AbstractIntra-and interspecific DNA

Abstract
Intra-and interspecific DNA variations in the blast resistance gene Pita in wild rice (Oryza rufipogon), cultivated rice (O. sativa), and two other related wild rice species (O. meridionalis and O. officinalis) were analyzed to elucidate the nucleotide polymorphism maintenance mechanisms and evolution of Pita in these species. Nucleotide diversity at silent sites of O. rufipogon Pita was 0.0101, an intermediate value relative to other O. rufipogon nuclear genes. A dimorphic pattern of nucleotide polymorphism was detected in the O. rufipogon Pita region. Inoculation of the blast fungus Magnaporthe oryzae verified that the O. rufipogon Pita gene resides in a dimorphic sequence type. The resistance Pita allele had lower levels of variation than the susceptibility pita allele. A hypothesis of evolutionary relationships indicated that the amino acid mutation in the O. rufipogon Pita protein responsible for the difference between resistance and susceptibility occurred relatively recently. These results suggested that the resistance Pita originated from the susceptibility pita. Nucleotide diversity at replacement sites of the leucine-rich domain (LRD) of both the resistance and susceptibility O. rufipogon pita was low. In tests of neutrality, significantly negative values were detected for the LRD of O. rufipogon susceptibility pita. The low nucleotide diversity at replacement sites of the LRD of the susceptibility pita could be explained by purifying selection. Comparison of Pita between O. rufipogon and O. officinalis revealed an excess of nonconservative amino acid substitutions in the LRD, which could be related to the host-pathogen interaction.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

นามธรรม
ภายในและ interspecific dna รูปแบบในการระเบิดความต้านทานไฟลนก้นยีนในข้าวป่า (Oryza rufipogon) ข้าวที่เพาะปลูก (O. sativa) และอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องทั้งสองสายพันธุ์ข้าวป่า (meridionalis O. และ o. officinalis) มีการวิเคราะห์เพื่ออธิบาย กลไกการบำรุงรักษาเบื่อหน่ายหลายรูปแบบและวิวัฒนาการของไฟลนก้นในสายพันธุ์เหล่านี้ เบื่อหน่ายความหลากหลายที่เว็บไซต์ของเงียบ orufipogon ไฟลนก้นเป็น 0.0101 ค่ากลางเมื่อเทียบกับ o อื่น ๆ rufipogon ยีนนิวเคลียร์ รูปแบบของ dimorphic เบื่อหน่าย polymorphism ถูกตรวจพบใน o rufipogon ภูมิภาคไฟลนก้น การฉีดวัคซีนของ Magnaporthe oryzae ระเบิดเชื้อรายืนยันว่า o rufipogon ยีนไฟลนก้นอยู่ในประเภทลำดับ dimorphicอัลลีลต้านทานไฟลนก้นมีระดับที่ต่ำกว่าของการเปลี่ยนแปลงกว่าอัลลีลไวต่อไฟลนก้น สมมติฐานของความสัมพันธ์ของว​​ิวัฒนาการชี้ให้เห็นว่าการกลายพันธุ์กรดอะมิโนใน o rufipogon โปรตีนไฟลนก้นรับผิดชอบสำหรับความแตกต่างระหว่างความต้านทานและความอ่อนแอที่เกิดขึ้นค่อนข้างเร็ว ผลลัพธ์เหล่านี้ชี้ให้เห็นว่าไฟลนก้นต้านทานมาจากความอ่อนแอของไฟลนก้นเบื่อหน่ายความหลากหลายในเว็บไซต์แทนของโดเมน leucine ที่อุดมด้วย (LRD) ของทั้งสองความต้านทานและความอ่อนแอ o rufipogon ไฟลนก้นต่ำ ในการทดสอบของความเป็นกลางค่าเชิงลบอย่างมีนัยสำคัญได้รับการตรวจพบของ lrd o rufipogon ไวต่อไฟลนก้น เบื่อหน่ายความหลากหลายต่ำที่เว็บไซต์แทน lrd ไฟลนก้นของความอ่อนแอที่อาจจะอธิบายได้ด้วยการเลือกบริสุทธิ์การเปรียบเทียบระหว่าง o ไฟลนก้น rufipogon และ o officinalis เปิดเผยเกิน nonconservative แทนกรดอะมิโนใน lrd ซึ่งอาจจะเกี่ยวข้องกับการทำงานร่วมกันเป็นเจ้าภาพการติดเชื้อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

นามธรรม
Intra-interspecific รูปดีเอ็นเอในยีนต้านทานระเบิด Pita ข้าวข้าวป่า (Oryza rufipogon), cultivated (O. ซา), และสองการพันธุ์ข้าวป่า (O. meridionalis และ O. officinalis) ได้วิเคราะห์การ elucidate นิวคลีโอไทด์โพลีมอร์ฟิซึมบำรุงรักษากลไกและวิวัฒนาการของ Pita ในสายพันธุ์เหล่านี้ ความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์ที่อเมริกาเงียบของโอ rufipogon Pita 0.0101 ค่ากลางสัมพันธ์อื่น ๆ O. rufipogon นิวเคลียร์ยีนได้ รูปแบบของนิวคลีโอไทด์โพลีมอร์ฟิซึม dimorphic พบในภูมิภาค Pita O. rufipogon Inoculation ระเบิดเชื้อรา Magnaporthe แห้งระดับต่าง ๆ การตรวจสอบว่า ยีน Pita O. rufipogon อยู่ในชนิดลำดับ dimorphic ระดับความผันแปรต่ำกว่า allele ปิตาภูมิไวรับ allele Pita ต้านทานได้ สมมติฐานความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการของระบุว่า กลายพันธุ์กรดอะมิโนใน O. rufipogon Pita โปรตีนชอบความแตกต่างระหว่างความต้านทานและภูมิไวรับเกิดค่อนข้างล่าสุด ผลลัพธ์เหล่านี้แนะนำว่า ต่อต้าน Pita มาจากปิตาภูมิไวรับ ความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์ที่เปลี่ยนไซต์โดเมน leucine ริช (LRD) ความต้านทานและภูมิไวรับ O. rufipogon ปิตาอยู่ในระดับต่ำ ในการทดสอบความเป็นกลาง มีค่าลบพบสำหรับปิตาภูมิไวรับ rufipogon LRD โอ ความหลากหลายต่ำนิวคลีโอไทด์ที่เปลี่ยนไซต์ของ LRD ของปิตาภูมิไวรับสามารถอธิบายได้ โดยบริสุทธิ์เลือก เปรียบเทียบของ Pita ระหว่าง O. rufipogon O. officinalis เปิดเผยมากเกินของกรดอะมิโน nonconservative ใน LRD ซึ่งอาจเกี่ยวข้องกับการโต้ตอบที่โฮสต์การศึกษา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็นนามธรรม
ภายใน และ interspecific ดีเอ็นเอที่แตกต่างกันในการต่อต้านการระเบิดยีน pita ในป่าข้าว(สิ้น rufipogon ),ปลูกข้าว( O กระท่อม Sativa Sanur มีระดับ)และอีกสองสายพันธุ์ข้าวป่าที่เกี่ยวข้อง( O meridionalis และ O officinalis )ได้วิเคราะห์ถึงจะอธิบายถึงการบำรุงรักษาที่ nucleotide polymorphism กลไกและวิวัฒนาการของ pita ในสายพันธุ์. ความหลากหลายที่ไซต์ nucleotide เงียบของ Opita rufipogon เป็น 0.0101 ค่ากลางที่เกี่ยวข้องกับนิวเคลียร์ยีน rufipogon O อื่นๆ รูปแบบ dimorphic ของ polymorphism nucleotide มีการตรวจพบใน ภูมิภาค O rufipogon pita ได้ เพาะ(ความคิด)ของ oryzae magnaporthe เห็ดหูหนูเป็นเหตุให้ได้รับการรับรองว่ายีน. O rufipogon pita ที่อยู่ใน ประเภท ตามลำดับ dimorphic ที่allele pita ความต้านทานที่มีระดับต่ำกว่าของการเปลี่ยนแปลงกว่า allele pita ความไวได้ สมมติฐานของวิวัฒนาการความสัมพันธ์ระบุไว้ว่าคือมันกรดอะมิโนที่ O pita rufipogon โปรตีนที่เป็นผู้รับผิดชอบสำหรับความแตกต่างระหว่างการต่อต้านและความไวเกิดขึ้นเมื่อไม่นานมานี้ค่อนข้าง ผลการทดสอบนี้แนะนำว่า pita การต่อต้านที่มีต้นกำเนิดจาก pita ความไวได้ความหลากหลาย nucleotide ที่ไซต์การเปลี่ยน leucine - ที่โดเมน( LRD )ในการต่อต้านและ pita ความไว O rufipogon ทั้งสองอยู่ในระดับต่ำ ในการทดสอบของความเป็นกลางอย่างมีนัยสำคัญค่าติดลบจะถูกตรวจจับสำหรับ LRD ของ pita ความไว rufipogon O . ความหลากหลาย nucleotide ระดับต่ำที่ไซต์การเปลี่ยน LRD ของ pita ความไวที่ไม่สามารถอธิบายได้ว่าสาเหตุการเลือกการทำน้ำบริสุทธิ์การเปรียบเทียบ pita ระหว่าง O . O . officinalis และ rufipogon เผยให้เห็นส่วนเกินของกรดอะมิโน nonconservative อะไหล่ใน LRD ซึ่งไม่สามารถมีความสัมพันธ์กับการโฮสต์ - เชื้อได้