Fungi are an important source of en

Fungi are an important source of enzymes for saccharification of plant polysaccharides and production of biofuels. Understanding of the regulation and induction of expression of genes encoding these enzymes is still incomplete. To explore the induction mechanism, we analysed the response of the industrially important fungus Aspergillus niger to wheat straw, with a focus on events occurring shortly after exposure to the substrate. RNA sequencing showed that the transcriptional response after 6 h of exposure to wheat straw was very different from the response at 24 h of exposure to the same substrate. For example, less than half of the genes encoding carbohydrate active enzymes that were induced after 24 h of exposure to wheat straw, were also induced after 6 h exposure. Importantly, over a third of the genes induced after 6 h of exposure to wheat straw were also induced during 6 h of carbon starvation, indicating that carbon starvation is probably an important factor in the early response to wheat straw. The up-regulation of the expression of a high number of genes encoding CAZymes that are active on plant-derived carbohydrates during early carbon starvation suggests that these enzymes could be involved in a scouting role during starvation, releasing inducing sugars from complex plant polysaccharides. We show, using proteomics, that carbon-starved cultures indeed release CAZymes with predicted activity on plant polysaccharides. Analysis of the enzymatic activity and the reaction products, indicates that these proteins are enzymes that can degrade various plant polysaccharides to generate both known, as well as potentially new, inducers of CAZymes.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เชื้อราเป็นแหล่งสำคัญของเอนไซม์ saccharification polysaccharides พืชและผลิตเชื้อเพลิงชีวภาพ ความเข้าใจข้อบังคับและการเหนี่ยวนำของนิพจน์ของยีนเอนไซม์เหล่านี้เข้าจะยังไม่สมบูรณ์ การสำรวจกลไกเหนี่ยวนำ เรา analysed การตอบสนองของเชื้อราที่สำคัญ industrially ไนเจอร์ Aspergillus ฟางข้าวสาลี โดยเฉพาะเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นหลังจากสัมผัสกับพื้นผิว ลำดับอาร์เอ็นเอพบว่าการตอบสนอง transcriptional หลังจาก 6 h ของการสัมผัสกับฟางข้าวสาลีได้มากแตกต่างจากคำตอบใน 24 ชมของการสัมผัสกับพื้นผิวเดียวกัน ตัวอย่าง น้อยกว่าครึ่งหนึ่งของยีนเอนไซม์ใช้คาร์โบไฮเดรตที่นำหลังจาก 24 ชมของการสัมผัสกับฟางข้าวสาลี การเข้ารหัสยังนำหลังแสง 6 h สำคัญ กว่าหนึ่งในสามของยีนที่เกิดหลังจากยังนำ 6 h ของการสัมผัสกับฟางข้าวสาลีระหว่าง h 6 ของคาร์บอนความอดอยาก บ่งชี้ว่า ความอดอยากของคาร์บอนจะเป็นปัจจัยสำคัญในการตอบสนองต่อต้นข้าวสาลีฟาง สายระเบียบของนิพจน์ของจำนวนยีน CAZymes เข้ารหัสที่ใช้งานอยู่ในโรงงานที่ได้รับคาร์โบไฮเดรตระหว่างช่วงคาร์บอนความอดอยาก แนะนำว่า เอนไซม์เหล่านี้อาจจะเกี่ยวข้องกับบทบาทลูกเสือระหว่างความอดอยาก ปล่อย inducing น้ำตาลจากพืชซับซ้อน polysaccharides สูง เราแสดง ใช้โปรตีโอมิกส์ ว่า วัฒนธรรม starved คาร์บอนแท้ปล่อย CAZymes กับ polysaccharides พืชกิจกรรมคาดการณ์ กิจกรรมเอนไซม์ในระบบและผลิตภัณฑ์ปฏิกิริยา การวิเคราะห์บ่งชี้ว่า โปรตีนเหล่านี้มีเอนไซม์ที่สามารถย่อยสลาย polysaccharides โรงงานต่าง ๆ ในการสร้างทั้งชื่อเสียง ตลอดจนอาจ ใหม่ inducers ของ CAZymes

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เชื้อราเป็นแหล่งสำคัญของเอนไซม์สำหรับ saccharification ของ polysaccharides โรงงานและการผลิตเชื้อเพลิงชีวภาพ ความเข้าใจในกฎระเบียบและการชักนำของการแสดงออกของยีนเอนไซม์เหล่านี้ยังคงไม่สมบูรณ์ ในการสำรวจกลไกการเหนี่ยวนำเราวิเคราะห์การตอบสนองของเชื้อรา Aspergillus อุตสาหกรรมที่สำคัญไนเจอร์ฟางข้าวสาลีให้ความสำคัญกับเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นไม่นานหลังจากที่สัมผัสกับพื้นผิวที่ อาร์เอ็นเอลำดับแสดงให้เห็นว่าการตอบสนองการถอดรหัสหลังจาก 6 ชั่วโมงของการสัมผัสกับฟางข้าวสาลีเป็นความแตกต่างจากการตอบสนองเวลา 24 ชั่วโมงจากการสัมผัสกับพื้นผิวเดียวกัน ยกตัวอย่างเช่นน้อยกว่าครึ่งหนึ่งของยีนเข้ารหัสเอนไซม์ที่ใช้งานคาร์โบไฮเดรตที่ถูกเหนี่ยวนำให้เกิดหลังจาก 24 ชั่วโมงของการสัมผัสกับฟางข้าวสาลีที่ถูกเหนี่ยวนำให้เกิดการสัมผัสหลังจาก 6 ชั่วโมง ที่สำคัญมากกว่าหนึ่งในสามของยีนเหนี่ยวนำให้เกิดหลังจาก 6 ชั่วโมงของการสัมผัสกับฟางข้าวสาลีที่ถูกเหนี่ยวนำให้เกิดในช่วง 6 ชั่วโมงจากความอดอยากคาร์บอนแสดงให้เห็นว่าการอดอาหารคาร์บอนอาจจะเป็นปัจจัยสำคัญในการตอบสนองเร็วฟางข้าวสาลี ขึ้นการควบคุมการแสดงออกของจำนวนมากของยีนที่เข้ารหัส CAZymes ที่มีการใช้งานในคาร์โบไฮเดรตจากพืชที่ได้มาในระหว่างการอดอาหารคาร์บอนต้นแสดงให้เห็นว่าเอนไซม์เหล่านี้อาจจะมีส่วนร่วมในบทบาทหัวเราะเยาะความอดอยากในระหว่างการปล่อยน้ำตาลจากการกระตุ้นให้เกิด polysaccharides พืชที่ซับซ้อน เราจะแสดงโดยใช้โปรตีนที่วัฒนธรรมคาร์บอนหิวโหยแน่นอนปล่อย CAZymes ด้วยกิจกรรมที่คาดการณ์ไว้ใน polysaccharides โรงงาน การวิเคราะห์กิจกรรมของเอนไซม์และผลิตภัณฑ์ปฏิกิริยาบ่งชี้ว่าโปรตีนเหล่านี้จะมีเอนไซม์ที่สามารถลด polysaccharides พืชต่างๆที่จะสร้างทั้งที่รู้จักกันเช่นเดียวกับใหม่ที่อาจเกิดขึ้นจากปฏิกิริยา CAZymes

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เชื้อราที่สำคัญแหล่งที่มาของเอนไซม์สำหรับการผลิตพอลิแซกคาไรด์และถูกพืชเชื้อเพลิงชีวภาพ . ความเข้าใจในระเบียบและการเหนี่ยวนำของการแสดงออกของยีนเข้ารหัสเอ็นไซม์นี้ยังไม่สมบูรณ์ เพื่อศึกษากลไกเหนี่ยวเราวิเคราะห์การตอบสนองของเชื้อรา Aspergillus niger ทางอุตสาหกรรมที่สำคัญให้ฟางข้าวสาลี ,โดยมุ่งเน้นในเหตุการณ์ที่เกิดขึ้นไม่นานหลังจากการใช้สาร ลำดับ RNA พบว่า particle การตอบสนองหลังจาก 6 ชั่วโมงของแสงฟางข้าวสาลีมีมากแตกต่างจากการตอบสนองที่ชั่วโมงที่ 24 ของการสัมผัสกับพื้นผิวเดิม ตัวอย่างเช่น น้อยกว่าครึ่งหนึ่งของยีนเข้ารหัสคาร์โบไฮเดรตปราดเปรียวเอนไซม์ที่ถูกชักนำ หลังจาก 24 ชั่วโมงของแสงสาลี ฟางก็เกิดหลัง 6 ชั่วโมงแสง ที่สำคัญ กว่าหนึ่งในสามของยีนที่เกิดหลังจาก 6 ชั่วโมงของแสงฟางข้าวสาลียังเกิดในช่วง 6 ชั่วโมงของการอดอาหารการอดอาหารคาร์บอนคาร์บอน ระบุว่า อาจเป็นปัจจัยสําคัญในการตอบสนองต้นสาลี ฟางขึ้นการควบคุมการแสดงออกของยีน cazymes จำนวนสูงของการเข้ารหัสที่ใช้ในพืชซึ่งคาร์โบไฮเดรตในระหว่างการอดอาหารคาร์บอนก่อนแสดงให้เห็นว่าเอนไซม์เหล่านี้อาจจะเกี่ยวข้องกับการหัวเราะเยาะบทบาทในระหว่างการอดอาหาร การกระตุ้นโดยน้ำตาลจากพืชที่ซับซ้อน เราใช้แสดงรายการที่คาร์บอนอดวัฒนธรรมแน่นอนปล่อย cazymes กับคาดการณ์กิจกรรมโดยพืช การวิเคราะห์เอนไซม์และผลิตภัณฑ์ของปฏิกิริยาพบว่า โปรตีนเหล่านี้เป็นเอนไซม์ที่สามารถย่อยสลายพืชต่าง ๆโดยสร้างทั้งสองรู้จัก รวมทั้งอาจใหม่ ใช้ของ cazymes .