A cDNA encoding a new isoenzyme of

A cDNA encoding a new isoenzyme of β-type carbonic anhydrase (CA; EC 4.2.1.1) in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum Bohlin has been cloned. The cDNA contained an open reading frame of 819 bp, which encodes a polypeptide of 273 amino acids. This gene, which is designated as ptca2, was found to be highly homologous (83% at the nucleotide level) to the previously isolated intracellular β-CA gene from Phaeodactylum tricornutum (ptca1). Comparison of the deduced amino acid sequence of ptca2 with β-CAs from other sources demonstrated that PtCA2 possesses the completely conserved zinc coordination residues of β-CA. The N-terminus 19 amino acid sequence of PtCA2 was predicted to be an endoplasmic reticulum-targeting signal, suggesting localization of the protein in an organelle or in the periplasmic space. Quantitative analysis of mRNA accumulation of ptca2 using real-time polymerase chain reaction revealed a significant level of mRNA accumulation even under 5% CO2 and a 3.5-fold increase in accumulation upon acclimation of the diatom to air. This indicates that ptca2 belongs to a constitutive class of enzyme that responds only weakly to the ambient CO2 concentration. The sequences of both ptca1 and ptca2 were shown to be grouped into a phylogeny that is composed of mixture of sequences from the eucarya and procarya domains, including sequences from the red alga Porphyridium purpureum, the green alga Coccomyxa, the red mold Neurospora crassa, and the yeast Saccharomyces cerevisiae.Key words: carbonic anhydrase, marine diatom, inorganic carbon concentrating mechanism (CCM), Phaeodactylum tricornutum.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

CDNA isoenzyme ใหม่ของ carbonic anhydrase ชนิดβ (CA การเข้ารหัส EC 4.2.1.1) ใน tricornutum Phaeodactylum ไดอะตอมทะเล Bohlin มีการโคลน CDNA ที่ประกอบด้วยกรอบการเปิดอ่านของ 819 bp ซึ่งจแมป polypeptide ของกรดอะมิโน 273 พบยีนนี้ ซึ่งจะถูกกำหนดเป็น ptca2 จะ สูง homologous (83% ที่ระดับนิวคลีโอไทด์ยีนก่อนหน้านี้แยก intracellular β-CA จาก Phaeodactylum tricornutum (ptca1) เปรียบเทียบลำดับกรดอะมิโน deduced ของ ptca2 กับβ-CAs จากแหล่งอื่น ๆ แสดงว่า PtCA2 มีตกประสานอย่างสมบูรณ์นำสังกะสีของβ-CA ลำดับกรดอะมิโน N-นัส 19 ของ PtCA2 ถูกคาดว่า จะเป็นการกำหนดเป้าหมายลัม endoplasmic สัญญาณ การแนะนำการแปลของโปรตีนเป็นออร์แกเนลล์ หรือพื้นที่ periplasmic การวิเคราะห์เชิงปริมาณการสะสม mRNA ของ ptca2 ที่ใช้ปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสแบบเรียลไทม์เปิดเผยระดับความสำคัญของ mRNA สะสมแม้ภายใต้ 5% CO2 และเพิ่ม 3.5-fold ในสะสมตาม acclimation ของไดอะตอมอากาศ บ่งชี้ ptca2 ที่เป็นของคลาสขึ้นของเอนไซม์ที่ตอบสนองเฉพาะสูญเพื่อความเข้มข้น CO2 แวดล้อม ลำดับของ ptca1 และ ptca2 ได้แสดงการแบ่ง phylogeny ที่ประกอบด้วยส่วนผสมของลำดับจาก eucarya และ procarya โดเมน รวมทั้งลำดับ purpureum Porphyridium แดง alga, alga กรี Coccomyxa แม่แดง Neurospora crassa และในยีสต์ Saccharomyces cerevisiae คำสำคัญ: carbonic anhydrase ไดอะตอมทะเล อนินทรีย์คาร์บอน concentrating กลไก (CCM), Phaeodactylum tricornutum

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ยีนเข้ารหัส isoenzyme ใหม่βชนิด anhydrase คาร์บอ (CA; EC 4.2.1.1) ในไดอะตอมทะเล Phaeodactylum tricornutum Bohlin ได้รับการโคลน ยีนที่มีกรอบการอ่านเปิด 819 bp ซึ่ง encodes เพปไทด์ของกรดอะมิโน 273 ยีนนี้ซึ่งถูกกำหนดให้เป็น ptca2 ถูกพบว่ามีความคล้ายคลึงกันอย่างมาก (83% ในระดับเบส) เพื่อแยกเซลล์ก่อนหน้านี้ยีนβ-CA จาก Phaeodactylum tricornutum (ptca1) เปรียบเทียบลำดับกรดอะมิโนที่แปลของ ptca2 กับβ-CAs จากแหล่งอื่น ๆ แสดงให้เห็นว่ามี PtCA2 อนุรักษ์สมบูรณ์ตกค้างประสานงานสังกะสีของβ-CA N-19 สถานีลำดับกรดอะมิโนของ PtCA2 ถูกคาดว่าจะเป็นสัญญาณร่างแหกำหนดเป้​​าหมาย endoplasmic บอกตำแหน่งของโปรตีนใน organelle หรือในพื้นที่ periplasmic การวิเคราะห์เชิงปริมาณของการสะสมของ mRNA ptca2 ใช้เวลาจริงวิธี polymerase chain reaction เปิดเผยระดับนัยสำคัญของการสะสม mRNA แม้ภายใต้ CO2 5% และเพิ่มขึ้น 3.5 เท่าในการสะสมเมื่อเคยชินกับสภาพของไดอะตอมไปในอากาศ นี้บ่งชี้ว่า ptca2 เป็นระดับที่เป็นส่วนประกอบของเอนไซม์ที่ตอบสนองเพียงอย่างอ่อนกับความเข้มข้นของ CO2 โดยรอบ ลำดับของ ptca1 และ ptca2 มีการแสดงที่แบ่งออกเป็นเชื้อชาติที่ประกอบด้วยส่วนผสมของลำดับจากโดเมน eucarya และ procarya รวมทั้งลำดับจากสาหร่ายสีแดง Porphyridium purpureum, สาหร่ายสีเขียว Coccomyxa, แม่พิมพ์สีแดง Neurospora crassa และ ยีสต์ Saccharomyces คำ cerevisiae.Key: anhydrase คาร์บอไดอะตอมทะเลกลไกมุ่งเน้นคาร์บอนนินทรีย์ (CCM) Phaeodactylum tricornutum

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สายพันธุ์ใหม่ของบีตา - ความรู้สึกชนิดฉะนี้แลการเข้ารหัส ( CA ; EC 4.2.1.1 ) ในทะเลจาก phaeodactylum tricornutum bohlin มีโคลน วิธีประกอบด้วย open reading frame คุณ BP ซึ่งเข้ารหัสเป็น polypeptide 273 กรดอะมิโน ยีน ซึ่งเป็นเขต ptca2 ,พบว่ามีความคล้ายคลึง ( 83 เปอร์เซ็นต์ ที่ระดับนิวคลีโอไทด์ ) เพื่อแยกเซลล์ยีนบีตา - CA ก่อนหน้านี้จาก phaeodactylum tricornutum ( ptca1 ) การเปรียบเทียบลำดับกรดอะมิโนที่ได้จาก ptca2 กับบีตา - CAS จากแหล่งอื่น ๆพบว่า ptca2 ครบถ้วนสมบูรณ์เพื่อการตกค้างของบีตา - สังกะสี .19 ลำดับกรดอะมิโนของยีน ptca2 ถูกคาดการณ์ว่าจะเป็นเรื่องราวที่ถูกกล่าวขานเป้าหมายสัญญาณ แนะนำให้ปรับภาษาของโปรตีนในออร์แกเนลล์หรือในพื้นที่ periplasmic . การวิเคราะห์เชิงปริมาณของ mRNA สะสม ptca2 โดยใช้เวลาจริงการใช้ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสพบว่าระดับของการสะสมของคาร์บอนไดออกไซด์แม้ภายใต้ 5 % และ 3 .ผู้อื่นในการสะสมเพิ่มเมื่อ acclimation ของไดอะตอมกับอากาศ นี้บ่งชี้ว่า ptca2 เป็นของและระดับเอนไซม์ที่ตอบสนองเพียงอย่างอ่อนเพื่อความเข้มข้น CO2 ในอากาศแวดล้อม ลำดับของทั้งสอง ptca1 ptca2 ถูกแสดงและถูกจัดกลุ่มในระบบเชื้อชาติที่ประกอบด้วยส่วนผสมของลำดับจาก eucarya procarya และโดเมนรวมถึงลำดับจากสีแดงสาหร่าย porphyridium 3 , coccomyxa สาหร่ายสีเขียว , สีแดง crassa บอดราและยีสต์ Saccharomyces cerevisiae . คำสำคัญ : ฉะนี้แล ทางทะเล ไดอะตอม อนินทรีย์คาร์บอนมุ่งเน้นกลไก ( CCM ) phaeodactylum tricornutum .