Analysis was performed by using the

Analysis was performed by using the software package
MEGA
version 2.1 (Kumar et al., 2001), after multiple alignments of
the data via
CLUSTAL X (Thompson et al., 1997). The distance
matrix method (distance options according to Kimura’s twoparameter
model), including clustering by neighbour-joining
(Saitou & Nei, 1987) (Fig. 1) and a discrete character-based
maximum-parsimony method (Kluge & Farris, 1969), was
used. In each case, bootstrap values were calculated based
on 1000 replications. The 16S rRNA gene sequence of
strain CC-SBABM117
T
was a continuous stretch of 1400 bp.
Sequence similarity calculations indicated that strain
CC-SBABM117
T
phragmitetus C6/19
was related most closely to Pannonibacter
T
(92.5 %; Borsodi et al., 2003),
Methylopila capsulata IM1
T
(92.3 %; Doronina et al., 1998),
Prosthecomicrobium pneumaticum MBIC3489
(92.3 %;
Staley, 1968; Jenkins et al., 2005), Nesiotobacter exalbescens
LA33B
T
T
(91.5 %; Donachie et al., 2006), Pleomorphomonas
oryzae IAM15079
T
(91.1 %; Xie & Yokota, 2005) and Stappia

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การวิเคราะห์ได้รับการดำเนินการโดยใช้แพคเกจซอฟต์แวร์

ล้านรุ่น 2.1 (kumar et al,., 2001) หลังจากที่หลายการจัดแนวของข้อมูล

ผ่าน clustal x (thompson, et al., 1997) วิธีการระยะ
เมทริกซ์ (ตัวเลือกระยะทางที่เป็นไปตามรูปแบบการ twoparameter
คิมูระ) ที่รวมทั้งการจัดกลุ่มโดยเพื่อนบ้านเข้า
(Sai​​tou & Nei, 1987) (รูปที่ 1) และต่อเนื่องตามตัวอักษร
วิธีการประหยัดสูงสุด (Kluge & Farris, 1969) ถูกนำมาใช้
ในแต่ละกรณีค่าบูตถูกคำนวณตาม
1000 ซ้ำ ลำดับยีน 16s rRNA ของ
ความเครียด cc-sbabm117

เป็นเสื้อยืดอย่างต่อเนื่อง 1400 bp.
ลำดับการคำนวณความคล้ายคลึงกันชี้ให้เห็นว่าความเครียด
cc-sbabm117
T

phragmitetus c6/19 ที่เกี่ยวข้องมากที่สุดอย่างใกล้ชิดกับ pannonibacter
T
(92.5%. Borsodi et al, 2003),
methylopila capsulata IM1
T
(92.3%. Doronina และคณะ, 1998),
prosthecomicrobium pneumaticum mbic3489
(92.3%;
สเตลีย์, 1968;. เจนกินส์และอัล, 2005), exalbescens nesiotobacter

la33b T
T
( 91.5%. Donachie et al, 2006), pleomorphomonas
oryzae iam15079
T
(91.1%; Xie &โยโกตะ, 2005) และ stappia

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ทำการวิเคราะห์ โดยใช้แพคเกจซอฟต์แวร์
ร็อค
รุ่น 2.1 (Kumar et al., 2001), หลังจากการจัดแนวหลาย
ข้อมูลผ่าน
X CLUSTAL (ทอมป์สันและ al., 1997) ระยะห่าง
วิธีเมตริกซ์ (ห่างจากที่พักตัวตามของคิมุระโย twoparameter
รุ่น), รวมทั้งคลัสเตอร์ โดยรวมเพื่อนบ้าน
(Saitou & Nei, 1987) (Fig. 1) และแบบเดี่ยว ๆ ตามอักขระ
วิธีสูงสุด parsimony (Kluge & Farris, 1969), ถูก
ใช้ ในแต่ละกรณี ค่าเริ่มต้นระบบได้คำนวณตาม
ในระยะ 1000 ลำดับยีน 16S rRNA ของ
สายพันธุ์ CC SBABM117
T
ถูกยืดอย่างต่อเนื่องของ 1400 bp.
ลำดับคล้ายคำนวณระบุว่า ต้องใช้
CC SBABM117
T
phragmitetus C6/19
ถูกเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดที่สุดกับ Pannonibacter
T
(92.5 %; Borsodi และ al., 2003),
Methylopila capsulata IM1
T
(92.3 %; Doronina และ al., 1998),
Prosthecomicrobium pneumaticum MBIC3489
(92.3%;
Staley, 1968 เจงกินส์ et al., 2005), Nesiotobacter exalbescens
LA33B
T
T
(91.5 %; Donachie และ al., 2006), Pleomorphomonas
แห้งระดับต่าง ๆ IAM15079
T
(91.1 %; โยโกเจีย&ต้า 2005) และ Stappia

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ได้ดำเนินการโดยการใช้แพคเกจซอฟต์แวร์

เวอร์ชัน 2.1 เมกะ(ทำงานนอกเหนือหน้า et al . 2001 )หลังจาก alignments ของข้อมูลได้อย่างหลากหลาย

ซึ่งจะช่วยโดยผ่านทาง clustal x (ธอมป์สัน et al . 1997 ) วิธีการระยะทาง
Matrix Storage Manager (ตัวเลือกระยะห่างของในรุ่น twoparameter
)ซึ่งรวมถึงระบบคลัสเตอร์โดยเพื่อนบ้าน - เข้าร่วม
( saitou & Chao Nei Dai Jie 1987 )(รูปที่ 1 )และแบบแยกต่างหากแบบตัวอักษร
ตามมาตรฐานที่วิธีการสูงสุด - ตระหนี่ถี่ถ้วน( Kluge & farris 1969 )เป็น
ใช้ ในแต่ละกรณีค่า Bootstrap Processor คำนวณโดยใช้
บน 1000 replications ที่ 16 S rrna ยีนตามลำดับของ
ซึ่งจะช่วยลดความตึงเครียด CC - sbabm 117

T เป็นอย่างต่อเนื่องของ 1400 BP .
ตามลำดับความเหมือนการคำนวณระบุว่าความเครียด
CC sbabm 117

T phragmitetus C 6/19
เป็นที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดมากที่สุดเพื่อ pannonibacter

T ( 92.5% , borsodi et al ., 2003 ),
methylopila capsulata ฉัน 1

T ( 92.3% , doronina et al ., 1998 ),
prosthecomicrobium pneumaticum mbic 3489
( 92.3% ;
จริงๆ!!, 1968 ;ว่าไง et al ., 2005 ), nesiotobacter exalbescens
La 33 B

t t
( 91.5% , donachie et al ., 2006 ), pleomorphomonas
oryzae Kum Iam 15079

T ( 91.1% ,เห& yokota , 2005 )และ stappia