The reaction was performed
in 20 μL, containing 10 μL of SsoAdvanced SYBR Green Supermix
(Bio-Rad), 1 μL of each primer (10 μM), 2 μL of cDNA (2.5 ng/μL) and 6 μL
of RNase/DNase-free H2O. The thermal cycling parameters were as
follows: 95 °C for 30 s, followed by 40 cycles at 95 °C for 3 s and 60 °C
for 30 s. The specificity of amplification was determined by melting
curve analysis at the end, over a temperature range between 65 and
95 °C in 0.5 °C increments. The relative fold change was calculated
using the 2−ΔΔCt calculation (Schmittgen & Livak, 2008). The expression
level for each steer was obtained from the mean of three independent
experiments.
2.3. SNP genotyping
The NCBI_ss1388116468 SNP was genotyped by the PCR-restriction
fragment length polymorphism method as described previously (Tong
et al., 2012). Using this method, 186-bp PCR fragments containing the
SNP site were amplified and HpaII-digested into 57- and 129-bp fragments
at the G allele, but not the C allele: the GG homozygotes, the CC
homozygotes and the GC heterozygotes yielded two bands (57 and
129 bp), one band (186 bp) and three bands (57, 129 and 186 bp),
respectively.
ทำปฏิกิริยาใน 20 μL ประกอบด้วย 10 μL ของ SsoAdvanced SYBR Green Supermix(ไบโอ-Rad), μL 1 ของรองพื้นแต่ละ (10 ไมครอน), μL 2 ของ cDNA (2.5 ฉบับ μL) และ 6 μLของ H2O RNase DNase-ฟรี / พารามิเตอร์ความร้อนขี่จักรยานได้เป็นต่อไปนี้: 95 ° C 30 s ตาม ด้วย 40 รอบที่ 95 ° C สำหรับ 3 s และ 60 ° C30 s ความของขยายถูกกำหนด โดยการหลอมเส้นโค้งวิเคราะห์ปลาย ช่วงอุณหภูมิระหว่าง 65 และ95 ° C ทีละ 0.5 ° C คำนวณการเปลี่ยนแปลงสัมพัทธ์พับใช้การคำนวณ 2−ΔΔCt (Schmittgen & Livak, 2008) การแสดงออกมาจากความหมายของอิสระสามระดับสำหรับแต่ละคัดท้ายการทดลอง2.3. SNP genotypingNCBI_ss1388116468 SNP เป็น genotyped โดย PCR-จำกัดส่วนความยาวโพลิมอร์ฟิซึมวิธีตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (ตองet al. 2012) ใช้วิธีการนี้ 186 bp บางส่วนของ PCR ที่ประกอบด้วยการเว็บไซต์ SNP ถูกขยาย และ ย่อย HpaII เป็นชิ้น ๆ bp 57 และ 129ที่อัลลีล G แต่ไม่ลสามารถ C: homozygotes GG, CChomozygotes และ GC heterozygotes ตอนสองวง (57 และ129 bp), วงหนึ่ง (186 bp) และสาม (57, 129 และ 186 bp),ตามลาดับ
การแปล กรุณารอสักครู่..
