Subsequently, abundances of archaea

Subsequently, abundances of archaeal and bacterial 16S rRNA genes were measured on the ABI Prism 3300 system (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) under compara- ble conditions (10 min 95°C, 40 cycles of 20 s 95°C, 1 min 50°C and 30 s 72°C) in triplicates. Signal acquisition was done at 78°C to overcome bias due to primer dimers. PCR reaction mixtures (25 μl volume) contained 2 mM MgCl2, 0.1μM of respective primers (forward and reverse), 1× Power Sybr®Green (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) and 4 ng of template DNA. Curves for both standards were linear (r2>0.99) over five orders of magnitude, and amplifi- cation efficiencies were comparable at 87%.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ต่อจากนั้นอนุภาค archaeal และแบคทีเรีย 16S rRNA ยีนถูกวัดใน ABI Prism 3300 ระบบ (Applied Biosystems, ฟอสเตอร์ซิตี, CA, USA) ภายใต้เงื่อนไข compara- เบิ้ล (10 นาที 95 ° C, 40 รอบของ 20 s 95 ° C, 1 นาที 50 ° C และ 30 s 72 ° C) triplicates สัญญาณซื้อได้กระทำที่ 78 ° C ที่จะเอาชนะอคติเนื่องจาก dimers ไพรเมอร์ PCR ผสมปฏิกิริยา (ปริมาตรไมโครลิตร 25) มี 2 mm MgCl2, 0.1μMของไพรเมอร์ที่เกี่ยวข้อง (ไปข้างหน้าและย้อนกลับ) 1 ×พลังงานSybr®Green (Applied Biosystems, ฟอสเตอร์ซิตี, แคลิฟอร์เนีย, สหรัฐอเมริกา) และ 4 NG ดีเอ็นเอแม่แบบ เส้นโค้งสำหรับทั้งสองมาตรฐานเป็นเชิงเส้น (R2> 0.99) กว่าห้าคำสั่งของขนาดและมีประสิทธิภาพจากเครื่องขยายไอออนถูกเปรียบเทียบที่ 87%

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ต่อมา abundances ของ archaeal เบส 16S rRNA ยีนแบคทีเรีย วัด ABI ปริซึม 3 ระบบ ( Applied Biosystems ฟอสเตอร์ ซิตี้ , แคลิฟอร์เนีย , สหรัฐอเมริกา ) ภายใต้เงื่อนไข compara ble ( 10 นาที 95 องศา C 40 รอบ 20 s 95 องศา C , 1 นาที 50 ° C และ 30 s 72 ° C ) 3 ซ้ำ . การกระทำที่ 78 องศา C สัญญาณเพื่อเอาชนะอคติเนื่องจากรองพื้นิ . เพื่อตรวจหาสารผสม ( หมวด L 25 μ ) ประกอบด้วยชุด 2 มม. μ 0.1 M ของไพรเมอร์ที่เกี่ยวข้อง ( ไปข้างหน้าและย้อนกลับ ) , 1 ×พลัง® SYBR กรีน ( Applied Biosystems ฟอสเตอร์ ซิตี้ , แคลิฟอร์เนีย , สหรัฐอเมริกา ) และ 4 นาโนดีเอ็นเอแม่แบบ เส้นโค้งทั้งสองมาตรฐานมีเส้น ( R2 > 0.99 ) มากกว่าคำสั่งของขนาด 5 และ amplifi - บวกประสิทธิภาพใกล้เคียงกันร้อยละ 87