Clinical laboratories are often cha

Clinical laboratories are often challenged with mold identification. In contrast with bacterial or Candida species, which are identified on the basis of biochemical properties, mold identification is largely based on phenotypic criteria. Related species or phenotypic variants may be misidentified and rare species may remain unidentified. As a result, molecular methods have been developed to overcome these problems, and comparative sequence analysis is now considered the gold standard identification technique [4, 5].
The internal transcribed spacer (ITS) region is the most commonly used target for sequencing in clinical laboratories because of the following benefits: (i) multiple copies of the ribosomal gene are present in all organisms, enabling sensitive detection by PCR, and (ii) the ITS region contains both highly conserved and variable regions, and is therefore, the optimal target for developing specific PCR primers that discriminate among closely related species [6-9]. However, the ITS region might not provide species-level resolution for all species. In such cases, other targets such as the D1/D2 region of the 28S subunit, the ß-tubulin gene, or the translation elongation factor gene may prove useful, depending on the genus in question. In this study, we used molecular methods for mold identification and compared the performances of the ITS region, the D1/D2 region, and the ß-tubulin gene as amplification targets for comparative sequence analysis

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ห้องปฏิบัติการทางคลินิกมีท้าทายมักมีแม่พิมพ์ สีแบคทีเรียหรือพันธุ์ Candida ที่กำหนดบนพื้นฐานของคุณสมบัติทางชีวเคมี รหัสแม่พิมพ์ส่วนใหญ่ใช้เกณฑ์ไทป์ ญาติหรือตัวแปรไทป์อาจฟังก์ และพันธุ์หายากอาจยังคงไม่สามารถระบุได้ ผล วิธีโมเลกุลได้รับการพัฒนาเพื่อเอาชนะปัญหาเหล่านี้ และการวิเคราะห์เปรียบเทียบกำลังถือเทคนิครหัสมาตรฐานทองคำ [4, 5] ภายในแผ่นรองทับ (ของ) คือ เป้าหมายใช้มากที่สุดสำหรับลำดับในห้องปฏิบัติการทางคลินิกเนื่องจากสิทธิประโยชน์ต่อไปนี้: (i) หลายสำเนาของยีน ribosomal อยู่ในสิ่งมีชีวิตทั้งหมด เปิดใช้งานการตรวจสอบที่สำคัญ โดย PCR และ (ii) ของภูมิภาคประกอบด้วยทั้งเมืองเก่า และสูงตัวแปรภูมิภาค ดัง นั้นจึง เป้าหมายที่เหมาะสมสำหรับการพัฒนาไพรเมอร์ PCR เฉพาะที่แยกแยะระหว่างใกล้ชิดเกี่ยวข้องสายพันธุ์ [6-9] อย่างไรก็ตาม ภูมิภาคของอาจให้ความละเอียดระดับชนิดสำหรับทุกสายพันธุ์ ในกรณีดังกล่าว เป้าหมายอื่น ๆ เช่นภูมิภาค D1/D2 ของย่อย 28S ยีนß tubulin หรือแปลยืดตัวยีนอาจพิสูจน์ว่ามีประโยชน์ ขึ้นอยู่กับสกุลในคำถาม ในการศึกษานี้ เราใช้วิธีการระดับโมเลกุลสำหรับแม่พิมพ์ และเปรียบเทียบการแสดงของภูมิภาค ภูมิภาค D1/D2 และยีนß tubulin เป็นเป้าหมายขยายการวิเคราะห์เปรียบเทียบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การทดลองทางคลินิกมักจะถูกท้าทายด้วยการระบุแม่พิมพ์ ในทางตรงกันข้ามกับเชื้อแบคทีเรียหรือเชื้อราแคนดิดาสปีชีส์ซึ่งจะมีการระบุบนพื้นฐานของคุณสมบัติทางชีวเคมีบัตรประจำตัวแม่พิมพ์ส่วนใหญ่จะขึ้นอยู่กับเกณฑ์ฟีโนไทป์ สายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องหรือสายพันธุ์ฟีโนไทป์อาจจะ misidentified และพันธุ์หายากอาจจะยังคงไม่ปรากฏหลักฐาน เป็นผลให้วิธีการในระดับโมเลกุลได้รับการพัฒนาเพื่อเอาชนะปัญหาเหล่านี้และการวิเคราะห์ลำดับเปรียบเทียบถือว่าเป็นตอนนี้เทคนิคการระบุมาตรฐานทองคำ [4, 5].
spacer คัดลอกภายใน (ITS) ภูมิภาคเป็นเป้าหมายที่ใช้กันมากที่สุดสำหรับการจัดลำดับในทางคลินิก ห้องปฏิบัติการเพราะผลประโยชน์ดังต่อไปนี้: (i) หลายชุดของยีนโซมอลที่มีอยู่ในชีวิตทุกชนิดที่ช่วยให้การตรวจสอบมีความละเอียดอ่อนโดยวิธี PCR และ (ii) ภูมิภาคมีทั้งภูมิภาคอนุรักษ์สูงและไม่แน่นอนและดังนั้นจึงเป็นเป้าหมายที่ดีที่สุด สำหรับการพัฒนาไพรเมอร์ PCR เฉพาะที่เลือกปฏิบัติระหว่างสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด [6-9] อย่างไรก็ตามภูมิภาคอาจจะไม่ให้ความละเอียดสายพันธุ์ระดับสำหรับทุกสายพันธุ์ ในกรณีเช่นนี้เป้าหมายอื่น ๆ เช่นภูมิภาค D1 / D2 ของ subunit 28S, ยีน SS-tubulin หรือแปลยืดตัวปัจจัยยีนอาจพิสูจน์ว่ามีประโยชน์ขึ้นอยู่กับประเภทในคำถาม ในการศึกษาครั้งนี้เราใช้วิธีการโมเลกุลสำหรับการระบุแม่พิมพ์และเมื่อเทียบกับการแสดงของภูมิภาคในภูมิภาค D1 / D2 และยีน SS-tubulin เป็นเป้าหมายการขยายสำหรับการวิเคราะห์เปรียบเทียบลำดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ห้องปฏิบัติการทางคลินิกมักจะท้าทายการแม่พิมพ์ ในทางตรงกันข้ามกับแบคทีเรียหรือเชื้อราชนิดที่ระบุบนพื้นฐานของการศึกษาสมบัติทางชีวเคมี การแม่พิมพ์เป็นส่วนใหญ่ขึ้นอยู่กับเกณฑ์คุณสมบัติ . สายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องหรือใกล้เคียงพันธุ์อาจจะ misidentified และชนิดที่หายากก็ไม่อาจระบุได้ เป็นผลให้วิธีการโมเลกุลได้ถูกพัฒนาขึ้นเพื่อแก้ปัญหาดังกล่าวและการวิเคราะห์ลำดับเปรียบเทียบขณะนี้ถือว่ามาตรฐานทองเทคนิคการจำแนก [ 4 , 5 ]ภายในและ spacer ( ITS ) ภูมิภาคที่ใช้บ่อยที่สุดสำหรับการติดตามเป้าหมายในห้องปฏิบัติการทางคลินิกเพราะประโยชน์ต่อไปนี้ : ( i ) หลายชุดของยีนไรโบโซมอลที่มีอยู่ในสิ่งมีชีวิต ทำให้มีการตรวจสอบดีเอ็นเอ และ ( ii ) พื้นที่ที่มีการอนุรักษ์และตัวแปรของมันมีทั้งภูมิภาค และดังนั้น , เป้าหมายที่เหมาะสมสำหรับการพัฒนาเฉพาะ PCR ไพรเมอร์ที่แบ่งแยกระหว่างที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดชนิด [ 6-9 ] อย่างไรก็ตาม พื้นที่ของตนไม่อาจให้ชนิดระดับความละเอียดทุกชนิด ในบางกรณี เป้าหมายอื่น ๆเช่น D1 / D2 ภูมิภาคของ 28s 1 , ßยีนทูบูลิน หรือยีนที่อาจพิสูจน์ประโยชน์ด้านการแปลการขึ้นอยู่กับสกุลในคำถาม ในการศึกษานี้ เราใช้วิธีโมเลกุลชนิดแม่พิมพ์และเปรียบเทียบสมรรถนะของภูมิภาค , D1 / D2 ภูมิภาค และß - ทิวบูลินเป็นเป้าหมายสำหรับการวิเคราะห์ลำดับยีนแบบเปรียบเทียบ