This study describes the phenotypic

This study describes the phenotypic and genotypic characterization of strains CD3 : 27, CD3 : 28
T
and CD3 : 33, representing isolates of a novel species, CD3 : 32, probably a strain of Prevotella histicola (Downes et al., 2008), and CD3 : 34, probably a strain of Prevotella melaninogenica (Shah & Collins, 1990). Additionally, we describe the phylogenetic relationships between the five isolates and other members of the genus Prevotella, based upon comparative 16S rRNA gene sequence analyses. Moreover, the five isolates have been subjected to whole genome sequencing (WGS) using 454 pyro-sequencing technology (GS Junior; Roche Diagnostics), and the sequences of the genes encoding chaperonin 60 (cpn60) and DNA-directed RNA polymerase subunitb (rpoB)havealsobeencompared.
The five strains were isolated from a biopsy of the proximal small intestine of a girl with CD, born in 1995, i.e. during the 1985–1996 Swedish CD epidemic. She was on a glutenfree diet when the biopsy was taken at the Department of Paediatrics, Umea ˚ University Hospital, Umea ˚ , in 2007. Informed consent was obtained from her parents. The study was approved by the local Research Ethics Committee of the Faculty of Medicine (Um dnr: 96-304 and 04-156). The biopsy was weighed, homogenized and serially diluted tenfold in Fastidious Anaerobe Broth medium (Lab M) and immediately plated onto selective and non-selective agar media. All Prevotella strains were primarily isolated on blood agar plates [ Columbia Blood Agar Base (Acumedia), supplemented with 5 % defibrinated horse blood ] . P. histicola CCUG 55407
T
, P. melaninogenica CCUG 4944B
and Prevotella stercorea CCUG 55595
T
were obtained from the Culture Collection University of Gothenburg (CCUG; http://www.ccug.se).
T

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การศึกษาครั้งนี้อธิบายถึงฟีโนไทป์และลักษณะทางพันธุกรรมของสายพันธุ์ cd3: 27, cd3: 28

เสื้อและ cd3: 33, ที่เป็นตัวแทนของสายพันธุ์ของสายพันธุ์ใหม่ cd3: 32 อาจจะเป็นสายพันธุ์ของ Prevotella histicola (Downes et al, 2008.) และ cd3: 34 อาจจะเป็นสายพันธุ์ของ Prevotella melaninogenica (กษัตริย์&คอลลิน, 1990) นอกจากนี้เราจะอธิบายความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการระหว่างห้าแยกและสมาชิกคนอื่น ๆ ของ Prevotella ประเภทตามลำดับเปรียบเทียบ 16s rRNA ยีนวิเคราะห์ นอกจากนี้ห้าสายพันธุ์ที่ได้รับภายใต้การจัดลำดับจีโนมทั้งหมด (WGS) โดยใช้เทคโนโลยี 454-Pyro ลำดับ (GS จูเนียร์; การวินิจฉัยโรช)และลำดับของยีนเข้ารหัส chaperonin 60 (cpn60) และ dna กำกับโพลิเมอร์ subunitb (rpob) havealsobeencompared.
ห้าสายพันธุ์ที่แยกได้จากการตรวจชิ้นเนื้อของลำไส้ใกล้เคียงเล็ก ๆ ของหญิงสาวที่มีซีดี, เกิดในปี 1995 คือระหว่าง 1985-1996 ระบาด cd สวีเดน เธอเป็นในอาหาร glutenfree เมื่อเนื้อเยื่อที่ถูกนำมาที่ภาควิชากุมารเวชศาสต​​ร์ที่อูเมอา˚โรงพยาบาลมหาวิทยาลัยอูเมอา˚, ในปี 2007 ความยินยอมที่ได้รับจากพ่อแม่ของเธอ การศึกษาได้รับการอนุมัติโดยคณะกรรมการจริยธรรมการวิจัยในท้องถิ่นของคณะแพทยศาสตร์ (หนอ DNR: 96-304 และ 04-156) เนื้อเยื่อที่ถูกชั่งน้ำหนักหดหายและปรับลดลำดับเป็นสิบเท่าในจุกจิกกลางน้ำซุปบัคเตรีจำพวกที่ไม่ต้องการออากาศหายใจ (ห้องปฏิบัติการเมตร) และชุบทันทีบนเลือกและไม่เลือกสื่อวุ้นทุกสายพันธุ์ Prevotella ถูกแยกหลักบนจานวุ้นเลือด [โคลัมเบียฐานวุ้นเลือด (acumedia) เสริมด้วย 5% เลือดม้า defibrinated] พี histicola ccug 55407

ทีพี melaninogenica ccug 4944b
และ Prevotella stercorea ccug 55595

เสื้อที่ได้รับจากมหาวิทยาลัยวัฒนธรรมการสะสมของจีพีเอส (ccug; http://www.ccug.se).
T

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ศึกษาอธิบายสมบัติฟีโนไทป์ และจีโนไทป์ของสายพันธุ์ CD3: 27, CD3: 28
T
CD3 และ: 33 แทน isolates พันธุ์นวนิยาย CD3: 32 คงต้องใช้ของ Prevotella histicola (Downes et al., 2008), CD3: 34 คงต้องใช้ของ Prevotella melaninogenica (&ชาห์คอลลินส์ 1990) นอกจากนี้ เราอธิบายความสัมพันธ์ phylogenetic isolates ห้าและสมาชิกคนอื่น ๆ ของตระกูลนี้ Prevotella ตามเปรียบเทียบ 16S rRNA ยีนลำดับวิเคราะห์ นอกจากนี้ isolates ห้าได้ถูกต้องทั้งจีโนมลำดับ (WGS) โดยใช้เทคโนโลยี pyro ลำดับ 454 (GS จูเนียร์ โรชวินิจฉัย), และลำดับของยีนเข้า 60 chaperonin (cpn60) แล้วนำดีเอ็นเออาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส (rpoB) subunitb havealsobeencompared
สายพันธุ์ห้าถูกแยกต่างหากจากการตรวจชิ้นเนื้อของลำไส้เล็ก proximal กับ CD เกิดใน 1995 เช่นในระหว่างการระบาด 1985–1996 CD สวีเดน เธอในอาหาร glutenfree เมื่อตรวจชิ้นเนื้อจะถูกนำมาที่แผนก Paediatrics โรงพยาบาลมหาวิทยาลัย˚ Umea, Umea ˚ 2550 แจ้งความยินยอมได้รับจากพ่อแม่ การศึกษาได้รับการอนุมัติ โดยคณะกรรมการจริยธรรมวิจัยท้องถิ่นของคณะแพทยศาสตร์ (Um dnr: 96-304 และ 04-156) การตรวจชิ้นเนื้อมีน้ำหนัก homogenized serially diluted tenfold ในกลาง Fastidious Anaerobe ซุป (ห้องปฏิบัติการ M) และชุบลงในสื่อที่ใช้ และไม่ใช้ agar ทันที สายพันธุ์ Prevotella ทั้งหมดถูกหลักแยกต่างหากบนแผ่นเลือด agar [โคลัมเบีย Agar เลือดฐาน (Acumedia), เสริม ด้วย 5% defibrinated ม้าเลือด] Histicola P. CCUG 55407
T
, P. melaninogenica CCUG 4944B
และ Prevotella stercorea CCUG 55595
T
ได้รับมาจากโกเธนวัฒนธรรมชุดมหาวิทยาลัยของเบิร์ก (CCUG; http://www.ccug.se)
T

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การศึกษานี้จะอธิบายถึงคุณลักษณ์ phenotypic และ genotypic ของพันธุ์ซีดี 27 แผ่นซีดี 3328

ซีดีและ T 333 แผ่นซีดีเป็นตัวแทนแยกของสายพันธุ์ใหม่ที่ 332 อาจจะเป็นความเมื่อยล้าของ histicola prevotella ( downes et al . 2008 )และแผ่นซีดี 334 อาจเป็นความเมื่อยล้าของ melaninogenica prevotella (ชาห์& Collins 1990 ) นอกเหนือจากนี้เราจะอธิบายถึงความสัมพันธ์กับ phylogenetic ระหว่างห้าแยกและสมาชิกอื่นๆของ prevotella พืชที่ขึ้นอยู่กับการวิเคราะห์ 16 S rrna ยีนตามลำดับเปรียบเทียบ ยิ่งไปกว่านั้นยังห้าแยกได้รับการเปลี่ยนแปลงทั้งหมดยีนการจัดลำดับ(:)ได้โดยใช้ความร้อน 454 - การจัดลำดับ technology ( GS Junior Suites Roche diagnostics )และลำดับของการเข้ารหัส chaperonin ยีนที่ 60 (:ซีพีเอ็นผู้นำธุรกิจ 60 )และดีเอ็นเอไป rna polymerase subunitb ( rpob ) havealsobeencompared .
ที่ห้าพันธุ์ได้แยกออกจากที่ดร.โมฮัมหมัดซิงห์ของ proximal ลำไส้เล็กของหญิงสาวด้วยแผ่นซีดี,เกิดมาในปี 1995 ,เช่นในระหว่างที่; Spark , 1985 - 1996 ประเทศสวีเดนซีดีการแพร่ระบาด. ท่านอยู่บนอาหาร glutenfree เมื่อตับได้ถูกนำตัวไปที่กรมโดยจำกัดโรงพยาบาลมหาวิทยาลัย umea เจริญเติบโต umea องศาอย่างรวดเร็วในปี 2007 . ได้รับความยินยอมจากแจ้งได้มาจากพ่อแม่ของเธอ การศึกษาได้รับการรับรองโดย Research คณะกรรมการจรรยาบรรณของคณาจารย์ของยา( dnr UM 96-304 และ 04-156 ) ดร.โมฮัมหมัดซิงห์ได้ชั่งน้ำหนักสดพร่องมันเนยเป็นแบบอนุกรมเจือจางและทำหน้าเคร่งบัคเตรีจำพวกที่ไม่ต้องการอากาศหายใจในน้ำซุปขนาดกลางจู้จี้( LAB ม.)และในทันทีตัวเสียบเคลือบทองลงบนมีเดียสรรหาและไม่เลือกสาหร่ายทะเลความตึงเครียด prevotella ทั้งหมดก็ถูกแยกออกจากกันบนแผ่นทำความร้อนสาหร่ายทะเลเลือด[โคลัมเบียเลือดสาหร่ายทะเลฐาน( acumedia )และเสริมด้วยเลือดม้า defibrinated 5% ]เป็นหลัก histicola p . CCUG )ทัน 55407

melaninogenica p . T CCUG )ทัน 4944 B
และ prevotella stercorea CCUG )ทัน 55595

T ได้จากวัฒนธรรมมหาวิทยาลัยคอลเลคชั่นของ Gothenburg ( CCUG )ทัน http://www.ccug.se).
t