Abstract
Objective
Ovarian cancer is a hormone-related disease with a strong genetic basis. However, none of its high-penetrance susceptibility genes and GWAS-identified variants to date are known to be involved in hormonal pathways. Given the hypothesized etiologic role of gonadotropins, an assessment of how variability in genes involved in the gonadotropin signaling pathway impacts disease risk is warranted.
Methods
Genetic data from 41 ovarian cancer study sites were pooled and unconditional logistic regression was used to evaluate whether any of the 2185 SNPs from 11 gonadotropin signaling pathway genes was associated with ovarian cancer risk. A burden test using the admixture likelihood (AML) method was also used to evaluate gene-level associations.
Results
We did not find any genome-wide significant associations between individual SNPs and ovarian cancer risk. However, there was some suggestion of gene-level associations for four gonadotropin signaling pathway genes: INHBB (p = 0.045, mucinous), LHCGR (p = 0.046, high-grade serous), GNRH (p = 0.041, high-grade serous), and FSHB (p = 0.036, overall invasive). There was also suggestive evidence for INHA (p = 0.060, overall invasive).
Conclusions
Ovarian cancer studies have limited sample numbers, thus fewer genome-wide susceptibility alleles, with only modest associations, have been identified relative to breast and prostate cancers. We have evaluated the majority of ovarian cancer studies with biological samples, to our knowledge, leaving no opportunity for replication. Using both our understanding of biology and powerful gene-level tests, we have identified four putative ovarian cancer loci near INHBB, LHCGR, GNRH, and FSHB that warrant a second look if larger sample sizes and denser genotype chips become available.
AbstractObjectiveOvarian cancer is a hormone-related disease with a strong genetic basis. However, none of its high-penetrance susceptibility genes and GWAS-identified variants to date are known to be involved in hormonal pathways. Given the hypothesized etiologic role of gonadotropins, an assessment of how variability in genes involved in the gonadotropin signaling pathway impacts disease risk is warranted.MethodsGenetic data from 41 ovarian cancer study sites were pooled and unconditional logistic regression was used to evaluate whether any of the 2185 SNPs from 11 gonadotropin signaling pathway genes was associated with ovarian cancer risk. A burden test using the admixture likelihood (AML) method was also used to evaluate gene-level associations.ResultsWe did not find any genome-wide significant associations between individual SNPs and ovarian cancer risk. However, there was some suggestion of gene-level associations for four gonadotropin signaling pathway genes: INHBB (p = 0.045, mucinous), LHCGR (p = 0.046, high-grade serous), GNRH (p = 0.041, high-grade serous), and FSHB (p = 0.036, overall invasive). There was also suggestive evidence for INHA (p = 0.060, overall invasive).ConclusionsOvarian cancer studies have limited sample numbers, thus fewer genome-wide susceptibility alleles, with only modest associations, have been identified relative to breast and prostate cancers. We have evaluated the majority of ovarian cancer studies with biological samples, to our knowledge, leaving no opportunity for replication. Using both our understanding of biology and powerful gene-level tests, we have identified four putative ovarian cancer loci near INHBB, LHCGR, GNRH, and FSHB that warrant a second look if larger sample sizes and denser genotype chips become available.
การแปล กรุณารอสักครู่..
บทคัดย่อวัตถุประสงค์
มะเร็งรังไข่ เป็นฮอร์โมนที่เกี่ยวข้องกับแข็งแรงทางพันธุกรรมโรคพื้นฐาน อย่างไรก็ตาม เรื่องของความไวสูงเพเนแทรนซ์ยีนและ gwas ระบุตัวแปรที่จะอาจจะเรียกว่าเป็น เกี่ยวข้องในการรับฮอร์โมน ให้ศึกษาบทบาทของโกนาโดโทร etiologic ,การประเมินวิธีความแปรปรวนในยีนที่เกี่ยวข้องในระดับปานกลางส่งสัญญาณทางผลกระทบเสี่ยงโรครับประกัน
วิธี
ทางพันธุกรรมข้อมูลจาก 41 มะเร็งรังไข่การศึกษาเว็บไซต์ถูก pooled และไม่มีเงื่อนไข ใช้ Logistic Regression ประเมินว่าใด ๆของ 2 snps จาก 11 gonadotropin ส่งสัญญาณทางยีนมีความสัมพันธ์กับความเสี่ยงมะเร็งรังไข่ .ภาระการทดสอบโดยใช้สารผสมเพิ่มโอกาส ( AML ) ถูกใช้เพื่อประเมินสมาคมระดับยีน ผล
เราไม่พบใด ๆ genome-wide สำคัญสมาคมระหว่าง snps บุคคลและความเสี่ยงมะเร็งรังไข่
อย่างไรก็ตาม มีบางข้อเสนอของสมาคมระดับยีนสำหรับสี่ gonadotropin ส่งสัญญาณทางพันธุกรรม : inhbb ( P = 0.045 , mucinous ) lhcgr ( p = 0.046 ,คุณภาพสูง serous ) กล้องจุลทรรศน์ ( P = 0.041 , คุณภาพสูง serous ) และ fshb ( p = 0.036 , รวมรุกราน ) ยังมีหลักฐานร่องรอยสำหรับ inha ( P = 0.060 , รวม invasive )
สรุป
มะเร็งรังไข่ มีการศึกษา จำกัด ตัวอย่างตัวเลขจึงน้อยลง genome-wide เกิดอัลลีลที่มีเพียงสมาคมเจียมเนื้อเจียมตัว มีการระบุให้สัมพันธ์กับเต้านมและมะเร็งต่อมลูกหมาก .เราได้ประเมินส่วนใหญ่ของมะเร็งรังไข่ ศึกษากับตัวอย่างทางชีวภาพเพื่อความรู้ของเรา กลับไม่มีโอกาสได้ซ้ำ ใช้ทั้งความรู้ชีววิทยาและการทดสอบระดับยีนที่มีประสิทธิภาพเราได้ระบุสี่ซึ่งมะเร็งรังไข่ของ lhcgr inhbb , ใกล้ , กล้องจุลทรรศน์ และ fshb หมายจับที่สองดูหากมีขนาดใหญ่ขนาดตัวอย่างและหนาแน่นกับชิปที่กลายเป็นใช้ได้
การแปล กรุณารอสักครู่..