Genetic diversity of microsatellite

Genetic diversity of microsatellite markers
A total of 260 progeny and 10 parents were collected from five full-sib families of S. chuatsi (named HA, HB, HC, HD and HE), with each family containing 52 offspring. Then these individuals were genotyped by ten microsatellite markers (The information of these ten markers was shown in Table 1). The number of alleles (Na) ranged from 4 to 7, with an average of 5.4 alleles per locus (Table 2). The polymorphism information content (PIC), observed and expected heterozygosity (Ho and He) ranged from 0.406 to 0.953, from 0.498 to 0.823 and from 0.437 to 0.797, respectively. The mean PIC, Ho and He were 0.644, 0.732 and 0.689. Nine loci showed high informative (PIC > 0.5), only one locus (Locus Sin142) exhibited middle informative (0.25 < PIC < 0.5) (Botstein et al., 1980). The Hardy–Weinberg test results indicated four out of ten markers did not follow Hardy–Weinberg equilibrium this may be caused by the existence of null alleles, limited amounts of sampling and nonrandomly mating (Ma et al., 2013). Null allele frequency estimates from CERVUS 3.0 algorithm lay between 0 and 0.24% for all loci analyzed in this study. No linkage was detected among the ten microsatellite marker

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเมตตาจำนวน 260 ลูกหลานและผู้ปกครอง 10 ถูกเก็บรวบรวมจากครอบครัวเต็มสิบห้าของ S. chuatsi (ชื่อฮา HB, HC, HD และเขา), กับทุกครอบครัวที่ประกอบด้วยลูกหลานที่ 52 แล้ว บุคคลเหล่านี้ถูก genotyped โดยเครื่องหมายชนิด microsatellite สิบ (รายละเอียดของเครื่องหมายเหล่านี้สิบถูกแสดงในตารางที่ 1) หมายเลขของ alleles (นา) อยู่ในช่วงตั้งแต่ 4 ถึง 7 โดยเฉลี่ย 5.4 alleles ต่อโลกัสโพล (ตาราง 2) โพลิมอร์ฟิซึมข้อมูลเนื้อหา (PIC), สังเกต และคาด heterozygosity (โฮจิมินห์และเขา) อยู่ในช่วงจาก 0.406 กับ 0.953 จาก 0.498 กับ 0.823 และ 0.437 กับ 0.797 ตามลำดับ รูปภาพหมายถึง โฮจิมินห์ และเขาถูก 0.644, 0.732 และ 0.689 เก้า loci พบสูงข้อมูล (PIC > 0.5), เพียงหนึ่งโลกัสโพล (Sin142 โลกัสโพล) จัดแสดงข้อมูลกลาง (0.25 < PIC < 0.5) (Botstein et al., 1980) ผลการทดสอบของ Hardy – Weinberg ระบุเครื่องหมายของสี่สิบได้ตามสมดุล Hardy – Weinberg นี้อาจเกิดจากการดำรงอยู่ของ null alleles จำนวนที่จำกัดของการสุ่มตัวอย่างและการผสมพันธุ์ nonrandomly (Ma et al., 2013) ประเมินความถี่ของ allele เป็น null จากอัลกอริทึม CERVUS 3.0 วางระหว่าง 0 และ 0.24 สำหรับ loci ที่วิเคราะห์ในการศึกษานี้ทั้งหมด เชื่อมโยงไม่พบระหว่างเครื่องหมายชนิด microsatellite สิบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเครื่องหมายไมโครรวม 260 ลูกหลานและ 10 ผู้ปกครองที่ถูกเก็บรวบรวมจากห้าครอบครัวเต็ม SIB เอส chuatsi (ชื่อ HA, HB, HC, HD และ HE) กับแต่ละครอบครัวที่มีลูกหลาน 52
แล้วบุคคลเหล่านี้ถูก genotyped สิบเครื่องหมายไมโคร (ข้อมูลเหล่านี้สิบเครื่องหมายถูกแสดงในตารางที่ 1) จำนวนของอัลลีล (นา) อยู่ในช่วง 4-7 มีค่าเฉลี่ย 5.4 ต่ออัลลีลสถานที่ (ตารางที่ 2) เนื้อหาข้อมูลที่แตกต่าง (PIC) ตั้งข้อสังเกตและคาดว่า heterozygosity (โฮและเขา) อยู่ระหว่าง 0.406-0.953, 0.498-0.823 และ 0.437-0.797 ตามลำดับ ค่าเฉลี่ย PIC โฮและเขาเป็น 0.644, 0.732 และ 0.689 เก้าตำแหน่งสูงแสดงให้เห็นข้อมูล (PIC> 0.5) เพียงหนึ่งในสถานที่ (ที Sin142) แสดงข้อมูลกลาง (0.25 <PIC <0.5) (Botstein et al., 1980) ฮาร์ดี-Weinberg ผลการทดสอบแสดงให้เห็นสี่สิบเครื่องหมายไม่ได้ทำตามสมดุล Hardy-Weinberg นี้อาจจะเกิดจากการดำรงอยู่ของอัลลีลโมฆะจำนวน จำกัด ของการสุ่มตัวอย่างและการผสมพันธุ์ nonrandomly (Ma et al., 2013) ประมาณการความถี่อัลลีล Null จากอัลกอริทึม Cervus 3.0 อยู่ระหว่าง 0 และ 0.24% สำหรับทุกตำแหน่งการวิเคราะห์ในการศึกษาครั้งนี้ การเชื่อมโยงไม่ได้รับการตรวจพบในหมู่เครื่องหมายไมโครสิบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์
รวม 260 ลูกหลานและพ่อแม่ถูกเก็บจากห้าเต็มสิบครอบครัวของเอส chuatsi ( ชื่อฮา , HB , HC , HD และเขา ) ให้กับแต่ละครอบครัวที่มีแต่ลูกหลาน แล้วบุคคลเหล่านี้ genotyped สิบเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์ ( รายละเอียดของเครื่องหมายเหล่านี้สิบถูกแสดงในตารางที่ 1 ) จำนวนอัลลีล ( นา ) อยู่ระหว่าง 4 ถึง 7โดยเฉลี่ย 5.4 อัลลีลต่อโลกัส ( ตารางที่ 2 ) ข้อมูล polymorphism content ( PIC ) , ตรวจสอบ และคาดว่าเฉพาะที่ ( โฮเขา ) อยู่ระหว่าง 0.406 เพื่อ 0.953 จาก 0.498 เพื่อ 0.823 และจากการ 0.797 0.437 ตามลำดับ หมายถึงรูปโฮและเขา 0.644 0.732 , และ 0.689 . เก้าของข้อมูลมีค่าสูง ( รูป + ) เพียงหนึ่งสถานที่ ( สถานที่ sin142 ) แสดงข้อมูลกลาง ( 0รูปที่ 25 < < 0.5 ) ( botstein et al . , 1980 ) และทดสอบ hardy Weinberg พบสี่จากสิบเครื่องหมายไม่ได้เป็นไปตาม Hardy Weinberg ) สมดุลนี้อาจจะเกิดจากการมีอยู่ของ null อัลลีล , ปริมาณ จำกัด ของคน และ nonrandomly ผสมพันธุ์ ( ma et al . , 2013 ) ความถี่อัลลีลในขั้นตอนวิธีประมาณการจากนครราชสีมา 3.0 วางระหว่าง 0 และร้อยละ 0.24 สำหรับเทคนิควิเคราะห์ในการศึกษานี้