The correct typing of Salmonella is essential for epidemiological
investigation in infections and outbreaks. Numerous subtyping
methods have been developed, including pulsed-field gel electrophoresis
(PFGE) and multilocus sequence typing (MLST). PFGE has
been commonly recognized as the gold standard method becauseof its good repeatability and high discriminatory power, and this
method is widely accepted for Salmonella subtyping and contamination
tracing (Achtman et al., 2012). MLST is based on the sequences
of gene fragments from a number of different
housekeeping loci and has also been used successfully to subtype
Salmonella isolates and to study the evolution and population genetics
of various Salmonella serotypes (Achtman, Hale, Murphy,
Boyd, & Porwollik, 2013; Lan, Reeves, & Octavia, 2009; Litrup
et al., 2010). One major advantage of MLST over PFGE is that the
data are publicly available online and can be compared readily
between laboratories, thus producing a powerful resource for
global epidemiology (Maiden et al., 1998). Additionally, virulotyping
has been helpful for characterizing Salmonella, and various
serovars and strains of Salmonella that cause specific disease syndromes
are distinguished by the complements of virulence genes
they carry (Capuano, Mancusi, Capparelli, Esposito, & Proroga,
2013; Graziani et al., 2008).
พิมพ์ถูกต้องของสายเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับความตรวจสอบการติดเชื้อและแพร่ระบาด ลูกผสมสามมากมายวิธีได้รับการพัฒนา รวมทั้งฟิลด์สูงเจ electrophoresis(PFGE) และลำดับที่ multilocus พิมพ์ (MLST) มี PFGEรับรู้โดยทั่วไปเป็นวิธีการมาตรฐานเนื่องจากการทำซ้ำในความดี และพลังงานสูงโจ่งแจ้ง และนี้วิธีการยอมรับอย่างกว้างขวางสำหรับลูกผสมสามสายและการปนเปื้อนสืบค้นกลับ (Achtman et al., 2012) MLST ตามลำดับที่ของบางส่วนของยีนจากจำนวนแตกต่างกันแม่บ้าน loci และมียังการใช้สำเร็จชนิดย่อยแยกระดับ การศึกษาวิวัฒนาการและพันธุศาสตร์เชิงประชากรของ serotypes ระดับต่าง ๆ (Achtman เฮล เมอร์ ฟี่Boyd, & Porwollik, 2013 Lan บ้าเป็นหลัง & Octavia, 2009 Litrupร้อยเอ็ด al., 2010) หนึ่งข้อดีหลัก ๆ ของ MLST ผ่าน PFGE เป็นที่ข้อมูลทั่วไปเยี่ยมชม และสามารถเปรียบเทียบพร้อมระหว่างห้องปฏิบัติการ จึงผลิตทรัพยากรที่มีประสิทธิภาพสำหรับโลกระบาดวิทยา (หญิงสาวร้อยเอ็ด al., 1998) นอกจากนี้ virulotypingมีประโยชน์สำหรับการกำหนดลักษณะของระดับ และต่าง ๆserovars และสายพันธุ์ของสายที่ทำให้เกิดโรคเฉพาะแสงศตวรรษโดดเด่น ด้วยการเติมเต็มของยีน virulenceพวกเขาพก (Capuano, Mancusi, Capparelli, Esposito, & Proroga2013 Graziani et al., 2008)
การแปล กรุณารอสักครู่..
พิมพ์ที่ถูกต้องของเชื้อ Salmonella
เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการระบาดการตรวจสอบในการติดเชื้อและการแพร่ระบาด subtyping
หลายวิธีการได้รับการพัฒนารวมทั้งข่าวคราวชีพจรสนาม
(PFGE) และการพิมพ์ลำดับ Multilocus (MLST) PFGE
ได้รับการยอมรับกันทั่วไปว่าเป็นวิธีการมาตรฐานทองคำbecauseof
การทำซ้ำที่ดีและพลังพินิจพิเคราะห์สูงและวิธีการที่เป็นที่ยอมรับกันอย่างแพร่หลายสำหรับsubtyping เชื้อ Salmonella
และการปนเปื้อนติดตาม(Achtman et al., 2012) MLST จะขึ้นอยู่กับลำดับของชิ้นส่วนของยีนจากจำนวนที่แตกต่างกันตำแหน่งดูแลทำความสะอาดและยังได้รับการใช้ประสบความสำเร็จชนิดย่อยเชื้อSalmonella ที่แยกและศึกษาพันธุศาสตร์วิวัฒนาการและจำนวนประชากรของสายพันธุ์เชื้อ Salmonella ต่างๆ (Achtman, เฮลเมอร์ฟี่, บอยด์และ Porwollik, 2013; Lan, รีฟส์และ Octavia 2009; Litrup et al, 2010). ข้อดีอย่างหนึ่งที่สำคัญของ MLST มากกว่า PFGE ก็คือว่าข้อมูลที่เปิดเผยต่อสาธารณชนอยู่ทั่วไปและสามารถนำมาเปรียบเทียบได้อย่างง่ายดายระหว่างห้องปฏิบัติการจึงผลิตทรัพยากรที่มีประสิทธิภาพสำหรับการระบาดทั่วโลก(Maiden et al., 1998) นอกจากนี้ virulotyping ได้รับประโยชน์ในการพัฒนาการ Salmonella และต่างๆserovars และสายพันธุ์ของเชื้อ Salmonella ที่ก่อให้เกิดอาการเฉพาะโรคมีความโดดเด่นด้วยการเติมเต็มของยีนที่รุนแรงพวกเขาดำเนินการ(Capuano, Mancusi, Capparelli, Esposito และ Proroga, 2013; Graziani et al, 2008)
การแปล กรุณารอสักครู่..
ถูกต้อง พิมพ์เชื้อ เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการศึกษาระบาดวิทยา
การติดเชื้อและระบาด วิธีการ subtyping
มากมายที่ได้รับการพัฒนา รวมทั้งการฟิลด์เจล
( PFGE ) และ multilocus ลำดับการพิมพ์ ( mlst ) มีที่รู้จักเป็น PFGE
ได้รับมาตรฐานทองคำวิธีการที่ดีและมีอำนาจจำแนกสูง และนี้
เป็นวิธีที่ได้รับการยอมรับอย่างกว้างขวางสำหรับ subtyping
ติดตาม ( และการปนเปื้อนเชื้อซัลโมเนลลา แอคท์แมน et al . , 2012 ) mlst ขึ้นอยู่กับลำดับของยีน
เศษจากหมายเลขของตำแหน่งแม่บ้าน และยังถูกใช้แตกต่างกัน
เรียบร้อยแล้วทั้งเชื้อไอโซเลทและเพื่อศึกษาวิวัฒนาการ และพันธุศาสตร์ประชากรของเชื้อต่างๆ แอคท์แมน ( (
,
เฮล เมอร์ฟี่ บอยด์ & porwollik 2013 ; ลานรีฟส์ , & Octavia , 2009 ; litrup
et al . , 2010 ) หลักประโยชน์ของ mlst กว่า PFGE นั่น
ข้อมูลเป็นสาธารณะพร้อมใช้งานแบบออนไลน์ และสามารถเปรียบเทียบพร้อม
ระหว่างห้องปฏิบัติการ จึงผลิตเป็นทรัพยากรที่มีประสิทธิภาพสำหรับ
ระบาดวิทยาทั่วโลก ( Maiden et al . , 1998 ) นอกจากนี้ virulotyping
ได้รับประโยชน์เพื่อการพัฒนาต่างๆ
Salmonella และและสายพันธุ์ของเชื้อซัลโมเนลลาโน ที่ก่อให้เกิดโรคเฉพาะอาการ
มีความโดดเด่น โดยเสริมความรุนแรงของยีน
พวกเขาพก capuano มอนคูซี่ capparelli เอสโปซิโต้ , , , ,
proroga & , 2013 ; กราซีอานี et al . , 2008 )
การแปล กรุณารอสักครู่..