- ข้อความ
- ประวัติศาสตร์
IntroductionMyosins are fundamental
Introduction
Myosins are fundamental myofibrillar proteins found in muscle fibers, and are involved in muscle contraction (Schiaffino & Reggiani, 1996). Myosin molecules comprise two homodimerized heavy chains, two regulatory light chains, and two essential light chains (Weiss & Leinwand, 1996). In particular, the myosin heavy chains (MyHCs) containing the ATP-binding and the actin-binding domains have a major influence on the ATPase activity of myosin, and consequently on the contractile properties of muscle. In mammals, there are various MyHC isoforms with different ATPase activities in skeletal muscle (Lefaucheur et al., 1998). In pigs, four MyHC isoforms (I, IIa, IIx, and IIb) have been identified in adult skeletal muscle (Chang and Fernandes, 1997 and Lefaucheur et al., 1998). They are classified into the slow MyHC isoform (type I) and the fast isoforms (type IIa, IIx, and IIb) based on their ATPase activities and maximum contractile velocities, which increase in the order type I, IIa, IIx, IIb (Galler, Schmitt, & Pette, 1994). The heterogeneity of MyHC isoforms in muscle fibers corresponds to histochemical muscle fiber types, which are classified into slow/oxidative (type I), fast/glycolytic (type IIb), and intermediate (type IIa) (Choi, Ryu, & Kim, 2007). Previous studies have revealed a considerable association of muscle fiber type composition with pork quality traits due to the effects on the postmortem metabolic rate in conversion of muscle to meat (Ryu & Kim, 2005).
Porcine MyHC isoforms are each encoded by a separate gene (Sun, Da Costa, & Chang, 2003). MYH2, MYH1, and MYH4 encode the fast MyHC isoforms IIa, IIx, and IIb, respectively, and are sequentially located in a cluster on porcine chromosome (SSC) 12 ( Davoli et al., 2002). The clustered genomic structure of the fast MyHC isoform genes is completely conserved in humans (chromosome 17) and mice (chromosome 11). In addition, fast MyHC genes show temporal expression patterns that correspond to their order in the cluster during prenatal muscle growth in humans, mice, and pigs ( Sun et al., 2003). Notably, longissimus dorsi (LD) muscle, which is major skeletal muscles in pigs, contain predominantly fast isoforms, and the relative expression levels of fast MyHC genes are closely related to the variation in muscle properties among breeds and individuals ( Gunawan et al., 2007 and Wimmers et al., 2008). In addition, the syntenic genomic cluster region is contained within quantitative trait loci (QTLs) for meat quality ( Luo et al., 2012 and Xiong et al., 2015), and the dynamics of fast MyHC gene expression are closely related to variation of meat quality traits such as muscle pH, meat color, and water holding capacity ( Choi et al., 2007 and Kang et al., 2011).
The coding sequences of the fast MyHC genes are very highly conserved between and within species, and there were few reports of polymorphism in the porcine fast MyHC genes (Chikuni, Tanabe, Muroya, & Nakajima, 2001). Therefore, the possibility of the regulatory DNA element in noncoding region for the orientation of MyHC isoforms was suggested by previous study (Da Costa & Chang, 2005), and it may explain expressional and morphological diversity of the fast MyHC. The objective of this study was to identify polymorphisms in the intergenic region of the fast MyHC gene cluster on SSC 12 and to investigate their effects on muscle fiber characteristics and meat quality traits in Berkshire pigs.
2. Materials and methods
2.1. Sequencing and polymorphism identification
To identify polymorphisms in the fast MyHC cluster and its flanking regions on SSC 12, specific primer sets (Table S1) and breed-specific DNA pools from Berkshire, Duroc, Landrace, and Yorkshire pigs were used for polymerase chain reaction (PCR) amplification. The purified PCR products were directly sequenced using an ABI 3730xl DNA Analyzer (Applied Biosystems, Foster City, CA), and polymorphisms were identified based on the resulting sequence alignments by SeqMan software (DNASTAR, Madison, WI, USA). The identified polymorphisms were named according to the Human Genome Variation Society's nomenclature guidelines.
Myosins are fundamental myofibrillar proteins found in muscle fibers, and are involved in muscle contraction (Schiaffino & Reggiani, 1996). Myosin molecules comprise two homodimerized heavy chains, two regulatory light chains, and two essential light chains (Weiss & Leinwand, 1996). In particular, the myosin heavy chains (MyHCs) containing the ATP-binding and the actin-binding domains have a major influence on the ATPase activity of myosin, and consequently on the contractile properties of muscle. In mammals, there are various MyHC isoforms with different ATPase activities in skeletal muscle (Lefaucheur et al., 1998). In pigs, four MyHC isoforms (I, IIa, IIx, and IIb) have been identified in adult skeletal muscle (Chang and Fernandes, 1997 and Lefaucheur et al., 1998). They are classified into the slow MyHC isoform (type I) and the fast isoforms (type IIa, IIx, and IIb) based on their ATPase activities and maximum contractile velocities, which increase in the order type I, IIa, IIx, IIb (Galler, Schmitt, & Pette, 1994). The heterogeneity of MyHC isoforms in muscle fibers corresponds to histochemical muscle fiber types, which are classified into slow/oxidative (type I), fast/glycolytic (type IIb), and intermediate (type IIa) (Choi, Ryu, & Kim, 2007). Previous studies have revealed a considerable association of muscle fiber type composition with pork quality traits due to the effects on the postmortem metabolic rate in conversion of muscle to meat (Ryu & Kim, 2005).
Porcine MyHC isoforms are each encoded by a separate gene (Sun, Da Costa, & Chang, 2003). MYH2, MYH1, and MYH4 encode the fast MyHC isoforms IIa, IIx, and IIb, respectively, and are sequentially located in a cluster on porcine chromosome (SSC) 12 ( Davoli et al., 2002). The clustered genomic structure of the fast MyHC isoform genes is completely conserved in humans (chromosome 17) and mice (chromosome 11). In addition, fast MyHC genes show temporal expression patterns that correspond to their order in the cluster during prenatal muscle growth in humans, mice, and pigs ( Sun et al., 2003). Notably, longissimus dorsi (LD) muscle, which is major skeletal muscles in pigs, contain predominantly fast isoforms, and the relative expression levels of fast MyHC genes are closely related to the variation in muscle properties among breeds and individuals ( Gunawan et al., 2007 and Wimmers et al., 2008). In addition, the syntenic genomic cluster region is contained within quantitative trait loci (QTLs) for meat quality ( Luo et al., 2012 and Xiong et al., 2015), and the dynamics of fast MyHC gene expression are closely related to variation of meat quality traits such as muscle pH, meat color, and water holding capacity ( Choi et al., 2007 and Kang et al., 2011).
The coding sequences of the fast MyHC genes are very highly conserved between and within species, and there were few reports of polymorphism in the porcine fast MyHC genes (Chikuni, Tanabe, Muroya, & Nakajima, 2001). Therefore, the possibility of the regulatory DNA element in noncoding region for the orientation of MyHC isoforms was suggested by previous study (Da Costa & Chang, 2005), and it may explain expressional and morphological diversity of the fast MyHC. The objective of this study was to identify polymorphisms in the intergenic region of the fast MyHC gene cluster on SSC 12 and to investigate their effects on muscle fiber characteristics and meat quality traits in Berkshire pigs.
2. Materials and methods
2.1. Sequencing and polymorphism identification
To identify polymorphisms in the fast MyHC cluster and its flanking regions on SSC 12, specific primer sets (Table S1) and breed-specific DNA pools from Berkshire, Duroc, Landrace, and Yorkshire pigs were used for polymerase chain reaction (PCR) amplification. The purified PCR products were directly sequenced using an ABI 3730xl DNA Analyzer (Applied Biosystems, Foster City, CA), and polymorphisms were identified based on the resulting sequence alignments by SeqMan software (DNASTAR, Madison, WI, USA). The identified polymorphisms were named according to the Human Genome Variation Society's nomenclature guidelines.
0/5000
IntroductionMyosins are fundamental myofibrillar proteins found in muscle fibers, and are involved in muscle contraction (Schiaffino & Reggiani, 1996). Myosin molecules comprise two homodimerized heavy chains, two regulatory light chains, and two essential light chains (Weiss & Leinwand, 1996). In particular, the myosin heavy chains (MyHCs) containing the ATP-binding and the actin-binding domains have a major influence on the ATPase activity of myosin, and consequently on the contractile properties of muscle. In mammals, there are various MyHC isoforms with different ATPase activities in skeletal muscle (Lefaucheur et al., 1998). In pigs, four MyHC isoforms (I, IIa, IIx, and IIb) have been identified in adult skeletal muscle (Chang and Fernandes, 1997 and Lefaucheur et al., 1998). They are classified into the slow MyHC isoform (type I) and the fast isoforms (type IIa, IIx, and IIb) based on their ATPase activities and maximum contractile velocities, which increase in the order type I, IIa, IIx, IIb (Galler, Schmitt, & Pette, 1994). The heterogeneity of MyHC isoforms in muscle fibers corresponds to histochemical muscle fiber types, which are classified into slow/oxidative (type I), fast/glycolytic (type IIb), and intermediate (type IIa) (Choi, Ryu, & Kim, 2007). Previous studies have revealed a considerable association of muscle fiber type composition with pork quality traits due to the effects on the postmortem metabolic rate in conversion of muscle to meat (Ryu & Kim, 2005).
Porcine MyHC isoforms are each encoded by a separate gene (Sun, Da Costa, & Chang, 2003). MYH2, MYH1, and MYH4 encode the fast MyHC isoforms IIa, IIx, and IIb, respectively, and are sequentially located in a cluster on porcine chromosome (SSC) 12 ( Davoli et al., 2002). The clustered genomic structure of the fast MyHC isoform genes is completely conserved in humans (chromosome 17) and mice (chromosome 11). In addition, fast MyHC genes show temporal expression patterns that correspond to their order in the cluster during prenatal muscle growth in humans, mice, and pigs ( Sun et al., 2003). Notably, longissimus dorsi (LD) muscle, which is major skeletal muscles in pigs, contain predominantly fast isoforms, and the relative expression levels of fast MyHC genes are closely related to the variation in muscle properties among breeds and individuals ( Gunawan et al., 2007 and Wimmers et al., 2008). In addition, the syntenic genomic cluster region is contained within quantitative trait loci (QTLs) for meat quality ( Luo et al., 2012 and Xiong et al., 2015), and the dynamics of fast MyHC gene expression are closely related to variation of meat quality traits such as muscle pH, meat color, and water holding capacity ( Choi et al., 2007 and Kang et al., 2011).
The coding sequences of the fast MyHC genes are very highly conserved between and within species, and there were few reports of polymorphism in the porcine fast MyHC genes (Chikuni, Tanabe, Muroya, & Nakajima, 2001). Therefore, the possibility of the regulatory DNA element in noncoding region for the orientation of MyHC isoforms was suggested by previous study (Da Costa & Chang, 2005), and it may explain expressional and morphological diversity of the fast MyHC. The objective of this study was to identify polymorphisms in the intergenic region of the fast MyHC gene cluster on SSC 12 and to investigate their effects on muscle fiber characteristics and meat quality traits in Berkshire pigs.
2. Materials and methods
2.1. Sequencing and polymorphism identification
To identify polymorphisms in the fast MyHC cluster and its flanking regions on SSC 12, specific primer sets (Table S1) and breed-specific DNA pools from Berkshire, Duroc, Landrace, and Yorkshire pigs were used for polymerase chain reaction (PCR) amplification. The purified PCR products were directly sequenced using an ABI 3730xl DNA Analyzer (Applied Biosystems, Foster City, CA), and polymorphisms were identified based on the resulting sequence alignments by SeqMan software (DNASTAR, Madison, WI, USA). The identified polymorphisms were named according to the Human Genome Variation Society's nomenclature guidelines.
Porcine MyHC isoforms are each encoded by a separate gene (Sun, Da Costa, & Chang, 2003). MYH2, MYH1, and MYH4 encode the fast MyHC isoforms IIa, IIx, and IIb, respectively, and are sequentially located in a cluster on porcine chromosome (SSC) 12 ( Davoli et al., 2002). The clustered genomic structure of the fast MyHC isoform genes is completely conserved in humans (chromosome 17) and mice (chromosome 11). In addition, fast MyHC genes show temporal expression patterns that correspond to their order in the cluster during prenatal muscle growth in humans, mice, and pigs ( Sun et al., 2003). Notably, longissimus dorsi (LD) muscle, which is major skeletal muscles in pigs, contain predominantly fast isoforms, and the relative expression levels of fast MyHC genes are closely related to the variation in muscle properties among breeds and individuals ( Gunawan et al., 2007 and Wimmers et al., 2008). In addition, the syntenic genomic cluster region is contained within quantitative trait loci (QTLs) for meat quality ( Luo et al., 2012 and Xiong et al., 2015), and the dynamics of fast MyHC gene expression are closely related to variation of meat quality traits such as muscle pH, meat color, and water holding capacity ( Choi et al., 2007 and Kang et al., 2011).
The coding sequences of the fast MyHC genes are very highly conserved between and within species, and there were few reports of polymorphism in the porcine fast MyHC genes (Chikuni, Tanabe, Muroya, & Nakajima, 2001). Therefore, the possibility of the regulatory DNA element in noncoding region for the orientation of MyHC isoforms was suggested by previous study (Da Costa & Chang, 2005), and it may explain expressional and morphological diversity of the fast MyHC. The objective of this study was to identify polymorphisms in the intergenic region of the fast MyHC gene cluster on SSC 12 and to investigate their effects on muscle fiber characteristics and meat quality traits in Berkshire pigs.
2. Materials and methods
2.1. Sequencing and polymorphism identification
To identify polymorphisms in the fast MyHC cluster and its flanking regions on SSC 12, specific primer sets (Table S1) and breed-specific DNA pools from Berkshire, Duroc, Landrace, and Yorkshire pigs were used for polymerase chain reaction (PCR) amplification. The purified PCR products were directly sequenced using an ABI 3730xl DNA Analyzer (Applied Biosystems, Foster City, CA), and polymorphisms were identified based on the resulting sequence alignments by SeqMan software (DNASTAR, Madison, WI, USA). The identified polymorphisms were named according to the Human Genome Variation Society's nomenclature guidelines.
การแปล กรุณารอสักครู่..
บทนำMyosins เป็นโปรตีนกล้ามเนื้อพื้นฐานที่พบในเส้นใยกล้ามเนื้อและมีส่วนร่วมในการหดตัวของกล้ามเนื้อ (Schiaffino และ Reggiani, 1996) โมเลกุล myosin ประกอบด้วยสองโซ่หนัก homodimerized สองโซ่แสงกฎระเบียบและสองโซ่แสงที่จำเป็น (ไวส์และ Leinwand, 1996) โดยเฉพาะอย่างยิ่ง myosin โซ่หนัก (MyHCs) ที่มีเอทีพีผูกพันและโดเมนโปรตีนผูกพันมีอิทธิพลสำคัญกับกิจกรรม ATPase ของ myosin และส่งผลต่อคุณสมบัติการหดตัวของกล้ามเนื้อ ในการเลี้ยงลูกด้วยนมที่มีไอโซฟอร์ม MyHC ต่างๆที่มีกิจกรรม ATPase แตกต่างกันในกล้ามเนื้อโครงร่าง (Lefaucheur et al., 1998) ในสุกรสี่ไอโซฟอร์ม MyHC (ผม IIa, IIx และ IIb) ได้รับการระบุไว้ในกล้ามเนื้อโครงร่างผู้ใหญ่ (ช้างและเฟอร์นันเดปี 1997 และ Lefaucheur et al., 1998) พวกเขาจะแบ่งออกเป็นไอโซฟอร์ม MyHC ช้า (type I) และไอโซฟอร์มได้อย่างรวดเร็ว (ชนิด IIa, IIx และ IIb) ตามกิจกรรม ATPase ของพวกเขาและความเร็วที่หดตัวสูงสุดซึ่งเพิ่มขึ้นในรูปแบบคำสั่งฉัน IIa, IIx, IIb (แกลเลอรี ซมิตและ Pette, 1994) ความแตกต่างของไอโซฟอร์ม MyHC ในเส้นใยกล้ามเนื้อที่สอดคล้องกับประเภทเส้นใยกล้ามเนื้อฮีสโตเคมีซึ่งจะแบ่งออกเป็นช้า / ออกซิเดชัน (ชนิด I) ได้อย่างรวดเร็ว / glycolytic (ชนิด IIb) และกลาง (ชนิด IIa) (ชอยรและคิม 2007 ) การศึกษาก่อนหน้านี้ได้เผยให้เห็นความสัมพันธ์มากขององค์ประกอบประเภทเส้นใยกล้ามเนื้อมีลักษณะที่มีคุณภาพเนื้อหมูเนื่องจากการที่มีผลต่ออัตราการเผาผลาญการชันสูตรศพในแปลงของกล้ามเนื้อเนื้อ (รและคิม 2005). ไอโซฟอร์มสุกร MyHC แต่ละเข้ารหัสโดยยีนที่แยกต่างหาก ( ซันดาคอสตาและช้าง, 2003) MYH2, MYH1 และ MYH4 เข้ารหัส MyHC รวดเร็วไอโซฟอร์ม IIa, IIx และ IIb ตามลำดับและจะอยู่ตามลำดับในคลัสเตอร์บนโครโมโซมสุกร (SSC) 12 (Davoli et al., 2002) โครงสร้างจีโนมของคลัสเตอร์ MyHC รวดเร็วยีนไอโซฟอร์มเป็นป่าสงวนสมบูรณ์ในมนุษย์ (โครโมโซม 17) และเมาส์ (โครโมโซม 11) นอกจากนี้ยีน MyHC รวดเร็วแสดงรูปแบบการแสดงออกชั่วคราวที่สอดคล้องกับคำสั่งของพวกเขาในคลัสเตอร์ระหว่างการเจริญเติบโตของกล้ามเนื้อก่อนคลอดในมนุษย์หนูและหมู (Sun et al., 2003) ยวด longissimus dorsi (LD) ของกล้ามเนื้อซึ่งเป็นกล้ามเนื้อโครงร่างที่สำคัญในสุกรมีไอโซฟอร์มได้อย่างรวดเร็วส่วนใหญ่และระดับการแสดงออกความสัมพันธ์ของยีนได้อย่างรวดเร็ว MyHC มีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับการเปลี่ยนแปลงในคุณสมบัติของกล้ามเนื้อระหว่างสายพันธุ์และบุคคล (Gunawan et al., ปี 2007 และ Wimmers et al., 2008) นอกจากนี้ภูมิภาคกลุ่มจีโนม syntenic ที่มีอยู่ในตำแหน่งลักษณะเชิงปริมาณ (QTLs) สำหรับคุณภาพเนื้อ (Luo et al., 2012 และ Xiong et al., 2015) และการเปลี่ยนแปลงของการแสดงออก MyHC รวดเร็วของยีนที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับการเปลี่ยนแปลงของ ลักษณะคุณภาพเนื้อเช่นค่า pH ของกล้ามเนื้อสีเนื้อและน้ำถือครองความจุ (Choi et al., 2007 และ Kang et al., 2011). ลำดับการเข้ารหัสของยีน MyHC อย่างรวดเร็วมีความอนุรักษ์สูงภายในและระหว่างสายพันธุ์และมี รายงานบางส่วนของความแตกต่างใน MyHC รวดเร็วหมูยีน (Chikuni ทานาเบะ, Muroya และจิมา, 2001) ดังนั้นความเป็นไปได้ขององค์ประกอบดีเอ็นเอการกำกับดูแลในภูมิภาค noncoding สำหรับการวางแนวของไอโซฟอร์ม MyHC ที่ถูกแนะนำโดยการศึกษาก่อนหน้า (ดาคอสตาและช้าง, 2005) และมันอาจจะอธิบายความหลากหลาย expressional และลักษณะทางสัณฐานวิทยาของ MyHC รวดเร็ว วัตถุประสงค์ของการศึกษาครั้งนี้คือการระบุความหลากหลายในภูมิภาค intergenic ของกลุ่มยีนรวดเร็ว MyHC หลักทรัพย์ SSC ที่ 12 และเพื่อศึกษาผลของพวกเขาในลักษณะกล้ามเนื้อและลักษณะคุณภาพเนื้อสุกรใน Berkshire. 2 วัสดุและวิธีการ2.1 ลำดับและการระบุความแตกต่างเพื่อระบุความหลากหลายในกลุ่ม MyHC รวดเร็วและภูมิภาคขนาบข้างที่มีต่อเอสเอส 12 ชุดไพรเมอร์ที่เฉพาะเจาะจง (ตาราง S1) และพันธุ์เฉพาะสระว่ายน้ำดีเอ็นเอจากเบิร์กเชียร์ Duroc, แลนด์เรซและหมูยอร์คถูกนำมาใช้สำหรับการเกิดปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอร์ ( PCR) ขยาย บริสุทธิ์ผลิตภัณฑ์ PCR มีลำดับขั้นตอนโดยตรงใช้ ABI 3730xl วิเคราะห์ดีเอ็นเอ (Applied Biosystems, ฟอสเตอร์ซิตี, แคลิฟอร์เนีย) และความหลากหลายที่ถูกระบุอยู่บนพื้นฐานของการจัดแนวลำดับส่งผลให้ซอฟต์แวร์ SeqMan (DNASTAR เมดิสันวิสคอนซินสหรัฐอเมริกา) หลากหลายระบุชื่อตามที่จีโนมมนุษย์การเปลี่ยนแปลงของสังคมแนวทางการตั้งชื่อ
การแปล กรุณารอสักครู่..
แนะนำ
myosins พื้นฐานลดลง โปรตีนที่พบในเส้นใยกล้ามเนื้อ และเกี่ยวข้องกับการหดตัวของกล้ามเนื้อ ( schiaffino & reggiani , 1996 ) โมเลกุลที่ประกอบด้วยสอง homodimerized myosin โซ่หนัก สองโซ่แสงกฎระเบียบและสองที่สำคัญโซ่แสง ( ไว& leinwand , 1996 ) โดยเฉพาะอย่างยิ่งช่วงไมโอซีนหนักโซ่ ( myhcs ) ซึ่ง ATP รวมและโปรตีนในกล้ามเนื้อมัดโดเมนมีอิทธิพลหลักในกิจกรรมของโปรตีนไมโอซิน และดังนั้นบน คุณสมบัติด้านการหดตัวของกล้ามเนื้อ ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม มีกิจกรรมต่าง ๆที่มีผลต่อ myhc แตกต่างกันกล้ามเนื้อลาย ( lefaucheur et al . , 1998 ) ในสุกรต่อสี่ myhc ( IIa iix , , ,ด้วย ) และได้รับการระบุในผู้ใหญ่กล้ามเนื้อลาย ( ชาง และ เฟอร์นานเดส , 1997 และ lefaucheur et al . , 1998 ) พวกเขาจะจัดในไอโซฟอร์ม myhc ช้า ( Type I ) และต่ออย่างรวดเร็ว ( ชนิด IIa iix , และด้วย ) ตามกิจกรรม ATPase และสูงสุดที่ความเร็วที่เพิ่มขึ้นในสินค้าประเภท IIa iix ด้วย , , , ( กอลเลอร์ชมิตต์ , & pette , 2537 )มีความหลากหลายของ myhc ไอโซฟอร์มในเส้นใยกล้ามเนื้อกับเส้นใยกล้ามเนื้อชนิดเอ ซึ่งจะแบ่งเป็นช้า / ออกซิเดชัน ( ประเภท ) , รวดเร็ว / glycolytic ( พิมพ์ด้วย ) และระดับกลาง ( ชนิด IIa ) ( ชอย ริว &คิม , 2007 )ก่อนหน้านี้มีการศึกษาพบความสัมพันธ์มากของเส้นใยกล้ามเนื้อชนิดองค์ประกอบที่มีลักษณะคุณภาพเนื้อสุกรเนื่องจากผลการชันสูตรศพในการแปลงอัตราการเผาผลาญของกล้ามเนื้อ ( ริว&คิม , 2005 ) .
จาก myhc ต่อแต่ละเข้ารหัสโดยแยกยีน ( ซุน ดา คอสต้า &ช้าง , 2003 ) myh2 myh1 , และ myh4 เข้ารหัส myhc ต่อ iix จัดขึ้นอย่างรวดเร็ว , และด้วยตามลำดับและมีความสามารถอยู่ในกลุ่มบนโครโมโซมเลือดหมู ( SSC ) 12 ( davoli et al . , 2002 ) ซึ่งเป็นกลุ่มที่มีโครงสร้างของ myhc อย่างรวดเร็วไอโซฟอร์มสมบูรณ์อนุรักษ์ยีนในมนุษย์ ( โครโมโซมคู่ที่ 17 ) และ หนู ( โครโมโซมคู่ที่ 11 ) นอกจากนี้ยีน myhc อย่างรวดเร็วแสดงสีหน้าและลวดลายที่สอดคล้องกับสินค้าของตนในกลุ่มในช่วงการเจริญเติบโตของกล้ามเนื้อท้องในมนุษย์ หนูหมู ( Sun et al . , 2003 ) โดย โคเมารถ ( LD ) กล้ามเนื้อซึ่งเป็นหลักกล้ามเนื้อโครงร่างในสุกรประกอบด้วยความเด่นต่ออย่างรวดเร็ว และสัมพันธ์กับระดับการแสดงออกของยีน myhc อย่างรวดเร็วที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับการเปลี่ยนแปลงในกล้ามเนื้อ คุณสมบัติของสายพันธุ์และบุคคล ( gunawan et al . , 2007 และ wimmers et al . , 2008 ) นอกจากนี้การ syntenic เขตกลุ่มที่มีบรรจุอยู่ในรูปแบบเชิงคุณลักษณะ ( ยีน ) เนื้อแดง ( Luo et al . , 2012 และสง et al . , 2015 ) และการเปลี่ยนแปลงของการแสดงออกของยีน myhc อย่างรวดเร็วที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับการเปลี่ยนแปลงของลักษณะคุณภาพเนื้อ เช่น เนื้อสี เนื้อ และน้ำความจุถือ ( ชอย et al . , 2007 และคัง et al . , 2011 ) .
การเขียนลำดับของยีน myhc อย่างรวดเร็วมากที่มีการอนุรักษ์ระหว่างและภายในชนิด และมีกี่รายงานของความหลากหลายในยีน myhc อย่างรวดเร็ว ( เลือดหมู ชิคูนิ ( muroya &นาคาจิมะ , , , , 2001 ) ดังนั้น ความเป็นไปได้ขององค์ประกอบในด้านดีเอ็นเอ noncoding เขตสำหรับการ myhc ไอโซฟอร์มเป็นข้อเสนอแนะโดยการศึกษาก่อนหน้านี้ ( Da Costa &ชาง , 2005 )และมันอาจจะอธิบาย expressional สัณฐานวิทยาและความหลากหลายของ myhc อย่างรวดเร็ว การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาความหลากหลายในภูมิภาคส่าของกลุ่มยีน myhc อย่างรวดเร็วใน SSC 12 และเพื่อศึกษาผลกระทบต่อลักษณะเส้นใยกล้ามเนื้อ และลักษณะคุณภาพเนื้อในสุกร .
2 วัสดุและวิธีการ
2.1 . การจัดลำดับและ
)ระบุความหลากหลายในกลุ่ม myhc อย่างรวดเร็วและ flanking ภูมิภาคใน SSC 12 ชุดไพรเมอร์จำเพาะ ( ตาราง S1 ) และพันธุ์พูลดีเอ็นเอเฉพาะจาก Berkshire ดูร็อคแลนด์เรซและยอร์คเชียร์ , สุกร ใช้เทคนิคพีซีอาร์ ( PCR ) ที่ขยาย . และเทคนิคผลิตภัณฑ์ได้โดยตรง นี้ใช้อบิ 3730xl ดีเอ็นเอวิเคราะห์ ( Applied Biosystems ฟอสเตอร์ ซิตี้ , แคลิฟอร์เนีย )ความหลากหลายและถูกระบุตามลำดับ การทำให้ซอฟต์แวร์ seqman ( dnastar เมดิสัน , WI , USA ) ระบุความหลากหลายถูกตั้งชื่อตามแนวทางระบบการจีโนมมนุษย์การเปลี่ยนแปลง ของสังคม
myosins พื้นฐานลดลง โปรตีนที่พบในเส้นใยกล้ามเนื้อ และเกี่ยวข้องกับการหดตัวของกล้ามเนื้อ ( schiaffino & reggiani , 1996 ) โมเลกุลที่ประกอบด้วยสอง homodimerized myosin โซ่หนัก สองโซ่แสงกฎระเบียบและสองที่สำคัญโซ่แสง ( ไว& leinwand , 1996 ) โดยเฉพาะอย่างยิ่งช่วงไมโอซีนหนักโซ่ ( myhcs ) ซึ่ง ATP รวมและโปรตีนในกล้ามเนื้อมัดโดเมนมีอิทธิพลหลักในกิจกรรมของโปรตีนไมโอซิน และดังนั้นบน คุณสมบัติด้านการหดตัวของกล้ามเนื้อ ในสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม มีกิจกรรมต่าง ๆที่มีผลต่อ myhc แตกต่างกันกล้ามเนื้อลาย ( lefaucheur et al . , 1998 ) ในสุกรต่อสี่ myhc ( IIa iix , , ,ด้วย ) และได้รับการระบุในผู้ใหญ่กล้ามเนื้อลาย ( ชาง และ เฟอร์นานเดส , 1997 และ lefaucheur et al . , 1998 ) พวกเขาจะจัดในไอโซฟอร์ม myhc ช้า ( Type I ) และต่ออย่างรวดเร็ว ( ชนิด IIa iix , และด้วย ) ตามกิจกรรม ATPase และสูงสุดที่ความเร็วที่เพิ่มขึ้นในสินค้าประเภท IIa iix ด้วย , , , ( กอลเลอร์ชมิตต์ , & pette , 2537 )มีความหลากหลายของ myhc ไอโซฟอร์มในเส้นใยกล้ามเนื้อกับเส้นใยกล้ามเนื้อชนิดเอ ซึ่งจะแบ่งเป็นช้า / ออกซิเดชัน ( ประเภท ) , รวดเร็ว / glycolytic ( พิมพ์ด้วย ) และระดับกลาง ( ชนิด IIa ) ( ชอย ริว &คิม , 2007 )ก่อนหน้านี้มีการศึกษาพบความสัมพันธ์มากของเส้นใยกล้ามเนื้อชนิดองค์ประกอบที่มีลักษณะคุณภาพเนื้อสุกรเนื่องจากผลการชันสูตรศพในการแปลงอัตราการเผาผลาญของกล้ามเนื้อ ( ริว&คิม , 2005 ) .
จาก myhc ต่อแต่ละเข้ารหัสโดยแยกยีน ( ซุน ดา คอสต้า &ช้าง , 2003 ) myh2 myh1 , และ myh4 เข้ารหัส myhc ต่อ iix จัดขึ้นอย่างรวดเร็ว , และด้วยตามลำดับและมีความสามารถอยู่ในกลุ่มบนโครโมโซมเลือดหมู ( SSC ) 12 ( davoli et al . , 2002 ) ซึ่งเป็นกลุ่มที่มีโครงสร้างของ myhc อย่างรวดเร็วไอโซฟอร์มสมบูรณ์อนุรักษ์ยีนในมนุษย์ ( โครโมโซมคู่ที่ 17 ) และ หนู ( โครโมโซมคู่ที่ 11 ) นอกจากนี้ยีน myhc อย่างรวดเร็วแสดงสีหน้าและลวดลายที่สอดคล้องกับสินค้าของตนในกลุ่มในช่วงการเจริญเติบโตของกล้ามเนื้อท้องในมนุษย์ หนูหมู ( Sun et al . , 2003 ) โดย โคเมารถ ( LD ) กล้ามเนื้อซึ่งเป็นหลักกล้ามเนื้อโครงร่างในสุกรประกอบด้วยความเด่นต่ออย่างรวดเร็ว และสัมพันธ์กับระดับการแสดงออกของยีน myhc อย่างรวดเร็วที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับการเปลี่ยนแปลงในกล้ามเนื้อ คุณสมบัติของสายพันธุ์และบุคคล ( gunawan et al . , 2007 และ wimmers et al . , 2008 ) นอกจากนี้การ syntenic เขตกลุ่มที่มีบรรจุอยู่ในรูปแบบเชิงคุณลักษณะ ( ยีน ) เนื้อแดง ( Luo et al . , 2012 และสง et al . , 2015 ) และการเปลี่ยนแปลงของการแสดงออกของยีน myhc อย่างรวดเร็วที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับการเปลี่ยนแปลงของลักษณะคุณภาพเนื้อ เช่น เนื้อสี เนื้อ และน้ำความจุถือ ( ชอย et al . , 2007 และคัง et al . , 2011 ) .
การเขียนลำดับของยีน myhc อย่างรวดเร็วมากที่มีการอนุรักษ์ระหว่างและภายในชนิด และมีกี่รายงานของความหลากหลายในยีน myhc อย่างรวดเร็ว ( เลือดหมู ชิคูนิ ( muroya &นาคาจิมะ , , , , 2001 ) ดังนั้น ความเป็นไปได้ขององค์ประกอบในด้านดีเอ็นเอ noncoding เขตสำหรับการ myhc ไอโซฟอร์มเป็นข้อเสนอแนะโดยการศึกษาก่อนหน้านี้ ( Da Costa &ชาง , 2005 )และมันอาจจะอธิบาย expressional สัณฐานวิทยาและความหลากหลายของ myhc อย่างรวดเร็ว การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาความหลากหลายในภูมิภาคส่าของกลุ่มยีน myhc อย่างรวดเร็วใน SSC 12 และเพื่อศึกษาผลกระทบต่อลักษณะเส้นใยกล้ามเนื้อ และลักษณะคุณภาพเนื้อในสุกร .
2 วัสดุและวิธีการ
2.1 . การจัดลำดับและ
)ระบุความหลากหลายในกลุ่ม myhc อย่างรวดเร็วและ flanking ภูมิภาคใน SSC 12 ชุดไพรเมอร์จำเพาะ ( ตาราง S1 ) และพันธุ์พูลดีเอ็นเอเฉพาะจาก Berkshire ดูร็อคแลนด์เรซและยอร์คเชียร์ , สุกร ใช้เทคนิคพีซีอาร์ ( PCR ) ที่ขยาย . และเทคนิคผลิตภัณฑ์ได้โดยตรง นี้ใช้อบิ 3730xl ดีเอ็นเอวิเคราะห์ ( Applied Biosystems ฟอสเตอร์ ซิตี้ , แคลิฟอร์เนีย )ความหลากหลายและถูกระบุตามลำดับ การทำให้ซอฟต์แวร์ seqman ( dnastar เมดิสัน , WI , USA ) ระบุความหลากหลายถูกตั้งชื่อตามแนวทางระบบการจีโนมมนุษย์การเปลี่ยนแปลง ของสังคม
การแปล กรุณารอสักครู่..
ภาษาอื่น ๆ
การสนับสนุนเครื่องมือแปลภาษา: กรีก, กันนาดา, กาลิเชียน, คลิงออน, คอร์สิกา, คาซัค, คาตาลัน, คินยารวันดา, คีร์กิซ, คุชราต, จอร์เจีย, จีน, จีนดั้งเดิม, ชวา, ชิเชวา, ซามัว, ซีบัวโน, ซุนดา, ซูลู, ญี่ปุ่น, ดัตช์, ตรวจหาภาษา, ตุรกี, ทมิฬ, ทาจิก, ทาทาร์, นอร์เวย์, บอสเนีย, บัลแกเรีย, บาสก์, ปัญจาป, ฝรั่งเศส, พาชตู, ฟริเชียน, ฟินแลนด์, ฟิลิปปินส์, ภาษาอินโดนีเซี, มองโกเลีย, มัลทีส, มาซีโดเนีย, มาราฐี, มาลากาซี, มาลายาลัม, มาเลย์, ม้ง, ยิดดิช, ยูเครน, รัสเซีย, ละติน, ลักเซมเบิร์ก, ลัตเวีย, ลาว, ลิทัวเนีย, สวาฮิลี, สวีเดน, สิงหล, สินธี, สเปน, สโลวัก, สโลวีเนีย, อังกฤษ, อัมฮาริก, อาร์เซอร์ไบจัน, อาร์เมเนีย, อาหรับ, อิกโบ, อิตาลี, อุยกูร์, อุสเบกิสถาน, อูรดู, ฮังการี, ฮัวซา, ฮาวาย, ฮินดี, ฮีบรู, เกลิกสกอต, เกาหลี, เขมร, เคิร์ด, เช็ก, เซอร์เบียน, เซโซโท, เดนมาร์ก, เตลูกู, เติร์กเมน, เนปาล, เบงกอล, เบลารุส, เปอร์เซีย, เมารี, เมียนมา (พม่า), เยอรมัน, เวลส์, เวียดนาม, เอสเปอแรนโต, เอสโทเนีย, เฮติครีโอล, แอฟริกา, แอลเบเนีย, โคซา, โครเอเชีย, โชนา, โซมาลี, โปรตุเกส, โปแลนด์, โยรูบา, โรมาเนีย, โอเดีย (โอริยา), ไทย, ไอซ์แลนด์, ไอร์แลนด์, การแปลภาษา.
- แล้วฉันจะยอมคุณ
- วันนี้ รู้สึกเจ็บตรงหน้าอกอย่างลึกๆเดิน
- interested
- วันนี้ รู้สึกเจ็บตรงหน้าอกอย่างลึกๆเดิน
- Global warming is increasing of extreme
- คืออะไรAno ang
- Hi Honey i tinking about You
- มีหลายคู่ที่ฉันขายอยู่
- This scale, which was prepared by Arslan
- She knows who to harm me. She quite accu
- math
- it may be in a preceding
- it may be
- 你怎么说汉语这么好 原来你是中国人
- self-made equipment
- วีดิโอออนไลน์อะไรที่คุณดู
- The coarser gluten fibrils indicated the
- Simply
- cover way
- น้ำเต้าหู้
- ทำงานพาสทาม
- I want to be
- Right lobes
- ฉันอยากกลับนิวยอร์ก
