Genomic DNA was prepared from 38 S. formosus samples (including golden arowana, green arowana and red arowana)
originating from Southeast Asia (Table 1). Amplicons of three mitochondrial DNA (mtDNA) regions, namely 12S,16S and cox3,
among the S. formosus individuals were amplified individually and subjected to agarose gel electrophoresis. The PCR products
for each mtDNA region were detected, and there were no size variations on the agarose gel among any of the amplicons
examined (not shown).
Sequence data for the mitochondrial genes, 12S, 16S and cox3, from a total of 38 individuals were aligned, with a further
five obtained from GenBank, providing a total of 43 sequences. The data consisted of a concatenated alignment of 1793
nucleotides: 601 bp in length for p12S, 628 bp for p16S, and 564 bp for pcox3. The A þT contents of the sequences were 49.9–
50.3% (p12S), 51.0–51.8% (p16S) and 49.7–51.2% (pcox3), which is consistent with previous reports of the AT content for the
arowana species (Inoue et al., 2001; Yue et al., 2006). Information regarding the number of base frequencies and the variable
and parsimony informative sites of the mtDNA loci is explained in Table 3.
Surprisingly, little inter-variety sequence variation existed among the different varieties of S. formosus, with values ranging
from 0 to 1.66% for p12S, 0–2.4% for p16S and from 0 to 3.2% for pcox3 (Table 4). Within the red arowana samples, the genetic
variation of p12S, p16S and pcox3 was 0–0.5%, 0.2–1.8% and 0.4–3.2%, respectively. Sequence variation among the green
arowana samples was 0–1.3% (p12S), 0.3–2.4% (p16S) and 0.4–2.5% (pcox3). The sequence differences among golden arowana
dna จีโนมได้รับการจัดทำขึ้นจาก 38 s ตัวอย่างฟอร์มอซัส (รวมถึง arowana ทอง arowana สีเขียวและสีแดง arowana)
ที่มาจากเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ (ตารางที่ 1) amplicons สามยลดีเอ็นเอ (mtDNA) ภูมิภาค 12s คือ 16s และ cox3
ในหมู่ s บุคคล formosus ถูกขยายรายบุคคลและยัดเยียดให้อิเจล agarose pcr ผลิตภัณฑ์
สำหรับภูมิภาค mtDNA แต่ละถูกตรวจพบและไม่มีรูปแบบขนาดที่เจล agarose หมู่ใด ๆ ของ amplicons
ตรวจสอบ (ไม่แสดง).
ข้อมูลลำดับสำหรับยีนยล, 12s, 16s และ cox3, จากทั้งหมด 38 บุคคลที่ถูกจัดชิดกับอีกห้า
ที่ได้รับจาก genbank ให้รวม 43 ลำดับ ข้อมูลประกอบการจัดตำแหน่งการตัดแบ่ง 1793
นิวคลีโอ: 601 bp ในความยาว p12s, 628 bp เพื่อ p16s,และ 564 bp เพื่อ pcox3 THT เนื้อหาของลำดับที่ 49.9-
50.3% (p12s) 51.0-51.8% (p16s) และ 49.7-51.2% (pcox3) ซึ่งสอดคล้องกับรายงานก่อนหน้านี้ของที่เนื้อหาสำหรับสายพันธุ์ปลาตะพัดอเมริกาใต้
(อิโนอุเอะ et al, 2001;.. yue et al, 2006) ข้อมูลเกี่ยวกับจำนวนของความถี่พื้นฐานและตัวแปร
และเว็บไซต์ให้ข้อมูลความประหยัดของตำแหน่ง mtDNA จะมีการอธิบายในตารางที่ 3.
น่าแปลกใจลำดับระหว่างความหลากหลายรูปแบบเล็ก ๆ น้อย ๆ อยู่ในหมู่สายพันธุ์ที่แตกต่างกันของส ฟอร์มอซัสที่มีค่าตั้งแต่
0-1.66% ใน p12s, 0-2.4% ใน p16s และ 0-3.2% ใน pcox3 (ตารางที่ 4) ภายในตัวอย่าง arowana แดงพันธุกรรม
รูปแบบของ p12s, p16s และ pcox3 เป็น 0-0.5%, 0.2-1.8% และ 0.4-3.2% ตามลำดับ การเปลี่ยนแปลงลำดับในหมู่สีเขียว
ตัวอย่างปลาตะพัดอเมริกาใต้เป็น 0-1.3% (p12s) 0.3-2.4% (p16s) และ 0.4-2.5% (pcox3) ความแตกต่างของลำดับในหมู่ arowana ทอง
การแปล กรุณารอสักครู่..
Genomic DNA ถูกจัดเตรียมอย่าง formosus S. 38 (รวมถึงปลาอะโรวาน่าสีทอง สีเขียวปลาอะโรวาน่า และปลาอะโรวาน่าแดง)
มาจากเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ (ตารางที่ 1) Amplicons สาม mitochondrial DNA (mtDNA) ภูมิภาค ได้แก่ 12S, 16S และ cox3,
S. formosus บุคคลถูกขยายแต่ละ และการ electrophoresis agarose เจ ผลิตภัณฑ์ PCR
สำหรับแต่ละภูมิภาค mtDNA พบ และมีรูปแบบขนาดไม่บนเจ agarose ระหว่างใด ๆ amplicons
ตรวจสอบ (ไม่แสดง) .
ข้อมูลลำดับยีน mitochondrial, 12S, 16S และ cox3 จากทั้งหมด 38 บุคคลถูกจัด มีการเพิ่มเติม
ห้ารับจาก GenBank ให้ผลรวมของลำดับที่ 43 ข้อมูลประกอบด้วยการจัดตำแหน่ง 1793 ต่อ
นิวคลีโอไทด์: 601 bp ความยาวสำหรับ p12S, 628 bp สำหรับ p16S และ 564 bp สำหรับ pcox3 เนื้อหา þT A ลำดับ 49.9–
% 50.3 สา (p12S), 51.0–51.8% (p16S) และ 49.7–51.2% (pcox3), ซึ่งจะสอดคล้องกับรายงานก่อนหน้านี้ของเนื้อหาของ AT
ปลาอะโรวาน่าสายพันธุ์ (โนะอุเอะและ al., 2001 ยิวและ al., 2006) ข้อมูลเกี่ยวกับจำนวนของความถี่พื้นฐานและตัวแปร
parsimony ไซต์ข้อมูลของ mtDNA loci เป็นอย่างชัดเจนในตาราง 3.
จู่ ๆ การเปลี่ยนแปลงต่าง ๆ ระหว่างลำดับน้อยมีอยู่ระหว่างสายพันธุ์ต่าง ๆ ของ S. formosus มีค่าตั้งแต่
0 1.66% สำหรับ p12S, 0–2.4% p16S และ 0% 3.2 สำหรับ pcox3 (ตาราง 4) ภายในตัวปลาอะโรวาน่าแดงอย่าง การพันธุ
ของ p12S, p16S และ pcox3 มีการ 0–0.5%, 0.2–1.8% และ 0.4–3.2% ตามลำดับ ลำดับการเปลี่ยนแปลงระหว่างสีเขียว
ตัวอย่างปลาอะโรวาน่าได้ 0–1.3% (p12S), 0.3–2.4 (p16S) และ 0.4–2.5% (pcox3) ลำดับความแตกต่างระหว่างปลาอะโรวาน่าสีทอง
การแปล กรุณารอสักครู่..
genomic ดีเอ็นเอก็เตรียมไว้จาก 38 . S . S .ตัวอย่าง formosus (รวมถึง arowana arowana สีทองสีเขียวและสีแดง arowana )
การเริ่มต้นจากเอเชียตะวันออกเฉียงใต้(ตารางที่ 1 ) amplicons ดีเอ็นเอของสาม mitochondrial ( mtdna )เขตพื้นที่คือ 12 s, 16 S และ Cox 3
ท่ามกลาง formosus S .ที่ผู้ใช้บริการแบบเฉพาะรายเป็นแอมพลิฟายแบบเฉพาะตัวและเปลี่ยนแปลง electrophoresis เจล agarose . ผลิตภัณฑ์ pcr
ซึ่งจะช่วยให้แต่ละเขตพื้นที่ mtdna ถูกตรวจพบและไม่มีขนาดที่หลากหลาย agarose เจลในหมู่ของ amplicons
ซึ่งจะช่วยตรวจสอบ(ไม่มีใน ภาพ ประกอบ)..
ตามลำดับสำหรับการใช้ข้อมูลที่ mitochondrial ยีน, 12 S , 16 S และ cox3 ,จากยอดรวมทั้งหมด 38 คนได้ในแนวเดียวกันด้วยอีกห้า
ซึ่งจะช่วยได้รับจากเลี้ยงดูให้รวม 43 ลำดับ. ข้อมูลที่ประกอบไปด้วยการจัดแนวค่าใช้จ่ายเป็น SMS แบบต่อเนื่องของ 1793
กว้างขวาง 601 BP ในความยาวของ P 12 S 628 BP สำหรับ p 16 Sและคู่มือการใช้งานเบื้องต้น GB 564 BP สำหรับ pcox3 . ที่ที่ þt เนื้อหาของซีเควนซ์ที่เป็น 49.9 -
50.3% ( P 12 S ) 51.0% -51.8 ( p 16 S )และ 49.7% -51.2 ( pcox 3 )ซึ่งมีความสอดคล้องกับรายงานก่อนหน้าของเนื้อหาที่สำหรับสายพันธุ์
arowana ( inoue et al . 2001 Yue et al . 2006 ) ข้อมูลที่เกี่ยวกับจำนวนความถี่และฐาน
ซึ่งจะช่วยปรับเปลี่ยนสถานที่ให้ความรู้และรวดเร็วประหนึ่งของ สภาพ mtdna ที่จะมีการอธิบายไว้อย่างละเอียดในตารางที่ 3 .
การเปลี่ยนแปลงตามลำดับอย่างน่ามหัศจรรย์ใจ( Inter - ความหลากหลายขนาดเล็กมีอยู่ท่ามกลางความแตกต่างที่หลากหลายของ formosus . S . S .พร้อมด้วยคุณค่าหลากหลาย
จาก 0 ถึง 1.66% สำหรับ P 12 S 0-2.4% p 16 S และจาก 0 ถึง 3.2% สำหรับ pcox 3 (ตารางที่ 4 ) ในตัวอย่าง arowana สีแดงทางพันธุกรรม
ซึ่งจะช่วยในเรื่องของ P 12 S , p 16 S และ pcox 3 เป็น 0-0.5% 0.2% และ 0.4 -1.8 -3.2% ตามลำดับ การเปลี่ยนแปลงลำดับท่ามกลางสีเขียว
ตามมาตรฐานตัวอย่าง arowana เป็น 0-1.3% ( P 12 S ), 0.3 - 2.4 ทั้งนี้%( p 16 S )และ 0.4% -2.5 ( pcox 3 ) ความแตกต่างกันตามลำดับท่ามกลาง arowana สีทอง
การแปล กรุณารอสักครู่..