ข้อเสียของเนยคือมีไขมันอิ่มตัวสูง เจ้าไขมันอิ่มตัวนี้ส่งผลเพิ่มคอเลสเตอรอลที่ไม่ดีในร่างกายของเรา การบริโภคเป็นปริมาณมากจึงเพิ่มความเสี่ยงต่อโรคหลอดเลือดหัวใจได้ นอกจากไขมันอิ่มตัวแล้ว เนยยังมีปริมาณคอเลสเตอรอลสูงถึง 33 มิลลิกรัมต่อหนึ่งช้อนชา ซึ่งปริมาณคอเลสเตอรอลที่เราควรรับประทานต่อวันนั้น ไม่ควรเกิน 200 มิลลิกรัม