AbstractThe genome of Thai-isolate

Abstract

The genome of Thai-isolate of tomato yellow leaf curl virus (TYLCV-THL), a bipartite geminivirus, was cloned and the nucleotide sequence was analysed. The genome designated component A and B are 2751 and 2737 nucleotides long, respectively. The component A contains seven open reading frames (ORFs) with coding potential for proteins of molecular weight more than 10,000 Daltons. The component B has totally three ORFs on both strands. Computer-based analysis to compare nucleotide sequence of TYLCV-THL DNAs and the predicted amino acids with other selected geminiviruses indicated high degree of similarity with geminivirus which infected tomato in Australia and Israel for the component A. The component B showed greater homology of amino acid sequence with those of cassava latent and squash leaf curl geminiviruses.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อจีโนมของไทยแยกเชื้อไวรัสขดใบเหลืองมะเขือเทศ (TYLCV-THL) ซึ่งเป็นเจมิฝ่ายเป็นโคลนและลำดับเบสได้รับการวิเคราะห์ องค์ประกอบที่กำหนดจีโนม A และ B เป็น 2,751 และ 2,737 นิวคลีโอยาวตามลำดับ ส่วนประกอบที่มีเจ็ดเฟรมอ่านเปิด (ORFs) ที่มีการเข้ารหัสที่มีศักยภาพสำหรับโปรตีนที่มีน้ำหนักโมเลกุลมากกว่า 10,000 Daltons องค์ประกอบ B มีทั้งหมดสาม ORFs บนเส้นทั้งสอง การวิเคราะห์คอมพิวเตอร์ที่ใช้ในการเปรียบเทียบลำดับเบสของ TYLCV-THL DNAs ที่คาดการณ์และกรดอะมิโนที่มีเจมินีเลือกอื่น ๆ ที่ระบุไว้ในระดับสูงของความคล้ายคลึงกันกับเจมิซึ่งติดเชื้อมะเขือเทศในประเทศออสเตรเลียและอิสราเอลสำหรับองค์ประกอบเอองค์ประกอบ B แสดงให้เห็นคล้ายคลึงกันมากขึ้นของกรดอะมิโน ลำดับที่มีผู้แฝงมันสำปะหลังและม้วนใบสควอชเจมินี

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

นามธรรม

จีโนมของไทยแยกเชื้อไวรัสใบหงิกเหลืองของมะเขือเทศ ( tylcv-thl ) , ทวิภาคี geminivirus , โคลนและวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ . จีโนมเขตชิ้นส่วน A และ B และความเป็นมา 2737 นิวคลีโอไทด์ยาวตามลำดับ ส่วนประกอบที่ประกอบด้วยเจ็ด open reading frames ( orfs ) ด้วยการเข้ารหัสโปรตีนที่มีน้ำหนักโมเลกุลมากกว่า 10 , 000 ดาลตัน .ส่วน B มีทั้งหมด 3 orfs ทั้งสองเส้น . คอมพิวเตอร์ที่ใช้วิเคราะห์เพื่อเปรียบเทียบลำดับนิวคลีโอไทด์ของ tylcv-thl จำเพาะและคาดการณ์กรดอะมิโน geminiviruses เลือกอื่น ๆพบระดับสูงของความคล้ายคลึงกันกับ geminivirus ซึ่งติดเชื้อมะเขือเทศในออสเตรเลียและอิสราเอล ส่วนประกอบ 1 .องค์ประกอบ B พบมากขึ้นเป็นลำดับกรดอะมิโนที่มีแป้งมันสำปะหลังแฝงและสควอชใบหงิก geminiviruses .