Nested PCR is useful for detecting

Nested PCR is useful for detecting low copy-number
genes in environmental samples. First, we tried to retrieve
the nifH gene fragments from soil samples by PCR only with
primers PolF and AQER, but could not (data not shown). As
direct amplification failed, to increase sensitivity, the nifH
gene fragments were retrieved by nested PCR. Demba Diallo
et al. (7) explained that direct amplification failed using PolF
and AQER in the first PCR due to quite a low nifH copy
number compared with the other nifH gene pools in the sample.
Another possible explanation is contamination, by inhibiting
substances (e.g., humic acids), of the DNA extracted
from soil samples (38). However, in the present study, the
purity of extracted DNA was checked photometrically (based
on spectra and the A260/230 ratio) and the level of contamination
seemed low (data not shown).

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

PCR
ที่ซ้อนกันจะเป็นประโยชน์สำหรับการตรวจสอบการคัดลอกจำนวนต่ำยีนในตัวอย่างด้านสิ่งแวดล้อม ครั้งแรกที่เราพยายามที่จะดึงเศษยีน nifH จากตัวอย่างดินโดยวิธี PCR เฉพาะกับไพรเมอร์และPolF AQER แต่ไม่สามารถ (ไม่ได้แสดงข้อมูล) ขณะที่การขยายโดยตรงล้มเหลวในการเพิ่มความไวที่ nifH ชิ้นส่วนของยีนที่ถูกเรียกโดยวิธี PCR ที่ซ้อนกัน เดมบาอัลโลและอัล (7) อธิบายว่าการขยายโดยตรงล้มเหลวในการใช้ PolF และ AQER ใน PCR เนื่องจากการค่อนข้างแรก nifH ต่ำคัดลอกหมายเลขเทียบกับสระว่ายน้ำอื่นๆ ยีน nifH ในตัวอย่าง. อีกคำอธิบายที่เป็นไปได้คือการปนเปื้อนโดยการยับยั้งสาร (เช่นกรดฮิวมิก) ของดีเอ็นเอที่สกัดจากตัวอย่างดิน(38) อย่างไรก็ตามในการศึกษาปัจจุบันที่ความบริสุทธิ์ของดีเอ็นเอที่สกัดได้ตรวจสอบ photometrically (ขึ้นอยู่กับสเปกตรัมและA260 / 230 อัตราส่วน) และระดับของการปนเปื้อนดูเหมือนต่ำ(ไม่ได้แสดงข้อมูล)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็นประโยชน์สำหรับการตรวจหาเชื้อซ้อนต่ำคัดลอกหมายเลข
ยีนในตัวอย่างสิ่งแวดล้อม ตอนแรกเราพยายามจะดึงเศษ
nifh ยีนจากตัวอย่างดินโดยวิธี PCR ไพรเมอร์และด้วย
polf aqer แต่ไม่สามารถ ( ข้อมูลไม่แสดง ) โดย
( ตรงล้มเหลว เพื่อเพิ่มความไว , nifh
ยีนชิ้นส่วนถูกดึงโดยซ้อน PCR เดมบา diallo
et al .( 7 ) อธิบายว่า การสื่อสารโดยตรงและใช้ polf
aqer ล้มเหลวในการตรวจครั้งแรกเนื่องจากค่อนข้างต่ำคัดลอก
nifh หมายเลขเมื่อเทียบกับอื่น ๆ nifh ยีนสระว่ายน้ำในตัวอย่าง มีการปนเปื้อนที่เป็นไปได้อธิบายอีก

โดยยับยั้งสาร ( เช่น กรดฮิวมิก ) ของดีเอ็นเอที่สกัดได้จากตัวอย่างดิน (
38 ) อย่างไรก็ตาม ในการศึกษา
บริสุทธิ์สกัดดีเอ็นเอตรวจสอบ ( ตาม photometrically
บนสเปกตรัม และ a260 / 230 อัตรา ) และระดับของการปนเปื้อน
ดูเหมือนต่ำ ( ข้อมูลไม่แสดง )