2.4. Determining sample size for sc

2.4. Determining sample size for screening
When screening a library,it is crucial to acknowledge the
importance of statistics for estimating the number of analyses to
cover all different possibilities with an established degree of
confidence. Standard sampling can be used to a certain extent
to estimate sample size.But it is important to consider that even
if nucleotides in the degenerated codon are equally represented,
the distribution of encoded amino acids is bound to the genetic
code redundancy.Thus a library constructed with NNN
configuration will have serine represented six times for every
methionine or tryptophan.As a result,the sample size should always be
calculated on the basis of nucleotide rather than amino acid
diversity, influencing significantly the range of screening
capabilities. For example,to achieve 95% probability to cover all mutants
in a 1024-fold degenerated library,it has been estimated that
about 3000 clones should be screened(Warren andBenkovic,
1997). As a general observation,most SSM experiments reported
in the literature cover the mutagenized library between two to
four times on a basis of nucleotide diversity(e.g.,64–128clones
are usuallyscreenedfora32-folddegeneratedlibrary).
Incomplete screening of large libraries can be actually useful and in
some cases allows identification of variants with desirable
features (Koga etal.,2003). This strategy is,however,prone to the
statistical uncertainty of missing clones with remarkable
properties. To reduce the library size and overcome genetic code
redundancy, mixtures of specific primers can be used instead of
a degenerated primer.Therefore,19 primers must be used to
randomize each codon.While this technique is affordable for a
single codon,it is likely too expensive to randomize two proximal
codons simultaneously which requires hundreds of primers.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.4 การกำหนดขนาดตัวอย่างสำหรับตรวจ
เมื่อคัดกรองรี มันเป็นสิ่งสำคัญเพื่อรับทราบการ
ความสำคัญของสถิติสำหรับการประเมินจำนวนวิเคราะห์การ
ครอบคลุมไปทั้งหมดแตกต่างกันกับระดับขึ้น
มั่นใจ สุ่มตัวอย่างมาตรฐานที่สามารถใช้ขอบแบบบางเขต
การประมาณขนาดตัวอย่างได้แต่สิ่งสำคัญคือต้องพิจารณาที่แม้
ถ้านิวคลีโอไทด์ในรหัสพันธุกรรม degenerated เท่าเทียมกันแสดง,
การกระจายของกรดอะมิโนเข้าถูกผูกไว้กับที่พันธุกรรม
รหัสซ้ำดังนั้นห้องสมุดสร้างขึ้น ด้วย NNN
ตั้งค่าคอนฟิกจะมีแถแทน 6 ครั้งสำหรับทุก
methionine หรือทริปโตเฟนดัง ขนาดตัวอย่างควรจะเสมอ
คำนวณนิวคลีโอไทด์มากกว่ากรดอะมิโน
หลากหลาย มีอิทธิพลต่อช่วงของการคัดกรองอย่างมีนัยสำคัญ
ความสามารถในการ ตัวอย่าง ให้มีความน่าเป็น 95% เพื่อให้ครอบคลุมสายพันธุ์ทั้งหมด
ใน 1024-fold degenerated รี จะมีการประเมินที่
ควรฉายโคลนประมาณ 3000 (วอร์เรน andBenkovic,
1997) เป็นการสังเกตทั่วไป ทดลอง SSM ส่วนใหญ่รายงาน
ในวรรณคดีครอบคลุมรี mutagenized ระหว่างสองการ
ครั้งที่ 4 บนพื้นฐานของนิวคลีโอไทด์ diversity(e.g.,64–128clones
are usuallyscreenedfora32-folddegeneratedlibrary)
คัดกรองที่ไม่สมบูรณ์ของไลบรารีขนาดใหญ่จะมีประโยชน์จริง และใน
บางกรณีช่วยให้รหัสย่อยประกอบ
คุณลักษณะ (โคกะ etal., 2003) ได้ กลยุทธ์นี้ อย่างไรก็ตาม มีแนวโน้มที่จะการ
clones ความไม่แน่นอนทางสถิติของหายไปกับความโดดเด่น
คุณสมบัติ เพื่อลดขนาดของไลบรารี และเอาชนะรหัสพันธุกรรม
ซ้ำ ส่วนผสมของไพรเมอร์เฉพาะสามารถใช้แทน
พื้น degeneratedดังนั้น 19 ไพรเมอร์ต้องใช้
สุ่มรหัสพันธุกรรมแต่ละขณะนี้เทคนิคราคาไม่แพงสำหรับการ
รหัสพันธุกรรมเดียว ก็อาจจะแพงเกินไปการสุ่มสอง proximal
codons พร้อม ๆ กันซึ่งต้องของไพรเมอร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.4 . การกำหนดขนาดตัวอย่างในการกลั่นกรอง
เมื่อตรวจคัดกรองไลบรารีที่เป็นสิ่งสำคัญในการตอบรับ
ซึ่งจะช่วยความสำคัญของสถิติของการประเมินจำนวนของการวิเคราะห์เพื่อ
ฝาครอบความเป็นไปได้ที่หลากหลายโดยทั้งหมดพร้อมด้วยระดับของ
ซึ่งจะช่วยสร้างความเชื่อมั่น การสุ่มตัวอย่างแบบมาตรฐานสามารถใช้ในระดับหนึ่งด้วย
ซึ่งจะช่วยในการประเมินตัวอย่าง.แต่เป็นเรื่องสำคัญที่จะพิจารณาว่าแม้
ตามมาตรฐานหากกว้างขวางในที่เต็มยศละลานตา codon มีอย่างเท่าเทียมกันแทน,
ที่เข้ารหัสการกระจายของกรดอะมิโนกรดมีความผูกพันกับทางพันธุกรรม
รหัสการสำรองการทำงาน.ที่ไลบรารีสร้างขึ้นพร้อมด้วย nnn
ซึ่งจะช่วยการตั้งค่าจะมี serine แทนหกครั้งสำหรับทุก
เมไทโอนินซึ่งปริมาณหรือ tryptophan .เป็นผล,ตัวอย่างขนาดควรมี
ซึ่งจะช่วยในการคำนวณที่พื้นฐานของ nucleotide มากกว่ากรดอะมิโน
ความหลากหลาย,อนึ่งอย่างมีนัยสำคัญช่วงที่คัดกรอง
ความสามารถ ตัวอย่างเช่นในการได้รับโอกาส 95% ในการปิดฝาข้าวเจ้า
ทั้งหมดที่มีในไลบรารีเต็มยศละลานตา 1024 - เท่าที่มีการประเมินว่า
ประมาณ 3000 โคลนจะเป็นฉาก(ที่ andbenkovic
1997 ) เป็นการสังเกตทั่วไปการทดลอง SSM ส่วนใหญ่รายงาน
ในวรรณคดีที่ฝาครอบไลบรารี mutagenized ระหว่างสองเพื่อตอบแทน
สี่ครั้งในหนึ่ง nucleotide พื้นฐานของความหลากหลาย(เช่น, 64 - 128 โคลน
ซึ่งจะช่วยเป็น usuallyscreenedfora 32 - folddegeneratedlibrary )..
ไม่สมบูรณ์ของไลบรารีขนาดใหญ่สามารถเป็นจริงๆและเป็นประโยชน์ต่อ
ซึ่งจะช่วยในการระบุตัวตนบางกรณีทำให้เป็นที่ต้องการของความแตกต่างด้วย
โดดเด่นไปด้วย( koga etal ., 2003 ) การใช้งานนี้มีแต่ถึงอย่างไรก็ตามมีแนวโน้มที่จะไม่แน่นอนทางสถิติที่
ของโคลนหายไปพร้อมด้วยความโดดเด่น
คุณสมบัติ( Properties )เพื่อช่วยให้ไลบรารีขนาดใหญ่และสามารถเอาชนะยีนรหัส
ซึ่งจะช่วยการสำรองการทำงาน,มีส่วนผสมของ primers สามารถใช้แทนที่ของ
เต็มยศละลานตาเชื้อปะทุ. therefore, 19 primers ต้องใช้
ซึ่งจะช่วยให้แต่ละคนต้องสุ่ม ภาพ จากแหล่งเก็บ codon .ในขณะที่โรงแรมแห่งนี้เป็นเทคนิคที่เหมาะสมสำหรับ
ซึ่งจะช่วยเดียว codon ,และมีแนวโน้มราคาแพงเกินไปทั้งสองจะต้องสุ่ม ภาพ จากแหล่งเก็บ proximal
codons พร้อมกันซึ่งจะต้องมีหลายร้อย primers .