INTRODUCTIONMycorrhizal fungi const

INTRODUCTION
Mycorrhizal fungi constitute an important component of
the agricultural and forestry ecosystems. Recently, there has
been considerable interest in the application of PCR-based
analyses for resolving the systematics and phylogeny, and for
understanding the ecology of mycorrhizal fungi (Kretzer
et al. 1996; Bonfante et al. 1997; Kretzer and Bruns 1999;
Wu et al. 2000; Zhou et al. 2001). Though abundant in soil,
the endo-mycorrhizae cannot be grown in culture, while the
ecto-mycorrhizae are extremely slow growing. This limitation
with mycorrhizal fungi necessitates the availability of a
simple protocol that requires only minute quantities of
fungal material.
Various methods available for extracting fungal genomic
DNA (Raeder and Broda 1985; Lee et al. 1988; Bainbridge
et al. 1990; Loftus et al. 1993; Lecellier and Silar 1994)
require freeze-dried mycelium and involve multiple extraction,
and precipitation steps. A chelex-based DNA extraction
method has been adapted for endo-mycorrhizal fungi
(Simon et al. 1992; Lanfranco et al. 1995). Various workers,
however, have suggested the use of such DNA immediately
after extraction or within a short period of time (Wyss
and Bonfonte 1993; Sanders et al. 1995; Simon 1996). We
con®rmed these limitations and also found that DNA
extracted using the chelex-based method did not yield good
levels of ampli®cation consistently. We describe a simple
and rapid protocol for the isolation of PCR ampli®able DNA
from minute quantities of both endo- and ecto-mycorrhizal
fungi.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แนะนำMycorrhizal เชื้อราเป็นส่วนประกอบสำคัญของระบบนิเวศเกษตรและการป่าไม้ เมื่อเร็ว ๆ นี้ มีถูกมากสนใจในการประยุกต์ใช้ PCRวิเคราะห์แก้ไขอนุกรมวิธานของและ phylogeny และสำหรับทำความเข้าใจเกี่ยวกับระบบนิเวศของเชื้อรา mycorrhizal (Kretzerร้อยเอ็ด al. 1996 Bonfante et al. 1997 Kretzer และบรันซ์ 1999Wu et al. 2000 โจว et al. 2001) ว่าอุดมสมบูรณ์ในดินendo mycorrhizae ไม่สามารถเติบโตในวัฒนธรรม ในขณะecto mycorrhizae มีการเจริญเติบโตช้ามาก ข้อจำกัดนี้กับเชื้อรา mycorrhizal necessitates ความพร้อมของการโพรโทคอลอย่างที่ต้องการเท่านั้นนาทีปริมาณวัสดุที่เชื้อราวิธีต่าง ๆ ที่ใช้สำหรับแยกเชื้อรา genomicดีเอ็นเอ (Raeder และ Broda 1985 ลี et al. 1988 Bainbridgeร้อยเอ็ด al. 1990 ลอฟตัส et al. 1993 Lecellier และ Silar ปี 1994)ต้องการกรอบ mycelium และเกี่ยวข้องกับการสกัดหลายและขั้นตอนการฝน Chelex ตามสกัดดีเอ็นเอวิธีได้รับการดัดแปลงสำหรับเชื้อรา endo mycorrhizal(Simon et al. 1992 Lanfranco et al. 1995) ผู้ปฏิบัติงานต่าง ๆอย่างไรก็ตาม ได้แนะนำการใช้ดีเอ็นเอดังกล่าวทันทีหลัง จากสกัด หรือภาย ในระยะเวลาสั้น ๆ ของเวลา (Wyssและ Bonfonte 1993 แซนเดอร์ส์ et al. 1995 Simon 1996) เรากอน ® rmed ข้อจำกัดเหล่านี้ และพบว่าดีเอ็นเอแยกโดยใช้วิธีตาม chelex ได้ไม่ผลตอบแทนดีระดับของ ampli ® cation อย่างสม่ำเสมอ เราอธิบายที่เรียบง่ายและโพรโทคอลอย่างรวดเร็วสำหรับแยกของ PCR ampli ® ดีเอ็นเอได้จากปริมาณของทั้ง endo - และ ecto-mycorrhizal นาทีเชื้อรา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทนำ
เชื้อราเป็นองค์ประกอบที่สำคัญของ
ระบบนิเวศการเกษตรและการป่าไม้ เมื่อเร็ว ๆ นี้ได้
รับความสนใจเป็นอย่างมากในการประยุกต์ใช้วิธี PCR ที่ใช้
สำหรับการแก้ปัญหาการวิเคราะห์ระบบและเชื้อชาติและสำหรับ
การทำความเข้าใจระบบนิเวศของเชื้อรา (Kretzer
et al, 1996;. Bonfante et al, 1997;. และบรู Kretzer 1999;
Wu et อัล 2000.. โจว et al, 2001) แม้ว่าความอุดมสมบูรณ์ในดิน
Endo-mycorrhizae ไม่สามารถปลูกได้ในวัฒนธรรมในขณะที่
มี ecto-mycorrhizae การเจริญเติบโตช้ามาก ข้อ จำกัด นี้
มีเชื้อราจำเป็นพร้อมของ
โปรโตคอลที่เรียบง่ายที่ต้องใช้ปริมาณนาทีเดียวของ
วัสดุเชื้อรา.
วิธีการต่างๆที่มีอยู่สำหรับการสกัดจีโนมของเชื้อรา
ดีเอ็นเอ (Raeder และ Broda 1985; Lee et al, 1988;. บริดจ์
et al, 1990;. Loftus et al, . 1993; Lecellier และ Silar 1994)
จำเป็นต้องมีเส้นใยแห้งและเกี่ยวข้องกับการสกัดหลาย
ขั้นตอนและการตกตะกอน การสกัดดีเอ็นเอ chelex ตาม
วิธีการที่ได้รับการปรับให้เหมาะสมกับเชื้อราไมคอไรซา Endo-
(ไซมอน et al, 1992;. Lanfranco et al, 1995). คนงานต่าง ๆ
แต่มีข้อเสนอแนะการใช้ดีเอ็นเอดังกล่าวทันที
หลังจากการสกัดหรือภายในระยะเวลาสั้น ๆ (Wyss
และ Bonfonte 1993; แซนเดอ et al, 1995;. ไซมอน 1996) เรา
con®rmedข้อ จำกัด เหล่านี้และยังพบว่าดีเอ็นเอ
ที่สกัดโดยใช้วิธี chelex ตามไม่ได้ผลดี
ระดับของampli®cationอย่างต่อเนื่อง เราอธิบายง่าย
โปรโตคอลและการอย่างรวดเร็วสำหรับการแยก DNA PCR ampli®able
จากจำนวนนาทีของทั้ง endo- และ ecto-mycorrhizal
เชื้อรา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

บทนำ
ไมโคไรซา เชื้อรา เป็นองค์ประกอบที่สำคัญของระบบนิเวศเกษตรและป่าไม้
. เมื่อเร็วๆ นี้ มี ได้รับความสนใจเป็นอย่างมากในการ

สามารถใช้วิเคราะห์เพื่อแก้ไขระบบ และระบบเชื้อชาติและ
เข้าใจนิเวศวิทยาของเชื้อราไมโคไรซา ( kretzer
et al . 1996 ; bonfante et al . 1997 ; kretzer และ บรันส์ 2542 ;
Wu et al . 2000 ; โจว et al .2001 ) แม้ว่าความอุดมสมบูรณ์ในดิน
เอ็นโดไมคอร์ไรซา ไม่สามารถเพาะเอคโตไมคอร์ไรซา ขณะที่
จะช้ามากเพิ่มขึ้น ข้อ จำกัด นี้
กับเชื้อราไมโคไรซาการศึกษาความพร้อมของ
ง่ายโปรโตคอลที่ต้องการเพียงนาทีปริมาณของเชื้อรา

วัสดุ วิธีการต่าง ๆเพื่อสกัดดีเอ็นเอจีโนมเชื้อรา
( เรเดอร์ broda และ 1985 ; ลี et al . 1988 ;
เบนบริดจ์et al . 1990 ; ลอฟตัส et al . 2536 และ 2537 )
; lecellier silar ต้องแห้งและเกี่ยวข้องกับการสกัดเส้นใยหลาย
และขั้นตอนการตกตะกอน วิธีการสกัดดีเอ็นเอตาม
chelex ได้ถูกดัดแปลงให้เอ็นโดไมโคไรซารา
( ไซมอน et al . 1992 ; lanfranco et al . 1995 ) คนงาน ,
แต่ต่าง ๆ ได้แนะนำให้ใช้ DNA ทันที
เช่นหลังจากการสกัดหรือภายในระยะเวลาสั้น ๆของเวลา ( และวิ ์
bonfonte 1993 ; Sanders et al . 1995 ; ไซม่อน 1996 ) เรา
® con rmed ข้อ จำกัด เหล่านี้ และยังพบว่าสารสกัดดีเอ็นเอ
ใช้วิธีตาม chelex ไม่ได้ให้ผลดีระดับ
ของ ampli ®บวกอย่างต่อเนื่อง เราอธิบายง่ายๆ
และโปรโตคอลอย่างรวดเร็วสำหรับการแยกดีเอ็นเอ ดีเอ็นเอ ampli ®สามารถนาทีปริมาณของทั้งสอง
-
เอคโตไมโคไรซาโด้เชื้อรา