ผลการวิเคราะห์ตัวอย่างน้ำผิวดินทั้ง 3 ตัวอย่าง แสดงให้เห็นว่าคุณภาพน้ำของคลองแคบส่วนใหญ่ มีค่าอยู่ในเกณฑ์มาตรฐานที่กำหนด ยกเว้นบีโอดีซึ่งทุกสถานีมีค่าเกินมาตรฐานที่กำหนด คือ 2.0 มิลลิกรัมต่อลิตร (ค่ามาตรฐานแหล่งน้ำผิวดินประเภทที่ 3) โดยค่าบีโอดีที่สถานีเหนือน้ำมีค่า 21.0 มิลลิกรัมต่อลิตร ที่จุดระบายน้ำของท่าอากาศยานตรวจพบค่าบีโอดีลดลงมีค่า 16.2 มิลลิกรัมต่อลิตร เมื่อไหลรวมกับน้ำในคลองแคบจนไปถึงจุดท้ายน้ำพบค่าความสกปรกในรูปบีโอดี 9.57 มิลลิกรัมต่อลิตร และค่า BOD มีแนวโน้มลดลงไปตามการไหลของน้ำที่จะช่วยเจือจางความสกปรกลงได้ ทั้งนี้แสดงให้เห็นว่า น้ำในคลองแคบมีการปนเปื้อนมาตั้งแต่ตอนต้นทางก่อนที่จะรองรับน้ำจากท่าอากาศยานนครศรีธรรมราช และเมื่อพิจารณาปริมาณออกซิเจนละลาย ที่สถานีเหนือน้ำมีค่า 7.75 มิลลิกรัมต่อลิตร ที่จุดระบายน้ำมีค่า 8.99 มิลลิกรัมต่อลิตร และที่สถานีท้ายน้ำมีค่า 8.94 มิลลิกรัมต่อลิตร แสดงให้เห็นว่าปริมาณออกซิเจน
ละลายมีแนวโน้มเพิ่มขึ้นไปตามการไหลของน้ำที่จะช่วยเจือจางความสกปรกลงได้เช่นกัน