IntroductionProtein sequences are far from a random arrangement of ami การแปล - IntroductionProtein sequences are far from a random arrangement of ami ไทย วิธีการพูด

IntroductionProtein sequences are f

Introduction

Protein sequences are far from a random arrangement of amino acids. Function and history have a great influence on the composition of peptide sequences. It seems intuitive that proteins involved in similar functions would share similar features in their amino acid sequence. Likewise, orthologous sequences show sequence conservation. Even much broader groups, such as developmental proteins, can been shown to possess patterns characteristic of that group (Karlin and Burge 1996; Huntley and Golding 2004).

One of these unusual sequence features is the presence of excess simple sequence in proteins (Wootton and Federhen 1993). Simple sequences can range from highly biased homopolymer tracts and regions enriched primarily for one amino acid, to larger, more complex repetitive structures. Simple repetitive protein sequences are found in all domains of life; however, they are particularly abundant within eukaryotic proteins (Karlin and Burge 1996; Marcotte et al. 1999; Huntley and Golding 2000; Sim and Creamer 2002).

Within the eukaryotes, most homopolymer tracts have been investigated more thoroughly owing to their relative ease of detection. Karlin and Burge (1996) found that both short and long homopeptides are more frequent in developmental proteins than in other classes of proteins. They also found that many proteins containing multiple long homopeptide sequences were involved in nervous system disease and development. Indeed, Huntington disease (Duyao et al. 1993; Snell et al. 1993; Kieburtz et al. 1994), Kennedy dis ease (also known as spinal and bulbar muscular atrophy (La Spada et al. 1991)), dentatorubral pallidoluysian atrophy (Li et al. 1993; Burke et al. 1994; Koide et al. 1994; Nagafuchi et al. 1994), and several spinocerebellar ataxias (Banfi et al. 1994; Kawaguchi et al. 1994; Pulst et al. 1996; David et al. 1997; Zhuchenko et al. 1997; Nakamura et al. 2001; Silveira et al. 2002) contain CAG repeats, which encode polyglutamine tracts.

To investigate this association with repetitive sequence, we previously conducted a survey of neurological and developmental proteins from Homo sapiens and Drosophila melanogaster (Huntley and Golding 2004). Our results confirmed that developmental proteins are indeed enriched for simple sequences but that sequences with neurological function are not. However, many of those sequences considered to be neurological proteins may not be specific to the brain and nervous system. Further, many of the proteins involved in the neurodegenerative disorders may have a normal, nonpathogenic function that remains elusive.

Therefore, to study sequences specific to the brain and nervous system we used EST expression data. In this study, we examine ESTs from the brain and nervous system, which may not have a known function, to determine whether sequences expressed specifically in these tissues are enriched for simple sequences.
0/5000
จาก: -
เป็น: -
ผลลัพธ์ (ไทย) 1: [สำเนา]
คัดลอก!
แนะนำลำดับโปรตีนจากการจัดเรียงแบบสุ่มของกรดอะมิโนได้ ฟังก์ชันและประวัติศาสตร์มีอิทธิพลมากในองค์ประกอบของเพปไทด์ลำดับ เหมือนง่ายว่า โปรตีนที่เกี่ยวข้องในหน้าที่คล้ายกันจะใช้ร่วมกันคุณลักษณะคล้ายในลำดับของกรดอะมิโน ในทำนองเดียวกัน orthologous ลำดับแสดงลำดับอนุรักษ์ กลุ่มที่กว้างมากยิ่งขึ้น เช่นโปรตีนพัฒนา สามารถถูกแสดงจะมีรูปแบบลักษณะของกลุ่มนั้น (Karlin และ Burge 1996 เคลียร์วิวและโกล์ดดิง 2004)คุณลักษณะลำดับผิดปกติเหล่านี้อย่างใดอย่างหนึ่งเป็นของเกินลำดับในโปรตีน (Wootton และ Federhen 1993) ลำดับง่ายสามารถช่วงจากรามิด homopolymer สูง biased และภูมิภาคอุดมไปสำหรับกรดอะมิโนหนึ่ง ให้ใหญ่ โครงสร้างซ้ำที่ซับซ้อน ลำดับโปรตีนซ้ำ ๆ อย่างมีอยู่ในโดเมนทั้งหมดของชีวิต อย่างไรก็ตาม พวกเขาจะอุดมสมบูรณ์โดยเฉพาะอย่างยิ่งภายใน eukaryotic โปรตีน (Karlin และ Burge 1996 Marcotte et al. 1999 เคลียร์วิวและโกล์ดดิง 2000 ซิมการ์ดและครีมเทียม 2002)ภายใน eukaryotes รามิด homopolymer ส่วนใหญ่มีการตรวจสอบอย่างครบถ้วน เพราะตรวจง่ายของญาติ Karlin และ Burge (1996) พบว่า homopeptides ทั้งสั้น และยาวได้บ่อยกว่าในโปรตีนพัฒนากว่าในชั้นเรียนอื่น ๆ ของโปรตีน พวกเขายังพบว่า โปรตีนจำนวนมากประกอบด้วยหลาย homopeptide ยาวลำดับได้เกี่ยวข้องในโรคระบบประสาทและการพัฒนา โรคฮันติงตันจริง ๆ (Duyao et al. 1993 Al. ร้อยเอ็ดเซี 1993 Kieburtz et al. ปี 1994), ง่ายโรคเคนเนดี้ (bulbar และสันหลังหรือที่เรียกว่ากล้ามเนื้อฝ่อ (ลา Spada et al. 1991)) dentatorubral pallidoluysian ฝ่อ (Li et al. 1993 ลิตี้เบอร์กร้อยเอ็ด al. 1994 Al. ร้อยเอ็ด Koide 1994 Nagafuchi et al. ปี 1994), และ ataxias spinocerebellar หลาย (Banfi et al. 1994 คาวากูชิ et al. 1994 Pulst et al. 1996 David et al. 1997 Zhuchenko et al. 1997 มุระ et al. 2001 Silveira et al. 2002) ประกอบด้วย CAG ทำซ้ำ การเข้ารหัส polyglutamine รามิดการตรวจสอบนี้เชื่อมโยงกับลำดับซ้ำ เราก่อนหน้านี้ดำเนินการสำรวจพัฒนา และระบบประสาทโปรตีนจากตุ๊ด sapiens และแมลงวันทอง (เคลียร์วิวและโกล์ดดิง 2004) ผลของเรายืนยันว่า พัฒนาโปรตีนอุดมไปแน่นอนสำหรับลำดับเรื่อง แต่ลำดับ ด้วยฟังก์ชันระบบประสาทไม่ อย่างไรก็ตาม หลายลำดับดังกล่าวถือเป็นโปรตีนมหาราชได้เฉพาะสมองและระบบประสาท เพิ่มเติม มากของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับโรค neurodegenerative อาจมีฟังก์ชันปกติ nonpathogenic ที่ยังคงเข้าใจยากดังนั้น การเรียนลำดับ เฉพาะสมองและระบบประสาท เราใช้ข้อมูลนิพจน์ EST ในการศึกษานี้ เราตรวจสอบ ESTs จากสมองและระบบประสาท ซึ่งอาจไม่มีรู้จักฟังก์ชัน กำหนดว่าแสดงลำดับโดยเฉพาะใน เนื้อเยื่อเหล่านี้จะอุดมไปลำดับเรื่อง
การแปล กรุณารอสักครู่..
ผลลัพธ์ (ไทย) 2:[สำเนา]
คัดลอก!
Introduction

Protein sequences are far from a random arrangement of amino acids. Function and history have a great influence on the composition of peptide sequences. It seems intuitive that proteins involved in similar functions would share similar features in their amino acid sequence. Likewise, orthologous sequences show sequence conservation. Even much broader groups, such as developmental proteins, can been shown to possess patterns characteristic of that group (Karlin and Burge 1996; Huntley and Golding 2004).

One of these unusual sequence features is the presence of excess simple sequence in proteins (Wootton and Federhen 1993). Simple sequences can range from highly biased homopolymer tracts and regions enriched primarily for one amino acid, to larger, more complex repetitive structures. Simple repetitive protein sequences are found in all domains of life; however, they are particularly abundant within eukaryotic proteins (Karlin and Burge 1996; Marcotte et al. 1999; Huntley and Golding 2000; Sim and Creamer 2002).

Within the eukaryotes, most homopolymer tracts have been investigated more thoroughly owing to their relative ease of detection. Karlin and Burge (1996) found that both short and long homopeptides are more frequent in developmental proteins than in other classes of proteins. They also found that many proteins containing multiple long homopeptide sequences were involved in nervous system disease and development. Indeed, Huntington disease (Duyao et al. 1993; Snell et al. 1993; Kieburtz et al. 1994), Kennedy dis ease (also known as spinal and bulbar muscular atrophy (La Spada et al. 1991)), dentatorubral pallidoluysian atrophy (Li et al. 1993; Burke et al. 1994; Koide et al. 1994; Nagafuchi et al. 1994), and several spinocerebellar ataxias (Banfi et al. 1994; Kawaguchi et al. 1994; Pulst et al. 1996; David et al. 1997; Zhuchenko et al. 1997; Nakamura et al. 2001; Silveira et al. 2002) contain CAG repeats, which encode polyglutamine tracts.

To investigate this association with repetitive sequence, we previously conducted a survey of neurological and developmental proteins from Homo sapiens and Drosophila melanogaster (Huntley and Golding 2004). Our results confirmed that developmental proteins are indeed enriched for simple sequences but that sequences with neurological function are not. However, many of those sequences considered to be neurological proteins may not be specific to the brain and nervous system. Further, many of the proteins involved in the neurodegenerative disorders may have a normal, nonpathogenic function that remains elusive.

Therefore, to study sequences specific to the brain and nervous system we used EST expression data. In this study, we examine ESTs from the brain and nervous system, which may not have a known function, to determine whether sequences expressed specifically in these tissues are enriched for simple sequences.
การแปล กรุณารอสักครู่..
ผลลัพธ์ (ไทย) 3:[สำเนา]
คัดลอก!
บทนำ

โปรตีน ลำดับไกลจากการจัดเรียงของกรดอะมิโน ประวัติและการทำงานที่มีอิทธิพลมากในองค์ประกอบของเปปไทด์ ลำดับ มันดูเหมือนง่ายที่โปรตีนเกี่ยวข้องกับฟังก์ชันคล้ายกันจะใช้คุณลักษณะที่คล้ายคลึงกันของลำดับกรดอะมิโน . อนึ่ง orthologous การอนุรักษ์ลำดับแสดงลำดับ กลุ่มยิ่งถูกเช่นโปรตีนพัฒนาการ สามารถถูกแสดงให้มีลวดลายลักษณะของกลุ่ม ( คาร์ลินเบิร์กลีย์และ 1996 และ 2004 ; Golding )

อันนี้ผิดปกติลำดับคุณลักษณะคือการปรากฏตัวของลำดับง่าย ( และโปรตีนส่วนเกินใน Wootton federhen 1993 ) ลำดับง่ายสามารถช่วงจากอคติสูง โฮโมพอลิเมอร์ tracts และภูมิภาคหลักสำหรับหนึ่งที่อุดมด้วยกรดอะมิโน , ขนาดใหญ่โครงสร้างที่ซ้ำ ๆที่ซับซ้อนมากขึ้น ง่าย ๆดังนี้ โปรตีนที่พบในโดเมนทั้งหมดของชีวิต อย่างไรก็ตาม พวกเขาจะยิ่งชุกชุมภายในโปรตีน eukaryotic และคาร์ลินเบิร์ก ( 1996 ; มาร์ค็อต et al . ปี 1999 และ 2000 ; ลีย์ดิงส์ ; ซิมและครีมเทียม 2002 ) .

ภายในยูแคริโอต ทางเดินอาหารโฮโมพอลิเมอร์ส่วนใหญ่ได้รับการตรวจสอบอย่างถี่ถ้วนมากขึ้น เนื่องจากความสะดวกญาติในการตรวจหาคาร์ลิน และ เบิร์ก ( 1996 ) พบว่า homopeptides ทั้งในระยะสั้นและระยะยาว เป็นบ่อยมากขึ้นในการพัฒนามากกว่าในชั้นเรียนอื่น ๆของโปรตีนโปรตีน นอกจากนี้ยังพบว่าโปรตีนหลายที่มีหลายลำดับยาว homopeptide เกี่ยวข้องในโรคระบบประสาท และการพัฒนา แน่นอน ใน โรค ( duyao et al . 1993 ; นล et al . 1993 ; kieburtz et al . 1994 )เคนเนดี DIS ง่าย ( ยังเป็นที่รู้จัก และ bulbar กระดูกสันหลังเสื่อมของกล้ามเนื้อ ( ลาด้า et al . 1991 ) ) dentatorubral pallidoluysian ฝ่อ ( Li et al . 1993 ; เบิร์ก et al . 1994 ; สัตวแพทย์ et al . 1994 ; nagafuchi et al . 1994 ) และ ataxias spinocerebellar หลาย ( โล่ บานฟิ et al . 1994 ; Kawaguchi et al . 1994 ; pulst et al . 1996 ; เดวิด et al . 1997 ; zhuchenko et al . 1997 ; นากามูระ et al . 2001 Silveira et al .2545 ) ประกอบด้วย CAG ซ้ำซึ่งเข้ารหัส polyglutamine ผืน

เพื่อตรวจสอบเรื่องนี้กับสมาคมซ้ำลำดับ เราเคยทำการสำรวจพัฒนาการของระบบประสาทและโปรตีนจาก โฮโมเซเปียน และแมลงวันทอง ( Huntley Golding และ 2004 )ผลของเรายืนยันว่ามีแน่นอนที่อุดมด้วยโปรตีนที่มีลำดับง่ายแต่ลำดับด้วยฟังก์ชันสมองหรือไม่ อย่างไรก็ตาม ผู้ลำดับถือว่าเป็นโปรตีนระบบประสาทอาจไม่เฉพาะระบบประสาทและสมอง นอกจากนี้จำนวนมากของโปรตีนที่เกี่ยวข้องในโรค Neurodegenerative อาจจะปกติnonpathogenic ฟังก์ชันที่ยังคงเข้าใจยาก

ดังนั้นเพื่อศึกษาลำดับเฉพาะระบบประสาทและสมองที่เราใช้และการแสดงออกของข้อมูล ในการศึกษาครั้งนี้ได้ตรวจสอบฐานข้อมูลจากระบบสมองและประสาท ซึ่งอาจจะไม่ได้รู้จักหน้าที่ เพื่อตรวจสอบว่า ลำดับแสดงเฉพาะในเนื้อเยื่อเหล่านี้จะอุดมด้วยเทคนิคง่ายๆ
การแปล กรุณารอสักครู่..
 
ภาษาอื่น ๆ
การสนับสนุนเครื่องมือแปลภาษา: กรีก, กันนาดา, กาลิเชียน, คลิงออน, คอร์สิกา, คาซัค, คาตาลัน, คินยารวันดา, คีร์กิซ, คุชราต, จอร์เจีย, จีน, จีนดั้งเดิม, ชวา, ชิเชวา, ซามัว, ซีบัวโน, ซุนดา, ซูลู, ญี่ปุ่น, ดัตช์, ตรวจหาภาษา, ตุรกี, ทมิฬ, ทาจิก, ทาทาร์, นอร์เวย์, บอสเนีย, บัลแกเรีย, บาสก์, ปัญจาป, ฝรั่งเศส, พาชตู, ฟริเชียน, ฟินแลนด์, ฟิลิปปินส์, ภาษาอินโดนีเซี, มองโกเลีย, มัลทีส, มาซีโดเนีย, มาราฐี, มาลากาซี, มาลายาลัม, มาเลย์, ม้ง, ยิดดิช, ยูเครน, รัสเซีย, ละติน, ลักเซมเบิร์ก, ลัตเวีย, ลาว, ลิทัวเนีย, สวาฮิลี, สวีเดน, สิงหล, สินธี, สเปน, สโลวัก, สโลวีเนีย, อังกฤษ, อัมฮาริก, อาร์เซอร์ไบจัน, อาร์เมเนีย, อาหรับ, อิกโบ, อิตาลี, อุยกูร์, อุสเบกิสถาน, อูรดู, ฮังการี, ฮัวซา, ฮาวาย, ฮินดี, ฮีบรู, เกลิกสกอต, เกาหลี, เขมร, เคิร์ด, เช็ก, เซอร์เบียน, เซโซโท, เดนมาร์ก, เตลูกู, เติร์กเมน, เนปาล, เบงกอล, เบลารุส, เปอร์เซีย, เมารี, เมียนมา (พม่า), เยอรมัน, เวลส์, เวียดนาม, เอสเปอแรนโต, เอสโทเนีย, เฮติครีโอล, แอฟริกา, แอลเบเนีย, โคซา, โครเอเชีย, โชนา, โซมาลี, โปรตุเกส, โปแลนด์, โยรูบา, โรมาเนีย, โอเดีย (โอริยา), ไทย, ไอซ์แลนด์, ไอร์แลนด์, การแปลภาษา.

Copyright ©2025 I Love Translation. All reserved.

E-mail: