AbstractDamask Rose (Rosa damascena

Abstract
Damask Rose (Rosa damascena; Family Rosaceace) is one of the most expensive essential oil bearing crops of many countries including India. A previously undescribed “rose witches'-broom” infestation was detected and exhibited symptoms of little leaf, apical proliferation and chlorosis during winter season in the experimental farms of CSIR-CIMAP, Lucknow (India). Samples from the healthy and infected plants were collected and indexed by PCR using the generic primer pairs P1/P6 and R16F2n/R16R2. The nested PCR product was cloned, sequenced and phytoplasma detected. The 16S rRNA gene sequence revealed that present phytoplasma showed maximum similarity of 97–98% with Candidatus Phytoplasma balanitae (HG937644), Balanites triflora' witches'-broom phytoplasma (BltWB) (AB689678) and Periwinkle yellows phytoplasma (EU375835), as well as other members of 16SrV group. Phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene sequences of phytoplasma from Damask rose clustered with 16SrV phytoplasma group. However, computer-simulated RFLP analysis revealed unique profile of the phytoplasma sequence from rose with BamHI, HpaI and MseI and distinguished it from Periwinkle phytoplasma, Ca. P. Balanitae, Balanites triflora' witches'-broom phytoplasma and all previously described ‘Candidatus Phytoplasma’ of 16SrV groups. Further, the pattern similarity coefficient value was 0.55, lower than 0.85 with the representative phytoplasmas classified previously in 16SrV groups. Taking into consideration the unique plant host, RFLP profile and the restricted geographical occurrence in addition to the 16S rRNA gene sequence, the present phytoplasma is proposed to be rose witches'-broom phytoplasma representing a novel taxon 16SrV-B1. This is the first record of phytoplasma infection on Damask Rose from India

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทคัดย่อDamask Rose (Rosa damascena; Family Rosaceace) is one of the most expensive essential oil bearing crops of many countries including India. A previously undescribed “rose witches'-broom” infestation was detected and exhibited symptoms of little leaf, apical proliferation and chlorosis during winter season in the experimental farms of CSIR-CIMAP, Lucknow (India). Samples from the healthy and infected plants were collected and indexed by PCR using the generic primer pairs P1/P6 and R16F2n/R16R2. The nested PCR product was cloned, sequenced and phytoplasma detected. The 16S rRNA gene sequence revealed that present phytoplasma showed maximum similarity of 97–98% with Candidatus Phytoplasma balanitae (HG937644), Balanites triflora' witches'-broom phytoplasma (BltWB) (AB689678) and Periwinkle yellows phytoplasma (EU375835), as well as other members of 16SrV group. Phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene sequences of phytoplasma from Damask rose clustered with 16SrV phytoplasma group. However, computer-simulated RFLP analysis revealed unique profile of the phytoplasma sequence from rose with BamHI, HpaI and MseI and distinguished it from Periwinkle phytoplasma, Ca. P. Balanitae, Balanites triflora' witches'-broom phytoplasma and all previously described ‘Candidatus Phytoplasma’ of 16SrV groups. Further, the pattern similarity coefficient value was 0.55, lower than 0.85 with the representative phytoplasmas classified previously in 16SrV groups. Taking into consideration the unique plant host, RFLP profile and the restricted geographical occurrence in addition to the 16S rRNA gene sequence, the present phytoplasma is proposed to be rose witches'-broom phytoplasma representing a novel taxon 16SrV-B1. This is the first record of phytoplasma infection on Damask Rose from India

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อ
กุหลาบมอญ (กุหลาบมอญ; ครอบครัว Rosaceace) เป็นหนึ่งในน้ำมันพืชที่สำคัญแบริ่งที่แพงที่สุดของหลายประเทศรวมทั้งอินเดีย undescribed ก่อนหน้านี้ "กุหลาบ witches'-ไม้กวาด" รบกวนได้รับการตรวจพบและแสดงอาการของใบเล็ก ๆ น้อย ๆ งอกปลายและ chlorosis ในช่วงฤดูหนาวในฟาร์มทดลอง CSIR-CIMAP ลัคเนา (อินเดีย) ตัวอย่างจากพืชที่มีสุขภาพดีและติดเชื้อถูกเก็บรวบรวมและจัดทำดัชนีโดยวิธี PCR โดยใช้คู่ไพรเมอร์ทั่วไป P1 / P6 และ R16F2n / R16R2 ผลิตภัณฑ์ PCR ที่ซ้อนกันเป็นโคลน, ติดใจและ phytoplasma ตรวจพบ ลำดับของยีน 16S rRNA เปิดเผยว่าปัจจุบันพบว่ามีความคล้ายคลึงกัน phytoplasma สูงสุด 97-98% โดยมี candidatus Phytoplasma balanitae (HG937644) Balanites triflora 'phytoplasma witches'-ไม้กวาด (BltWB) (AB689678) และหอยขมสีเหลือง phytoplasma (EU375835) เช่นเดียวกับ สมาชิกคนอื่น ๆ ของกลุ่ม 16SrV การวิเคราะห์วิวัฒนาการของลำดับ 16S rRNA ยีน phytoplasma จากกุหลาบมอญกับกลุ่มคลัสเตอร์ phytoplasma 16SrV อย่างไรก็ตามการวิเคราะห์ RFLP คอมพิวเตอร์จำลองการเปิดเผยรายละเอียดที่ไม่ซ้ำกันของลำดับ phytoplasma จากดอกกุหลาบกับ BamHI, HPAI และ MseI และโดดเด่นได้จากหอยขม phytoplasma แคลิฟอร์เนีย พี Balanitae, Balanites triflora 'phytoplasma witches'-ไม้กวาดและทั้งหมดที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้' candidatus Phytoplasma ของกลุ่ม 16SrV นอกจากนี้ค่าสัมประสิทธิ์การรูปแบบที่คล้ายคลึงกันคือ 0.55 ต่ำกว่า 0.85 ด้วยไฟโตพลาสมาตัวแทนจัดก่อนหน้านี้ในกลุ่ม 16SrV โดยคำนึงถึงโฮสต์พืชที่ไม่ซ้ำกันรายละเอียด RFLP และ จำกัด ทางภูมิศาสตร์ที่เกิดขึ้นนอกเหนือไปจากยีน 16S rRNA ที่ phytoplasma ที่ปัจจุบันถูกเสนอให้มีการปรับตัวสูงขึ้น phytoplasma witches'-ไม้กวาดคิดเป็นนวนิยายแท็กซอน 16SrV-B1 นี้เป็นครั้งแรกที่บันทึกของการติดเชื้อใน phytoplasma กุหลาบมอญจากอินเดีย