we report expression analysis data for the a-1,2-
mannosidase gene from T. harzianum during interaction with
Fusarium solani, Fusarium oxysporum and Sclerotinia sclerotiorum.
real-time PCR. Reactions were performed in the iQ5 real-time
PCR system (Bio-Rad). Each reaction (20 ll) contained 10 ll of
MAXIMA SYBR-green PCR Master mix (Fermentas), forward
(MANF:GCTGTTGTCAAAGATGCAGAAG) and reverse (MANR:
CTTGTACGGGAACGTAGTTGAG) primers (500 nM each), cDNA template,
and nuclease-free water. PCR cycling conditions were 10 min
at 95 C (1 cycle), 15 s at 95 C followed by 1 min at 60 C (40
cycles), and a melting curve of 1 min at 95 C followed by 30 s at
55 C with a final ramp to 95 C with continuous data collection
(1 cycle) to test for primer dimers and non-specific amplification.
The a-actin transcript was used as an internal reference to normalize
the amount of total RNA present in each reaction. The
expression levels of the genes were calculated from the threshold
cycle according to the 2DDCT method (Livak and Schmittgen,
2001). The experiment was conducted with three repetitions for
each sample and results were compared by one-way ANOVA with
Dunnett’s post test (a = 5%) to analyze the differences between
conditions related to controls using GraphPad Prism 5 for
Windows.
3.
เรารายงานข้อมูลวิเคราะห์นิพจน์สำหรับการเป็น-1, 2 -ยีน mannosidase จาก T. harzianum ในระหว่างการโต้ตอบกับFusarium solani, Fusarium oxysporum และ Sclerotinia sclerotiorumPCR แบบเรียลไทม์ ปฏิกิริยาดำเนินใน iQ5 แบบเรียลไทม์ระบบ PCR (Bio Rad) แต่ละปฏิกิริยา (20 ll) อยู่ 10 จะของแมกสีเขียว SYBR PCR หลักผสม (Fermentas), ไปข้างหน้า(MANF:GCTGTTGTCAAAGATGCAGAAG) และย้อนกลับ (MANR:ไพรเมอร์ CTTGTACGGGAACGTAGTTGAG) (500 nM แต่ละ), cDNA แม่และน้ำฟรี nuclease สภาพขี่จักรยาน PCR ก็ 10 นาทีที่ 95 C (1 รอบ), 15 s ที่ 95 C ตาม ด้วยนาทีที่ 60 C (40รอบ), และเส้นโค้งหลอม 1 นาทีที่ 95 C ตาม ด้วย 30 s ที่55 C มีทางลาดสุดท้ายถึง 95 C ด้วยการรวบรวมข้อมูลอย่างต่อเนื่อง(1 รอบ) การทดสอบสำหรับรองพื้น dimers และขยายเฉพาะไม่เสียงบรรยายเป็นแอกตินใช้เป็นการอ้างอิงภายในปกติจำนวนของ RNA ทั้งหมดที่อยู่ในแต่ละปฏิกิริยา การระดับการแสดงออกของยีนได้คำนวณจากขีดจำกัดวนตามวิธีของ DDCT 2 (Livak และ Schmittgen2001) ดำเนินการทดลองกับทำซ้ำสามสำหรับแต่ละอย่างและผลลัพธ์ถูกเปรียบเทียบ โดยทางเดียว ANOVA ด้วยการทดสอบของ Dunnett โพสต์ (5%) การวิเคราะห์ความแตกต่างระหว่างเงื่อนไขที่เกี่ยวข้องกับการควบคุมโดยใช้ 5 ปริซึม GraphPadWindows3
การแปล กรุณารอสักครู่..