Article outlineShow full outlineAbs

Article outlineShow full outline
Abstract
Abbreviation
Keywords
1. Introduction
2. Material and methods
3. Results
4. Discussion
Acknowledgements
Appendix A. Supplementary data
References
Figures and tables

Table 1
Image for unlabelled figure
Image for unlabelled figure
(A)-(K) Phylogenetic trees constructed from the nucleotide sequences of the VP7, ...
Image for unlabelled figure
Image for unlabelled figure
Image for unlabelled figure
Image for unlabelled figure
Supplementary Table S1
Supplementary Table S2
ADVERTISEMENT

Infection, Genetics and Evolution
Volume 16, June 2013, Pages 103–112

Cover image
Complex evolutionary patterns of two rare human G3P[9] rotavirus strains possessing a feline/canine-like H6 genotype on an AU-1-like genotype constellation

Yuan-Hong Wanga, , , Bei-Bei Panga, Xuan Zhoua, Souvik Ghoshb, , , , Wei-Feng Tanga, Jin-Song Penga, Quan Hua, Dun-Jin Zhoua, Nobumichi Kobayashib
Show more
doi:10.1016/j.meegid.2013.01.016
Get rights and content
Abstract
The group A rotavirus (RVA) G3P[9] is a rare VP7–VP4 genotype combination, detected occasionally in humans and cats. Other than the prototype G3P[9] strain, RVA/Human- tc/JPN/AU-l/1982/G3P3[9], the whole genomes of only two human G3P[9] RVA strains and two feline G3P[9] RVA strains have been analyzed so far, revealing complex evolutionary patterns, distinct from that of AU-1. We report here the whole genomic analyses of two human G3P[9] RVA strains, RVA/Human-tc/CHN/L621/2006/G3P[9] and RVA/Human-wt/CHN/E2451/2011/G3P[9], detected in patients with diarrhea in China. Strains L621 and E2451 possessed a H6 NSP5 genotype on an AU-1-like genotype constellation, not reported previously. However, not all the genes of L621 and E2451 were closely related to those of AU-1, or to each other, revealing different evolutionary patterns among the AU-1-like RVAs. The VP7, VP4, VP6 and NSP4 genes of E2451 and L621 were found to cluster together with human G3P[9] RVA strains believed to be of possible feline/canine origin, and feline or raccoon dog RVA strains. The VP1, VP3, NSP2 and NSP5 genes of E2451 and L621 formed distinct clusters in genotypes typically found in feline/canine RVA strains or RVA strains from other host species which are believed to be of feline/canine RVA origin. The VP2 genes of E2451 and L621, and NSP3 gene of L621 clustered among RVA strains from different host species which are believed to have a complete or partial feline/canine RVA origin. The NSP1 genes of E2451 and L621, and NSP3 gene of E2451 clustered with AU-1 and several other strains possessing a complete or partial feline RVA strain BA222-05-like genotype constellation. Taken together, these observations suggest that nearly all the eleven gene segments of G3P[9] RVA strains L621 and E2451 might have originated from feline/canine RVAs, and that reassortments may have occurred among these feline/canine RVA strains, before being transmitted to humans.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทความ outlineShow เต็มรูปแบบเค้าร่างบทคัดย่อตัวย่อคำสำคัญ1. บทนำ2. วัสดุและวิธีการ3. ผลลัพธ์4. สนทนาถาม-ตอบข้อมูลภาคผนวก A. Supplementaryการอ้างอิงตัวเลขและตารางตารางที่ 1รูปภาพสำหรับรูป unlabelledรูปภาพสำหรับรูป unlabelled(ต้นไม้ Phylogenetic A)-(K) สร้างจากลำดับนิวคลีโอไทด์ของ VP7,...รูปภาพสำหรับรูป unlabelledรูปภาพสำหรับรูป unlabelledรูปภาพสำหรับรูป unlabelledรูปภาพสำหรับรูป unlabelledตารางเสริม S1ตารางเสริม S2โฆษณา ติดเชื้อ พันธุศาสตร์ และวิวัฒนาการปริมาณ 16, 2013 มิถุนายน หน้า 103-112 ภาพปกรูปแบบวิวัฒนาการซับซ้อนของสองยากมนุษย์ G3P rotavirus [9] สายพันธุ์มีการแมว/สุนัขเหมือน H6 ลักษณะทางพันธุกรรมในกลุ่มดาวมีลักษณะทางพันธุกรรมเหมือน 1 AUหยวน -Hong Wanga,,, Panga เป่ยเป่ย Zhoua ซวน Souvik Ghoshb,,,, Tanga เฟิงเว่ย จิ้นเพลง Penga หัวควน Dun จิ Zhoua, Nobumichi Kobayashib ดูเพิ่มเติมdoi:10.1016/j.meegid.2013.01.016ได้รับสิทธิและเนื้อหาบทคัดย่อRotavirus กลุ่ม A (RVA) G3P [9] เป็นหายาก VP7 – VP4 ลักษณะทางพันธุกรรมชุด บางครั้งพบในมนุษย์และแมว ไม่ใช่ต้นแบบ G3P [9] ต้องใช้ RVA/บุคคล-tc/JPN/AU-l/1982/G3P3 [9], genomes ทั้งของมนุษย์ G3P เพียงสองสายพันธุ์ [9] RVA และ G3P แมวสองสายพันธุ์ RVA [9] ได้รับการวิเคราะห์เพื่อห่างไกล เปิดเผยซับซ้อนวิวัฒนาการรูปแบบ แตกต่างจากที่ AU 1 เรานี่รายงานวิเคราะห์ทั้ง genomic ของ G3P สองมนุษย์ [9] RVA สายพันธุ์ RVA/บุคคล-tc/CHN/L621/2006/G3P [9] และ RVA/บุคคล-wt/CHN/E2451/2011/G3P [9], ตรวจพบในผู้ป่วย ด้วยโรคอุจจาระร่วงในประเทศจีน สายพันธุ์ L621 และ E2451 ต้องมีลักษณะทางพันธุกรรม H6 NSP5 บนเป็น AU 1 เช่นลักษณะทางพันธุกรรมกลุ่มดาว ไม่มีรายงานก่อนหน้านี้ อย่างไรก็ตาม ยีนไม่ L621 และ E2451 ได้ความสัมพันธ์ของ AU-1 หรือ อื่น ๆ เปิดเผยรูปแบบวิวัฒนาการระหว่าง RVAs AU 1 เหมือนกัน พบยีน VP7, VP4, VP6 และ NSP4 E2451 และ L621 การคลัสเตอร์กับ G3P มนุษย์ [9] สายพันธุ์ RVA ที่เชื่อว่าเป็นต้นกำเนิดสุนัข/แมวได้ และสายพันธุ์ RVA สุนัขของแมวหรือสัตว์คล้ายหมีเล็ก VP1, VP3, NSP2 และ NSP5 ยีน E2451 และ L621 คลัสเตอร์ทั้งหมดที่เกิดขึ้นในการศึกษาจีโนไทป์ซึ่งมักพบในสุนัข/แมว RVA สายพันธุ์หรือสายพันธุ์ RVA จากสปีชีส์อื่นโฮสต์ซึ่งเชื่อว่าเป็นต้นกำเนิดสุนัข/แมว RVA ยีนของยีน E2451 และ L621 และ NSP3 ของ L621 VP2 จับกลุ่มระหว่าง RVA สายพันธุ์จากพันธุ์โฮสต์ซึ่งเชื่อว่ามีความสมบูรณ์ หรือบางส่วนสุนัข/แมว RVA กำเนิด ยีน NSP1 ของยีน E2451 และ L621 และ NSP3 ของ E2451 จับกลุ่มกับ AU และอื่น ๆ สายพันธุ์ต่าง ๆ ที่มีบางส่วน หรือสมบูรณ์ RVA แมวสายพันธุ์ BA222-05-เหมือนกลุ่มดาวลักษณะทางพันธุกรรม ดำเนินการร่วมกัน สังเกตเหล่านี้แนะนำที่เซ็กเมนต์ยีน 11 เกือบทั้งหมดของ G3P สายพันธุ์ [9] RVA L621 และ E2451 อาจมีต้นกำเนิดจากแมว/ข่าวลือสุนัข RVAs และ reassortments อาจเกิดขึ้นระหว่างสายพันธุ์เหล่านี้แมว/สุนัข RVA ก่อนที่จะถูกส่งไปยังมนุษย์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทความ outlineShow ร่างเต็มบทคัดย่อชื่อย่อคำ1 บทนำ2 วัสดุและวิธีการที่ 3 ผลการค้นหา4 คำอธิบายกิตติกรรมประกาศภาคผนวกเสริมข้อมูลอ้างอิงตัวเลขและตารางตารางที่1 ภาพสำหรับรูปป้ายกำกับภาพรูปป้ายกำกับ(ก) - (K) ต้นไม้ที่สร้างขึ้นจากลำดับเบสของ VP7 ที่ ... ภาพรูปป้ายกำกับภาพรูปป้ายกำกับภาพรูปป้ายกำกับภาพรูปป้ายกำกับเสริมS1 ตารางเสริมตารางS2 โฆษณาติดเชื้อพันธุศาสตร์และวิวัฒนาการเล่มที่16 มิถุนายน 2013, หน้า 103-112 ปกภาพรูปแบบวิวัฒนาการที่ซับซ้อนของทั้งสองที่หายากของมนุษย์ G3P [9] โรตาไวรัสสายพันธุ์ที่มีแมว / สุนัข เหมือนจีโนไทป์ H6 บนจีโนไทป์ AU-1 เหมือนงูหยวน-Hong Wanga,, Bei Bei-Panga ซวน Zhoua, Souvik Ghoshb,,,, Wei-ฮแทงก้าจินเพลง Penga, Quan หัวตาลจิน Zhoua, Nobumichi Kobayashib แสดงมากขึ้นดอย: 10.1016 / j.meegid.2013.01.016 รับสิทธิและเนื้อหาบทคัดย่อกลุ่มโรตาไวรัสA (RVA) G3P [9] เป็นที่หายาก VP7-VP4 รวมกันจีโนไทป์ตรวจพบเป็นครั้งคราวในมนุษย์และแมว นอกเหนือจาก G3P ต้นแบบ [9] ความเครียด RVA / ของมนุษย์ TC / JPN / AU-ลิตร / 1982 / G3P3 [9], จีโนมทั้งหมดของมนุษย์เพียงสอง G3P [9] สายพันธุ์ RVA และสองแมว G3P [9] RVA สายพันธุ์ที่ได้รับการวิเคราะห์เพื่อให้ห่างไกลเผยให้เห็นรูปแบบวิวัฒนาการที่ซับซ้อนที่แตกต่างจากที่ AU-1 เรารายงานที่นี่วิเคราะห์จีโนมทั้งสองมนุษย์ G3P [9] สายพันธุ์ RVA, RVA / มนุษย์-TC / CHN / L621 / 2006 / G3P [9] และ RVA / มนุษย์น้ำหนัก / CHN / E2451 / 2011 / G3P [9] ตรวจพบในผู้ป่วยที่มีอาการท้องเสียในประเทศจีน สายพันธุ์ L621 และ E2451 ครอบครอง H6 NSP5 จีโนไทป์บน AU-1 เหมือนงูจีโนไทป์, ไม่ได้รายงานก่อนหน้านี้ แต่ไม่ทั้งหมดของยีน L621 และ E2451 มีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับผู้ที่ AU-1 หรือกับแต่ละอื่น ๆ เผยให้เห็นรูปแบบที่แตกต่างกันวิวัฒนาการในหมู่ AU-1 เหมือน RVAs VP7, VP4, VP6 และยีน NSP4 ของ E2451 และ L621 พบว่ากลุ่มร่วมกับมนุษย์ G3P [9] สายพันธุ์ RVA เชื่อว่าจะเป็นไปได้แมว / ต้นกำเนิดของสุนัขและแมวหรือสุนัขสายพันธุ์แรคคูน RVA VP1, VP3, NSP2 และยีน NSP5 ของ E2451 และ L621 ที่เกิดขึ้นในกลุ่มยีนที่แตกต่างกันมักจะพบในแมว / สุนัขสายพันธุ์หรือสายพันธุ์ RVA RVA จากสายพันธุ์อื่น ๆ ที่เป็นเจ้าภาพซึ่งเชื่อว่าจะเป็นแมว / สุนัขต้นกำเนิด RVA ยีน VP2 ของ E2451 และ L621 และยีน NSP3 ของ L621 คลัสเตอร์ในหมู่สายพันธุ์ RVA จากสายพันธุ์ที่แตกต่างกันเป็นเจ้าภาพซึ่งเชื่อว่าจะมีแมวที่สมบูรณ์หรือบางส่วน / ต้นกำเนิด RVA สุนัข ยีน NSP1 ของ E2451 และ L621 และยีน NSP3 E2451 ของคลัสเตอร์กับ AU-1 และสายพันธุ์อื่น ๆ อีกหลายที่มีสายพันธุ์แมวที่สมบูรณ์หรือบางส่วน RVA BA222-05 เหมือนงูจีโนไทป์ ที่ร่วมกันสังเกตเหล่านี้ชี้ให้เห็นว่าเกือบทั้งหมดสิบเอ็ดกลุ่มยีนของ G3P [9] RVA สายพันธุ์ L621 และ E2451 อาจมีต้นตอมาจาก RVAs แมว / สุนัขและที่ reassortments อาจจะเกิดขึ้นในหมู่แมวเหล่านี้ / สุนัขสายพันธุ์ RVA ก่อนที่จะถูกส่งไปยัง มนุษย์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

บทความ outlineshow เต็มร่าง



สรุปย่อคํา 1 บทนำ
2 วัสดุและวิธีการ
3 ผลลัพธ์
4 การอภิปราย
ขอบคุณ
ภาคผนวก A เสริมข้อมูลตัวเลขและตารางอ้างอิง




ภาพตารางที่ 1 ภาพรูป

unlabelled สำหรับรูป unlabelled ( ) - ( K ) ต้นไม้ ซึ่งสร้างจากลำดับนิวคลีโอไทด์ของ vp7 . . .

unlabelled รูปภาพภาพ unlabelled รูปภาพรูป

unlabelled ภาพ unlabelled รูปตาราง S1

เพิ่มเติมเสริมตาราง S2
โฆษณา

การติดเชื้อพันธุศาสตร์และวิวัฒนาการ
เล่ม 16 มิถุนายน 2556 , หน้า 103 - 112


ภาพปกที่หายากของมนุษย์วิวัฒนาการรูปแบบสอง g3p [ 9 ] โรตาไวรัสสายพันธุ์มีแมว / สุนัขชอบไทป์ genotype ในกลุ่มดาว au-1-like H6

หยวน ฮอง wanga , , , เป่ยเป่ย panga ซวน zhoua souvik ghoshb , , , , , , กรุเว่ยเฟิงจินซอง penga Quan หัวหิน , Dun จิน zhoua nobumichi , kobayashib

ดอย : แสดงเพิ่มเติม 10.1016 / j.meegid . 2013.01.016


ได้รับสิทธิและเนื้อหาบทคัดย่อกลุ่มโรตา ( ความหนืด ) g3p [ 9 ] คือ หายาก vp7 – vp4 พันธุกรรม การตรวจพบเป็นครั้งคราวในมนุษย์และแมว นอกจากต้นแบบ g3p [ 9 ] ความเครียดความหนืด / มนุษย์ - TC / JPEG / au-l / 1982 / g3p3 [ 9 ] , จีโนมทั้งหมดของมนุษย์ เพียงสอง g3p [ 9 ] ความหนืด สายพันธุ์ และสองแมว g3p [ 9 ] ความหนืดสายพันธุ์ มาทำการวิเคราะห์เพื่อให้ห่างไกล เปิดเผยรูปแบบการวิวัฒนาการที่แตกต่างจากที่ของ au-1 . เรารายงานมาวิเคราะห์จีโนมทั้งหมดของมนุษย์ สอง g3p [ 9 ] ความหนืดสายพันธุ์ความหนืดมนุษย์ / TC / CHN / l621 / 2006 / g3p [ 9 ] และความหนืด / มนุษย์ WT / CHN / e2451 / 2011 / g3p [ 9 ]พบผู้ป่วยด้วยโรคอุจจาระร่วงในประเทศจีน สายพันธุ์และ l621 e2451 ครอบครอง H6 nsp5 genotype ในกลุ่มจี au-1-like ไม่รายงานก่อนหน้านี้ อย่างไรก็ตาม ไม่ใช่ทั้งหมดของยีนและมี l621 e2451 เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับบรรดา au-1 หรือกับแต่ละอื่น ๆ แสดงให้เห็นลวดลายวิวัฒนาการที่แตกต่างกันระหว่าง rvas au-1-like . การ vp7 vp4 , ,และยีนของ vp6 nsp4 e2451 l621 และพบกลุ่มร่วมกับ [ 9 ] ความหนืด g3p มนุษย์สายพันธุ์ที่เชื่อว่าจะเป็นไปได้แมว / สุนัขและแมวที่มา หรือแรคคูนความหนืด สายพันธุ์สุนัข การ vp1 vp3 , ,และยีนของ nsp2 nsp5 e2451 l621 เกิดขึ้นและกลุ่มที่แตกต่างกันในน้ำหนักมักจะพบในแมว / สุนัขสายพันธุ์สายพันธุ์ชนิดความหนืดหรือความหนืดโฮสต์อื่น ๆซึ่งเชื่อว่าเป็นแมว / สุนัขความหนืดที่มา การ vp2 ของยีน และ l621 e2451 ,และยีน nsp3 ของ l621 เป็นกลุ่มของความหนืดสายพันธุ์จากโฮสต์ชนิดต่าง ๆซึ่งเชื่อว่ามีทั้งหมดหรือบางส่วนที่แมว / สุนัขความหนืดที่มา การ nsp1 ยีนและยีนของ e2451 l621 และ nsp3 ของ e2451 พัวกับ au-1 และสายพันธุ์อื่น ๆหลายครอบครองทั้งหมดหรือบางส่วน ba222-05-like พันธุกรรมสายพันธุ์แมวความหนืดกลุ่มดาว ถ่ายด้วยกันข้อสังเกตเหล่านี้ชี้ให้เห็นว่า เกือบทุกส่วนของยีน 11 g3p [ 9 ] ความหนืดและสายพันธุ์ l621 e2451 อาจมีที่มาจาก rvas แมว / สุนัข และ reassortments อาจเกิดขึ้นระหว่างนี้แมว / สุนัข สายพันธุ์ ความหนืด ก่อนที่จะถูกส่งไปยังมนุษย์