวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงพื้นที่และเวลาของชุมชนจุลินทรีย์ วิธี t-rflp throughputs สูงใช้ประโยชน์ในการหาเว็บฐานข้อมูล RDP [ 8 ] , ในขณะที่การทดลองมีความละเอียดสูง โดยการแบ่งชิ้นส่วนขนาดเดียวกันและลำดับแต่ละวง [ 9 ] ดังนั้นในการศึกษานี้การรวมกันของทั้งสองวิธีจะให้ความเข้าใจที่ดีขึ้นของเชื้อราในดินบริเวณรากแตงกวา
ชุมชน .
การแปล กรุณารอสักครู่..
