PCR fragments were obtained using t

PCR fragments were obtained using the REXF1/R2 primers from Solanum species that
had been chosen for their broad genetic diversity and/or used in breeding programs. Every plant
tested gave a 720-bp fragment, which was sequenced and analyzed for SNPs, indels,
heterozygosity, and homozygosity. The resulting sequences were used to create a phylogenetic
tree, which showed four distinct clades. The phylgenetic tree was represented by a clade with
lycopersicum, pimpinelifolium, and cerasiforme, and three others with accessions from chilense,
peruvianum, and habrochaites. Each clade was characterized by unique SNPs and these were
used to make inferences about evolutionary relationships among the Solanum species. These
results also allowed the identification of the origin of sequence at the REX-1 locus in breeding
lines, which can be used by researchers to make predictions about phenotypic characteristics,
such as resistance to root-knot nematodes or begomoviruses.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บางส่วนของ PCR ได้รับการใช้ไพรเมอร์ REXF1/R2 จากสายพันธุ์ Solanum ที่มีสำหรับความหลากหลายพันธุกรรมของพวกเขากว้าง หรือใช้ในโปรแกรมการเพาะพันธุ์ ทุกโรงงานทดสอบให้ส่วน 720 bp ซึ่งถูกเรียงลำดับ และวิเคราะห์ความ SNPs, indelsheterozygosity ก homozygosity ลำดับที่ได้ใช้สร้างเป็น phylogeneticต้นไม้ ซึ่งแสดงให้เห็นว่า clades สี่ ต้น phylgenetic ถูกแทน ด้วย clade ด้วยlycopersicum, pimpinelifolium และ cerasiforme และอื่น ๆ สามกับ accessions จาก chilenseperuvianum และ habrochaites แต่ละ clade ถูกลักษณะ โดยเฉพาะ SNPs และคนเหล่านี้ใช้ทำ inferences เกี่ยวกับวิวัฒนาการความสัมพันธ์ระหว่างสายพันธุ์ Solanum เหล่านี้ผลลัพธ์ยังอนุญาตให้รหัสของจุดเริ่มต้นของลำดับที่โลกัสโพล REX 1 ในพันธุ์บรรทัด ซึ่งสามารถใช้ โดยนักวิจัยต้องคาดคะเนเกี่ยวกับลักษณะไทป์เช่นทนต่อ nematodes รากปมหรือ begomoviruses

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เศษ PCR ที่ได้รับโดยใช้ไพรเมอร์ REXF1 / R2
จากสายพันธุ์มะเขือที่ได้รับเลือกสำหรับความหลากหลายทางพันธุกรรมของพวกเขาในวงกว้างและ/ หรือใช้ในโปรแกรมการปรับปรุงพันธุ์ พืชทุกการทดสอบให้ส่วน 720 bp ซึ่งได้รับการจัดลำดับและวิเคราะห์ SNPs, indels, heterozygosity และ homozygosity ลำดับส่งผลให้ถูกนำมาใช้ในการสร้างสายวิวัฒนาการต้นไม้ซึ่งแสดงให้เห็นสี่ clades ที่แตกต่างกัน ต้นไม้ phylgenetic เป็นตัวแทนโดย clade กับlycopersicum, pimpinelifolium และ cerasiforme และสามคนอื่น ๆ ด้วยสายจาก chilense, peruvianum และ habrochaites clade แต่ละคนก็มีลักษณะที่ไม่ซ้ำกันและ SNPs เหล่านี้ถูกนำมาใช้เพื่อทำให้การหาข้อสรุปเกี่ยวกับความสัมพันธ์ในหมู่วิวัฒนาการสายพันธุ์มะเขือ เหล่านี้ผลยังอนุญาตให้ระบุแหล่งที่มาของลำดับที่สถานที REX-1 ในการผสมพันธุ์ของสายซึ่งสามารถนำมาใช้โดยนักวิจัยที่จะทำให้การคาดการณ์เกี่ยวกับลักษณะฟีโนไทป์, เช่นความต้านทานต่อไส้เดือนฝอยรากปมหรือ begomoviruses

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ชิ้นส่วนดีเอ็นเอที่ได้รับการ rexf1 / R2 ไพรเมอร์จากโซลานัมชนิด
ได้รับเลือกสำหรับความหลากหลายกว้างของพวกเขาและ / หรือใช้ในโปรแกรมการเพาะพันธุ์ ทุกโรงงาน
ทดสอบให้ขนาด 720 BP ซึ่งเป็นลำดับ และวิเคราะห์ snps indels
, , เฉพาะที่ , และ homozygosity . ผลที่ใช้ในการสร้างลำดับ phylogenetic ต้นไม้
ซึ่งพบ 4 clades .ต้นไม้ phylgenetic ถูกแทนด้วย clade ด้วย
lycopersicum pimpinelifolium , และ cerasiforme และสามคนอื่น ๆที่มีตัวอย่างจาก chilense
peruvianum , และ habrochaites . แต่ละ clade มีลักษณะที่เป็นเอกลักษณ์และมี snps
เคยให้ข้อสรุปเกี่ยวกับความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการของโซลานัมชนิด เหล่านี้
ผลลัพธ์ที่ไม่ได้ระบุที่มาของความเชื่อในลำดับที่ rex-1
สายพันธุ์ , ซึ่งสามารถใช้โดยนักวิจัยที่จะทำให้การคาดการณ์เกี่ยวกับลักษณะฟีโนไทป์
, เช่นความต้านทานไส้เดือนฝอยรากปม หรือ begomoviruses .