Identification of orthologous seque

Identification of orthologous sequences: Complete
O. niloticus mRNA sequences were obtained from the
NCBI database for most of the analyzed genes (Table 3).
The sequences identified by BLAST had E-values ,e39.
The E-value was relatively high only for Amh. When we repeated
the search using the Amh of zebrafish (AAT77729),
we identified two tilapia sequences (ONI06JC.39_H08
and ONI05ID.39_D09) with much lower E-values (2e15
and 9e12, respectively). The two sequences were positioned
in two adjacent exons of the tilapia Amh, and one
of them was similar to the human Amh. In the RBEST
database, an Fhl2-like cDNA was found with an E-value of
e104. This cDNA showed a higher similarity to Fhl3 (E ¼
e109) in the NCBI database, which is another human
gene of the FHL family. Hence, we defined the detected
tilapia cDNA as part of the Fhl3l (Fhl3-like) gene.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รหัส orthologous ลำดับ: สมบูรณ์Niloticus โอ mRNA ลำดับได้รับจากการฐานข้อมูล NCBI สำหรับส่วนใหญ่ของการวิเคราะห์ยีน (ตาราง 3)ลำดับที่ระบุ โดยระเบิดมีค่า E, e 39ค่า E ค่อนข้างสูงสำหรับ Amh เมื่อเราทำซ้ำการค้นหาโดยใช้ Amh ของปลาม้าลาย (AAT77729),เราระบุลำดับสองในปลานิล (ONI06JC.39_H08และ ONI05ID.39_D09) มีมากลดค่า E (2e 15และ 9e 12 ตามลำดับ) มีวางลำดับที่สองใน exons ติดสองนิล Amh และหนึ่งของพวกเขานั้นคล้ายกับ Amh มนุษย์ ในการ RBESTฐานข้อมูล พบกับ E-ค่าของ cDNA เหมือน Fhl2e 104 CDNA นี้แสดงให้เห็นความคล้ายคลึงกันสูงถึง Fhl3 (E ¼e 109) ในฐานข้อมูล NCBI ซึ่งเป็นบุคคลที่อื่นยีนของ FHL ดังนั้น เรากำหนดที่ตรวจพบนิล cDNA ของยีน (เช่น Fhl3) Fhl3l

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บัตรประจำตัวของลำดับ orthologous: สมบูรณ์
ทุม ลำดับ niloticus mRNA ที่ได้รับจาก
ฐานข้อมูล NCBI สำหรับส่วนมากของยีนวิเคราะห์ (ตารางที่ 3).
ลำดับระบุระเบิดมี E-ค่าอี? 39.
E-มูลค่าค่อนข้างสูงเท่านั้นสำหรับ Amh เมื่อเราทำซ้ำ
ค้นหาโดยใช้ Amh ของ zebrafish (AAT77729)
เราระบุลำดับสองปลานิล (ONI06JC.39_H08
และ ONI05ID.39_D09) ด้วยการที่ต่ำกว่ามาก E-ค่า (2e? 15
และ 9e 12 ตามลำดับ) ลำดับสองอยู่ในตำแหน่ง
ในสอง exons อยู่ติดกันของ Amh ปลานิลและหนึ่ง
ในนั้นคือคล้ายกับมนุษย์ Amh ใน RBEST
ฐานข้อมูล cDNA Fhl2 เหมือนถูกพบกับ E-ค่าของ
อี? 104 ยีนนี้แสดงให้เห็นความคล้ายคลึงกันที่สูงขึ้นเพื่อ Fhl3 (E ¼
จ? 109) ในฐานข้อมูล NCBI ซึ่งเป็นอีกหนึ่งของมนุษย์
ยีนของครอบครัว FHL ดังนั้นเราจึงกำหนดตรวจพบ
ยีนปลานิลเป็นส่วนหนึ่งของ Fhl3l (Fhl3 เหมือน) ยีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การ orthologous ลำดับ : สมบูรณ์
o . niloticus mRNA ลำดับ ได้จาก
ncbi ฐานข้อมูลส่วนใหญ่ของวิเคราะห์ยีน ( ตารางที่ 3 ) .
ลำดับที่ระบุระเบิดได้ e-values E  39 .
ที่เป็นประโยชน์ค่อนข้างสูงสำหรับ amh . เมื่อเราซ้ำ
ค้นหาโดยใช้ AMH ของปลาม้าลาย ( aat77729 )
เราระบุสองลำดับปลานิล ( oni06jc . 39_h08
และ oni05id .39_d09 ) ราคาเท่าไหร่ ( 2 e-values  15
9E  และ 12 ตามลำดับ ) สองลำดับอยู่ในตําแหน่ง
2 ที่มีที่อยู่ติดกันของปลานิล AMH และหนึ่ง
ของพวกเขาคล้ายกับมนุษย์ amh . ในฐานข้อมูล rbest
, fhl2 เหมือน cDNA พบที่มีประโยชน์ของ
E  104 สายพันธุ์นี้มีความคล้ายคลึงกันสูง fhl3 ( E ¼
E  109 ) ใน ncbi ฐานข้อมูล ซึ่งเป็นอีกหนึ่งยีนมนุษย์
ครอบครัวของแกนนำสุขภาพประจำครอบครัว . ดังนั้นเราตรวจพบยีนที่กำหนด
ปลานิลเป็นส่วนหนึ่งของ fhl3l ( fhl3 เหมือน ) ยีน