• Transcription-factor-binding site

• Transcription-factor-binding site (TFBSs) are short sequences near the transcription-start site of each to which specific transcription-factor proteins bind.

• DNAse footprinting is an experimental technique used to identify the DNA region bound by a given transcription factor. It is often used with electrophoretic mobility shift assays (EMSA) to demonstrate specific DNA-protein interactions.

• A position weight matrix (PWM) is a statistical model that represents the frequency at which a DNA sequence motif. These are used for computational prediction of putative TFBSs.

• Phylogenetic footprinting attempts to identify regulatory DNA sequences on the basis of their conservation in an alignment of genomic DNA from different species.

• Cis-regulatory modules are the clusters of TFBSs that regulate each gene, often including multiple site for each transcription factor that regulates the gene.

• ChIP-onchip or ChIP-chip is a recently developed techinqe that uses chromatin immunoprecipitation (ChIP) of transcription factors with their associated DNA, followed by microarray (DNA chip) analysis of the bound DNA sequences.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

• Transcription-ปัจจัยรวมเว็บไซต์ (TFBSs) ลำดับสั้นใกล้ไซต์เริ่มต้น transcription ของแต่ละที่จะผูกโปรตีน transcription ปัจจัยเฉพาะที่ได้• DNAse footprinting เป็นเทคนิคการทดลองที่ใช้เพื่อระบุภูมิภาค DNA ติดตัวให้ transcription มันมักจะใช้กับเห็นด้วยกะ assays (EMSA) แสดงให้เห็นถึงการโต้ตอบเฉพาะดีเอ็นเอโปรตีน• A ตำแหน่งน้ำหนักเมตริกซ์ (PWM) เป็นแบบจำลองทางสถิติที่แสดงถึงความถี่ที่ดีเอ็นเอเป็นลำดับสาระสำคัญ เหล่านี้จะใช้สำหรับการคำนวณการคาดการณ์ของ putative TFBSs• Phylogenetic footprinting พยายามระบุระเบียบลำดับดีเอ็นเอ โดยการอนุรักษ์ในการจัดตำแหน่งของ genomic DNA จากต่างชนิด•กำกับดูแลล่วงหน้าโมดูลคลัสเตอร์ของ TFBSs ที่แต่ละยีน มักจะรวมถึงหลายไซต์สำหรับแต่ละปัจจัย transcription ที่กำหนดยีนควบคุม ได้• Onchip ชิพหรือชิพชิเป็น techinqe สุดที่ใช้ immunoprecipitation โครมาติน (ชิพ) transcription ปัจจัย มีความสัมพันธ์ดีเอ็นเอ ตาม microarray (ดีเอ็นเอชิป) การวิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอที่ถูกผูกไว้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

•เว็บไซต์ถอดความปัจจัยที่มีผลผูกพัน (TFBSs) เป็นลำดับสั้นใกล้เว็บไซต์ถอดความเริ่มต้นของแต่ละที่โปรตีนถอดความปัจจัยเฉพาะผูก. • footprinting DNase เป็นเทคนิคการทดลองใช้ในการระบุพื้นที่ดีเอ็นเอผูกพันตามถอดความปัจจัยที่กำหนด มันมักจะถูกนำมาใช้กับการวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงความคล่องตัว electrophoretic (EMSA) แสดงให้เห็นถึงการมีปฏิสัมพันธ์ดีเอ็นเอโปรตีนที่เฉพาะเจาะจง. •เมทริกซ์น้ำหนักตำแหน่ง (PWM) เป็นแบบจำลองทางสถิติที่แสดงถึงความถี่ที่บรรทัดฐานลำดับดีเอ็นเอ เหล่านี้จะถูกนำมาใช้ในการทำนายการคำนวณของสมมุติ TFBSs. •พยายาม Phylogenetic footprinting เพื่อระบุลำดับดีเอ็นเอกฎระเบียบบนพื้นฐานของการอนุรักษ์ของพวกเขาในการจัดตำแหน่งของดีเอ็นเอจากสายพันธุ์ที่แตกต่างกัน. •โมดูล Cis กำกับดูแลเป็นกลุ่มของ TFBSs ที่ควบคุมยีนแต่ละ มักจะรวมถึงเว็บไซต์หลายถอดความปัจจัยแต่ละที่ควบคุมยีน. •ชิป OnChip หรือ Chip-Chip เป็นพัฒนาเมื่อเร็ว ๆ techinqe ที่ใช้ immunoprecipitation โครมาติ (ชิพ) ของปัจจัยการถอดความกับดีเอ็นเอที่เกี่ยวข้องตาม microarray (ชิปดีเอ็นเอ) การวิเคราะห์ของ ลำดับดีเอ็นเอที่ถูกผูกไว้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

บริการถอดความปัจจัยรวมเว็บไซต์ ( tfbss ) สั้นลำดับใกล้ถอดความเริ่มเว็บไซต์ที่เฉพาะเจาะจงของแต่ละโปรตีนถอดความปัจจัยมัด

บริการตรวจหา ADNase footprinting เป็นการทดลองเทคนิคที่ใช้เพื่อระบุดีเอ็นเอเขตผูกพันให้ถอดความปัจจัยมันมักจะใช้กับยูไนเต็ดเปลี่ยนยีน ( emsa ) แสดงเฉพาะดีเอ็นเอโปรตีนปฏิสัมพันธ์

แต่ละตำแหน่งน้ำหนักเมทริกซ์ ( PWM ) เป็นแบบจำลองทางสถิติที่แสดงถึงความถี่ซึ่งเป็นดีเอ็นเอลำดับบรรทัดฐาน เหล่านี้จะถูกใช้เพื่อการพยากรณ์การคำนวณของการแสดงออก tfbss .

บริการ footprinting ซึ่งพยายามที่จะระบุกฎระเบียบลำดับ DNA บนพื้นฐานของการอนุรักษ์ของพวกเขาในการเรียงตัวของดีเอ็นเอจากสายพันธุ์ที่แตกต่างกัน

- CIS กฎระเบียบต่างๆที่กลุ่มของ tfbss ที่ควบคุมแต่ละยีน มักรวมหลายเว็บไซต์สำหรับแต่ละการถอดความปัจจัยที่ควบคุมยีน .

บริการ onchip ชิปหรือชิปเป็นชิปที่ใช้เมื่อเร็ว ๆนี้พัฒนา techinqe โครมาติน immunoprecipitation ( Chip ) ของพวกเขาที่เกี่ยวข้องกับปัจจัยการถอดความดีเอ็นเอ microarray ( ตามด้วยชิปดีเอ็นเอการวิเคราะห์ดีเอ็นเอ

ไว้ดังนี้