We introduce a general probabilisti

We introduce a general probabilistic model of the gene structure of
human genomic sequences which incorporates descriptions of the basic
transcriptional, translational and splicing signals, as well as length distributions
and compositional features of exons, introns and intergenic
regions. Distinct sets of model parameters are derived to account for the
many substantial differences in gene density and structure observed in
distinct C ‡ G compositional regions of the human genome. In addition,
new models of the donor and acceptor splice signals are described which
capture potentially important dependencies between signal positions. The
model is applied to the problem of gene identi®cation in a computer program,
GENSCAN, which identi®es complete exon/intron structures of
genes in genomic DNA. Novel features of the program include the capacity
to predict multiple genes in a sequence, to deal with partial as
well as complete genes, and to predict consistent sets of genes occurring
on either or both DNA strands. GENSCAN is shown to have substantially
higher accuracy than existing methods when tested on standardized
sets of human and vertebrate genes, with 75 to 80% of exons identi®ed
exactly. The program is also capable of indicating fairly accurately the reliability
of each predicted exon. Consistently high levels of accuracy are
observed for sequences of differing C ‡ G content and for distinct groups
of vertebrates.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เราแนะนำแบบ probabilistic ทั่วไปของโครงสร้างยีนของลำดับ genomic มนุษย์ซึ่งประกอบด้วยคำอธิบายของพื้นฐานสัญญาณ transcriptional, translational และ splicing ตลอดจนการกระจายของความยาวและคุณลักษณะ compositional ของ exons, introns และ intergenicขอบเขตการ มาชุดทั้งหมดของพารามิเตอร์รูปแบบบัญชีสำหรับการความแตกต่างที่พบมากในยีนความหนาแน่นและโครงสร้างที่พบในหมด C G compositional ภูมิภาคของกลุ่มมนุษย์ นอกจากนี้รุ่นใหม่ของประกบผู้บริจาคและ acceptor สัญญาณมีอธิบายที่จับอาจสำคัญเชื่อมโยงระหว่างสัญญาณตำแหน่ง ที่ใช้รูปแบบของยีน identi ® cation ในโปรแกรมคอมพิวเตอร์GENSCAN, identi ที่ ® เอสสมบูรณ์ exon/intron โครงสร้างของยีนใน genomic DNA นวนิยายของโปรแกรมมีกำลังการผลิตการทำนายยีนหลายตามลำดับ การจัดการกับบางส่วนที่เป็นดีสมบูรณ์ยีน และ การทำนายสอดคล้องชุดของยีนที่เกิดขึ้นบน strands DNA อย่างใดอย่างหนึ่ง หรือทั้งสอง GENSCAN จะแสดงได้มากความแม่นยำสูงกว่าวิธีการที่มีอยู่เมื่อทดสอบในมาตรฐานชุดของยีนมนุษย์ และหลอด 75-80% ของ exons identi ® edถูกต้อง โปรแกรมนี้ยังสามารถแสดงธรรมได้อย่างถูกต้องความน่าเชื่อถือแต่ละทำนาย exon มีความแม่นยำในระดับสูงอย่างสม่ำเสมอสังเกตลำดับของเนื้อหา C G แตกต่างกัน และกลุ่มที่แตกต่างกันของ vertebrates

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เราแนะนำน่าจะเป็นรูปแบบทั่วไปของโครงสร้างยีนลำดับจีโนมของมนุษย์ซึ่งประกอบด้วยรายละเอียดของขั้นพื้นฐานการถอดรหัส, แปลและสัญญาณประกบเช่นเดียวกับระยะเวลาในการกระจายและคุณสมบัติของ compositional exons, introns และ intergenic ภูมิภาค ชุดที่แตกต่างของพารามิเตอร์แบบที่ได้รับการบัญชีสำหรับความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญจำนวนมากในความหนาแน่นของยีนและโครงสร้างการปฏิบัติในC ที่แตกต่างกัน ?? G ภูมิภาค compositional ของจีโนมมนุษย์ นอกจากนี้รูปแบบใหม่ของผู้บริจาคและสัญญาณประกบใบเสร็จจะมีคำอธิบายที่จับภาพที่อาจเกิดขึ้นที่สำคัญระหว่างการอ้างอิงตำแหน่งของสัญญาณ รูปแบบถูกนำไปใช้ในการแก้ไขปัญหาของidenti®cationยีนในโปรแกรมคอมพิวเตอร์GENSCAN ซึ่งidenti®esเอกซ์ซอนสมบูรณ์ / intron โครงสร้างของยีนในดีเอ็นเอ คุณสมบัติใหม่ของโปรแกรมรวมถึงความสามารถในการที่จะคาดการณ์ยีนหลายตัวในลำดับที่จะจัดการกับบางส่วนเป็นเดียวกับยีนที่สมบูรณ์และชุดที่จะคาดการณ์ที่สอดคล้องกันของยีนที่เกิดขึ้นในหนึ่งหรือทั้งสองเส้นดีเอ็นเอ GENSCAN แสดงให้เห็นว่ามีนัยสำคัญความถูกต้องสูงกว่าวิธีการที่มีอยู่เมื่อทดสอบมาตรฐานในชุดของยีนของมนุษย์และสัตว์มีกระดูกสันหลังที่มี75-80% ของ exons identi®edว่า โปรแกรมนี้ยังมีความสามารถในการแสดงให้เห็นอย่างเป็นธรรมอย่างถูกต้องน่าเชื่อถือของแต่ละเอกซ์ซอนที่คาดการณ์ไว้ อย่างต่อเนื่องในระดับสูงของความถูกต้องมีการตั้งข้อสังเกตสำหรับลำดับที่แตกต่างกันของ C ?? G เนื้อหาและกลุ่มที่แตกต่างของสัตว์มีกระดูกสันหลัง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เราแนะนำรูปแบบการทั่วไปของยีนโครงสร้างของจีโนมลำดับ
มนุษย์ซึ่งประกอบด้วยคำอธิบายของขั้นพื้นฐาน
particle แปลและ splicing , สัญญาณ , เช่นเดียวกับความยาวและคุณสมบัติที่มีส่วนประกอบของการแจกแจง
introns และภูมิภาค , ส่า

ชุดของพารามิเตอร์ของแบบจำลองที่แตกต่างกันซึ่งมีบัญชีสำหรับ
หลายมากมายความแตกต่างในความหนาแน่นของโครงสร้างยีนที่แตกต่างกัน C G )
‡ส่วนประกอบภูมิภาคของจีโนมมนุษย์ นอกจากนี้
รุ่นใหม่ของผู้บริจาคและพระนาสิกตัดต่อสัญญาณอธิบายที่สำคัญระหว่างตำแหน่งการอ้างอิงอาจ
จับสัญญาณ
แบบที่ใช้กับปัญหาของยีน identi ®ไอออนบวกในโปรแกรมคอมพิวเตอร์
genscan , ,ซึ่ง identi ® ES สมบูรณ์ 8 / iNtRON โครงสร้างของยีนในจีโนมของ DNA
. คุณสมบัติใหม่ของโปรแกรมรวมถึงความจุ
ทำนายหลายยีนในลำดับจัดการกับบางส่วนที่
รวมทั้งยีนที่สมบูรณ์ และทำนายชุดสอดคล้องของยีนเกิดขึ้น
บนอย่างใดอย่างหนึ่ง หรือทั้งสอง ดีเอ็นเอเส้น . genscan แสดงให้เห็นอย่างเต็มที่
ความถูกต้องสูงกว่าวิธีเดิม เมื่อทดสอบในชุดมาตรฐาน
ของมนุษย์และสัตว์มีกระดูกสันหลังยีน กับ 75 ถึง 80% ของโค identi ®เอ็ด
ทุกประการ โปรแกรมนี้ยังสามารถระบุค่อนข้างถูกต้องความน่าเชื่อถือ
แต่ละคาดการณ์เอ็กซ . อย่างมีระดับสูงของความถูกต้องเป็น
) ลำดับต่างกัน C ‡กรัม เนื้อหา และกลุ่ม
ของสัตว์มีกระดูกสันหลังที่แตกต่างกัน