DiscussionERFs are plant-specific T

Discussion
ERFs are plant-specific TFs that bind to conserved motifs in promoter regions of target genes, thus regulating the expression of genes involved in the response to ethylene. ERFs comprise one of the largest TF families, with 122 members in Arabidopsis and 139 in rice (Nakano et al., 2006). Although sequence identity can be as low as 13% among these different ERFs, all ERFs exhibited a highly conserved AP2/ERF DNA-binding domain of 57–66 amino acids (Nakano et al., 2006; Yin et al., 2010). In this study, based on a transcriptome database, 15 banana fruit ERF genes, designated MaERF1 to MaERF15, were cloned. Similar to the previous reports (Nakano et al., 2006; Yin et al., 2010; Liu et al., 2011), alignment of the 15 MaERFs proteins showed that they shared a highly conserved ERF domain (Supplementary Fig. S1A, B), although they were highly diverse in size, ranging from 183 to 482 amino acids. The lowest similarity observed was 18% while the highest similarity observed was 76% (Supplementary Fig. S2 and Table S8). The 15 MaERFs fell into seven out of the 12 different groups of the previously characterized ERF proteins (Nakano et al., 2006; Yin et al., 2010) (Supplementary Fig. S3). In subfamily VIII, MaERF10 to MaERF15 also had an EAR repressor domain (Supplementary Fig. S1C), suggesting that these five members might act as transcription repressors (Ohta et al., 2001). Consistent with their role as TFs, all the 15 MaERFs have basic amino acid regions that potentially serve as NLS to target the proteins to the nucleus. Nuclear localization was further confirmed by transient expression of five MaERFs from different subfamilies in tobacco BY-2 protoplasts or leaves (Fig. 1 and Supplementary Fig. S4).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สนทนาERFs เป็นพืชเฉพาะ TFs ที่ผูกกับความนำในภูมิภาคโปรโมเตอร์ของยีนเป้าหมาย ควบคุมค่าของยีนที่เกี่ยวข้องในการตอบสนองต่อเอทิลีนดังนั้น ERFs เป็นส่วนประกอบหนึ่งของครอบครัว TF ใหญ่ที่สุด สมาชิก 122 ใน Arabidopsis และ 139 ในข้าว (นากาโนะและ al., 2006) ถึงแม้ว่าลำดับรหัสประจำตัวจะต่ำสุดที่ 13% ใน ERFs เหล่านี้แตกต่างกัน ERFs ทั้งหมดจัดแสดงโดเมนดีเอ็นเอของ AP2/ERF ผูกสูงนำกรดอะมิโน 57 – 66 (นากาโนะและ al., 2006 ยิน et al., 2010) ในการศึกษานี้ จากฐานข้อมูล transcriptome, 15 กล้วยผลไม้ ERF ยีน กำหนด MaERF1 เพื่อ MaERF15 ถูกโคลน คล้ายกับรายงานก่อนหน้านี้ (นากาโนะและ al., 2006 ยิน al. et, 2010 หลิว et al., 2011), ตำแหน่งของโปรตีน MaERFs 15 แสดงให้เห็นว่า พวกเขาร่วมกันนำสูง ERF โด (ฟิกเสริม S1A, B), แม้ว่าพวกมายขนาด ตั้งแต่ 183 482 กรดอะมิโน สังเกตเฉพาะราคาถูก 18% ในขณะสังเกตความคล้ายกันสูงสุด 76% (เสริมฟิก S2 และ S8 ตาราง) 15 MaERFs ตกลงไปในเจ็ดจากกลุ่มต่าง ๆ 12 ของก่อนหน้านี้ characterized ERF โปรตีน (นากาโนะและ al., 2006 ยิน et al., 2010) (ฟิกเสริม S3) ใน subfamily VIII, MaERF10 เพื่อ MaERF15 ยังมีโดเมน repressor หู (ฟิกเสริม S1C), แนะนำที่สมาชิกห้าเหล่านี้อาจทำหน้าที่เป็น repressors transcription (Ohta et al., 2001) สอดคล้องกับบทบาทของตนเป็น TFs, MaERFs 15 ทั้งหมดมีกรดอะมิโนพื้นฐานภูมิภาคที่อาจใช้เป็น NLS เพื่อเป้าหมายวิลเลียมนิวเคลียส นิวเคลียร์แปลเพิ่มเติมถูกยืนยัน โดยนิพจน์แบบฉับพลันของห้า MaERFs จาก subfamilies แตกต่างกันในยาสูบ BY 2 โปหรือใบไม้ (Fig. 1 และฟิกเสริม S4)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

คำอธิบาย
ERFs เป็น TFS พืชเฉพาะที่ผูกกับลวดลายอนุรักษ์ในภูมิภาคโปรโมเตอร์ของยีนเป้าหมายดังนั้นการควบคุมการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องในการตอบสนองต่อเอทิลีน ERFs ประกอบด้วยหนึ่งที่ใหญ่ที่สุดครอบครัว TF, 122 คนใน Arabidopsis และ 139 ในข้าว (Nakano et al., 2006) แม้ว่าลำดับบัตรสามารถจะต่ำเป็น 13% ในกลุ่มที่แตกต่างกันเหล่านี้ ERFs ทั้งหมด ERFs แสดงอนุรักษ์สูง AP2 / ERF โดเมนดีเอ็นเอผูกพันของ 57-66 กรดอะมิโน (Nakano et al, 2006;.. หยินและคณะ, 2010) ในการศึกษาครั้งนี้ขึ้นอยู่กับฐานข้อมูลของยีน, 15 ยีนกล้วยผลไม้ ERF กำหนด MaERF1 เพื่อ MaERF15, ถูกโคลน คล้ายกับรายงานก่อนหน้านี้ (Nakano et al, 2006;. หยินและคณะ, 2010;.. หลิว et al, 2011) การจัดตำแหน่งของ 15 MaERFs โปรตีนแสดงให้เห็นว่าพวกเขาร่วมกันอนุรักษ์สูงโดเมน ERF (เสริมรูป S1A, B. ) แม้ว่าพวกเขาจะมีความหลากหลายอย่างมากในขนาดตั้งแต่ 183-482 กรดอะมิโน ความคล้ายคลึงกันต่ำสุดที่สังเกตเป็น 18% ในขณะที่มีความคล้ายคลึงกันมากที่สุดสังเกตเป็น 76% (เสริมรูป. S2 และตาราง S8) 15 MaERFs ลดลงเป็นเจ็ดจาก 12 กลุ่มที่แตกต่างจากก่อนหน้านี้ที่โดดเด่นโปรตีน ERF (Nakano et al, 2006;.. หยิน et al, 2010) (. เสริมรูป S3) ในอนุวงศ์ VIII, MaERF10 เพื่อ MaERF15 ยังมีโดเมน EAR อดกลั้น (เสริมรูป. S1C) ชี้ให้เห็นว่าสิ่งเหล่านี้ห้าคนอาจจะทำหน้าที่เป็น repressors ถอดความ (Ohta et al., 2001) สอดคล้องกับบทบาทของพวกเขาเป็น TFS ทั้งหมด 15 MaERFs ภูมิภาคมีกรดอะมิโนขั้นพื้นฐานที่อาจทำหน้าที่เป็น NLS ที่จะกำหนดเป้าหมายโปรตีนนิวเคลียส การแปลนิวเคลียร์ได้รับการยืนยันต่อไปโดยการแสดงออกชั่วคราวของห้า MaERFs จากครอบครัวที่แตกต่างกันในยาสูบ BY-2 protoplasts หรือใบ (รูป. 1 และเสริมรูป. S4)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

erfs สนทนา
เป็นพืชเฉพาะ TFS ที่ผูกกับการอนุรักษ์ลวดลายในภูมิภาคของ promoter ของยีนเป้าหมาย ดังนั้น การควบคุมการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองเอทิลีน erfs มีหนึ่งที่ใหญ่ที่สุดของครอบครัว TF กับ 122 สมาชิกใน Arabidopsis และ 139 ในข้าว ( นากาโนะ et al . , 2006 ) แม้ว่าตัวตนดับสามารถเป็นต่ำเป็นร้อยละ 13 ของ erfs ที่แตกต่างกันเหล่านี้มีทั้งหมด erfs ที่มีการอนุรักษ์ ap2 / TAN ดีเอ็นเอมัดโดเมน 57 – 66 กรดอะมิโน ( นากาโนะ et al . , 2006 ; Yin et al . , 2010 ) ในการศึกษานี้ ขึ้นอยู่กับ ทราน ริปโตมฐานข้อมูล 15 กล้วยผลไม้ ERF ยีน , เขต maerf1 เพื่อ maerf15 , โคลน คล้ายคลึงกับรายงานก่อนหน้า ( นากาโนะ et al . , 2006 ; Yin et al . , 2010 ; Liu et al . , 2011 )ตำแหน่งของ 15 maerfs โปรตีนพบว่าพวกเขาใช้ร่วมกันที่มีการอนุรักษ์ ERF โดเมน ( เพิ่มเติมรูปที่ s1a , B ) ถึงแม้ว่าพวกเขามีความหลากหลายสูงในขนาดตั้งแต่ประมาณ 183 คือกรดอะมิโน สุดที่พบคือ 18% ในขณะที่ความเหมือนความเหมือนสูงสุดพบคือ 76% ( เพิ่มเติมรูป S2 และตาราง s8 )15 maerfs ลดลงใน 7 จาก 12 กลุ่มที่แตกต่างกันของก่อนหน้านี้ลักษณะ ERF โปรตีน ( นากาโนะ et al . , 2006 ; Yin et al . , 2010 ) ( เพิ่มเติมรูป S3 ) ใน subfamily 8 , maerf10 เพื่อ maerf15 ยังมีหูผู้ควบคุมโดเมน ( เพิ่มเติมรูปที่ s1c ) แนะนำว่าเหล่านี้ห้าสมาชิกอาจทำเป็นถอดความ repressors ( โอห์ตา et al . , 2001 ) สอดคล้องกับบทบาทของพวกเขาเป็น TFS ,ทั้งหมด 15 maerfs มีพื้นฐานกรดอะมิโนภูมิภาคที่อาจเป็น NLS เป้าหมายโปรตีนกับนิวเคลียส การจำกัดอาวุธนิวเคลียร์ได้ยืนยันเพิ่มเติมโดยมีการแสดงออกของ maerfs จาก 5 วงศ์ย่อยที่แตกต่างกันในเซลล์ หรือ ใบยาสูบ by-2 ( รูปที่ 1 และรูปเพิ่มเติม S4 )