treptococcus iniae is the most sign

treptococcus iniae is the most significant bacterial disease of tilapia throughout the world, and commonly leads to tremendous economic losses. In contrast to other important fish species, our knowledge about the molecular mechanisms of tilapia in response to bacterial infection is still limited. Here, therefore, we utilized RNA-seq to first profiling of host responses in tilapia spleen following S. iniae infection at transcriptome level. A total of 223 million reads were obtained and assembled into 192,884 contigs with average length 844 bp. Gene expression analysis between control and infected samples at 5 h, 50 h, and 7 d revealed 1475 differentially expressed genes. In particular, the differentially expressed gene set was dramatically induced as early as 5 h, and rapidly declined to basal levels at 50 h. Enrichment and pathway analysis of the differentially expressed genes revealed the centrality of the pathogen attachment and recognition, cytoskeletal rearrangement and immune activation/inflammation in the pathogen entry and host inflammatory responses. Understanding of these responses can highlight mechanisms of tilapia host defense, and expand our knowledge of teleost immunology. Our findings will set a foundation of valuable biomarkers for future individual, strain, and family-level studies to evaluate immune effect of vaccine and individual response in host defense mechanisms to S. iniae infection, to select disease resistant families and strains.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

treptococcus iniae เป็นโรคแบคทีเรียที่สำคัญของปลานิลทั่วโลก และโดยทั่วไปนำไปสู่การสูญเสียทางเศรษฐกิจอย่างมาก ตรงข้ามพันธุ์ปลาที่สำคัญอื่น ๆ ความรู้ของเราเกี่ยวกับกลไกระดับโมเลกุลของปลานิลในการตอบสนองการติดเชื้อแบคทีเรียจะยังคงจำกัด ที่นี่ ดังนั้น เราใช้อาร์เอ็นเอลำดับการสร้างโพรไฟล์แรกของการตอบสนองของโฮสต์ในม้ามนิลต่อ S. iniae เชื้อระดับ transcriptome จำนวนผู้อ่าน 223 ล้านได้รับ และรวมตัวกันเป็น contigs 192,884 มีความยาวเฉลี่ย 844 bp. วิเคราะห์นิพจน์ยีนระหว่างตัวควบคุมและตัวอย่างติดไวรัส 5 h, 50 h และ 7 d ยีน 1475 differentially แสดงเปิดเผย โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ชุดยีน differentially แสดงเป็นอย่างมากทำให้เกิดก่อนที่เป็น 5 h และปฏิเสธอย่างรวดเร็วเพื่อโรคระดับ h. 50 บ่อและทางเดินการวิเคราะห์ยีน differentially แสดงที่เปิดเผยแห่งแนบการศึกษา และการรับรู้ cytoskeletal rearrangement และเปิดใช้งานภูมิคุ้มกันอักเสบในการศึกษารายการและโฮสต์อักเสบตอบสนอง ความเข้าใจตอบสนองเหล่านี้เน้นกลไกของการป้องกันนิลโฮสต์ และสามารถขยายความรู้ของเราของภูมิคุ้มกันวิทยา teleost ผลการวิจัยของเราจะตั้งมูลนิธิของ biomarkers ที่มีคุณค่าสำหรับบุคคลในอนาคต ต้องใช้ และครอบครัวระดับการศึกษาเพื่อประเมินผลภูมิคุ้มกันของวัคซีนและการตอบสนองแต่ละในโฮสต์กลไกการป้องกันการติดเชื้อ S. iniae เลือกครอบครัวทนโรคและสายพันธุ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

treptococcus iniae เป็นโรคติดเชื้อแบคทีเรียที่สำคัญที่สุดของปลานิลทั่วโลกและมักนำไปสู่​​การสูญเสียทางเศรษฐกิจอย่างมาก ในทางตรงกันข้ามกับปลาชนิดอื่น ๆ ที่สำคัญความรู้ของเราเกี่ยวกับกลไกระดับโมเลกุลของปลานิลในการตอบสนองต่อการติดเชื้อแบคทีเรียที่ยังมีข้อ จำกัด ที่นี่ดังนั้นเราจึงใช้ RNA-หมายเลขโปรไฟล์ที่จะเป็นครั้งแรกของการตอบสนองเป็นเจ้าภาพในม้ามปลานิลต่อไปนี้การติดเชื้อ S. iniae ในระดับยีน รวม 223,000,000 อ่านที่ได้รับและประกอบเป็น 192,884 contigs ที่มีความยาวเฉลี่ย 844 bp การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนระหว่างการควบคุมและการติดเชื้อตัวอย่างที่ 5 ชั่​​วโมง, 50 ชั่วโมงและ 7 เปิดเผย 1,475 ยีนแสดงออกแตกต่างกัน โดยเฉพาะอย่างยิ่งชุดยีนแสดงออกแตกต่างกันอย่างมากได้รับการเหนี่ยวนำให้เกิดเป็นช่วงต้น 5 ชั่​​วโมงและลดลงอย่างรวดเร็วในระดับพื้นฐานที่ 50 ชั่วโมง การวิเคราะห์และการตกแต่งทางเดินของยีนที่แสดงออกแตกต่างกันเปิดเผยศูนย์กลางของสิ่งที่แนบติดเชื้อและการรับรู้, การปรับปรุงใหม่โครงสร้างเซลล์และกระตุ้นภูมิคุ้มกัน / การอักเสบในรายการเชื้อโรคและโฮสต์ตอบสนองการอักเสบ ความเข้าใจในการตอบสนองเหล่านี้สามารถเน้นกลไกของการป้องกันโฮสต์ปลานิลและขยายความรู้ของเราภูมิคุ้มกัน teleost ผลการวิจัยของเราจะตั้งมูลนิธิของ biomarkers ที่มีคุณค่าสำหรับบุคคลในอนาคตความเครียดในครอบครัวและการศึกษาในระดับที่จะประเมินผลกระทบของระบบภูมิคุ้มกันของวัคซีนและการตอบสนองของแต่ละบุคคลในกลไกการป้องกันเป็นเจ้าภาพเอส iniae ติดเชื้อเพื่อเลือกครอบครัวทนโรคและสายพันธุ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

treptococcus iniae เป็นสำคัญที่สุดของแบคทีเรียโรคปลานิล ทั่วโลก และโดยทั่วไปจะนำไปสู่ความสูญเสียทางเศรษฐกิจมหาศาล ในทางตรงกันข้ามกับสายพันธุ์ปลาที่สำคัญอื่น ๆ ความรู้ของเราเกี่ยวกับกลไกระดับโมเลกุลของปลานิลในการตอบสนองต่อการติดเชื้อแบคทีเรียก็มีจำกัด ที่นี่ , ดังนั้นเราใช้ RNA seq เป็นลักษณะการตอบสนองของโฮสต์ในปลานิลม้ามต่อไปนี้ . iniae การติดเชื้อระดับทราน ริปโตม . จำนวน 223 ล้านบาท อ่านได้ และรวมตัวกันเป็น 192884 สูงที่มีความยาวเฉลี่ยคุณบีพี การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนระหว่างการควบคุมและกลุ่มตัวอย่างที่ติดเชื้อ 5 H , 50 H , และ 7 D พบ 843 แสดงออกแตกต่างกันยีน โดยเฉพาะอย่างยิ่งยีนที่แสดงออกแตกต่างกันตั้งเป็นอย่างมากที่เกิดก่อนเป็น 5 ชั่วโมง และลดลงอย่างรวดเร็วในระดับแรกเริ่มที่ 50 ชั่วโมง เสริมและการวิเคราะห์เส้นทางของยีนที่แสดงออกแตกต่างกันพบว่าศูนย์กลางของเชื้อโรคความผูกพันและการรู้จำรูปแบบไซโตร กเลตัล และกระตุ้นภูมิคุ้มกัน / อักเสบ เชื้อโรคเข้าและโฮสต์การตอบสนองการอักเสบความเข้าใจของการตอบสนองเหล่านี้สามารถเน้นกลไกของปลานิลโฮสต์ป้องกัน และขยายความรู้ของเรา teleost วิทยาภูมิคุ้มกัน . การค้นพบของเราจะตั้งรากฐานของความก้าวหน้าที่มีคุณค่าสำหรับบุคคล อนาคต ความเครียดและครอบครัวระดับการศึกษาเพื่อประเมินผลภูมิคุ้มกันของวัคซีนและการตอบสนองของแต่ละบุคคลในกลไกการป้องกันโฮสต์เพื่อ S . iniae การติดเชื้อเพื่อเลือกต้านโรคในครอบครัว และสายพันธุ์