Abstract. Rubber tree is the main source of natural rubber and is the most important economic member of the Hevea genus. Polysaccharides and polyphenols in mature leaf can reduce the success of DNA extraction and downstream applications. This makes the isolation of high quality and molecular weight DNA from mature leaves of rubber tree challenging. The DNA yield and purity obtained using eight methods involving use of cetyltrimethylammonium bromide, SDS, and two commercial kits were compared. The modified procedure from Moreira & Oliveira (2011) consistently yields approximately 34 μg of high-quality amplifiable DNA with as little as 0.05 g fresh weight of mature leaf tissue of rubber tree. The key changes in the procedure were (1) a short grinding of leaf powder in mortar with extraction buffer after blending the leaf tissue in the presence of liquid nitrogen; (2) the optimization of the ratio of tissue (weight) to buffer (volume); (3) CTAB was added only once and (4) reduction in the incubation time of the macerated tissue in an extraction buffer including RNase A at 65 °C for 15 minutes. The procedure was also applicable to seventeen other tropical plant species. This helped to avoid the limitation of plant materials and could provide total DNA for further molecular studies.
Key Words: DNA extraction, mature leaf, Hevea genus, 18S rRNA, trnL-F, ISSR, RAPD.
นามธรรม ยางพาราเป็นแหล่งที่มาหลักของยางธรรมชาติและเป็นสมาชิกทางเศรษฐกิจที่สำคัญที่สุดของพืชยางพารา . ไรด์ โพลีฟีนอล ในใบแก่และสามารถลดความสำเร็จของการสกัดดีเอ็นเอและการประยุกต์ด้านท้ายน้ำ นี้จะทำให้การแยกคุณภาพสูงและดีเอ็นเอโมเลกุลจากผู้ใหญ่ ใบของต้นยางที่ท้าทาย ดีเอ็นเอผลผลิตและความบริสุทธิ์ได้รับใช้แปดวิธีการที่เกี่ยวข้องกับการใช้ cetyltrimethylammonium โบรไมด์ , SDS , และสองชุดเป็นเชิงเปรียบเทียบ การปรับเปลี่ยนวิธีการ จาก โมไรร่า & Oliveira ( 2011 ) อย่างต่อเนื่อง ผลผลิตประมาณ 34 μกรัม คุณภาพสูง amplifiable ดีเอ็นเอที่มีน้ำหนักเพียง 0.05 กรัม ใบแก่ เนื้อเยื่อของต้นยาง การเปลี่ยนแปลงที่สำคัญในขั้นตอนคือ ( 1 ) สั้นบดผงในครกใบบัฟเฟอร์สกัดหลังจากผสมใบเนื้อเยื่อในการแสดงตนของไนโตรเจนเหลว ( 2 ) การเพิ่มประสิทธิภาพของอัตราส่วนของเนื้อเยื่อ ( น้ำหนัก ) บัฟเฟอร์ ( เสียง ) ; ( 3 ) ctab เพิ่มเพียงครั้งเดียว ( 1 ) การลดเวลาในการบ่มของ macerated เนื้อเยื่อในการสกัดกันชนรวมถึงเลสที่ 65 °องศาเซลเซียสเป็นเวลา 15 นาที ขั้นตอนยังใช้ได้ถึง 17 ชนิดพืชเขตร้อนอื่น ๆ นี้จะช่วยหลีกเลี่ยงข้อจำกัดของวัสดุพืชและสามารถให้ดีเอ็นเอทั้งหมดเพื่อการศึกษาระดับโมเลกุล เพิ่มเติมคำสำคัญ : การสกัด ดีเอ็นเอผู้ใหญ่ใบยางพาราสกุล 18S rRNA trnl-f issr , , ด้วย , , .
การแปล กรุณารอสักครู่..
