AbstractWhile compiling genetic lin

Abstract

While compiling genetic linkage maps in several plant species based upon restriction fragment length polymorphisms (RFLPs), it was noted that the incidence of polymorphism differs among species. The basis of this disparity was investigated in this study by examining the nucleotide sequence at homologous loci among distinct cultivars within two species which exhibit considerably different levels of RFLPs. Using the polymerase chain reaction, homologous regions from different cultivars were first amplified and the nucleotide sequence of the products were determined. Four genomic regions of seven maize cultivars and three genomic regions of eight melon cultivars were examined to compare the respective levels of sequence variation between the two species. Levels of variation for both base substitutions and insertions/deletions varied widely among the maize sequences and between maize and melon for base substitutions. Estimates of theta (a measure of polymorphism) ranged from 0 to 0.002 in melon and from 0.006 to 0.040 for base substitutions and from 0.002 to 0.023 for insertions/deletions in maize. Critical value tests and chi-squared tests suggested that in maize the underlying processes generating and maintaining neutral mutations differ among the regions. The results not only suggest that several mechanisms are necessary to explain the variation seen in these two species, but also point to some basic dissimilarities in the organization and maintenance of the genomes of different plant species.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทคัดย่อในขณะที่ผังความเชื่อมโยงทางพันธุกรรมที่คอมไพล์ในหลายสปีชีส์พืชตามข้อจำกัดส่วนยาว polymorphisms (RFLPs), มันถูกสังเกตว่า อุบัติการณ์ของโพลิมอร์ฟิซึมแตกสายพันธุ์ พื้นฐานของ disparity นี้ถูกตรวจสอบในการศึกษานี้โดยตรวจสอบลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ homologous loci ระหว่างพันธุ์แตกต่างกันภายในสายพันธุ์ที่สองที่แสดงระดับที่แตกต่างกันมากของ RFLPs โดยใช้ปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรส ภูมิภาค homologous จากพันธุ์อื่นได้ก่อนขยาย และมีกำหนดลำดับของนิวคลีโอไทด์ของผลิตภัณฑ์ 4 ภาค genomic ของพันธุ์ข้าวโพดที่เจ็ดและแคว้น genomic สามแปดแตงโมพันธุ์ถูกตรวจสอบเพื่อเปรียบเทียบระดับตามลำดับของลำดับการเปลี่ยนแปลงระหว่างสองสายพันธุ์ ระดับของการเปลี่ยนแปลงฐานการแทนและการแทรก/ลบแตกต่างกันอย่างกว้างขวาง ระหว่างลำดับข้าวโพด และข้าวโพดและแตงสำหรับฐานแทน ประเมินทีตา (วัดของโพลิมอร์ฟิซึม) อยู่ในช่วง จาก 0 ถึง 0.002 ในแตงโม และ จาก 0.006 จะ 0.040 สำหรับทดแทนฐาน และ 0.002 กับ 0.023 การแทรก/ลบในข้าวโพด ทดสอบค่าวิกฤตและการทดสอบไคสแควร์แนะนำว่า ในข้าวโพด กระบวนการอยู่ภายใต้การสร้าง และรักษากลายพันธุ์กลางแตกต่างกันในขอบเขต ผลไม่เพียงแต่แนะนำว่า กลไกต่าง ๆ จำเป็นต้องอธิบายการเปลี่ยนแปลงที่เห็นในสปีชีส์เหล่านี้สอง แต่ยัง ชี้ไปที่ dissimilarities บางพื้นฐานในองค์กรและการบำรุงรักษา genomes ของสปีชีส์พืชแตกต่างกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อในขณะที่รวบรวมแผนที่เชื่อมโยงทางพันธุกรรมในพืชหลายชนิดขึ้นอยู่กับระยะเวลาในหลากหลายส่วนข้อ จำกัด (RFLPs) ก็ถูกตั้งข้อสังเกตว่าอุบัติการณ์ของหลายรูปแบบที่แตกต่างในหมู่สปีชีส์ พื้นฐานของความแตกต่างนี้ได้รับการตรวจสอบในการศึกษาครั้งนี้โดยการตรวจสอบลำดับเบสที่ตำแหน่งเดียวกันในหมู่สายพันธุ์ที่แตกต่างกันภายในสองสายพันธุ์ที่แสดงระดับที่แตกต่างอย่างมากของ RFLPs ใช้ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลิเมอร์ภูมิภาคเดียวกันจากสายพันธุ์ที่แตกต่างกันถูกขยายเป็นครั้งแรกและลำดับเบสของผลิตภัณฑ์ที่ได้รับการพิจารณา สี่ภูมิภาคจีโนมของเจ็ดพันธุ์ข้าวโพดและภูมิภาคที่สามจีโนมของแปดพันธุ์แตงโมมีการตรวจสอบเพื่อเปรียบเทียบระดับที่เกี่ยวข้องของการเปลี่ยนแปลงลำดับระหว่างสองเผ่าพันธุ์ ระดับของการเปลี่ยนแปลงทั้งการแทนฐานและการแทรก / ลบแตกต่างกันอย่างกว้างขวางในหมู่ลำดับข้าวโพดและระหว่างข้าวโพดและแตงโมแทนสำหรับฐาน ประมาณการของที (ตัวชี้วัดของความแตกต่าง) ตั้งแต่ 0-0.002 ในแตงโมและ 0.006-0.040 สำหรับการแทนฐานและ 0.002-0.023 สำหรับแทรก / ลบในข้าวโพด การทดสอบค่าที่สำคัญและการทดสอบไคสแควร์ชี้ให้เห็นว่าในข้าวโพดกระบวนการพื้นฐานการสร้างและการบำรุงรักษาการกลายพันธุ์ที่เป็นกลางแตกต่างกันระหว่างภูมิภาค ผลไม่เพียง แต่แสดงให้เห็นว่ากลไกหลายมีความจำเป็นที่จะอธิบายการเปลี่ยนแปลงที่เห็นในทั้งสองสายพันธุ์ แต่ยังชี้ให้เห็นความแตกต่างบางขั้นพื้นฐานในองค์กรและการบำรุงรักษาของจีโนมของพันธุ์พืชที่แตกต่างกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

นามธรรม

ในขณะที่การรวบรวมแผนที่พันธุกรรมในพืชชนิดต่าง ๆตามข้อ จำกัด ขนาดความยาวล ( rflps ) , มันเป็นข้อสังเกตว่า อุบัติการณ์ของความหลากหลายแตกต่างระหว่างชนิดพื้นฐานของความแตกต่างนี้ การศึกษานี้เป็นการตรวจสอบโดยการตรวจสอบลำดับนิวคลีโอไทด์ที่คล้ายคลึงกันของพันธุ์ที่แตกต่างกันภายในสองชนิด ซึ่งแสดงระดับที่แตกต่างกันมากของ rflps . การใช้ปฏิกิริยาลูกโซ่ปฏิกิริยาโฮโมโลกัส ภูมิภาค จากพันธุ์ที่แตกต่างกันถูกขยายและลำดับนิวคลีโอไทด์ของผลิตภัณฑ์ถูกกำหนดไว้สี่ภูมิภาคจีโนมของเจ็ดพันธุ์ ข้าวโพดเลี้ยงสัตว์ และสามภูมิภาคจีโนมของแตงโมแปดพันธุ์ได้ศึกษาเปรียบเทียบระดับของลำดับการเกี่ยวข้องระหว่างสองชนิด ระดับของการเปลี่ยนแปลงทั้งฐานแทรก / ลบและแทนที่แตกต่างกันอย่างกว้างขวางในหมู่ข้าวโพดและข้าวโพดและลำดับระหว่างแตงโมเพื่อเปลี่ยนฐานประมาณการของ Theta ( วัด ) ) มีค่าระหว่าง 0 ถึง 0.002 ในแตงโมและ 0.006 ถึง 0.040 สำหรับการทดแทนฐานและ 0.002 ถึง 0.023 สำหรับแทรก / ลบในข้าวโพด การทดสอบค่าวิกฤตและไคกำลังสองในการทดสอบพบว่า ข้าวโพด เป็นต้น กระบวนการการสร้างและรักษาความผิดปกติที่เป็นกลางแตกต่างระหว่างภูมิภาคผลไม่เพียง แต่แนะนำว่า กลไกต่าง ๆที่จำเป็นในการอธิบายการเปลี่ยนแปลงที่เห็นในทั้งสองชนิด แต่ยังจุด dissimilarities พื้นฐานบางอย่างในองค์กรและการบำรุงรักษาของจีโนมของพืชชนิดต่าง ๆ