Enumeration of sandy sediment bacte

Enumeration of sandy sediment bacteria: search for optimal protocol
Slava S. Epstein, Northeastern University
Jeffrey Rossel, Northeastern University
Article comments
Originally published in Marine Ecology Progress Series 117 (1995): 289-298. http://www.int-res.com/abstracts/meps/v117/

Abstract
We examined and compared a variety of existing protocols for enumeration of bacteria from marine sandy sediments. The focus was on how to dislodge bacteria from sediment particles; a commercial blender, an ultrasonic cleaner, and an ultrasonic cell disrupter were tested. The ultrasonic cell disrupter was found to be the most efficient device for bacterial dislodgment. With a 5 mm microtip vibrating at 109 μm amplitude and 20 kHz, the optimal sonication time of small (≤ 0.5 cm³) samples was 180 s. Having identified the optimal dislodgment treatment, we went through other steps of sediment bacteria enumeration (use of surfactants, thoroughness of sample washing, bacterial staining and counterstaining, etc.), striving for additional ways of improvement. The result was a protocol that, in our study, gave bacterial counts superior to those obtained by any other protocol currently in use.

Suggested Citation
Slava S. Epstein and Jeffrey Rossel. "Enumeration of sandy sediment bacteria: search for optimal protocol" Biology Faculty Publications (1995).
Available at: http://works.bepress.com/sepstein/6

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

นับของแบคทีเรียตะกอนทราย: การค้นหาโปรโตคอลที่เหมาะสม
s สลาวา Epstein, มหาวิทยาลัยภาคตะวันออกเฉียงเหนือ
เจฟฟรีย์ rossel มหาวิทยาลัยภาคตะวันออกเฉียงเหนือ

ความเห็นบทความตีพิมพ์ในระบบนิเวศทางทะเลความคืบหน้าชุด 117 (1995): 289-298 http://www.int-res.com/abstracts/meps/v117/


นามธรรมเราตรวจสอบและเปรียบเทียบความหลากหลายของโปรโตคอลที่มีอยู่สำหรับการนับของเชื้อแบคทีเรียจากตะกอนทรายทะเล มุ่งเน้นเป็นวิธีที่จะทำให้หลุดจากเชื้อแบคทีเรียจากอนุภาคตะกอนปั่นเชิงพาณิชย์ทำความสะอาดอัลตราโซนิกและ disrupter มือถือล้ำได้มีการทดสอบ disrupter มือถือล้ำพบว่าเป็นอุปกรณ์ที่มีประสิทธิภาพมากที่สุดสำหรับ dislodgment แบคทีเรียกับ 5 มม. microtip สั่นที่ 109 ไมโครเมตรและกว้าง 20 kHz เวลา sonication ที่ดีที่สุดของขนาดเล็ก (≤ 0.5 ซม. ³) กลุ่มตัวอย่างเป็น 180 s ที่มีการระบุการรักษา dislodgment ที่ดีที่สุดเราก็ผ่านขั้นตอนอื่น ๆ ของตะกอนแบคทีเรียนับ (การใช้ลดแรงตึงผิวของตัวอย่างทั่วถึงซักผ้าย้อมสีแบคทีเรียและ counterstaining ฯลฯ ) มุ่งมั่นในการวิธีการเพิ่มเติมของการปรับปรุงผลที่ได้โปรโตคอลที่ในการศึกษาของเราให้ปริมาณแบคทีเรียที่ดีกว่าผู้ที่ได้รับโดยโปรโตคอลอื่น ๆ ที่ใช้ในปัจจุบัน.


อ้างอิงแนะนำสลาวา s เอพสเตและเจฟฟรีย์ rossel "นับของแบคทีเรียตะกอนทราย: ค้นหาที่ดีที่สุดโปรโตคอล" ชีววิทยาคณะสิ่งพิมพ์ (1995)
ที่:. http://works.bepress.com/sepstein/6

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การแจงนับของแบคทีเรียตะกอนทราย: ค้นหาโพรโทคอลสูงสุด
Slava S. สเตียน มหาวิทยาลัยเฉียง
เจฟฟรีย์ Rossel เฉียงมหาวิทยาลัย
บทความข้อคิดเห็น
เผยแพร่ครั้งแรก ในทะเลนิเวศวิทยาความคืบหน้าชุด 117 (1995): 289-298 http://www.int-res.com/abstracts/meps/v117/

นามธรรม
เราตรวจสอบ และเปรียบเทียบความหลากหลายของโปรโตคอลที่มีอยู่สำหรับการแจงนับของแบคทีเรียจากตะกอนทะเลทราย โฟกัสอยู่บนวิธีการไล่ออกแบคทีเรียจากอนุภาคตะกอน เบลนเดอร์เชิงพาณิชย์ การทำความสะอาดอัลตราโซนิก และ disrupter อัลตราโซนิกเซลล์ที่ถูกทดสอบ พบ disrupter อัลตราโซนิกเซลล์เป็น อุปกรณ์มีประสิทธิภาพสูงสุดสำหรับ dislodgment แบคทีเรีย กับ microtip 5 มม.ที่สั่นสะเทือนคลื่น μm และ 20 kHz, 109 เวลา sonication เหมาะสมของขนาดเล็ก (≤ 0.5 cm³) ตัวอย่าง 180 s มุ่งมีระบุการรักษา dislodgment ดีที่สุด เราไปผ่านขั้นตอนอื่น ๆ ของตะกอนแบคทีเรียแจงนับ (ใช้ของ surfactants, thoroughness ซักผ้าตัวอย่าง แบคทีเรีย staining และ counterstaining, etc.), มั่นสำหรับวิธีการเพิ่มเติมปรับปรุง ผลคือ โพรโทคอลที่ ในการศึกษาของเรา ให้แบคทีเรียนับซูกับผู้รับ โดย protocol อื่น ๆ ในปัจจุบันใช้

แนะนำอ้างอิง
Slava S. สเตียนและเจฟฟรีย์ Rossel "แจงนับของแบคทีเรียตะกอนทราย: ค้นหาโพรโทคอลที่เหมาะสมที่สุด" สิ่งพิมพ์คณะชีววิทยา (1995) .
ขอได้ที่: http://works.bepress.com/sepstein/6

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ระบุของแบคทีเรียตะกอนทรายการค้นหาสำหรับโปรโตคอลดีที่สุด
slava . S . S . Julius Epstein ผู้เขียนบทมหาวิทยาลัย ภาค ตะวันออกเฉียงเหนือ
ตั้งแต่บ๊อบเกลด๊ rossel ความคิดเห็น ภาค ตะวันออกเฉียงเหนือมหาวิทยาลัย

ข้อแรกเริ่มเผยแพร่ในทะเลด้านนิเวศวิทยาความคืบหน้า Series 117 ( 1995 ) 289-298 . http://www.int-res.com/abstracts/meps/v117/

abstract
เราจะตรวจสอบและเมื่อเทียบกับความหลากหลายของโปรโตคอลที่มีอยู่สำหรับระบุของแบคทีเรียจากตะกอนทะเลหาดทราย โฟกัสที่อยู่ในแบคทีเรียได้อย่างไรเพื่อขจัดสิ่งสกปรกจากเศษตะกอนปั่นทางการค้าที่ทำความสะอาดอัลตราโซนิคและ disrupter เซลล์อัลตราโซนิคได้รับการทดสอบ disrupter เซลล์อัลตราโซนิคที่พบว่าเป็นอุปกรณ์ที่มี ประสิทธิภาพ สำหรับขับออกไปฆ่าเชื้อแบคทีเรียพร้อมด้วย microtip 5 มม.ที่สั่นที่ 109 แอมพลิจูดμ m และ 20 kHz เวลา sonication สูงสุดของขนาดเล็ก(≤ 0.5 ซม.เท่า)ตัวอย่างเป็น 180 S การระบุการบำบัดขับออกไปได้มากที่สุดที่เราผ่านเข้าไปตามขั้นตอนอื่นๆของระบุเชื้อแบคทีเรียตะกอน(การใช้ลดแรงตึงผิวชนิดปราศจากประจุรัดกุมของล้างทำความสะอาดตัวอย่าง counterstaining และเกิดรอยเปื้อนควรฆ่าเชื้อแบคมีเรียฯลฯ)ดิ้นรนสำหรับวิธีการเพิ่มเติมในการปรับปรุงผลที่ตามมาคือมีโปรโตคอลที่อยู่ในการศึกษาของเราให้นับถอยหลังฆ่าเชื้อแบคมีเรียในระดับ superior first class ที่ได้รับจากโปรโตคอลอื่นใดในขณะนี้ใช้.

slava . S . S . Julius Epstein ผู้เขียนบทราชบัณฑิตยสถาน
ที่แนะนำและตั้งแต่บ๊อบเกลด๊ rossel "ระบุของแบคทีเรียตะกอนทรายการค้นหาสำหรับโปรโตคอลดีที่สุด"ชีววิทยาคณะสื่อสิ่งพิมพ์( 1995 ). N จัดให้บริการที่ http://works.bepress.com/sepstein/6