strains MUSC 135T and MUSC 137 was

strains MUSC 135T and MUSC 137 was 100 %. Therefore,
strains MUSC 135T and MUSC 137 should be classified in
the same species. The 16S rRNA gene sequences of strains
MUSC 135T and MUSC 137 were aligned manually with
the corresponding partial 16S rRNA gene sequences of
the type strains of representative members of the genus
Streptomyces retrieved from the GenBank/EMBL/DDBJ
databases. The neighbour-joining phylogenetic tree reconstructed
based on 16S rRNA gene sequences showed that
strains MUSC 135T and MUSC 137 formed a distinct clade
with the type strains Streptomyces cinereospinus NBRC
15397T, Streptomyces mexicanus NBRC 100915T, Streptomyces
coeruleofuscus NBRC 12757T and Streptomyces
chromofuscus NBRC 12851T (Fig. 1). Strains MUSC 135T
and MUSC 137 formed a subclade with Streptomyces
mexicanus NBRC 100915T (Fig. 1), and this association was
also supported by the maximum-likelihood algorithm
(Fig. 2). Strain MUSC 135T exhibited the highest 16S
rRNA gene sequence similarity to Streptomyces cinereospinus
NBRC 15397T (99.18 %), which corresponds to 12
nucleotide differences over 1462 locations with gaps, and
lower similarity to Streptomyces mexicanus NBRC 100915T
(99.17 %) and Streptomyces coeruleofuscus NBRC 12757T
(98.97 %). The DNA–DNA relatedness between strain
MUSC 135T and Streptomyces cinereospinus NBRC 15397T
(26.3±2.1 %), Streptomyces mexicanus NBRC 100915T
(49.6±2.5 %) and Streptomyces coeruleofuscus NBRC
12757T (49.5±2.9 %) was significantly below 70 %, the
threshold value for the delineation of bacterial species
(Wayne et al., 1987). These results supported the notion
that strain MUSC 135T represents a novel species. The
DNA–DNA relatedness between strains MUSC 135T and
MUSC 137 was 83±3.2 %, which confirmed that these two
strains belong to the same species. The BOX-PCR results
showed that strain MUSC 135T yielded a unique BOX-PCR
fingerprint compared with MUSC 137 and closely related
type strains (Fig. S3), indicating that the two novel strains
are not clones. Finally, the DNA fingerprinting results were
in agreement with the results of DNA–DNA hybridization,
that strain MUSC 135T represents a novel species.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สายพันธุ์ 135T ไหล่และไหล่ 137 ถูก 100% ดังนั้นสายพันธุ์ 135T ไหล่และไหล่ 137 ควรจัดในชนิดเดียวกัน ลำดับการยีน 16S rRNA ของสายพันธุ์สมาคม 135T และ 137 ไหล่ถูกว่านด้วยตนเองที่สอดคล้องกันบางส่วน 16S rRNA ยีนลำดับสายพันธุ์ชนิดของตัวแทนสมาชิกของสกุลStreptomyces ที่ดึงมาจาก GenBank/EMBL/DDBJฐานข้อมูล เพื่อนบ้านร่วม phylogenetic ต้นไม้สร้างขึ้นใหม่อิงจาก 16S rRNA ยีนลำดับแสดงให้เห็นว่าสายพันธุ์ 135T ไหล่และไหล่ 137 clade แตกต่างที่เกิดขึ้นกับ cinereospinus สายพันธุ์ Streptomyces ชนิด NBRC15397T, mexicanus Streptomyces NBRC 100915T, Streptomycescoeruleofuscus NBRC 12757T และ Streptomyceschromofuscus NBRC 12851T (รูปที่ 1) สายพันธุ์ไหล่ 135Tและไหล่ 137 subclade กับ Streptomycesmexicanus NBRC 100915T (รูป 1), และความสัมพันธ์นี้สนับสนุน โดยอัลกอริทึมโอกาสสูงสุด(2 รูป) สายพันธุ์ไหล่ 135T กุมาร 16S สูงสุดคลึงลำดับยีน rRNA Streptomyces cinereospinusNBRC 15397T (99.18%), ซึ่งตรงกับ 12นิวคลีโอไทด์แตกต่าง 1462 กว่า ด้วยช่องว่าง และต่ำคล้ายคลึง Streptomyces mexicanus NBRC 100915T(99.17%) และ Streptomyces coeruleofuscus NBRC 12757T(98.97%) Relatedness ดีเอ็นเอดีเอ็นเอระหว่างสายพันธุ์สมาคม 135T และ Streptomyces cinereospinus NBRC 15397T(26.3±2.1%), Streptomyces mexicanus NBRC 100915T(49.6±2.5%) และ Streptomyces coeruleofuscus NBRC12757T (49.5±2.9%) อย่างมีนัยสำคัญต่ำกว่า 70% การค่าขีดจำกัดสำหรับอำนาจของแบคทีเรียสายพันธุ์(Wayne et al. 1987) ผลลัพธ์เหล่านี้สนับสนุนความคิดสายพันธุ์ที่ไหล่ 135T แทนสายพันธุ์ใหม่ การดีเอ็นเอดีเอ็นเอ relatedness ระหว่างสายพันธุ์ 135T ไหล่ และ137 ไหล่ร้อย 83±3.2 ซึ่งยืนยันว่า สองคนนี้สายพันธุ์เป็นสายพันธุ์เดียวกัน ผล PCR กล่องพบว่าสายพันธุ์ที่ไหล่ 135T ผล PCR กล่องไม่ซ้ำกันลายนิ้วมือเปรียบเทียบกับไหล่ 137 และสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดชนิดสายพันธุ์ (มะเดื่อ S3), ระบุว่า สายพันธุ์ใหม่สองไม่เป็นโคลน ในที่สุด DNA fingerprinting ผลลัพธ์ได้ตามซึ่งผลของ DNA – DNA hybridizationสายพันธุ์ที่ไหล่ 135T แทนสายพันธุ์ใหม่