The LEED..PEED (LP) gene family in

The LEED..PEED (LP) gene family in Medicago truncatula (A17) is composed of 13 genes coding small putatively secreted peptides with one to two conserved domains of negatively charged residues. This family is not present in the genomes of Glycine max, Lotus japonicus, or the IRLC species Cicer arietinum. LP genes were also not detected in a Trifolium pratense draft genome or Pisum sativum nodule transcriptome, which were sequenced de novo in this study, suggesting that the LP gene family arose within the past 25 million years. M. truncatula accession HM056 has 13 LP genes with high similarity to those in A17, whereas M. truncatula ssp. tricycla (R108) and M. sativa have 11 and 10 LP gene copies, respectively. In M. truncatula A17, 12 LP genes are located on chromosome 7 within a 93-kb window, whereas one LP gene copy is located on chromosome 4. A phylogenetic analysis of the gene family is consistent with most gene duplications occurring prior to Medicago speciation events, mainly through local tandem duplications and one distant duplication across chromosomes. Synteny comparisons between R108 and A17 confirm that gene order is conserved between the two subspecies, although a further duplication occurred solely in A17. In M. truncatula A17, all 13 LPs are exclusively transcribed in nodules and absent from other plant tissues, including roots, leaves, flowers, seeds, seed shells, and pods. The recent expansion of LP genes in Medicago spp. and their timing and location of expression suggest a novel function in nodulation, possibly as an aftermath of the evolution of bacteroid terminal differentiation or potentially associated with rhizobial-host specificit

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

LEED ... ด่วน (LP) ยีนครอบครัว Medicago truncatula (A17) ประกอบด้วย 13 ยีนโค้ดเล็กหลั่ง putatively ไทด์กับโดเมนภัตหนึ่งถึงสองประจุลบตกค้าง ครอบครัวนี้ไม่มีใน genomes ของ Glycine max โลตัสหลัก หรือสายพันธุ์ IRLC Cicer arietinum LP ยีนยังไม่พบในจีโนมที่ร่าง pratense Trifolium หรือ Pisum sativum nodule transcriptome ซึ่งถูก sequenced de novo ในการศึกษานี้ บอกว่า LP ยีนครอบครัวเกิดภายใน 25 ล้านปีผ่านมา ภาคยานุวัติ truncatula M. HM056 มี 13 LP ยีนกับสูงคล้ายคลึงใน A17, M. truncatula ssp. tricycla (R108) และซา M. มี 11 และ 10 LP ย่อย ๆ ตามลำดับ ใน M. truncatula A17, LP 12 ยีนจะอยู่บนโครโมโซม 7 ภายในหน้าต่าง 93 kb ในขณะที่ห้างหุ้นส่วนจำกัดสำเนายีนอยู่บนโครโมโซม 4 การวิเคราะห์ผลของยีนไม่สอดคล้องกับทอาจยีนส่วนใหญ่ที่เกิดขึ้นก่อนเหตุการณ์ควิด Medicago ส่วนใหญ่ผ่านทอาจท้องถิ่นควบคู่ไปและซ้ำซ้อนไกลหนึ่งในโครโมโซม Synteny เปรียบเทียบ R108 และ A17 ยืนยันว่า สั่งยีนที่มีอยู่ระหว่างจัดจำแนก แม้ว่าซ้ำซ้อนเพิ่มเติมเกิดขึ้นแต่เพียงผู้เดียวใน A17 ใน M. truncatula A17, LPs 13 ทั้งหมดมีเฉพาะศัพท์ในก้อน และขาดจากเนื้อเยื่อพืชอื่น ๆ รวม ทั้งราก ใบ ดอก เมล็ด เปลือกเมล็ด ฝัก ขยายตัวล่าของยีน LP Medicago ออกซิเจน และการกำหนดเวลาและสถานที่ของนิพจน์แนะนำฟังก์ชันใน nodulation นวนิยายอาจจะเป็นเป็นผลพวงของการวิวัฒนาการของความแตกต่างของเทอร์มินัล bacteroid หรืออาจเกี่ยวข้องกับโฮสต์ rhizobial specificit

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

LEED..PEED (LP) ครอบครัวของยีนใน Medicago truncatula (A17) ประกอบด้วย 13 รหัสพันธุกรรมเปปไทด์ที่หลั่ง putatively ขนาดเล็กที่มี 1-2 โดเมนอนุรักษ์ของสารตกค้างที่มีประจุลบ ครอบครัวนี้ไม่ได้อยู่ในจีโนมของ Glycine max, โลตัส japonicus หรือ arietinum IRLC ชนิด Cicer ยีนแผ่นเสียงก็ยังไม่พบในจีโนม Trifolium pratense ร่างหรือ pisum sativum โหนกยีนซึ่งมีลำดับขั้นตอนโนโวในการศึกษานี้ชี้ให้เห็นว่าครอบครัว LP ยีนที่เกิดขึ้นภายในระยะเวลา 25 ล้านปีที่ผ่านมา เอ็ม truncatula ภาคยานุวัติ HM056 มี 13 LP ยีนที่มีความคล้ายคลึงกันสูงให้กับผู้ที่อยู่ใน A17 ขณะที่เอ็มเอสเอส truncatula tricycla (R108) และเอ็ม sativa มี 11 และ 10 LP ยีนตามลำดับ ในเอ็ม truncatula A17 12 LP ยีนอยู่บนโครโมโซม 7 ภายในหน้าต่าง 93 KB, ในขณะที่หนึ่งสำเนายีน LP ตั้งอยู่บนโครโมโซม 4. การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการของครอบครัวของยีนที่มีความสอดคล้องกับที่สุดซ้ำซ้อนกันของยีนที่เกิดขึ้นก่อนที่จะ Medicago speciation เหตุการณ์ที่เกิดขึ้นส่วนใหญ่ผ่านการเลียนควบคู่ท้องถิ่นและการทำสำเนาหนึ่งที่ห่างไกลทั่วโครโมโซม การเปรียบเทียบระหว่าง Synteny R108 และ A17 ยืนยันได้ว่ายีนที่เป็นป่าสงวนระหว่างสองชนิดย่อยแม้ว่าการทำสำเนาเพิ่มเติมที่เกิดขึ้น แต่เพียงผู้เดียวใน A17 ในเอ็ม truncatula A17 ทั้งหมด 13 ซีรี่ส์จะคัดลอกเฉพาะในก้อนและหายไปจากเนื้อเยื่อพืชอื่น ๆ รวมทั้งรากใบดอกเมล็ดเปลือกเมล็ดและฝัก ที่ผ่านมาการขยายตัวของยีนแผ่นเสียง Medicago เอสพีพี และการกำหนดเวลาและสถานที่ในการแสดงออกของพวกเขาแนะนำฟังก์ชั่นใหม่ในการเกิดปมอาจเป็นผลพวงของการวิวัฒนาการของความแตกต่างขั้ว bacteroid ๆ หรืออาจเกี่ยวข้องกับ specificit ไรโซเบียมเป็นเจ้าภาพ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

อิน . . . . . . . ฉี่ ( LP ) ยีนในครอบครัว MEDICAGO truncatula ( A17 ) ประกอบด้วย 13 ยีนนะครับ putatively เปปไทด์ที่มีขนาดเล็กที่มีหนึ่งถึงสองปี โดเมนซึ่งมีประจุลบที่ตกค้าง ครอบครัวที่ไม่ได้อยู่ในจีโนมของถั่วเหลือง , โลตัส japonicus หรือ irlc ชนิด cicer arietinum . LP ยีนยังไม่ได้ตรวจพบใน trifolium pratense ร่างพันธุกรรมหรือ pisum ทราน ริปโตม sativum ปมนี้อีกครั้ง ซึ่งในการศึกษานี้ชี้ให้เห็นว่า LP ยีนครอบครัวเกิดขึ้นภายในช่วง 25 ล้านปี เมตร truncatula ภาคยานุวัติ hm056 มี 13 ยีน LP กับความคล้ายคลึงกันสูงใน A17 และม. truncatula ssp . tricycla ( r108 ) และ M . , 11 และ 10 แผ่นเสียงจีนชุด ตามลำดับ ในม. truncatula A17 12 ยีนบนโครโมโซม 7 แผ่นเสียงอยู่ภายในหน้าต่าง 93 KB ส่วนยีน LP คัดลอกตั้งอยู่บนโครโมโซม 4 การวิเคราะห์ชนิดของครอบครัวจีน สอดคล้องกับที่สุดของยีนที่เกิดขึ้นก่อนเหตุการณ์การ MEDICAGO สปีชีย์ ส่วนใหญ่ผ่านการตีคู่และท้องถิ่นห่างไกลได้อย่างหนึ่งในโครโมโซม synteny เปรียบเทียบและ r108 A17 ยืนยันว่า ยีน เพื่ออนุรักษ์ ระหว่างสองชนิดย่อย แต่ไม่เน้นเพิ่มเติมที่เกิดขึ้น แต่เพียงผู้เดียวใน A17 . ในม. truncatula A17 ทั้งหมด 13 หล่อลื่นพิเศษและ nodules และขาดจากเนื้อเยื่อ พืชอื่น ๆ ได้แก่ ราก ใบ ดอก เมล็ด เมล็ด เปลือก และฝัก . ที่ผ่านมาการขยายตัวของ LP ยีนใน MEDICAGO spp . และเวลา และสถานที่ในการแสดงออกแนะนำฟังก์ชั่นใหม่ในการเกิด อาจเป็นผลที่ตามมาของการวิวัฒนาการของ bacteroid Terminal หรืออาจเกี่ยวข้องกับ specificit ตำรับโฮสต์