Filamentous cyanobacteria of the ge

Filamentous cyanobacteria of the genus Lyngbya are important
contributors to coral reef ecosystems, occasionally forming dominant
cover and impacting the health of many other co-occurring
organisms. Moreover, they are extraordinarily rich sources of bioactive
secondary metabolites, with 35% of all reported cyanobacterial
natural products deriving from this single pantropical genus.
However, the true natural product potential and life strategies of
Lyngbya strains are poorly understood because of phylogenetic
ambiguity, lack of genomic information, and their close associations
with heterotrophic bacteria and other cyanobacteria. To
gauge the natural product potential of Lyngbya and gain insights
into potential microbial interactions, we sequenced the genome
of Lyngbya majuscula 3L, a Caribbean strain that produces the
tubulin polymerization inhibitor curacin A and the molluscicide
barbamide, using a combination of Sanger and 454 sequencing
approaches. Whereas ∼293,000 nucleotides of the draft genome
are putatively dedicated to secondary metabolism, this is far too
few to encode a large suite of Lyngbya metabolites, suggesting
Lyngbya metabolites are strain specific and may be useful in species
delineation. Our analysis revealed a complex gene regulatory
network, including a large number of sigma factors and other
regulatory proteins, indicating an enhanced ability for environmental
adaptation or microbial associations. Although Lyngbya
species are reported to fix nitrogen, nitrogenase genes were not
found in the genome or by PCR of genomic DNA. Subsequent
growth experiments confirmed that L. majuscula 3L is unable to
fix atmospheric nitrogen. These unanticipated life history characteristics
challenge current views of the genus Lyngbya.

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไซยาโนแบคทีเรียเป็นของสกุล lyngbya เป็นผู้สนับสนุนที่สำคัญ
เพื่อระบบนิเวศแนวปะการังในการขึ้นรูปและปกเด่น
ส่งผลกระทบต่อสุขภาพอื่น ๆอีกมากมาย CO ที่เกิดขึ้น
สิ่งมีชีวิต นอกจากนี้ยังเป็นแหล่งที่อุดมไปด้วยสารเป็นพิเศษ
สารทุติยภูมิที่มี 35 % จากรายงานทั้งหมดธรรมชาติผลิตภัณฑ์ที่ได้รับจากระบบยู

สกุลพืชเขตร้อน ซิงเกิ้ลนี้ อย่างไรก็ตามที่แท้จริงของผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่มีศักยภาพและกลยุทธ์ของชีวิต
lyngbya สายพันธุ์จะไม่ค่อยเข้าใจเพราะวิวัฒนาการ
ความคลุมเครือ การขาดข้อมูลจีโนม และสมาคมของพวกเขาปิด
แบคทีเรียไซยาโนแบคทีเรียและแบบอื่น ๆ

วัดผลิตภัณฑ์ธรรมชาติและศักยภาพของ lyngbya ได้รับข้อมูลเชิงลึกในการโต้ตอบ
จุลินทรีย์ที่มีศักยภาพ เราลำดับเบสจีโนมของ lyngbya majuscula 3L
,คาริบเบียนสายพันธุ์ที่ผลิตสารยับยั้ง curacin
ทูบูลิน และสำหรับ
barbamide การรวมกันของ แซงเกอร์ 454
และแนวทางของ ส่วน∼ 293000 นิวคลีโอไทด์ของร่างจีโนม
เป็น putatively ทุ่มเทเพื่อรองการเผาผลาญอาหารนี้มากเกินไป
ไม่เข้ารหัสชุดใหญ่ของ lyngbya metabolites แนะนำ
lyngbya สารเป็นสายพันธุ์ที่เฉพาะเจาะจงและอาจเป็นประโยชน์ในการกำหนดชนิด
. การวิเคราะห์ของเราพบยีนกฎระเบียบที่ซับซ้อน
เครือข่ายรวมถึงจำนวนมากของปัจจัยที่ Sigma และโปรตีนกฎระเบียบอื่น ๆ
แสดงว่ามีความสามารถในการปรับตัว ปรับปรุงสิ่งแวดล้อม
สมาคม หรือจุลินทรีย์ แม้ว่า lyngbya
ชนิดมีรายงานการแก้ไขไนโตรเจนไม่
ยีนไนโตรจีเนสพบในจีโนม หรือโดยวิธี PCR ของจีโนมดีเอ็นเอ การทดลองการยืนยันว่า majuscula ตามมา
3 L ไม่สามารถ
ก๊าซไนโตรเจนจากบรรยากาศ เหล่านี้ unanticipated ประวัติชีวิตลักษณะ
ท้าทายในปัจจุบันมุมมองของสกุล lyngbya .