The so-called ‘promiscuous’ domains

The so-called ‘promiscuous’ domains which occur frequently in many
otherwise unrelated proteins, such as ATP-binding cassettes, actin
binding domains, WD repeats and SH3 domains (Marcotte et al.,
1999) were removed, to reduce errors.
• All proteins (fused and heterodimeric) identified in our study were
searched against InterPro (which combines diverse information
about protein families and domains from multiple databases)
(Hunter et al., 2011) for the full annotation of the individual protein
domains. The InterPro accession number for each protein domain is
indicated in the text by the three-letter code IPR followed by six digits.
• The predicted reference fused protein was split into its components
proteins and then checked by reverse BLAST (Altschul et al., 1997)
to assess whether these two proteins returned the initial two query
proteins as their best BLAST hit.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เรียกว่าโดเมน 'กะหรี่' ซึ่งเกิดขึ้นบ่อยในหลายอย่างอื่น ไม่เกี่ยว โปรตีนเช่น ATP รวมเทป แอกตินผูกโดเมน ทำซ้ำ WD และโดเมน SH3 (Marcotte et al.,1999) จะถูกตัดออก ลดข้อผิดพลาด•โปรตีนทั้งหมด (fused และ heterodimeric) identified ในการศึกษาของเราได้ค้นหาต่อ InterPro (ซึ่งรวมหลากหลายข้อมูลเกี่ยวกับครอบครัวโปรตีนและโดเมนจากหลายฐานข้อมูล)(Hunter et al. 2011) สำหรับคำอธิบายเต็มของโปรตีนแต่ละตัวโดเมน หมายเลขทะเบียน InterPro สำหรับแต่ละโดเมนของโปรตีนคือระบุไว้ในข้อความ ด้วยรหัสสามตัวอักษรตาม ด้วยเลขหกหลัก IPR•โปรตีนอ้างอิงที่คาดคะเนไว้หลอมรวมแยกออกเป็นองค์ประกอบโปรตีน และจากนั้น ตรวจสอบ โดยระเบิดย้อนกลับ (Altschul et al. 1997)เพื่อประเมินว่าโปรตีนเหล่านี้สองส่งคืนแบบสอบถามสองครั้งแรกโปรตีนเป็นตีระเบิดของพวกเขาที่ดีที่สุด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ที่เรียกว่าโดเมน 'สำส่อน' ซึ่งเกิดขึ้นบ่อยครั้งในหลาย
โปรตีนที่ไม่เกี่ยวข้องเป็นอย่างอื่นเช่นเอทีพีผูกพันเทป actin
โดเมนผูกพันซ้ำ WD และโดเมน SH3 (Marcotte et al.,
1999) ถูกถอดออกเพื่อลดความผิดพลาด.
•ทั้งหมด โปรตีน (ผสมและ heterodimeric) เอ็ด Fi ระบุในการศึกษาของเราได้
สืบค้นกับ InterPro (ซึ่งรวมข้อมูลที่หลากหลาย
เกี่ยวกับครอบครัวของโปรตีนและโดเมนจากหลายฐานข้อมูล)
(Hunter et al. 2011) สำหรับคำอธิบายประกอบเต็มรูปแบบของโปรตีนแต่ละ
โดเมน จำนวนการเข้า InterPro สำหรับโดเมนของโปรตีนแต่ละคนจะ
ระบุไว้ในข้อความโดยสามตัวอักษรรหัสทรัพย์สินทางปัญญาตามด้วยตัวเลขหกหลักได้.
•อ้างอิงทำนายผสมโปรตีนถูกแบ่งออกเป็นส่วนประกอบของ
โปรตีนและการตรวจสอบโดยการระเบิดย้อนกลับแล้ว (Altschul et al., 1997 )
เพื่อประเมินว่าทั้งสองโปรตีนกลับมาเริ่มต้นสองแบบสอบถาม
โปรตีนเป็นฮิตระเบิดของพวกเขาที่ดีที่สุด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ที่เรียกว่า " กากี " โดเมนซึ่งเกิดขึ้นบ่อยมากโปรตีนอื่นที่ไม่เกี่ยวข้อง เช่น เอทีพี ผูกแบบ แอกทินผูกโดเมนและโดเมนซ้ำตัวสินค้า ( มาร์ค็อต et al . ,2542 ) ออก เพื่อลดข้อผิดพลาดบริการทั้งหมด ( ผสมโปรตีน และ heterodimeric ) identi จึงเอ็ดในการศึกษาของเราค้นหากับ InterPro ( ซึ่งรวมข้อมูลหลากหลายเกี่ยวกับโปรตีนครอบครัวจากหลายฐานข้อมูล ) และโดเมน( Hunter et al . , 2011 ) สำหรับบันทึกย่อที่เต็มรูปแบบของโปรตีนแต่ละโดเมน หมายเลขภาคยานุวัติแต่ละโดเมน InterPro โปรตีนคือระบุในข้อความ โดยสามตัวอักษรรหัสทรัพย์สินทางปัญญาตามด้วยเลขหกหลัก- คาดการณ์อ้างอิงผสมโปรตีนที่ถูกแบ่งออกเป็นส่วนประกอบของมันโปรตีนและจากนั้นตรวจสอบโดยระเบิดย้อนกลับ ( แอลเชิล et al . , 2540 )เพื่อประเมินว่าโปรตีนทั้งสองคืนเริ่มต้น 2 สอบถามโปรตีนตามที่ดีที่สุดของพวกเขาระเบิดเข้าชม