White spot syndrome virus (WSSV) co

White spot syndrome virus (WSSV) continues to be the most pathogenic among the penaeid shrimp viruses. In this study, WSSV DNA was
detected in pond soil samples using a 2-step nested PCR. Primers described previously were used for the first round of amplification and based on
the sequenced amplicon, an inner primer was designed for the 2nd round of amplification. Using plasmid DNA (pET 100) containing the 211 bp
target WSSV sequence, analytical sensitivity showed that the 2-step nested PCR protocol was able to detect down to 0.015 fg of the plasmid DNA,
or approximately 2 copies of the target DNA sequence. Persistence of WSSV DNA in pond soil samples after various time intervals was determined.
WSSV-specific PCR product (161 bp) was still present in the soil samples even after 10 months of storage. The effect of soil heat treatment on the
WSSV DNA was also examined. Soils were subjected to 25, 37, 50 and 70 ◦C for 1, 3 and 5 days. The results showed that PCR amplifiable WSSV
DNA was still present even after 5 days at 70 ◦C. To our knowledge, this is the first report on the detection of WSSV DNA in soil samples. Based
on these findings, it is concluded that the persistence of viral DNA in soil habitats may be an important aspect of WSSV ecology and may have an
implication for viral transmissibility.
© 2008 Elsevier B.V. All rights reserved.
Keywords: White spot syndrome virus (WSSV); Pond soil; Nested-PCR; Persistence

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไวรัสโรคจุดขาว (WSSV) ยังคงเป็นที่ทำให้เกิดโรคมากที่สุดในหมู่ไวรัสกุ้ง ในการศึกษานี้ WSSV ดีเอ็นเอ
ที่ตรวจพบในบ่อดินโดยใช้ขั้นตอนที่ 2 ที่ซ้อนกัน PCR ไพรเมอร์ที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ที่ใช้ในรอบแรกของการขยายและอยู่บนพื้นฐาน
amplicon ติดใจ, ไพรเมอร์ภายในถูกออกแบบมาสำหรับรอบที่ 2 ของการขยาย การใช้พลาสมิดดีเอ็นเอ (PET 100) ที่มี 211 bp
เป้าหมายลำดับ WSSV, ความไวในการวิเคราะห์แสดงให้เห็นว่าขั้นตอนที่ 2 ซ้อนโปรโตคอล PCR ก็สามารถที่จะตรวจสอบลงไป 0.015 FG ของพลาสมิดดีเอ็นเอ,
หรือประมาณ 2 สำเนาของลำดับดีเอ็นเอเป้าหมาย ความคงทนของดีเอ็นเอของตัวแดงดวงขาวในบ่อดินหลังจากช่วงเวลาต่างๆได้กำหนด.
ผลิตภัณฑ์ PCR WSSV เฉพาะ (161 bp) ก็ยังคงอยู่ในตัวอย่างดินแม้หลังจาก 10 เดือนของการจัดเก็บข้อมูล ผลของการรักษาความร้อนของดินบน
ดีเอ็นเอ WSSV ถูกตรวจสอบยัง ดินถูกยัดเยียดให้ 25, 37, 50 และ 70 ◦C 1, 3 และ 5 วัน ผลการศึกษาพบว่าวิธี PCR amplifiable WSSV
ดีเอ็นเอก็ยังคงอยู่แม้หลังจากที่ 5 วันที่ 70 ◦C เพื่อความรู้ของเรานี้เป็นครั้งแรกในรายงานการตรวจสอบดีเอ็นเอ WSSV ในตัวอย่างดิน จาก
ผลการวิจัยเหล่านี้ก็จะได้ข้อสรุปว่าการคงอยู่ของดีเอ็นเอของไวรัสในแหล่งที่อยู่อาศัยในดินอาจจะเป็นสิ่งสำคัญของระบบนิเวศ WSSV และอาจจะมี
ความหมายสำหรับ transmissibility ไวรัส.
© 2008 Elsevier BV สงวนลิขสิทธิ์.
คำสำคัญ: ไวรัสโรคจุดขาว (WSSV ); บ่อดิน; ซ้อนกัน-PCR; การติดตา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไวรัสโรคจุดขาว ( ี ) ยังคงเป็นเชื้อโรคมากที่สุดของชนิดไวรัสกุ้ง ในการศึกษานี้พบว่าดีเอ็นเอ
ีในบ่อดินที่ใช้เป็นขั้นตอนที่ 2 ด้วย PCR ไพรเมอร์ที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ถูกใช้สำหรับรอบแรกของการขยายและตามลำดับและ
, รองพื้นด้านในได้รับการออกแบบสำหรับรอบที่ 2 ของการขยาย .โดยใช้พลาสมิดดีเอ็นเอ ( สัตว์เลี้ยง 100 ) ที่มี 211 bp
ีเป้าหมายลำดับวิเคราะห์ความอ่อนไหว พบว่า ขั้นตอนที่ 2 ซ้อนกันเป็นโปรโตคอล PCR สามารถตรวจพบลง FG ของพลาสมิดดีเอ็นเอ 3
, หรือประมาณ 2 ชุดของดีเอ็นเอเป้าหมายตามลําดับ ความคงอยู่ของดีเอ็นเอในตัวอย่างดินบ่อีตามช่วงเวลาต่าง ๆถูกกำหนด .
ผลิตภัณฑ์ PCR ีเฉพาะ ( 161 BP ) ยังคงมีอยู่ในตัวอย่างดินหลังจาก 10 เดือนของการจัดเก็บข้อมูล ผลของการรักษาความร้อน ดิน
ี DNA ยังตรวจสอบ ดินมีจำนวน 25 , 37 , 50 และ 70 ◦ C 1 , 3 และ 5 วัน ผลการศึกษาพบว่า PCR amplifiable ี
ดีเอ็นเอยังปัจจุบัน หลังจาก 5 วัน ที่อุณหภูมิ 70 ◦ C เพื่อความรู้ของเรานี่คือรายงานแรกในการตรวจหาดีเอ็นเอ ีในตัวอย่างดิน โดย
ผลการวิจัยครั้งนี้สรุปได้ว่า การดำรงอยู่ของไวรัสดีเอ็นเอในพื้นที่ดินอาจจะกว้างยาวสำคัญของระบบนิเวศ และอาจมีีความหมายสำหรับการส่งผ่านไวรัส
.
© 2008 สามารถนำเสนอสงวนลิขสิทธิ์ .
คำสำคัญ : ไวรัสโรคจุดขาว ( ี ) ; บ่อดิน ด้วย PCR ; เก็บรักษา