The construction of the three-dimen

The construction of the three-dimensional structures of the
fourteen selected epitopes bound to modified galactose (by the
addition of heteroatom cyclic) moieties was performed using
comparative modeling, which is a technique that is used to
construct three-dimensional protein structures based on two
structurally similar proteins that have an evolutionary relationship
(Dalton and Jackson, 2010 and Silva Júnior et al., 2012). The Basic
Local Alignment Search Tool (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)
and the Protein Data Bank ((PDB) http://www.rcsb.org/pdb/home/
home.do) were used to obtain a native protein with a resolved
three-dimensional structure that was used as template for the construction
of the epitopes (Szabadka and Grolmusz, 2007 and Shahlaei
et al., 2011). The SWISS-MODEL program was used to construct
the three-dimensional structures of the epitopes using a structural
alignment between the target sequence and the region of similarity
of the protein template, taking into account the conformational
aspects of the target protein (Bordoli et al., 2009).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การก่อสร้างโครงสร้างสามมิติของการ14 เลือก epitopes กับกาแล็กโทสแก้ไข (โดยmoieties แห่งวัฏจักร heteroatom) ทำโดยใช้สร้างโมเดลเปรียบเทียบ ซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้ในการสร้างโครงสร้างสามมิติของโปรตีนตามสองstructurally คล้ายโปรตีนที่มีความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการ(ดาลตัน และ แจ็คสัน 2010 แล้ว Silva Júnior et al., 2012) พื้นฐานเฉพาะตำแหน่งค้นหาเครื่องมือ (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)ธนาคารข้อมูลโปรตีน (http://www.rcsb.org/pdb/home/ (PDB)home.do) ก็จะได้รับโปรตีนดั้งเดิมกับการแก้ไขโครงสร้างสามมิติที่ใช้เป็นแม่แบบสำหรับการก่อสร้างของ epitopes (Szabadka และ Grolmusz, 2007 และ Shahlaeiร้อยเอ็ด al., 2011) ใช้สร้างโปรแกรมรูปแบบสวิสโครงสร้างสามมิติของ epitopes ที่ใช้เป็นโครงสร้างจัดลำดับเป้าหมายและขอบเขตของความคล้ายคลึงกันของแบบโปรตีน คำนึงที่ conformationalลักษณะของโปรตีนเป้าหมาย (Bordoli et al., 2009)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การก่อสร้างโครงสร้างสามมิติของ
สิบสี่ epitopes เลือกผูกไว้กับกาแลคโตดัดแปลง (โดย
การเพิ่มขึ้นของวงจร heteroatom) moieties ได้รับการดำเนินการโดยใช้
การสร้างแบบจำลองเปรียบเทียบซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้ในการ
สร้างโครงสร้างโปรตีนสามมิติขึ้นอยู่กับสอง
โครงสร้าง โปรตีนที่คล้ายกันที่มีความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการ
(ดาลตันและแจ็คสัน, ปี 2010 และซิลวาจูเนียร์ et al., 2012) พื้นฐาน
การจัดเครื่องมือการค้นหาในท้องถิ่น (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)
และธนาคารข้อมูลโปรตีน ((PDB) http://www.rcsb.org/pdb/home/
home.do) ถูกนำมาใช้เพื่อให้ได้โปรตีนพื้นเมืองที่มีการแก้ไข
โครงสร้างสามมิติที่ใช้เป็นแม่แบบสำหรับการก่อสร้าง
ของ epitopes (Szabadka และ Grolmusz 2007 และ Shahlaei
et al., 2011) โปรแกรม SWISS-MODEL ถูกใช้ในการสร้าง
โครงสร้างสามมิติของ epitopes โดยใช้โครงสร้าง
การจัดตำแหน่งระหว่างเป้าหมายลำดับและภูมิภาคของความคล้ายคลึงกัน
ของแม่แบบโปรตีนโดยคำนึงถึงโครงสร้าง
ด้านของโปรตีนเป้าหมาย (Bordoli et al, 2009)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การก่อสร้างของโครงสร้างสามมิติของ
14 เลือกผูกดัดแปลงจากกาแล็กโทส (
2 heteroatom เป็นวงกลม ) 54 ได้ดําเนินการโดยใช้
แบบเปรียบเทียบ ซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้เพื่อสร้างโครงสร้างสามมิติของโปรตีนขึ้นอยู่กับ
2
โปรตีนคล้ายโครงสร้างที่มีความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการ (
ดาลตั้นกับแจ็คสัน2010 และ ซิลวา เจ ú nior et al . , 2012 ) พื้นฐาน
ท้องถิ่นจัดเครื่องมือค้นหา ( http : / / www.ncbi . nlm . NIH . gov / ระเบิด )
และธนาคารข้อมูลโปรตีน ( PDB ) http : / / www.rcsb . org / PDB / home /
บ้าน ทำแบบเพื่อให้ได้โปรตีนพื้นเมืองที่มีการแก้ไข
โครงสร้างสามมิติที่ใช้เป็นแม่แบบสำหรับการสร้าง
ของผู้ป่วย ( szabadka และ grolmusz 2007 และ shahlaei
et al . , 2011 )โปรแกรมที่ใช้ในการสร้าง swiss-model
โครงสร้างสามมิติของผู้ป่วย การจัดโครงสร้าง
ระหว่างเป้าหมายลำดับและภูมิภาคของความเหมือน
ของโปรตีนแม่แบบ โดยคำนึงถึงลักษณะโครงสร้างของโปรตีนเป้าหมาย (
bordoli et al . , 2009 )