An enhanced version of comparative

An enhanced version of comparative binding energy (COMBINE) analysis, named Combine, based on both
ligand-based and structure-based alignments has been used to build several 3-D QSAR models for the eleven human zinc-based histone deacetylases (HDACs). When faced with an abundance of data from diverse structure−activity sources, choosing the best paradigm for an integrative analysis is difficult. A common example from studies on enzyme−inhibitors is the abundance of crystal structures characterized by diverse ligands complexed with different enzyme isoforms. A novel comprehensive tool for data mining on such inhomogeneous set of structure−activity data was developed based on the original approach of Ortiz, Gago,and Wade, and applied to predict HDAC inhibitors’ isoform selectivity. The COMBINEr approach (apart from the AMBER programs) has been developed to use only software freely available to academics.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รุ่นที่ปรับปรุงของพลังงานที่มีผลผูกพันเปรียบเทียบ (รวม) การวิเคราะห์ชื่อรวมอยู่บนพื้นฐานของการจัดแนว
แกนด์ที่ใช้และโครงสร้างพื้นฐานทั้งสองได้รับการใช้ในการสร้างหลาย 3-D รุ่น QSAR สำหรับสิบเอ็ดมนุษย์สโตน deacetylases สังกะสี-based (hdacs) . เมื่อต้องเผชิญกับความอุดมสมบูรณ์ของข้อมูลจากแหล่งข้อมูลโครงสร้างกิจกรรมหลากหลายเลือกกระบวนทัศน์ที่ดีที่สุดสำหรับการวิเคราะห์แบบบูรณาการเป็นเรื่องยากตัวอย่างที่พบจากการศึกษาเกี่ยวกับสารยับยั้งเอนไซม์คือความอุดมสมบูรณ์ของโครงสร้างผลึกแกนด์ที่โดดเด่นด้วยความหลากหลาย complexed กับไอโซฟอร์มของเอนไซม์ที่แตกต่างกัน เครื่องมือที่ครอบคลุมนวนิยายสำหรับการทำเหมืองข้อมูลชุด inhomogeneous ดังกล่าวของโครงสร้างข้อมูลกิจกรรมที่ได้รับการพัฒนาบนพื้นฐานของวิธีการเดิมของออร์ติซ, Gago และเวดและนำไปใช้ในการทำนายการเลือกไอโซฟอร์ม HDAC โปรตีน 'วิธี combiner (นอกเหนือจากโปรแกรมสีเหลืองอำพัน) ได้รับการพัฒนาขึ้นเพื่อใช้ซอฟต์แวร์เพียงอย่างอิสระที่มีนักวิชาการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รุ่นพิเศษของการวิเคราะห์เปรียบเทียบพลังงานยึดเหนี่ยว (รวม) การรวม การตั้งชื่อตามทั้ง
จัดแนว ตามโครงสร้าง และ ตามลิแกนด์ถูกใช้เพื่อสร้างโมเดล QSAR 3 มิติหลายสำหรับสิบเอ็ดฮิสโตนสังกะสีตามมนุษย์ deacetylases (HDACs) เมื่อต้องเผชิญกับความอุดมสมบูรณ์ของข้อมูลจากแหล่งหลากหลาย structure−activity เลือกกระบวนทัศน์ที่ดีที่สุดสำหรับการวิเคราะห์แบบบูรณาการเป็นเรื่องยาก ตัวอย่างทั่วไปจากการศึกษา enzyme−inhibitors เป็นความอุดมสมบูรณ์ของโครงสร้างผลึกโดย ligands complexed กับ isoforms เอนไซม์แตกต่างหลากหลาย เครื่องมือครอบคลุมนวนิยายสำหรับการทำเหมืองข้อมูลเช่น structure−activity ข้อมูลชุดงานถูกพัฒนาตามแนวทางเดิมของพล.ต. Gago และเวด และใช้ทำนาย HDAC inhibitors' isoform ใว วิธี COMBINEr (นอกเหนือจากแอมเบอร์โปรแกรม) ได้รับการพัฒนาเพื่อใช้เฉพาะซอฟต์แวร์อิสระพร้อมนักวิชาการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เวอร์ชั่นใหม่ที่ได้รับการปรับปรุงให้มีผลผูกพันของความได้เปรียบเชิงเปรียบเทียบด้านพลังงาน(รวม)การวิเคราะห์ชื่อรวมทั้งใช้ alignments
ligand - และโครงสร้างมีพื้นฐานการใช้ในการสร้างรุ่น 3 - D qsar หลากหลายสำหรับ deacetylases histone สิบเอ็ดมนุษย์สังกะสี - ( hdacs ) เมื่อต้องเผชิญกับความหลากหลายของข้อมูลจากแหล่งโครงสร้างการทำงานที่หลากหลายการเลือกใช้กระบวนทัศน์ที่ดีที่สุดสำหรับการวิเคราะห์การผสมผสานที่เป็นเรื่องยากตัวอย่างเช่นโดยทั่วไปจากการศึกษาในเรื่องเอนไซม์ - ผลลัพธ์โรคหลอดเลือดสมองแตกมีความหลากหลายของโครงสร้างคริสตัลโดย ligands complexed ที่หลากหลายพร้อมด้วย isoforms เอนไซม์แตกต่างกัน เครื่องมือใหม่ที่ครอบคลุมสำหรับการทำเหมืองแร่ข้อมูลในชุด inhomogeneous ดังกล่าวของข้อมูลโครงสร้างการทำงานของเขาพัฒนาขึ้นจากวิธีการแบบดั้งเดิมของ ortiz gago และตะลุยและใช้ตัวเลือกในการคาดเดา isoform ' hdac ผลลัพธ์โรคหลอดเลือดสมองแตกวิธีการ combiner (แยกออกจากโปรแกรมสีเหลือง)ได้รับการพัฒนาขึ้นเพื่อใช้ซอฟต์แวร์เฉพาะได้อย่างอิสระพร้อมใช้งานสำหรับนักวิชาการ