3.1. BPH has a complete DNA methyla

3.1. BPH has a complete DNA methylation toolkit

Bioinformatics analysis of a BPH transcriptome found fragments of Dnmt1, Dnmt2, and Dnmt3, indicating that BPH may have a complete DNA methylation toolkit. This interesting finding prompted us to amplify their full-length transcripts. We focused on Nlu-Dnmt1 and Nlu-Dnmt3 because they are known to methylate genomic DNA. Using RACE, we obtained the complete cDNA sequences of Nlu-Dnmt1 and Nlu-Dnmt3. The full-length Dnmt1 cDNA is 5729 bp with a 4563-bp open reading frame (ORF), a 119-bp 5′-untranslated region (UTR), and a 1047-bp 3′-UTR. The ORF encodes 1520 amino acids with a predicted molecular weight of 171.6 kDa and a pI of 6.18 ( Fig. S1). The full-length Dnmt3 cDNA is 2040 bp, comprising 316 bp of 5′-UTR, 1230 bp of ORF, and 494 bp of 3′-UTR. The ORF encodes 409 amino acids with a molecular weight of 46 kDa and pI of 8.62 ( Fig. S2). Compared with other insect DNMT3s, the protein encoded by Nlu-Dnmt3 lacks a short fragment at the 5′-end. We repeated the 5′-RACE experiments and obtained the same product, indicating that this transcript is authentic. The full-length sequences of Nlu-Dnmt1 and Nlu-Dnmt3 were submitted to GenBank with accession numbers KF294265 and KP890855, respectively ( Table S2).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.1. BPH มีชุดเครื่องมือปรับ DNA ให้สมบูรณ์วิเคราะห์ Bioinformatics BPH transcriptome พบชิ้นส่วนของ Dnmt1, Dnmt2 และ Dnmt3 แสดงว่า BPH อาจมีเครื่องมือปรับ DNA ให้สมบูรณ์ ค้นหานี้น่าสนใจให้เราขยายใบแสดงผลการจัด เราเน้น Nlu Dnmt1 และ Nlu Dnmt3 เนื่องจากพวกเขาทราบว่า methylate genomic DNA เราได้ลำดับ cDNA ที่สมบูรณ์ของ Nlu Dnmt1 และ Nlu Dnmt3 ใช้แข่งขัน CDNA Dnmt1 จัดเป็น bp 5729 4563 bp เปิดอ่านเฟรม (ORF), 119 bp 5′ untranslated ภูมิภาค (UTR), และ 3′-UTR 1047-bp การ ORF จแมปกรดอะมิโนค.ศ. 1520 น้ำหนักโมเลกุลการคาดการณ์ของ 171.6 kDa และปี่ของ 6.18 (ฟิก S1) CDNA Dnmt3 จัดเป็น 2040 bp, 316 ห้อง bp 5′ UTR, bp 1230 ของ ORF และ 494 bp 3′ UTR การ ORF จแมป 409 กรดอะมิโน molecular weight ของ 46 kDa และปี่ 8.62 (ฟิก S2) เมื่อเทียบกับแมลงอื่น ๆ DNMT3s โปรตีนที่เข้ารหัส โดย Nlu Dnmt3 ขาดส่วนที่สั้นที่สุด 5′ เราซ้ำทดลองแข่งขัน 5′ และรับผลิตภัณฑ์เดียว แสดงว่า เสียงบรรยายนี้แท้ ลำดับที่ปราศจากของ Nlu Dnmt1 และ Nlu Dnmt3 ส่งมาที่ GenBank มีหมายเลขทะเบียน KF294265 และ KP890855 ตามลำดับ (ตาราง S2)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.1 เพลี้ยกระโดดสีน้ำตาลมีเครื่องมือดีเอ็นเอ methylation สมบูรณ์วิเคราะห์ชีวสารสนเทศศาสตร์ของยีนเพลี้ยกระโดดสีน้ำตาลที่พบชิ้นส่วนของDnmt1, Dnmt2 และ Dnmt3 แสดงให้เห็นว่าเพลี้ยกระโดดสีน้ำตาลอาจมีเครื่องมือ methylation ดีเอ็นเอที่สมบูรณ์ การค้นพบที่น่าสนใจนี้แจ้งให้เราขยายยีนที่มีความยาวเต็มของพวกเขา เรามุ่งเน้น NLU-Dnmt1 และ NLU-Dnmt3 เพราะพวกเขาเป็นที่รู้จักกันดีเอ็นเอ methylate ใช้การแข่งขันเราได้รับลำดับยีนที่สมบูรณ์ของ NLU-Dnmt1 และ NLU-Dnmt3 เต็มรูปแบบที่มีความยาวยีน Dnmt1 เป็น 5,729 bp กับกรอบการอ่าน 4563-bp เปิด (ORF) เป็น 119 bp ภูมิภาค 5'-untranslated (UTR) และ 1047-bp 3- UTR ORF encodes กรดอะมิโน 1520 ที่มีการคาดการณ์น้ำหนักโมเลกุล 171.6 กิโลดาลตันและ pI ของ 6.18 (รูป. S1) เต็มรูปแบบที่มีความยาวยีน Dnmt3 เป็น 2,040 bp ประกอบด้วย 316 bp ของ 5'-UTR, 1230 bp ของ ORF และ 494 bp ของ 3'-UTR ORF เข้ารหัส 409 กรดอะมิโนที่มีน้ำหนักโมเลกุล 46 กิโลดาลตันและ pI ของ 8.62 (รูป. S2) เมื่อเทียบกับ DNMT3s แมลงอื่น ๆ โปรตีนเข้ารหัสโดย NLU-Dnmt3 ขาดชิ้นส่วนที่สั้น 5'สิ้น เราซ้ำแล้วซ้ำอีกการทดลอง 5'-การแข่งขันและได้รับสินค้าชนิดเดียวกันแสดงให้เห็นว่าหลักฐานนี้เป็นของแท้ ลำดับยาวเต็มรูปแบบของ NLU-Dnmt1 และ NLU-Dnmt3 ถูกส่งไปกับ GenBank หมายเลขภาคยานุวัติ KF294265 และ KP890855 ตามลำดับ (ตารางที่ S2)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.1 . เพลี้ยกระโดดสีน้ำตาล มีดีเอ็นเอเมทิลเลชั่นสมบูรณ์ Toolkit

รสนการวิเคราะห์ของเพลี้ยกระโดดสีน้ำตาล พบชิ้นส่วนของ dnmt1 dnmt2 ทราน ริปโตม , และ dnmt3 , ระบุว่า , อาจมีดีเอ็นเอเมทิลเลชั่นที่สมบูรณ์เครื่องมือ . นี้หาที่น่าสนใจแจ้งให้เราขยายของพวกเขาเต็มรายงาน เราเน้นและ nlu-dnmt1 nlu-dnmt3 เพราะพวกเขาเป็นที่รู้จักกัน methylate genomic DNA ที่ใช้แข่งเราได้เสร็จสมบูรณ์และลำดับ cDNA ของ nlu-dnmt1 nlu-dnmt3 . วิธี dnmt1 เต็มตัวเป็น 5729 ทำไม BP กับรายงานผลการดำเนินงาน BP เปิดอ่านกรอบ ( ORF ) , 119 / 5 ’ - untranslated ภูมิภาค ( UTR ) และที่ความดัน 3 ’ - UTR . โดย ORF encodes 1520 กรดอะมิโนกับทำนายน้ำหนักโมเลกุล 171.6 ไหมกิโลดาลตันและปี่ของ 6.60 ( รูปอะไร S1 ) วิธี dnmt3 เต็มตัวเป็น 2040 ทำไม BP ประกอบด้วย 316 ขนาดนั้นเหรอ - UTR 5 ,ขนาด 1230  และ  bp ORF , 494 จาก 3 ’ - UTR . โดย ORF encodes 409 กรดอะมิโน มีน้ำหนักโมเลกุล 46 ไหมกิโลดาลตันและปี่ของ 8.62 ( รูป S2 ไหม ) เมื่อเทียบกับ dnmt3s แมลง อื่น ๆ , โปรตีนเข้ารหัสโดย nlu-dnmt3 ขาดส่วนสั้น ๆใน 5 ’ - จบ เราทำซ้ำ 5 - การแข่งขันได้รับการทดลองและได้รับผลิตภัณฑ์เดียวกัน ระบุว่า หลักฐานนี้คือของแท้ลำดับของ nlu-dnmt1 nlu-dnmt3 เต็มตัวและถูกส่งไปยังขนาดกับการ kf294265 ตัวเลขและ kp890855 ตามลำดับ ( ตารางไหม S2 )